60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_3271 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009077  Mjls_3220  dehydratase  100 
 
 
156 aa  322  2e-87  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.216519  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3271  dehydratase  100 
 
 
156 aa  322  2e-87  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3209  MaoC-like dehydratase  100 
 
 
156 aa  322  2e-87  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.205501  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0512  hypothetical protein  35 
 
 
326 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5359  MaoC domain protein dehydratase  39.02 
 
 
158 aa  80.1  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3480  MaoC domain protein dehydratase  33.33 
 
 
143 aa  79.3  0.00000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8195  dehydratase  37.37 
 
 
136 aa  76.3  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1483  hypothetical protein  32.35 
 
 
152 aa  70.1  0.00000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.000382942  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3222  dehydratase  31.3 
 
 
141 aa  68.6  0.00000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.986163  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3273  dehydratase  31.3 
 
 
141 aa  68.6  0.00000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3211  MaoC-like dehydratase  31.3 
 
 
141 aa  68.6  0.00000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.582437  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2140  dehydratase  30.77 
 
 
148 aa  65.1  0.0000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.340394  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1853  hypothetical protein  33.66 
 
 
159 aa  64.3  0.0000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0381844  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0886  hypothetical protein  32.09 
 
 
141 aa  64.3  0.0000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0062  MaoC domain protein dehydratase  35 
 
 
133 aa  63.2  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3857  hypothetical protein  31.62 
 
 
138 aa  62.4  0.000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.284543  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1512  dehydratase  32.06 
 
 
133 aa  60.5  0.000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1608  dehydratase  28.68 
 
 
141 aa  58.5  0.00000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5254  MaoC-like dehydratase  32.06 
 
 
133 aa  57  0.00000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.407222 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0391  dehydratase  28.57 
 
 
322 aa  56.6  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000128192 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4759  dehydratase  31.3 
 
 
133 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.533729  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2727  putative MaoC-like dehydratase  28.36 
 
 
138 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4070  dehydratase  28.15 
 
 
147 aa  56.6  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.353484  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4673  MaoC-like dehydratase  31.3 
 
 
133 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.808483  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13574  hypothetical protein  33.93 
 
 
129 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000157487 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4153  MaoC domain protein dehydratase  29.37 
 
 
332 aa  54.7  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3994  MaoC-like dehydratase  29.71 
 
 
151 aa  55.1  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.270876 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4037  MaoC-like dehydratase  29.37 
 
 
326 aa  55.1  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.257252  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4180  MaoC domain protein dehydratase  29.37 
 
 
332 aa  54.7  0.0000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00128585  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2820  hypothetical protein  29.13 
 
 
129 aa  54.3  0.0000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0218869 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5058  MaoC-like dehydratase  30.53 
 
 
143 aa  54.3  0.0000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2787  dehydratase  30.93 
 
 
126 aa  53.9  0.0000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.231995  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1059  dehydratase  30.56 
 
 
141 aa  53.9  0.0000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.621453  normal  0.0175933 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2622  hypothetical protein  30.21 
 
 
129 aa  53.1  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0241614  normal  0.446784 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5027  putative acyl dehydratase  29.85 
 
 
138 aa  53.5  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000226168  normal  0.281597 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2338  MaoC domain protein dehydratase  27.82 
 
 
335 aa  53.1  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2527  MaoC-like dehydratase  23.58 
 
 
139 aa  48.5  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.367433 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0851  hypothetical protein  29.59 
 
 
281 aa  48.1  0.00005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.110102  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2940  dehydratase  26.83 
 
 
139 aa  47.8  0.00006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.156748  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4169  MaoC-like dehydratase  25.37 
 
 
138 aa  47.4  0.00007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.116288  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0634  hypothetical protein  26.28 
 
 
348 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.366687  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0552  hypothetical protein  26.28 
 
 
348 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5645  hypothetical protein  26.28 
 
 
348 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0531  hypothetical protein  26.28 
 
 
348 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.426838  normal 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5452  hypothetical protein  26.28 
 
 
348 aa  45.4  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.080026  normal 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5849  hypothetical protein  26.28 
 
 
348 aa  45.4  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0326756  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2686  MaoC-like dehydratase  28.79 
 
 
146 aa  45.1  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5770  MaoC domain protein dehydratase  26.72 
 
 
149 aa  44.7  0.0005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1696  hypothetical protein  25.74 
 
 
348 aa  44.3  0.0006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.896213 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1645  hypothetical protein  25.74 
 
 
348 aa  44.3  0.0006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.817495  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1672  hypothetical protein  25.74 
 
 
348 aa  44.3  0.0006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2779  MaoC domain protein dehydratase  28.79 
 
 
135 aa  43.9  0.0008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.072272  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3988  dehydratase  26.98 
 
 
136 aa  43.5  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3026  dehydratase  25.35 
 
 
150 aa  43.5  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1127  bifunctional enoyl-CoA hydratase/phosphate acetyltransferase  28.57 
 
 
472 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.345508 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1026  bifunctional enoyl-CoA hydratase/phosphate acetyltransferase  28.57 
 
 
472 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6628  dehydratase  29.33 
 
 
126 aa  41.6  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.211111  normal  0.931834 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3320  dehydratase  30.88 
 
 
132 aa  42  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.190665  hitchhiker  0.000697318 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2872  MaoC domain protein dehydratase  28.03 
 
 
135 aa  40.8  0.007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0899  MaoC domain protein dehydratase  24.59 
 
 
142 aa  40.4  0.008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.344654  normal  0.108371 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>