More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_3994 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_3994  MaoC-like dehydratase  100 
 
 		 151 aa  315  1e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.270876 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0908  dehydratase  57.34 
 
 		 155 aa  182  2.0000000000000003e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3467  MaoC-like dehydratase  36.64 
 
 		 145 aa  73.6  0.0000000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.273532  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2202  bifunctional enoyl-CoA hydratase/phosphate acetyltransferase  34.29 
 
 		 467 aa  72.4  0.000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.878399 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2915  bifunctional enoyl-CoA hydratase/phosphate acetyltransferase  35 
 
 		 473 aa  70.1  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1255  bifunctional enoyl-CoA hydratase/phosphate acetyltransferase  34.29 
 
 		 473 aa  68.2  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1998  MaoC-like dehydratase  31.43 
 
 		 184 aa  67.4  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0206  dehydratase  28.47 
 
 		 133 aa  66.6  0.0000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0588  MaoC-like dehydratase  36.59 
 
 		 147 aa  66.6  0.0000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00165454 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0409  bifunctional enoyl-CoA hydratase/phosphate acetyltransferase  34.29 
 
 		 480 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.935296  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0357  bifunctional enoyl-CoA hydratase/phosphate acetyltransferase  33.57 
 
 		 467 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.465716  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0391  dehydratase  30.67 
 
 		 322 aa  65.5  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000128192 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6099  bifunctional enoyl-CoA hydratase/phosphate acetyltransferase  33.57 
 
 		 482 aa  65.5  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.249001  normal  0.018881 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2693  bifunctional enoyl-CoA hydratase/phosphate acetyltransferase  32.86 
 
 		 473 aa  65.5  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5770  MaoC domain protein dehydratase  30.14 
 
 		 149 aa  64.7  0.0000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2195  dehydratase  33.8 
 
 		 147 aa  64.7  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3886  bifunctional enoyl-CoA hydratase/phosphate acetyltransferase  32.86 
 
 		 464 aa  63.9  0.0000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.271652  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0417  bifunctional enoyl-CoA hydratase/phosphate acetyltransferase  33.81 
 
 		 467 aa  63.5  0.0000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1596  MaoC domain protein dehydratase  34.75 
 
 		 149 aa  63.9  0.0000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.733518  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0980  dehydratase  33.1 
 
 		 147 aa  63.5  0.0000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.528408  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2305  MaoC family protein  33.1 
 
 		 147 aa  63.5  0.0000000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3315  bifunctional enoyl-CoA hydratase/phosphate acetyltransferase  32.14 
 
 		 470 aa  63.5  0.0000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.287925  normal  0.745735 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1127  bifunctional enoyl-CoA hydratase/phosphate acetyltransferase  32.14 
 
 		 472 aa  63.5  0.0000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.345508 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7293  bifunctional enoyl-CoA hydratase/phosphate acetyltransferase  32.86 
 
 		 472 aa  62.4  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2940  dehydratase  29.29 
 
 		 139 aa  62  0.000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.156748  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3026  dehydratase  35.05 
 
 		 150 aa  61.6  0.000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3661  dehydratase  32.87 
 
 		 148 aa  60.8  0.000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.831738  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4316  bifunctional enoyl-CoA hydratase/phosphate acetyltransferase  34.29 
 
 		 481 aa  60.8  0.000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.122938 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4426  bifunctional enoyl-CoA hydratase/phosphate acetyltransferase  34.29 
 
 		 481 aa  60.8  0.000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0121  bifunctional enoyl-CoA hydratase/phosphate acetyltransferase  33.09 
 
 		 476 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1058  bifunctional enoyl-CoA hydratase/phosphate acetyltransferase  33.09 
 
 		 467 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2798  bifunctional enoyl-CoA hydratase/phosphate acetyltransferase  33.09 
 
 		 467 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2655  bifunctional enoyl-CoA hydratase/phosphate acetyltransferase  33.09 
 
 		 467 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1286  bifunctional enoyl-CoA hydratase/phosphate acetyltransferase  33.09 
 
 		 467 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0145  bifunctional enoyl-CoA hydratase/phosphate acetyltransferase  33.09 
 
 		 467 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.880803  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0522  hypothetical protein  26.06 
 
 		 137 aa  60.1  0.000000009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000722837  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3364  MaoC-like dehydratase  35.64 
 
 		 147 aa  60.5  0.000000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.975509  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2329  MaoC domain protein dehydratase  29.93 
 
 		 134 aa  60.1  0.000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.676407  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1510  dehydratase  32.65 
 
 		 138 aa  59.7  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.301803  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3838  MaoC-like dehydratase  33.56 
 
 		 156 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3031  bifunctional enoyl-CoA hydratase/phosphate acetyltransferase  34.04 
 
 		 471 aa  60.1  0.00000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1026  bifunctional enoyl-CoA hydratase/phosphate acetyltransferase  30 
 
 		 472 aa  60.1  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1955  bifunctional enoyl-CoA hydratase/phosphate acetyltransferase  35.71 
 
 		 472 aa  59.7  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.435715  normal  0.221917 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2738  MaoC domain protein dehydratase  31.62 
 
 		 145 aa  58.9  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00396042 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0498  dehydratase  24.65 
 
 		 137 aa  58.9  0.00000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.14206  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1562  dehydratase  32.65 
 
 		 138 aa  59.7  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1539  MaoC-like dehydratase  32.65 
 
 		 138 aa  59.7  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.645367  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4100  MaoC-like domain protein  33.56 
 
 		 173 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1674  MaoC domain-containing protein dehydratase  31.58 
 
 		 134 aa  58.5  0.00000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0430305 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2527  MaoC-like dehydratase  24.65 
 
 		 139 aa  58.5  0.00000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.367433 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0047  MaoC domain protein dehydratase  31.11 
 
 		 152 aa  58.2  0.00000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2194  MaoC-like dehydratase  30.99 
 
 		 159 aa  58.2  0.00000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0161  MaoC domain protein dehydratase  29.84 
 
 		 140 aa  58.2  0.00000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.49242  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3284  dehydratase  31.16 
 
 		 158 aa  57.8  0.00000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.904701 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5194  dehydratase  29.86 
 
 		 154 aa  57.8  0.00000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.477522  normal  0.0490486 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5970  MaoC domain protein dehydratase  29.86 
 
 		 155 aa  57.8  0.00000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0874793  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2974  bifunctional enoyl-CoA hydratase/phosphate acetyltransferase  31.91 
 
 		 473 aa  57.4  0.00000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.530032  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0115  MaoC domain protein dehydratase  30 
 
 		 141 aa  57.4  0.00000007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.527256  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1356  (de)hydratase  28.89 
 
 		 141 aa  57.4  0.00000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4076  MaoC-like dehydratase  30.08 
 
 		 137 aa  57  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.354915 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4552  MaoC domain protein dehydratase  31.51 
 
 		 156 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.228955  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0664  MaoC domain-containing protein  26.62 
 
 		 137 aa  56.6  0.0000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6351  MaoC-like dehydratase  29.41 
 
 		 144 aa  56.6  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.040058  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0047  dehydratase  30.92 
 
 		 157 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0279175 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1337  dehydratase  31.51 
 
 		 156 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.574177  normal  0.282303 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4847  dehydratase  30.66 
 
 		 164 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0052  bifunctional enoyl-CoA hydratase/phosphate acetyltransferase  30.07 
 
 		 468 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.70674  normal  0.03837 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0447  dehydratase  27.27 
 
 		 141 aa  56.6  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.271007  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3812  MaoC-like dehydratase  27.66 
 
 		 140 aa  56.2  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0106778  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6753  dehydratase  31.88 
 
 		 156 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.478036  normal  0.607095 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1608  dehydratase  25.87 
 
 		 141 aa  55.5  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3847  dehydratase  32.19 
 
 		 156 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3724  MaoC domain protein dehydratase  31.11 
 
 		 141 aa  55.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.420067  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5482  dehydratase  31.97 
 
 		 147 aa  55.5  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4051  dehydratase  28.78 
 
 		 140 aa  55.8  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.46056  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18160  hypothetical protein  29.5 
 
 		 161 aa  56.2  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4059  dehydratase  31.51 
 
 		 156 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_463  acyl dehydratase  24.65 
 
 		 137 aa  55.8  0.0000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000000121955  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5047  bifunctional enoyl-CoA hydratase/phosphate acetyltransferase  30 
 
 		 471 aa  55.5  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1822  hypothetical protein  31.2 
 
 		 156 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2187  bifunctional enoyl-CoA hydratase/phosphate acetyltransferase  29.08 
 
 		 468 aa  55.5  0.0000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2239  dehydratase  30.34 
 
 		 138 aa  55.5  0.0000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.12703  normal  0.929294 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6218  dehydratase  31.67 
 
 		 177 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2215  bifunctional enoyl-CoA hydratase/phosphate acetyltransferase  28.37 
 
 		 468 aa  54.7  0.0000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3359  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  30.43 
 
 		 685 aa  54.7  0.0000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.990834  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1493  dehydratase  32.06 
 
 		 156 aa  54.3  0.0000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0447243  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0349  MaoC domain protein dehydratase  27.85 
 
 		 152 aa  54.7  0.0000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2811  dehydratase  29.69 
 
 		 152 aa  54.7  0.0000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.894889 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3454  MaoC domain protein dehydratase  33.33 
 
 		 158 aa  54.3  0.0000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1940  MaoC-like dehydratase  27.94 
 
 		 146 aa  54.3  0.0000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1390  dehydratase  33.09 
 
 		 150 aa  53.9  0.0000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.143554 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3568  bifunctional enoyl-CoA hydratase/phosphate acetyltransferase  31.71 
 
 		 500 aa  53.9  0.0000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5844  dehydratase  31.71 
 
 		 343 aa  53.9  0.0000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.513315 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6646  MaoC domain protein dehydratase  30.43 
 
 		 139 aa  53.5  0.0000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4755  MaoC-like dehydratase  25 
 
 		 138 aa  53.5  0.0000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0665  MaoC domain protein dehydratase  27.27 
 
 		 138 aa  53.5  0.0000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0187656  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2098  bifunctional enoyl-CoA hydratase/phosphate acetyltransferase  31.36 
 
 		 493 aa  53.5  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3480  MaoC domain protein dehydratase  30.82 
 
 		 143 aa  53.1  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1355  acyl dehydratase  27.74 
 
 		 142 aa  53.1  0.000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0611  dehydratase  30.77 
 
 		 147 aa  53.1  0.000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.519544  normal  0.134756 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>