More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_3359 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_0031  phenylacetic acid degradation protein paaN  58.24 
 
 		 678 aa  750    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.300256  normal  0.45539 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1515  phenylacetic acid degradation protein paaN  53.74 
 
 		 686 aa  705    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.629181  normal  0.465185 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0094  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  55.03 
 
 		 688 aa  672    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4152  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  60.24 
 
 		 686 aa  788    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.39195  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1910  phenylacetic acid degradation protein paaN  60.15 
 
 		 686 aa  760    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0302284  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3090  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  49.41 
 
 		 684 aa  635    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.748677  hitchhiker  0.00334678 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0748  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  61.93 
 
 		 675 aa  810    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.778513 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4804  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  58.67 
 
 		 686 aa  761    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.27422 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3359  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  100 
 
 		 685 aa  1368    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.990834  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5320  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  58.9 
 
 		 675 aa  752    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.248137  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3827  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  59.91 
 
 		 678 aa  776    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.145671  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3568  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  53.24 
 
 		 682 aa  640    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.282162 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3636  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  69.32 
 
 		 678 aa  917    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.387162 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0658  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  59.52 
 
 		 664 aa  746    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1226  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  54.19 
 
 		 686 aa  642    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0685  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  60.95 
 
 		 674 aa  786    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1850  phenylacetic acid degradation protein paaN  55.1 
 
 		 679 aa  738    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.8142  normal  0.547776 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1832  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  69.23 
 
 		 678 aa  942    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0934  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  57.27 
 
 		 691 aa  727    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1913  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  52.89 
 
 		 695 aa  649    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0600585  normal  0.0559603 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0437  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  60.54 
 
 		 676 aa  794    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.68112 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1556  phenylacetic acid degradation protein paaN  58.28 
 
 		 690 aa  763    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26540  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  58.05 
 
 		 681 aa  761    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.212629 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20290  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  54.49 
 
 		 706 aa  684    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0650346  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3053  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  56.68 
 
 		 702 aa  698    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1925  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  69.37 
 
 		 679 aa  928    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0838003  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0226  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  50.15 
 
 		 683 aa  659    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.577017 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0907  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  84.47 
 
 		 687 aa  1134    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.338542  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2485  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  54.72 
 
 		 683 aa  696    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00712993  hitchhiker  0.00576818 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3255  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  55.57 
 
 		 703 aa  711    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.607573  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2268  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  53.4 
 
 		 681 aa  629  1e-179  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2258  phenylacetic acid degradation protein paaN  53.56 
 
 		 681 aa  626  1e-178  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1474  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  53.4 
 
 		 681 aa  628  1e-178  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1572  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  53.56 
 
 		 681 aa  627  1e-178  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2489  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  52.28 
 
 		 684 aa  613  9.999999999999999e-175  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.997274 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0649  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  47.86 
 
 		 683 aa  613  9.999999999999999e-175  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.940422  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3270  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  52.28 
 
 		 684 aa  610  1e-173  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.289293  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3071  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  49.71 
 
 		 690 aa  611  1e-173  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.329771 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2626  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  52.15 
 
 		 684 aa  609  1e-173  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.574883  normal  0.162198 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2639  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  52 
 
 		 683 aa  604  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.31992  normal  0.197677 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05275  aldehyde dehydrogenase  48.23 
 
 		 836 aa  594  1e-168  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0895  aldehyde dehydrogenase  46.01 
 
 		 531 aa  394  1e-108  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.335826 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1625  aldehyde dehydrogenase  46.35 
 
 		 518 aa  390  1e-107  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0898756  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3656  aldehyde dehydrogenase  47.09 
 
 		 519 aa  384  1e-105  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2699  aldehyde dehydrogenase  45.79 
 
 		 531 aa  380  1e-104  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0090  aldehyde dehydrogenase  47.09 
 
 		 516 aa  377  1e-103  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2947  aldehyde dehydrogenase  47.59 
 
 		 523 aa  374  1e-102  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.738502  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1420  aldehyde dehydrogenase  45.71 
 
 		 531 aa  375  1e-102  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0677446  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4944  Aldehyde Dehydrogenase  45.65 
 
 		 517 aa  365  2e-99  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.141691  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0217  aldehyde dehydrogenase  45.74 
 
 		 520 aa  363  6e-99  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.286269  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1607  dehydratase  50.85 
 
 		 515 aa  179  2e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.244807  normal  0.332328 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2844  betaine-aldehyde dehydrogenase  29.87 
 
 		 481 aa  129  1.0000000000000001e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4593  aldehyde dehydrogenase  30.3 
 
 		 487 aa  124  4e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1779  aldehyde dehydrogenase  29.5 
 
 		 485 aa  123  9.999999999999999e-27  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0544  Aldehyde Dehydrogenase_  24.37 
 
 		 477 aa  122  1.9999999999999998e-26  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.257528  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2499  betaine-aldehyde dehydrogenase  30.28 
 
 		 496 aa  119  3e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.00184375  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2507  betaine-aldehyde dehydrogenase  30.24 
 
 		 496 aa  116  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.982399 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2462  betaine-aldehyde dehydrogenase  30.24 
 
 		 496 aa  116  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.1149  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2695  aldehyde dehydrogenase  28.48 
 
 		 477 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.152226  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0742  aldehyde dehydrogenase  29.46 
 
 		 476 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0742  aldehyde dehydrogenase  29.46 
 
 		 476 aa  115  3e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0948493  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0708  betaine-aldehyde dehydrogenase, putative  29.02 
 
 		 476 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1104  aldehyde dehydrogenase  28.46 
 
 		 474 aa  114  7.000000000000001e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.304588  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2977  benzaldehyde dehydrogenase (NAD+)  27.74 
 
 		 491 aa  114  8.000000000000001e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4410  Aldehyde Dehydrogenase  31.95 
 
 		 491 aa  113  1.0000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5405  Aldehyde Dehydrogenase  30.09 
 
 		 529 aa  112  2.0000000000000002e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.264091  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2655  aldehyde dehydrogenase  29.36 
 
 		 502 aa  112  2.0000000000000002e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4040  betaine-aldehyde dehydrogenase  29.43 
 
 		 477 aa  112  3e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.71775 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2196  aldehyde dehydrogenase  27.07 
 
 		 475 aa  111  3e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1410  2-hydroxymuconic semialdehyde dehydrogenase  26.3 
 
 		 488 aa  112  3e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2158  aldehyde dehydrogenase  27.07 
 
 		 475 aa  111  3e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4475  aldehyde dehydrogenase  29.33 
 
 		 476 aa  111  6e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2916  betaine aldehyde dehydrogenase  29 
 
 		 490 aa  109  2e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1018  Aldehyde Dehydrogenase  28.31 
 
 		 510 aa  109  2e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4733  aldehyde dehydrogenase  31.16 
 
 		 492 aa  108  3e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4763  Aldehyde Dehydrogenase  26.9 
 
 		 500 aa  108  4e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5054  aldehyde dehydrogenase  28.41 
 
 		 478 aa  108  4e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3794  aldehyde dehydrogenase  27.08 
 
 		 783 aa  107  5e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3083  betaine-aldehyde dehydrogenase  29.69 
 
 		 499 aa  108  5e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.36697 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3490  Aldehyde Dehydrogenase  29.09 
 
 		 488 aa  107  6e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.836011  normal  0.347598 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3788  aldehyde dehydrogenase  27.07 
 
 		 510 aa  107  9e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2635  Aldehyde Dehydrogenase  32.17 
 
 		 474 aa  107  1e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.311715 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2177  betaine aldehyde dehydrogenase  25.91 
 
 		 496 aa  105  2e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2830  betaine aldehyde dehydrogenase  27.96 
 
 		 490 aa  105  2e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.143897  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6305  aldehyde dehydrogenase  28.23 
 
 		 492 aa  106  2e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.482135  normal  0.128394 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31700  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  28.42 
 
 		 495 aa  105  2e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.465703  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2748  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, NADP-dependent  24.15 
 
 		 482 aa  106  2e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37090  putative aldehyde dehydrogenase  30.96 
 
 		 482 aa  106  2e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1729  aldehyde dehydrogenase  27.07 
 
 		 475 aa  105  3e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00132327  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6321  aldehyde dehydrogenase  27.97 
 
 		 478 aa  105  3e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1758  aldehyde dehydrogenase  27.97 
 
 		 478 aa  105  3e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1075  Aldehyde Dehydrogenase  26.37 
 
 		 475 aa  105  4e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2555  betaine aldehyde dehydrogenase  28.85 
 
 		 490 aa  104  5e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0789453  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3740  aldehyde dehydrogenase  30.52 
 
 		 791 aa  104  5e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.977934  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5498  aldehyde dehydrogenase  29.75 
 
 		 487 aa  104  6e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10225  aldehyde dehydrogenase  26.81 
 
 		 487 aa  104  6e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.749667  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2434  NADP-dependent glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase  24.42 
 
 		 482 aa  104  6e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1153  Aldehyde Dehydrogenase  27.52 
 
 		 474 aa  104  6e-21  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.720982  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1905  betaine-aldehyde dehydrogenase  30.56 
 
 		 472 aa  104  7e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.343927  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2689  betaine aldehyde dehydrogenase  25.58 
 
 		 496 aa  103  8e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>