More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_05275 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001637  EcDH1_2258  phenylacetic acid degradation protein paaN  50.94 
 
 
681 aa  657    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1850  phenylacetic acid degradation protein paaN  52.93 
 
 
679 aa  729    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.8142  normal  0.547776 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1474  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  50.8 
 
 
681 aa  655    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05275  aldehyde dehydrogenase  100 
 
 
836 aa  1746    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0226  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  49.93 
 
 
683 aa  641    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.577017 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1572  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  50.94 
 
 
681 aa  657    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1515  phenylacetic acid degradation protein paaN  53.58 
 
 
686 aa  727    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.629181  normal  0.465185 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1913  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  49.85 
 
 
695 aa  668    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0600585  normal  0.0559603 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2268  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  50.8 
 
 
681 aa  655    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3071  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  49.78 
 
 
690 aa  654    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.329771 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3090  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  51.83 
 
 
684 aa  667    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.748677  hitchhiker  0.00334678 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1556  phenylacetic acid degradation protein paaN  49.93 
 
 
690 aa  672    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4152  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  48.32 
 
 
686 aa  632  1e-180  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.39195  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4804  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  48.1 
 
 
686 aa  629  1e-179  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.27422 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0934  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  50.51 
 
 
691 aa  629  1e-179  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0649  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  46.88 
 
 
683 aa  620  1e-176  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.940422  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2626  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  50.15 
 
 
684 aa  612  9.999999999999999e-175  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.574883  normal  0.162198 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3270  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  50 
 
 
684 aa  610  1e-173  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.289293  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2489  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  50 
 
 
684 aa  610  1e-173  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.997274 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2639  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  49.71 
 
 
683 aa  609  1e-173  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.31992  normal  0.197677 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3568  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  48.75 
 
 
682 aa  611  1e-173  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.282162 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1226  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  50.29 
 
 
686 aa  608  9.999999999999999e-173  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0907  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  48.08 
 
 
687 aa  605  9.999999999999999e-173  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.338542  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26540  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  46.55 
 
 
681 aa  604  1.0000000000000001e-171  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.212629 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5320  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  46.13 
 
 
675 aa  600  1e-170  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.248137  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0748  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  47.36 
 
 
675 aa  601  1e-170  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.778513 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3827  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  46.48 
 
 
678 aa  593  1e-168  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.145671  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3359  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  48.23 
 
 
685 aa  593  1e-168  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.990834  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0437  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  47.49 
 
 
676 aa  592  1e-168  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.68112 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1910  phenylacetic acid degradation protein paaN  46.32 
 
 
686 aa  588  1e-166  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0302284  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0031  phenylacetic acid degradation protein paaN  46.32 
 
 
678 aa  574  1.0000000000000001e-162  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.300256  normal  0.45539 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2485  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  45.1 
 
 
683 aa  572  1e-161  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00712993  hitchhiker  0.00576818 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3255  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  46.37 
 
 
703 aa  566  1e-160  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.607573  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3053  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  46.13 
 
 
702 aa  562  1.0000000000000001e-159  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1832  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  44.13 
 
 
678 aa  559  1e-158  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0685  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  46.22 
 
 
674 aa  558  1e-157  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0658  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  43.94 
 
 
664 aa  546  1e-154  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20290  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  44.35 
 
 
706 aa  547  1e-154  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0650346  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0094  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  43.15 
 
 
688 aa  538  1e-151  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1925  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  43.77 
 
 
679 aa  535  1e-150  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0838003  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3636  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  45.33 
 
 
678 aa  528  1e-148  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.387162 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0895  aldehyde dehydrogenase  41.23 
 
 
531 aa  374  1e-102  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.335826 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1625  aldehyde dehydrogenase  38.75 
 
 
518 aa  355  2.9999999999999997e-96  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0898756  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2699  aldehyde dehydrogenase  39.5 
 
 
531 aa  354  4e-96  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0090  aldehyde dehydrogenase  39.1 
 
 
516 aa  353  8.999999999999999e-96  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3656  aldehyde dehydrogenase  39.41 
 
 
519 aa  351  3e-95  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2947  aldehyde dehydrogenase  39.18 
 
 
523 aa  349  1e-94  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.738502  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1420  aldehyde dehydrogenase  39.29 
 
 
531 aa  345  2e-93  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0677446  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0217  aldehyde dehydrogenase  39 
 
 
520 aa  336  7.999999999999999e-91  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.286269  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4944  Aldehyde Dehydrogenase  38.46 
 
 
517 aa  326  1e-87  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.141691  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1607  dehydratase  37.77 
 
 
515 aa  127  8.000000000000001e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.244807  normal  0.332328 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0544  Aldehyde Dehydrogenase_  27.39 
 
 
477 aa  116  2.0000000000000002e-24  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.257528  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4593  aldehyde dehydrogenase  26.45 
 
 
487 aa  116  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2323  aldehyde dehydrogenase family protein  26.7 
 
 
474 aa  115  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.489166  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2073  succinic-semialdehyde dehydrogenase NAD(P)+  26.47 
 
 
474 aa  115  5e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.578512  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2135  aldehyde dehydrogenase family protein  26.47 
 
 
474 aa  113  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.806044  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2289  aldehyde dehydrogenase family protein  26.47 
 
 
474 aa  113  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.896409  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2314  aldehyde dehydrogenase family protein  26.47 
 
 
474 aa  113  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2174  aldehyde dehydrogenase  24.26 
 
 
479 aa  112  3e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000019217 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1779  aldehyde dehydrogenase  30.41 
 
 
485 aa  112  3e-23  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2108  aldehyde dehydrogenase  27.65 
 
 
474 aa  112  4.0000000000000004e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2069  succinic-semialdehyde dehydrogenase NAD(P)+  26.02 
 
 
474 aa  110  1e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2398  aldehyde dehydrogenase family protein  25.79 
 
 
474 aa  110  1e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3054  aldehyde dehydrogenase family protein  26.7 
 
 
474 aa  109  2e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1284  aldehyde dehydrogenase  27.84 
 
 
478 aa  109  2e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.811614 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5222  Betaine-aldehyde dehydrogenase  26.49 
 
 
494 aa  108  3e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.938507  normal  0.927599 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3732  succinic semialdehyde dehydrogenase  25.15 
 
 
485 aa  107  7e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.253461  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2271  aldehyde dehydrogenase family protein  26.3 
 
 
474 aa  107  1e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1729  aldehyde dehydrogenase  26.68 
 
 
475 aa  106  2e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00132327  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0028  succinate-semialdehyde dehydrogenase oxidoreductase protein  25.1 
 
 
497 aa  106  2e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1456  putative betaine aldehyde dehydrogenase (BADH) oxidoreductase protein  27.25 
 
 
478 aa  106  2e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.812422 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0554  aldehyde dehydrogenase  24.68 
 
 
476 aa  106  2e-21  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  unclonable  0.000000239131  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3722  succinic semialdehyde dehydrogenase  24.31 
 
 
500 aa  105  3e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1095  Aldehyde Dehydrogenase  23.81 
 
 
479 aa  105  4e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1818  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  25.5 
 
 
474 aa  105  5e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1287  betaine-aldehyde dehydrogenase  26.72 
 
 
492 aa  104  7e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0677  aldehyde dehydrogenase  27.97 
 
 
478 aa  104  8e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.663172  normal  0.354632 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1014  aldehyde dehydrogenase family protein  25.15 
 
 
497 aa  103  1e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1415  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  25.3 
 
 
474 aa  103  1e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3399  succinic semialdehyde dehydrogenase  24.51 
 
 
500 aa  103  1e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.547981  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1577  aldehyde dehydrogenase  26.76 
 
 
476 aa  103  1e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0750441  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2344  Aldehyde Dehydrogenase  27.71 
 
 
477 aa  102  2e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.754482  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1842  betaine-aldehyde dehydrogenase  28.07 
 
 
476 aa  102  2e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0073  aldehyde dehydrogenase  25.58 
 
 
468 aa  102  2e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1286  aldehyde dehydrogenase  25.2 
 
 
490 aa  102  3e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2350  aldehyde dehydrogenase  28.7 
 
 
478 aa  102  4e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.944535  normal  0.84057 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2788  betaine-aldehyde dehydrogenase  26.12 
 
 
493 aa  102  4e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3585  betaine-aldehyde dehydrogenase  24.29 
 
 
477 aa  102  4e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.863463  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0091  betaine-aldehyde dehydrogenase  25.96 
 
 
482 aa  102  4e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2196  aldehyde dehydrogenase  27.72 
 
 
475 aa  102  4e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1682  betaine-aldehyde dehydrogenase  27.01 
 
 
502 aa  102  4e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2158  aldehyde dehydrogenase  27.72 
 
 
475 aa  102  4e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1944  betaine-aldehyde dehydrogenase  28.52 
 
 
474 aa  101  5e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0167894  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1153  Aldehyde Dehydrogenase  25.34 
 
 
474 aa  101  5e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.720982  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2418  Aldehyde Dehydrogenase  24.9 
 
 
509 aa  101  5e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.354297  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0956  aldehyde dehydrogenase family protein  25.15 
 
 
497 aa  101  6e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2499  betaine-aldehyde dehydrogenase  27.31 
 
 
496 aa  101  7e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.00184375  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1568  succinate semialdehyde dehydrogenase  23.84 
 
 
488 aa  100  8e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2161  Aldehyde Dehydrogenase  28.7 
 
 
478 aa  100  8e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.046835  normal  0.828531 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3191  succinate semialdehyde dehydrogenase  26.89 
 
 
483 aa  100  9e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>