More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_2161 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009074  BURPS668_1077  NAD-dependent aldehyde dehydrogenases  73.11 
 
 		 479 aa  699    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2344  Aldehyde Dehydrogenase  69.83 
 
 		 477 aa  695    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.754482  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2161  Aldehyde Dehydrogenase  100 
 
 		 478 aa  974    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.046835  normal  0.828531 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1966  Aldehyde Dehydrogenase  71.73 
 
 		 477 aa  713    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.150614  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2350  aldehyde dehydrogenase  91.42 
 
 		 478 aa  878    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.944535  normal  0.84057 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2328  aldehyde dehydrogenase  77.31 
 
 		 479 aa  717    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2422  aldehyde dehydrogenase  77.31 
 
 		 479 aa  720    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.283723 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0874  aldehyde dehydrogenase  77.52 
 
 		 479 aa  709    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.476262  normal  0.570338 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2566  Aldehyde Dehydrogenase  98.95 
 
 		 478 aa  966    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1095  Aldehyde Dehydrogenase  74.58 
 
 		 479 aa  751    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0735  aldehyde dehydrogenase family protein  73.32 
 
 		 479 aa  702    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2614  aldehyde dehydrogenase  83.26 
 
 		 478 aa  806    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1235  aldehyde dehydrogenase family protein  73.32 
 
 		 479 aa  701    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1083  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  73.32 
 
 		 479 aa  702    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1591  aldehyde dehydrogenase family protein  73.32 
 
 		 479 aa  702    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3004  aldehyde dehydrogenase  70.08 
 
 		 477 aa  677    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.638791  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2278  aldehyde dehydrogenase family protein  73.32 
 
 		 479 aa  702    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5745  aldehyde dehydrogenase  77.1 
 
 		 479 aa  718    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0583119  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1756  aldehyde dehydrogenase  71.31 
 
 		 477 aa  711    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0603102  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3006  aldehyde dehydrogenase family protein  73.32 
 
 		 479 aa  702    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0877  aldehyde dehydrogenase family protein  73.95 
 
 		 479 aa  699    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.928456  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2664  aldehyde dehydrogenase  70.46 
 
 		 480 aa  684    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0216707  normal  0.214781 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3585  betaine-aldehyde dehydrogenase  70.68 
 
 		 477 aa  681    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.863463  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2290  aldehyde dehydrogenase  68.14 
 
 		 486 aa  689    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.176448  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3401  betaine-aldehyde dehydrogenase  75.84 
 
 		 479 aa  758    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2418  aldehyde dehydrogenase  77.1 
 
 		 479 aa  719    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2174  aldehyde dehydrogenase  73.74 
 
 		 479 aa  736    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000019217 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0677  aldehyde dehydrogenase  84.94 
 
 		 478 aa  819    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.663172  normal  0.354632 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4882  aldehyde dehydrogenase  69.41 
 
 		 477 aa  667    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.895119  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1806  aldehyde dehydrogenase  77.1 
 
 		 479 aa  719    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2463  aldehyde dehydrogenase  77.31 
 
 		 479 aa  717    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.32545  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5904  aldehyde dehydrogenase  64.03 
 
 		 482 aa  622  1e-177  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.474261 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5539  aldehyde dehydrogenase  64.03 
 
 		 482 aa  622  1e-177  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1691  aldehyde dehydrogenase  64.56 
 
 		 478 aa  615  1e-175  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.246162 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1014  aldehyde dehydrogenase family protein  59 
 
 		 497 aa  589  1e-167  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0091  betaine-aldehyde dehydrogenase  62.66 
 
 		 482 aa  590  1e-167  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1286  aldehyde dehydrogenase  59.92 
 
 		 490 aa  586  1e-166  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0956  aldehyde dehydrogenase family protein  58.37 
 
 		 497 aa  580  1e-164  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1357  aldehyde dehydrogenase  60.68 
 
 		 487 aa  572  1.0000000000000001e-162  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4949  aldehyde dehydrogenase  57.78 
 
 		 477 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.986503  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1254  aldehyde dehydrogenase  60.74 
 
 		 481 aa  559  1e-158  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1974  NAD-dependent aldehyde dehydrogenase  58.77 
 
 		 486 aa  551  1e-155  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.489378  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0776  betaine-aldehyde dehydrogenase  58.99 
 
 		 481 aa  542  1e-153  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.141721  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3021  gamma-glutamyl-gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  61.22 
 
 		 485 aa  541  9.999999999999999e-153  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.143518  normal  0.755617 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1430  aldehyde dehydrogenase  56.83 
 
 		 487 aa  529  1e-149  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1251  Aldehyde Dehydrogenase  56.42 
 
 		 480 aa  517  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.019286 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2380  betaine-aldehyde dehydrogenase  55.06 
 
 		 487 aa  474  1e-132  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0928  aldehyde dehydrogenase  50.63 
 
 		 494 aa  451  1e-125  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1561  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  46.44 
 
 		 503 aa  415  9.999999999999999e-116  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2465  Aldehyde Dehydrogenase  43.45 
 
 		 485 aa  381  1e-104  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.146216  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3841  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  44.7 
 
 		 508 aa  376  1e-103  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.829655 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4856  aldehyde dehydrogenase  44.68 
 
 		 483 aa  378  1e-103  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.263653  normal  0.221142 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0847  betaine-aldehyde dehydrogenase  43.55 
 
 		 494 aa  376  1e-103  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00938434  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6025  Aldehyde Dehydrogenase  44.89 
 
 		 483 aa  378  1e-103  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.181581 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1381  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  43.84 
 
 		 496 aa  372  1e-102  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.514457 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4700  aldehyde dehydrogenase  42.86 
 
 		 483 aa  370  1e-101  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0199533 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0986  betaine-aldehyde dehydrogenase  43.67 
 
 		 481 aa  365  1e-100  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.669194  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2260  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  46.17 
 
 		 484 aa  368  1e-100  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5214  betaine-aldehyde dehydrogenase  43.51 
 
 		 488 aa  363  4e-99  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2634  aldehyde dehydrogenase  41.18 
 
 		 494 aa  362  5.0000000000000005e-99  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2837  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  41.81 
 
 		 494 aa  361  1e-98  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000177336 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2450  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  41.18 
 
 		 494 aa  362  1e-98  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5372  aldehyde dehydrogenase family protein  42.86 
 
 		 481 aa  361  2e-98  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.302622  normal  0.199595 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2640  aldehyde dehydrogenase  41.6 
 
 		 494 aa  360  3e-98  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.198513  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2882  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  41.39 
 
 		 494 aa  360  3e-98  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.198602  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2831  aldehyde dehydrogenase  41.6 
 
 		 494 aa  360  3e-98  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.217262  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1480  aldehyde dehydrogenase  40.21 
 
 		 490 aa  360  3e-98  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0515859  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2860  aldehyde dehydrogenase  41.39 
 
 		 494 aa  360  4e-98  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0886  Aldehyde Dehydrogenase  40.93 
 
 		 473 aa  360  4e-98  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2738  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  43.01 
 
 		 488 aa  360  4e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.525641  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2843  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  41.18 
 
 		 494 aa  359  5e-98  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.128159  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7156  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  42.23 
 
 		 494 aa  358  8e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2556  aldehyde dehydrogenase  41.18 
 
 		 494 aa  358  9.999999999999999e-98  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.271873  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3376  aldehyde dehydrogenase  43.51 
 
 		 488 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.399948  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2290  betaine-aldehyde dehydrogenase  41.42 
 
 		 503 aa  357  2.9999999999999997e-97  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.109533 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3431  betaine-aldehyde dehydrogenase  42.59 
 
 		 488 aa  356  3.9999999999999996e-97  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2504  Aldehyde Dehydrogenase  42.41 
 
 		 497 aa  356  5e-97  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.98157  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5622  aldehyde dehydrogenase  43.01 
 
 		 488 aa  356  5e-97  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.216133 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2591  aldehyde dehydrogenase  40.97 
 
 		 494 aa  356  5.999999999999999e-97  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1966  Aldehyde Dehydrogenase  42.3 
 
 		 478 aa  355  1e-96  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.57596 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1535  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  42.27 
 
 		 493 aa  355  1e-96  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.31089  normal  0.378909 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1036  aldehyde dehydrogenase  43.28 
 
 		 494 aa  355  1e-96  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.922959  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2407  aldehyde dehydrogenase  40.63 
 
 		 493 aa  354  2e-96  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.830868  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4323  aldehyde dehydrogenase  40.88 
 
 		 503 aa  354  2e-96  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.181761 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4086  aldehyde dehydrogenase  42.38 
 
 		 488 aa  354  2e-96  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.515709  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6072  aldehyde dehydrogenase  43.31 
 
 		 488 aa  352  5.9999999999999994e-96  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7306  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  40.8 
 
 		 496 aa  352  8.999999999999999e-96  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.508329 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3439  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  40.84 
 
 		 493 aa  351  2e-95  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.383483  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0085  Aldehyde dehydrogenase (NAD(+))  41.42 
 
 		 493 aa  350  3e-95  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2213  aldehyde dehydrogenase  43.01 
 
 		 490 aa  349  6e-95  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.00475065  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4196  Aldehyde Dehydrogenase  41.89 
 
 		 483 aa  348  1e-94  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.115052  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3102  aldehyde dehydrogenase  41.39 
 
 		 502 aa  348  1e-94  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4941  betaine-aldehyde dehydrogenase  39.45 
 
 		 498 aa  347  2e-94  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6130  Betaine-aldehyde dehydrogenase  41.77 
 
 		 492 aa  348  2e-94  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1655  aldehyde dehydrogenase (NAD)  40.08 
 
 		 494 aa  347  4e-94  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0330388 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2262  aldehyde dehydrogenase  40 
 
 		 493 aa  347  4e-94  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1745  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  40.89 
 
 		 498 aa  347  4e-94  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2257  aldehyde dehydrogenase  39.79 
 
 		 493 aa  346  4e-94  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4697  aldehyde dehydrogenase  39.03 
 
 		 496 aa  346  5e-94  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.754003  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3257  aldehyde dehydrogenase  40.3 
 
 		 494 aa  346  5e-94  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.536879  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>