More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_1561 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_1561  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  100 
 
 
503 aa  1022    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3759  Aldehyde Dehydrogenase  47.34 
 
 
490 aa  457  1e-127  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.304272 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1381  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  49.79 
 
 
496 aa  454  1.0000000000000001e-126  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.514457 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2599  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  48.21 
 
 
490 aa  449  1e-125  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.225795  normal  0.197804 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2634  aldehyde dehydrogenase  48.95 
 
 
494 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2591  aldehyde dehydrogenase  48.95 
 
 
494 aa  445  1.0000000000000001e-124  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2504  Aldehyde Dehydrogenase  47.76 
 
 
497 aa  446  1.0000000000000001e-124  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.98157  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1095  Aldehyde Dehydrogenase  47.37 
 
 
479 aa  442  1e-123  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2860  aldehyde dehydrogenase  48.73 
 
 
494 aa  444  1e-123  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1556  Retinal dehydrogenase  47 
 
 
490 aa  445  1e-123  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2882  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  48.95 
 
 
494 aa  444  1e-123  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.198602  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2640  aldehyde dehydrogenase  48.73 
 
 
494 aa  444  1e-123  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.198513  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2837  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  48.52 
 
 
494 aa  444  1e-123  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000177336 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2831  aldehyde dehydrogenase  48.73 
 
 
494 aa  444  1e-123  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.217262  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2450  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  48.31 
 
 
494 aa  443  1e-123  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2843  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  48.52 
 
 
494 aa  444  1e-123  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.128159  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1745  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  47.47 
 
 
498 aa  441  9.999999999999999e-123  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2556  aldehyde dehydrogenase  48.73 
 
 
494 aa  441  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.271873  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0886  Aldehyde Dehydrogenase  48.41 
 
 
473 aa  439  9.999999999999999e-123  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2465  Aldehyde Dehydrogenase  47.36 
 
 
485 aa  439  9.999999999999999e-123  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.146216  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1868  Retinal dehydrogenase  47.94 
 
 
492 aa  432  1e-120  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3401  betaine-aldehyde dehydrogenase  47.16 
 
 
479 aa  433  1e-120  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2174  aldehyde dehydrogenase  47.16 
 
 
479 aa  434  1e-120  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000019217 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1480  aldehyde dehydrogenase  44.98 
 
 
490 aa  431  1e-119  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0515859  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2229  aldehyde dehydrogenase  47.47 
 
 
494 aa  430  1e-119  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.545234  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3569  aldehyde dehydrogenase  46.41 
 
 
494 aa  427  1e-118  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0744  Betaine-aldehyde dehydrogenase  46.06 
 
 
496 aa  428  1e-118  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2380  betaine-aldehyde dehydrogenase  50.76 
 
 
487 aa  427  1e-118  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01689  aldehyde dehydrogenase family (Eurofung)  47.22 
 
 
501 aa  422  1e-117  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.259255 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3257  aldehyde dehydrogenase  45.99 
 
 
494 aa  424  1e-117  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.536879  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1655  aldehyde dehydrogenase (NAD)  45.99 
 
 
494 aa  424  1e-117  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0330388 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3348  aldehyde dehydrogenase  45.78 
 
 
494 aa  424  1e-117  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0219223  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3313  aldehyde dehydrogenase  45.78 
 
 
494 aa  424  1e-117  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3263  aldehyde dehydrogenase  45.78 
 
 
494 aa  424  1e-117  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2837  Aldehyde Dehydrogenase  44.49 
 
 
502 aa  424  1e-117  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3662  aldehyde dehydrogenase (NAD)  45.99 
 
 
494 aa  425  1e-117  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3609  aldehyde dehydrogenase  45.78 
 
 
494 aa  424  1e-117  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4196  Aldehyde Dehydrogenase  48.52 
 
 
483 aa  422  1e-117  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.115052  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3562  aldehyde dehydrogenase (NAD)  45.78 
 
 
494 aa  424  1e-117  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00134581 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00554  Aldehyde dehydrogenase (ALDDH)(ALDH)(EC 1.2.1.3) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P08157]  47.06 
 
 
497 aa  419  1e-116  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.534945  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2350  aldehyde dehydrogenase  47.49 
 
 
478 aa  422  1e-116  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.944535  normal  0.84057 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2566  Aldehyde Dehydrogenase  46.86 
 
 
478 aa  419  1e-116  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0677  aldehyde dehydrogenase  47.07 
 
 
478 aa  420  1e-116  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.663172  normal  0.354632 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2053  aldehyde dehydrogenase family protein  45.28 
 
 
499 aa  416  9.999999999999999e-116  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0308  hypothetical protein  43.51 
 
 
488 aa  416  9.999999999999999e-116  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0292  hypothetical protein  43.31 
 
 
488 aa  416  9.999999999999999e-116  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2161  Aldehyde Dehydrogenase  46.44 
 
 
478 aa  418  9.999999999999999e-116  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.046835  normal  0.828531 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6025  Aldehyde Dehydrogenase  47.26 
 
 
483 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.181581 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2605  aldehyde dehydrogenase  45.97 
 
 
494 aa  416  9.999999999999999e-116  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000129908  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4856  aldehyde dehydrogenase  48.29 
 
 
483 aa  417  9.999999999999999e-116  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.263653  normal  0.221142 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3841  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  45.88 
 
 
508 aa  418  9.999999999999999e-116  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.829655 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1036  aldehyde dehydrogenase  46.72 
 
 
494 aa  414  1e-114  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.922959  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2904  aldehyde dehydrogenase  47.36 
 
 
494 aa  413  1e-114  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.399829  normal  0.436531 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2614  aldehyde dehydrogenase  45.82 
 
 
478 aa  413  1e-114  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2344  Aldehyde Dehydrogenase  45.03 
 
 
477 aa  415  1e-114  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.754482  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0338  5-carboxymethyl-2-hydroxymuconate semialdehyde dehydrogenase  47.39 
 
 
513 aa  414  1e-114  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0482  betaine aldehyde dehydrogenase  46.23 
 
 
490 aa  412  1e-114  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1966  Aldehyde Dehydrogenase  45.34 
 
 
477 aa  410  1e-113  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.150614  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4061  Aldehyde dehydrogenase (NAD(+))  45.89 
 
 
505 aa  410  1e-113  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1756  aldehyde dehydrogenase  45.13 
 
 
477 aa  409  1e-113  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0603102  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1822  gamma-glutamyl-gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  46.14 
 
 
495 aa  409  1e-113  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0935717 
 
 
-
 
NC_006686  CND02060  Aldehyde dehydrogenase (ALDDH), putative  47.11 
 
 
495 aa  410  1e-113  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1235  aldehyde dehydrogenase family protein  46.74 
 
 
479 aa  411  1e-113  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1077  NAD-dependent aldehyde dehydrogenases  46.74 
 
 
479 aa  410  1e-113  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6130  Betaine-aldehyde dehydrogenase  45.59 
 
 
492 aa  411  1e-113  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0877  aldehyde dehydrogenase family protein  47.37 
 
 
479 aa  410  1e-113  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.928456  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2065  gamma-glutamyl-gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  44.03 
 
 
498 aa  409  1e-113  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1006  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  44.24 
 
 
491 aa  410  1e-113  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.179638  normal  0.457717 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0049  betaine-aldehyde dehydrogenase  47.17 
 
 
505 aa  411  1e-113  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1535  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  45.17 
 
 
493 aa  411  1e-113  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.31089  normal  0.378909 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01277  gamma-Glu-gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase, NAD(P)H-dependent  45.72 
 
 
495 aa  406  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2346  Aldehyde Dehydrogenase  45.72 
 
 
495 aa  406  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0952724  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1510  gamma-glutamyl-gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  45.93 
 
 
495 aa  407  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2325  gamma-glutamyl-gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  45.93 
 
 
495 aa  407  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01288  hypothetical protein  45.72 
 
 
495 aa  406  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0735  aldehyde dehydrogenase family protein  46.53 
 
 
479 aa  408  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF03900  aldehyde dehydrogenase (alddh), putative  44.54 
 
 
506 aa  407  1.0000000000000001e-112  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1083  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  46.53 
 
 
479 aa  408  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1591  aldehyde dehydrogenase family protein  46.53 
 
 
479 aa  408  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5435  aldehyde dehydrogenase  45.96 
 
 
504 aa  407  1.0000000000000001e-112  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.846738  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3006  aldehyde dehydrogenase family protein  46.53 
 
 
479 aa  408  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1415  gamma-glutamyl-gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  45.72 
 
 
495 aa  406  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4012  Aldehyde Dehydrogenase  45.47 
 
 
508 aa  407  1.0000000000000001e-112  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3585  betaine-aldehyde dehydrogenase  44.59 
 
 
477 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.863463  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2720  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  45.83 
 
 
496 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.133505  normal  0.10056 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3562  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  46.61 
 
 
494 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.37194  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0129  betaine aldehyde dehydrogenase  45 
 
 
494 aa  407  1.0000000000000001e-112  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00429668  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2278  aldehyde dehydrogenase family protein  46.53 
 
 
479 aa  408  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1942  gamma-glutamyl-gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  45.93 
 
 
495 aa  405  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1974  NAD-dependent aldehyde dehydrogenase  46.84 
 
 
486 aa  406  1.0000000000000001e-112  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.489378  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2295  2-hydroxymuconic semialdehyde dehydrogenase  44.19 
 
 
491 aa  407  1.0000000000000001e-112  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1536  gamma-glutamyl-gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  45.72 
 
 
495 aa  404  1e-111  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1476  betaine aldehyde dehydrogenase  44.19 
 
 
490 aa  403  1e-111  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3859  aldehyde dehydrogenase  48.44 
 
 
497 aa  404  1e-111  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4700  aldehyde dehydrogenase  45.76 
 
 
483 aa  404  1e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0199533 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4949  aldehyde dehydrogenase  44.78 
 
 
477 aa  402  1e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.986503  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2422  aldehyde dehydrogenase  46.95 
 
 
479 aa  402  1e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.283723 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1806  aldehyde dehydrogenase  46.95 
 
 
479 aa  403  1e-111  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1966  Aldehyde Dehydrogenase  44.7 
 
 
478 aa  404  1e-111  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.57596 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3047  Aldehyde Dehydrogenase  44.21 
 
 
508 aa  403  1e-111  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>