More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_2344 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010551  BamMC406_2328  aldehyde dehydrogenase  74.26 
 
 		 479 aa  695    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2664  aldehyde dehydrogenase  80.71 
 
 		 480 aa  805    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0216707  normal  0.214781 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2422  aldehyde dehydrogenase  74.68 
 
 		 479 aa  701    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.283723 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4882  aldehyde dehydrogenase  78.83 
 
 		 477 aa  776    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.895119  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1083  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  72.57 
 
 		 479 aa  692    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2350  aldehyde dehydrogenase  70.04 
 
 		 478 aa  680    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.944535  normal  0.84057 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1591  aldehyde dehydrogenase family protein  72.57 
 
 		 479 aa  692    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3004  aldehyde dehydrogenase  84.28 
 
 		 477 aa  817    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.638791  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1966  Aldehyde Dehydrogenase  83.02 
 
 		 477 aa  829    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.150614  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0735  aldehyde dehydrogenase family protein  72.57 
 
 		 479 aa  692    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2174  aldehyde dehydrogenase  75.11 
 
 		 479 aa  736    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000019217 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2344  Aldehyde Dehydrogenase  100 
 
 		 477 aa  974    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.754482  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2278  aldehyde dehydrogenase family protein  72.57 
 
 		 479 aa  692    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2614  aldehyde dehydrogenase  69.41 
 
 		 478 aa  674    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0874  aldehyde dehydrogenase  75.53 
 
 		 479 aa  692    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.476262  normal  0.570338 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1235  aldehyde dehydrogenase family protein  72.57 
 
 		 479 aa  692    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1691  aldehyde dehydrogenase  77.99 
 
 		 478 aa  747    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.246162 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2161  Aldehyde Dehydrogenase  69.83 
 
 		 478 aa  676    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.046835  normal  0.828531 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3006  aldehyde dehydrogenase family protein  72.57 
 
 		 479 aa  692    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5745  aldehyde dehydrogenase  74.68 
 
 		 479 aa  699    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0583119  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0877  aldehyde dehydrogenase family protein  73.21 
 
 		 479 aa  691    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.928456  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3585  betaine-aldehyde dehydrogenase  71.43 
 
 		 477 aa  694    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.863463  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2290  aldehyde dehydrogenase  86.79 
 
 		 486 aa  864    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.176448  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3401  betaine-aldehyde dehydrogenase  75.74 
 
 		 479 aa  748    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1077  NAD-dependent aldehyde dehydrogenases  72.57 
 
 		 479 aa  692    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1095  Aldehyde Dehydrogenase  75.32 
 
 		 479 aa  743    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2566  Aldehyde Dehydrogenase  70.25 
 
 		 478 aa  677    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2463  aldehyde dehydrogenase  74.26 
 
 		 479 aa  695    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.32545  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0677  aldehyde dehydrogenase  70.68 
 
 		 478 aa  687    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.663172  normal  0.354632 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1806  aldehyde dehydrogenase  74.89 
 
 		 479 aa  702    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2418  aldehyde dehydrogenase  74.89 
 
 		 479 aa  702    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1756  aldehyde dehydrogenase  82.6 
 
 		 477 aa  827    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0603102  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5904  aldehyde dehydrogenase  61.33 
 
 		 482 aa  606  9.999999999999999e-173  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.474261 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5539  aldehyde dehydrogenase  61.33 
 
 		 482 aa  606  9.999999999999999e-173  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0091  betaine-aldehyde dehydrogenase  62.61 
 
 		 482 aa  586  1e-166  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1014  aldehyde dehydrogenase family protein  56.75 
 
 		 497 aa  579  1e-164  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1286  aldehyde dehydrogenase  56.54 
 
 		 490 aa  578  1e-164  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0956  aldehyde dehydrogenase family protein  56.12 
 
 		 497 aa  570  1e-161  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1254  aldehyde dehydrogenase  59.79 
 
 		 481 aa  565  1e-160  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4949  aldehyde dehydrogenase  56.59 
 
 		 477 aa  556  1e-157  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.986503  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1357  aldehyde dehydrogenase  58.77 
 
 		 487 aa  555  1e-157  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1974  NAD-dependent aldehyde dehydrogenase  58.35 
 
 		 486 aa  550  1e-155  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.489378  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3021  gamma-glutamyl-gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  61.3 
 
 		 485 aa  540  9.999999999999999e-153  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.143518  normal  0.755617 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1430  aldehyde dehydrogenase  56.74 
 
 		 487 aa  530  1e-149  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0776  betaine-aldehyde dehydrogenase  57.98 
 
 		 481 aa  528  1e-149  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.141721  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1251  Aldehyde Dehydrogenase  57.68 
 
 		 480 aa  520  1e-146  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.019286 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2380  betaine-aldehyde dehydrogenase  51.19 
 
 		 487 aa  455  1e-127  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0928  aldehyde dehydrogenase  49.15 
 
 		 494 aa  433  1e-120  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1561  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  45.03 
 
 		 503 aa  402  1e-111  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4856  aldehyde dehydrogenase  43.4 
 
 		 483 aa  365  1e-99  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.263653  normal  0.221142 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3841  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  43.67 
 
 		 508 aa  363  3e-99  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.829655 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2465  Aldehyde Dehydrogenase  40.22 
 
 		 485 aa  363  4e-99  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.146216  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4700  aldehyde dehydrogenase  41.81 
 
 		 483 aa  359  6e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0199533 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0886  Aldehyde Dehydrogenase  41.35 
 
 		 473 aa  359  7e-98  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6025  Aldehyde Dehydrogenase  41.28 
 
 		 483 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.181581 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2599  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  41.47 
 
 		 490 aa  355  6.999999999999999e-97  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.225795  normal  0.197804 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1381  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  41.91 
 
 		 496 aa  352  1e-95  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.514457 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3759  Aldehyde Dehydrogenase  40.42 
 
 		 490 aa  349  7e-95  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.304272 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2504  Aldehyde Dehydrogenase  41.01 
 
 		 497 aa  348  8e-95  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.98157  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2837  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  40.42 
 
 		 494 aa  347  2e-94  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000177336 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2640  aldehyde dehydrogenase  40.63 
 
 		 494 aa  348  2e-94  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.198513  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2831  aldehyde dehydrogenase  40.63 
 
 		 494 aa  348  2e-94  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.217262  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3439  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  41.77 
 
 		 493 aa  348  2e-94  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.383483  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1480  aldehyde dehydrogenase  38.48 
 
 		 490 aa  347  3e-94  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0515859  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2556  aldehyde dehydrogenase  40.08 
 
 		 494 aa  347  3e-94  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.271873  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0847  betaine-aldehyde dehydrogenase  40.25 
 
 		 494 aa  347  3e-94  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00938434  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2591  aldehyde dehydrogenase  40.42 
 
 		 494 aa  346  5e-94  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2904  aldehyde dehydrogenase  42.86 
 
 		 494 aa  345  8e-94  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.399829  normal  0.436531 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5214  betaine-aldehyde dehydrogenase  42.3 
 
 		 488 aa  345  1e-93  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3431  betaine-aldehyde dehydrogenase  42.08 
 
 		 488 aa  345  1e-93  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1655  aldehyde dehydrogenase (NAD)  39.92 
 
 		 494 aa  344  2e-93  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0330388 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2407  aldehyde dehydrogenase  40.6 
 
 		 493 aa  344  2e-93  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.830868  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2882  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  39.87 
 
 		 494 aa  344  2e-93  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.198602  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1745  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  40.9 
 
 		 498 aa  344  2e-93  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3257  aldehyde dehydrogenase  40.08 
 
 		 494 aa  344  2e-93  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.536879  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1948  benzaldehyde dehydrogenase  41.84 
 
 		 492 aa  343  2.9999999999999997e-93  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000544418 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4086  aldehyde dehydrogenase  41.87 
 
 		 488 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.515709  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2738  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  41.87 
 
 		 488 aa  344  2.9999999999999997e-93  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.525641  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2860  aldehyde dehydrogenase  40 
 
 		 494 aa  343  5e-93  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1966  Aldehyde Dehydrogenase  39.79 
 
 		 478 aa  342  5.999999999999999e-93  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.57596 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4323  aldehyde dehydrogenase  40.25 
 
 		 503 aa  342  9e-93  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.181761 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1868  Retinal dehydrogenase  41.51 
 
 		 492 aa  341  1e-92  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3569  aldehyde dehydrogenase  39.7 
 
 		 494 aa  342  1e-92  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1036  aldehyde dehydrogenase  41.63 
 
 		 494 aa  342  1e-92  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.922959  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3662  aldehyde dehydrogenase (NAD)  39.7 
 
 		 494 aa  341  2e-92  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2634  aldehyde dehydrogenase  40 
 
 		 494 aa  341  2e-92  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2450  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  39.58 
 
 		 494 aa  341  2e-92  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3376  aldehyde dehydrogenase  42.52 
 
 		 488 aa  341  2e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.399948  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4012  Aldehyde Dehydrogenase  39.24 
 
 		 508 aa  340  2.9999999999999998e-92  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4941  betaine-aldehyde dehydrogenase  40.34 
 
 		 498 aa  340  2.9999999999999998e-92  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2260  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  41.91 
 
 		 484 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2843  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  39.79 
 
 		 494 aa  340  2.9999999999999998e-92  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.128159  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3348  aldehyde dehydrogenase  39.62 
 
 		 494 aa  339  5e-92  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0219223  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3313  aldehyde dehydrogenase  39.62 
 
 		 494 aa  339  5e-92  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3263  aldehyde dehydrogenase  39.62 
 
 		 494 aa  339  5e-92  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3562  aldehyde dehydrogenase (NAD)  39.62 
 
 		 494 aa  339  5e-92  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00134581 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3609  aldehyde dehydrogenase  39.62 
 
 		 494 aa  339  5e-92  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2229  aldehyde dehydrogenase  40.21 
 
 		 494 aa  339  8e-92  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.545234  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3562  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  41.05 
 
 		 494 aa  339  8e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.37194  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1556  Retinal dehydrogenase  40 
 
 		 490 aa  338  9.999999999999999e-92  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>