More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_0847 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_0847  betaine-aldehyde dehydrogenase  100 
 
 		 494 aa  994    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00938434  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4500  aldehyde dehydrogenase  56.39 
 
 		 496 aa  507  9.999999999999999e-143  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.947339  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2465  Aldehyde Dehydrogenase  45.44 
 
 		 485 aa  393  1e-108  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.146216  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1561  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  44.07 
 
 		 503 aa  382  1e-105  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2566  Aldehyde Dehydrogenase  43.55 
 
 		 478 aa  365  1e-100  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2161  Aldehyde Dehydrogenase  43.55 
 
 		 478 aa  366  1e-100  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.046835  normal  0.828531 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5904  aldehyde dehydrogenase  44.14 
 
 		 482 aa  367  1e-100  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.474261 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5539  aldehyde dehydrogenase  44.14 
 
 		 482 aa  367  1e-100  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0677  aldehyde dehydrogenase  43.34 
 
 		 478 aa  364  2e-99  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.663172  normal  0.354632 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3401  betaine-aldehyde dehydrogenase  43.86 
 
 		 479 aa  361  1e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6025  Aldehyde Dehydrogenase  43.24 
 
 		 483 aa  361  1e-98  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.181581 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1966  Aldehyde Dehydrogenase  42.58 
 
 		 477 aa  359  5e-98  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.150614  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1095  Aldehyde Dehydrogenase  43.64 
 
 		 479 aa  359  8e-98  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2350  aldehyde dehydrogenase  43.76 
 
 		 478 aa  358  9.999999999999999e-98  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.944535  normal  0.84057 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0308  hypothetical protein  39.87 
 
 		 488 aa  358  9.999999999999999e-98  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4941  betaine-aldehyde dehydrogenase  41.96 
 
 		 498 aa  358  9.999999999999999e-98  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2614  aldehyde dehydrogenase  42.92 
 
 		 478 aa  357  1.9999999999999998e-97  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4196  Aldehyde Dehydrogenase  42.14 
 
 		 483 aa  357  2.9999999999999997e-97  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.115052  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1756  aldehyde dehydrogenase  42.16 
 
 		 477 aa  356  5.999999999999999e-97  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0603102  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2174  aldehyde dehydrogenase  43.86 
 
 		 479 aa  355  6.999999999999999e-97  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000019217 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2837  Aldehyde Dehydrogenase  41.44 
 
 		 502 aa  353  4e-96  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4697  aldehyde dehydrogenase  40.59 
 
 		 496 aa  352  5.9999999999999994e-96  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.754003  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0292  hypothetical protein  39.24 
 
 		 488 aa  351  1e-95  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4700  aldehyde dehydrogenase  42 
 
 		 483 aa  351  2e-95  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0199533 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2380  betaine-aldehyde dehydrogenase  44.54 
 
 		 487 aa  350  2e-95  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0091  betaine-aldehyde dehydrogenase  43.33 
 
 		 482 aa  350  3e-95  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1966  Aldehyde Dehydrogenase  39.92 
 
 		 478 aa  349  5e-95  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.57596 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1948  benzaldehyde dehydrogenase  40.93 
 
 		 492 aa  348  1e-94  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000544418 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2260  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  43.45 
 
 		 484 aa  348  1e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2664  aldehyde dehydrogenase  42.16 
 
 		 480 aa  348  1e-94  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0216707  normal  0.214781 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2344  Aldehyde Dehydrogenase  40.25 
 
 		 477 aa  347  4e-94  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.754482  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6158  betaine aldehyde dehydrogenase  39.24 
 
 		 490 aa  346  6e-94  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70950  betaine aldehyde dehydrogenase  39.03 
 
 		 490 aa  345  1e-93  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.934353 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4086  aldehyde dehydrogenase  42.28 
 
 		 488 aa  345  1e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.515709  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3431  betaine-aldehyde dehydrogenase  42.41 
 
 		 488 aa  344  2e-93  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3841  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  42.2 
 
 		 508 aa  344  2.9999999999999997e-93  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.829655 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2278  aldehyde dehydrogenase family protein  44.7 
 
 		 479 aa  341  2e-92  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0735  aldehyde dehydrogenase family protein  44.7 
 
 		 479 aa  341  2e-92  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1083  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  44.7 
 
 		 479 aa  341  2e-92  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1591  aldehyde dehydrogenase family protein  44.7 
 
 		 479 aa  341  2e-92  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3006  aldehyde dehydrogenase family protein  44.7 
 
 		 479 aa  341  2e-92  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2738  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  41.65 
 
 		 488 aa  341  2e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.525641  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3585  betaine-aldehyde dehydrogenase  41.77 
 
 		 477 aa  341  2e-92  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.863463  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2487  aldehyde dehydrogenase family protein  40.72 
 
 		 503 aa  340  2.9999999999999998e-92  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5435  aldehyde dehydrogenase  41.94 
 
 		 504 aa  340  2.9999999999999998e-92  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.846738  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1235  aldehyde dehydrogenase family protein  44.7 
 
 		 479 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4949  aldehyde dehydrogenase  41.79 
 
 		 477 aa  339  8e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.986503  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2290  aldehyde dehydrogenase  39.62 
 
 		 486 aa  338  9e-92  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.176448  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5745  aldehyde dehydrogenase  43.86 
 
 		 479 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0583119  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1276  aldehyde dehydrogenase  37.84 
 
 		 497 aa  338  9.999999999999999e-92  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.420346  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0877  aldehyde dehydrogenase family protein  44.92 
 
 		 479 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.928456  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1077  NAD-dependent aldehyde dehydrogenases  44.49 
 
 		 479 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4882  aldehyde dehydrogenase  42.58 
 
 		 477 aa  337  1.9999999999999998e-91  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.895119  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_29563  Aldehyde dehydrogenase  36.62 
 
 		 495 aa  337  3.9999999999999995e-91  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.161421  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5372  aldehyde dehydrogenase family protein  40.93 
 
 		 481 aa  336  5e-91  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.302622  normal  0.199595 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5622  aldehyde dehydrogenase  40.3 
 
 		 488 aa  335  1e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.216133 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1476  betaine aldehyde dehydrogenase  38.4 
 
 		 490 aa  335  1e-90  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1381  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  39.31 
 
 		 496 aa  335  1e-90  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.514457 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1164  betaine-aldehyde dehydrogenase  40.08 
 
 		 512 aa  334  2e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.278559  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2422  aldehyde dehydrogenase  43.86 
 
 		 479 aa  334  3e-90  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.283723 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1036  aldehyde dehydrogenase  39.92 
 
 		 494 aa  333  4e-90  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.922959  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4856  aldehyde dehydrogenase  41.79 
 
 		 483 aa  332  6e-90  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.263653  normal  0.221142 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2418  aldehyde dehydrogenase  43.64 
 
 		 479 aa  332  7.000000000000001e-90  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1806  aldehyde dehydrogenase  43.64 
 
 		 479 aa  332  7.000000000000001e-90  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4080  betaine aldehyde dehydrogenase  38.14 
 
 		 485 aa  332  7.000000000000001e-90  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3004  aldehyde dehydrogenase  40.43 
 
 		 477 aa  332  8e-90  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.638791  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3439  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  40.43 
 
 		 493 aa  332  9e-90  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.383483  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3376  aldehyde dehydrogenase  41.56 
 
 		 488 aa  332  1e-89  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.399948  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4323  aldehyde dehydrogenase  39.66 
 
 		 503 aa  332  1e-89  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.181761 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5214  betaine-aldehyde dehydrogenase  41.14 
 
 		 488 aa  331  1e-89  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3646  aldehyde dehydrogenase family protein  40.64 
 
 		 493 aa  331  2e-89  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.196663 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0482  betaine aldehyde dehydrogenase  37.92 
 
 		 490 aa  331  2e-89  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2262  aldehyde dehydrogenase  40.64 
 
 		 493 aa  331  2e-89  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1286  aldehyde dehydrogenase  40.68 
 
 		 490 aa  330  3e-89  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18440  Aldehyde dehydrogenase family protein  39.87 
 
 		 499 aa  330  3e-89  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.931316  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2407  aldehyde dehydrogenase  40.72 
 
 		 493 aa  330  3e-89  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.830868  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2837  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  37.89 
 
 		 494 aa  330  4e-89  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000177336 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2640  aldehyde dehydrogenase  37.68 
 
 		 494 aa  330  5.0000000000000004e-89  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.198513  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2831  aldehyde dehydrogenase  37.68 
 
 		 494 aa  330  5.0000000000000004e-89  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.217262  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0142  aldehyde dehydrogenase  42.25 
 
 		 489 aa  330  5.0000000000000004e-89  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0776  betaine-aldehyde dehydrogenase  41.89 
 
 		 481 aa  329  6e-89  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.141721  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2084  aldehyde dehydrogenase  40.64 
 
 		 493 aa  329  6e-89  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3226  aldehyde dehydrogenase  41.89 
 
 		 493 aa  329  7e-89  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0874  aldehyde dehydrogenase  44.07 
 
 		 479 aa  329  8e-89  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.476262  normal  0.570338 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2882  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  37.68 
 
 		 494 aa  329  8e-89  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.198602  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2860  aldehyde dehydrogenase  37.47 
 
 		 494 aa  328  1.0000000000000001e-88  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1745  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  40 
 
 		 498 aa  328  1.0000000000000001e-88  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2673  aldehyde dehydrogenase family protein  40.43 
 
 		 493 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0828689  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1480  aldehyde dehydrogenase  38.85 
 
 		 490 aa  328  1.0000000000000001e-88  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0515859  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0443  aldehyde dehydrogenase  41.3 
 
 		 477 aa  328  1.0000000000000001e-88  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.451373  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2257  aldehyde dehydrogenase  40 
 
 		 493 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6130  Betaine-aldehyde dehydrogenase  39.13 
 
 		 492 aa  328  1.0000000000000001e-88  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001293  aldehyde dehydrogenase  39.19 
 
 		 478 aa  327  2.0000000000000001e-88  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2290  betaine-aldehyde dehydrogenase  39.7 
 
 		 503 aa  328  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.109533 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2504  Aldehyde Dehydrogenase  39.04 
 
 		 497 aa  327  3e-88  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.98157  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0129  betaine aldehyde dehydrogenase  39.49 
 
 		 494 aa  327  3e-88  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00429668  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3047  Aldehyde Dehydrogenase  38.83 
 
 		 508 aa  327  3e-88  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2862  Aldehyde Dehydrogenase  39.43 
 
 		 505 aa  327  3e-88  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1883  betaine aldehyde dehydrogenase  39.15 
 
 		 485 aa  327  3e-88  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.86306 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31700  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  40.97 
 
 		 495 aa  326  4.0000000000000003e-88  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.465703  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>