More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C1164 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008688  Pden_4941  betaine-aldehyde dehydrogenase  80.45 
 
 
498 aa  841    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4697  aldehyde dehydrogenase  79.35 
 
 
496 aa  838    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.754003  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1164  betaine-aldehyde dehydrogenase  100 
 
 
512 aa  1045    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.278559  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4824  aldehyde dehydrogenase  59.3 
 
 
492 aa  604  1.0000000000000001e-171  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.00512486  normal  0.364288 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6789  Aldehyde Dehydrogenase  57.11 
 
 
495 aa  573  1.0000000000000001e-162  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.772669  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1006  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  55.09 
 
 
491 aa  541  9.999999999999999e-153  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.179638  normal  0.457717 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0174  aldehyde dehydrogenase  54.27 
 
 
493 aa  520  1e-146  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.437593  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2720  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  51.87 
 
 
496 aa  518  1e-146  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.133505  normal  0.10056 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6831  aldehyde dehydrogenase  52.04 
 
 
493 aa  513  1e-144  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6123  aldehyde dehydrogenase  52.85 
 
 
493 aa  499  1e-140  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6411  aldehyde dehydrogenase  53.25 
 
 
493 aa  501  1e-140  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.599394 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0085  Aldehyde dehydrogenase (NAD(+))  49.59 
 
 
493 aa  495  1e-139  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3439  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  47.56 
 
 
493 aa  486  1e-136  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.383483  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2407  aldehyde dehydrogenase  47.36 
 
 
493 aa  486  1e-136  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.830868  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2673  aldehyde dehydrogenase family protein  47.15 
 
 
493 aa  482  1e-135  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0828689  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3233  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  47.15 
 
 
493 aa  481  1e-135  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.436611  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3646  aldehyde dehydrogenase family protein  47.56 
 
 
493 aa  481  1e-134  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.196663 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2257  aldehyde dehydrogenase  47.36 
 
 
493 aa  479  1e-134  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2084  aldehyde dehydrogenase  47.56 
 
 
493 aa  479  1e-134  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2262  aldehyde dehydrogenase  47.36 
 
 
493 aa  479  1e-134  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2290  betaine-aldehyde dehydrogenase  46.63 
 
 
503 aa  464  1e-129  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.109533 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4075  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  48.28 
 
 
496 aa  462  1e-129  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.234292 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4323  aldehyde dehydrogenase  45.81 
 
 
503 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.181761 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6756  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  45.42 
 
 
503 aa  458  1e-127  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.569452 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1250  aldehyde dehydrogenase  47.74 
 
 
503 aa  457  1e-127  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.790003 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1745  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  45.68 
 
 
498 aa  450  1e-125  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2524  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  44.86 
 
 
509 aa  443  1e-123  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.70277  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2213  aldehyde dehydrogenase  46.34 
 
 
490 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.00475065  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0886  Aldehyde Dehydrogenase  46.33 
 
 
473 aa  438  1e-121  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5505  Aldehyde Dehydrogenase  45.38 
 
 
504 aa  430  1e-119  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000574808 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4856  aldehyde dehydrogenase  45.21 
 
 
483 aa  423  1e-117  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.263653  normal  0.221142 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1480  aldehyde dehydrogenase  44.97 
 
 
490 aa  424  1e-117  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0515859  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3841  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  45.12 
 
 
508 aa  421  1e-116  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.829655 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1970  aldehyde dehydrogenase  42.63 
 
 
494 aa  419  1e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0798984  normal  0.254214 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4700  aldehyde dehydrogenase  44.38 
 
 
483 aa  418  9.999999999999999e-116  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0199533 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1556  Retinal dehydrogenase  43.4 
 
 
490 aa  415  1e-114  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6025  Aldehyde Dehydrogenase  45.32 
 
 
483 aa  412  1e-114  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.181581 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3759  Aldehyde Dehydrogenase  43.91 
 
 
490 aa  412  1e-114  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.304272 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2504  Aldehyde Dehydrogenase  44.42 
 
 
497 aa  413  1e-114  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.98157  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2487  aldehyde dehydrogenase family protein  43.69 
 
 
503 aa  409  1e-113  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3569  aldehyde dehydrogenase  42.74 
 
 
494 aa  409  1e-113  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3348  aldehyde dehydrogenase  42.95 
 
 
494 aa  409  1e-113  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0219223  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3313  aldehyde dehydrogenase  42.95 
 
 
494 aa  409  1e-113  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3263  aldehyde dehydrogenase  42.95 
 
 
494 aa  409  1e-113  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1655  aldehyde dehydrogenase (NAD)  42.53 
 
 
494 aa  409  1e-113  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0330388 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2476  aldehyde dehydrogenase  41.48 
 
 
497 aa  410  1e-113  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.124158  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3609  aldehyde dehydrogenase  42.95 
 
 
494 aa  409  1e-113  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3257  aldehyde dehydrogenase  42.53 
 
 
494 aa  410  1e-113  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.536879  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1535  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  45.93 
 
 
493 aa  410  1e-113  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.31089  normal  0.378909 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3562  aldehyde dehydrogenase (NAD)  42.95 
 
 
494 aa  409  1e-113  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00134581 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3662  aldehyde dehydrogenase (NAD)  42.74 
 
 
494 aa  410  1e-113  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0744  Betaine-aldehyde dehydrogenase  45.07 
 
 
496 aa  408  1.0000000000000001e-112  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_29563  Aldehyde dehydrogenase  43.1 
 
 
495 aa  405  1.0000000000000001e-112  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.161421  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4241  aldehyde dehydrogenase  43.04 
 
 
498 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0292  hypothetical protein  43.61 
 
 
488 aa  402  1e-111  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2634  aldehyde dehydrogenase  42.05 
 
 
494 aa  402  1e-111  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1054  Aldehyde Dehydrogenase  44.58 
 
 
513 aa  402  1e-111  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0152  Aldehyde Dehydrogenase  43.26 
 
 
510 aa  404  1e-111  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1868  Retinal dehydrogenase  44.28 
 
 
492 aa  405  1e-111  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2229  aldehyde dehydrogenase  41.89 
 
 
494 aa  403  1e-111  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.545234  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1381  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  42.63 
 
 
496 aa  403  1e-111  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.514457 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2599  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  42.83 
 
 
490 aa  404  1e-111  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.225795  normal  0.197804 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1966  Aldehyde Dehydrogenase  42.19 
 
 
478 aa  399  9.999999999999999e-111  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.57596 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2860  aldehyde dehydrogenase  41.63 
 
 
494 aa  399  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2088  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  47.34 
 
 
498 aa  399  9.999999999999999e-111  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.917173 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3165  Betaine-aldehyde dehydrogenase  41.46 
 
 
492 aa  400  9.999999999999999e-111  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2450  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  41.84 
 
 
494 aa  401  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2591  aldehyde dehydrogenase  41.84 
 
 
494 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0308  hypothetical protein  43.61 
 
 
488 aa  399  9.999999999999999e-111  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4061  Aldehyde dehydrogenase (NAD(+))  44.86 
 
 
505 aa  401  9.999999999999999e-111  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3957  aldehyde dehydrogenase  40.95 
 
 
489 aa  399  9.999999999999999e-111  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1493  aldehyde dehydrogenase family protein  44.03 
 
 
488 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4156  aldehyde dehydrogenase  42.28 
 
 
487 aa  399  9.999999999999999e-111  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.335298 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3599  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  46.9 
 
 
496 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.152099  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2260  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  45.95 
 
 
484 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1004  betaine-aldehyde dehydrogenase  41.05 
 
 
492 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.460845  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6088  aldehyde dehydrogenase  41.99 
 
 
487 aa  399  9.999999999999999e-111  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2843  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  41.84 
 
 
494 aa  399  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.128159  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5267  aldehyde dehydrogenase  45.89 
 
 
493 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2882  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  41.84 
 
 
494 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.198602  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1476  betaine aldehyde dehydrogenase  42.39 
 
 
490 aa  395  1e-109  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2640  aldehyde dehydrogenase  41.63 
 
 
494 aa  398  1e-109  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.198513  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2556  aldehyde dehydrogenase  41.42 
 
 
494 aa  396  1e-109  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.271873  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7067  Aldehyde Dehydrogenase  42.71 
 
 
496 aa  397  1e-109  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.340689  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2605  aldehyde dehydrogenase  43.04 
 
 
494 aa  395  1e-109  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000129908  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7305  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  45.7 
 
 
518 aa  398  1e-109  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.604954  normal  0.789293 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3431  betaine-aldehyde dehydrogenase  41.13 
 
 
488 aa  397  1e-109  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2831  aldehyde dehydrogenase  41.63 
 
 
494 aa  398  1e-109  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.217262  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4086  aldehyde dehydrogenase  41.13 
 
 
488 aa  397  1e-109  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.515709  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2837  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  41.42 
 
 
494 aa  397  1e-109  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000177336 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3047  Aldehyde Dehydrogenase  44.51 
 
 
508 aa  393  1e-108  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6251  aldehyde dehydrogenase  41.78 
 
 
487 aa  393  1e-108  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.392289 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7156  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  44.07 
 
 
494 aa  393  1e-108  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5435  aldehyde dehydrogenase  43.12 
 
 
504 aa  393  1e-108  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.846738  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5622  aldehyde dehydrogenase  40.55 
 
 
488 aa  392  1e-108  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.216133 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0183  betaine-aldehyde dehydrogenase  42.29 
 
 
499 aa  394  1e-108  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.352909  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6857  aldehyde dehydrogenase  45.23 
 
 
502 aa  392  1e-108  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0656347  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5214  betaine-aldehyde dehydrogenase  40.08 
 
 
488 aa  392  1e-108  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00554  Aldehyde dehydrogenase (ALDDH)(ALDH)(EC 1.2.1.3) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P08157]  43.04 
 
 
497 aa  391  1e-107  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.534945  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0804  aldehyde dehydrogenase  45.51 
 
 
500 aa  392  1e-107  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>