More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_0677 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010002  Daci_4882  aldehyde dehydrogenase  69.83 
 
 
477 aa  677    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.895119  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3006  aldehyde dehydrogenase family protein  73.53 
 
 
479 aa  710    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2463  aldehyde dehydrogenase  77.31 
 
 
479 aa  716    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.32545  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2350  aldehyde dehydrogenase  84.1 
 
 
478 aa  807    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.944535  normal  0.84057 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1966  Aldehyde Dehydrogenase  70.89 
 
 
477 aa  709    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.150614  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1591  aldehyde dehydrogenase family protein  73.53 
 
 
479 aa  710    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1756  aldehyde dehydrogenase  70.46 
 
 
477 aa  706    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0603102  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0735  aldehyde dehydrogenase family protein  73.53 
 
 
479 aa  710    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2344  Aldehyde Dehydrogenase  70.68 
 
 
477 aa  706    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.754482  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2161  Aldehyde Dehydrogenase  84.94 
 
 
478 aa  819    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.046835  normal  0.828531 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5904  aldehyde dehydrogenase  67.36 
 
 
482 aa  647    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.474261 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2566  Aldehyde Dehydrogenase  85.36 
 
 
478 aa  820    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2614  aldehyde dehydrogenase  92.47 
 
 
478 aa  882    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2174  aldehyde dehydrogenase  74.37 
 
 
479 aa  748    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000019217 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1235  aldehyde dehydrogenase family protein  73.53 
 
 
479 aa  709    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1095  Aldehyde Dehydrogenase  75.63 
 
 
479 aa  761    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1077  NAD-dependent aldehyde dehydrogenases  73.32 
 
 
479 aa  707    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2278  aldehyde dehydrogenase family protein  73.53 
 
 
479 aa  710    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2664  aldehyde dehydrogenase  69.83 
 
 
480 aa  693    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0216707  normal  0.214781 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5745  aldehyde dehydrogenase  77.52 
 
 
479 aa  721    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0583119  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2418  aldehyde dehydrogenase  77.1 
 
 
479 aa  721    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2422  aldehyde dehydrogenase  77.31 
 
 
479 aa  723    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.283723 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0877  aldehyde dehydrogenase family protein  74.37 
 
 
479 aa  707    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.928456  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3585  betaine-aldehyde dehydrogenase  71.31 
 
 
477 aa  686    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.863463  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2290  aldehyde dehydrogenase  68.57 
 
 
486 aa  692    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.176448  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3401  betaine-aldehyde dehydrogenase  76.05 
 
 
479 aa  761    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0874  aldehyde dehydrogenase  78.36 
 
 
479 aa  711    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.476262  normal  0.570338 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2328  aldehyde dehydrogenase  77.31 
 
 
479 aa  716    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0677  aldehyde dehydrogenase  100 
 
 
478 aa  969    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.663172  normal  0.354632 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1806  aldehyde dehydrogenase  77.1 
 
 
479 aa  721    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3004  aldehyde dehydrogenase  70.29 
 
 
477 aa  693    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.638791  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5539  aldehyde dehydrogenase  67.36 
 
 
482 aa  647    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1083  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  73.53 
 
 
479 aa  710    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1691  aldehyde dehydrogenase  64.98 
 
 
478 aa  614  9.999999999999999e-175  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.246162 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1014  aldehyde dehydrogenase family protein  59.41 
 
 
497 aa  600  1e-170  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1286  aldehyde dehydrogenase  59.49 
 
 
490 aa  592  1e-168  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0956  aldehyde dehydrogenase family protein  58.79 
 
 
497 aa  592  1e-168  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0091  betaine-aldehyde dehydrogenase  62.87 
 
 
482 aa  591  1e-168  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4949  aldehyde dehydrogenase  58.3 
 
 
477 aa  566  1e-160  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.986503  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1357  aldehyde dehydrogenase  59.41 
 
 
487 aa  563  1.0000000000000001e-159  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0776  betaine-aldehyde dehydrogenase  59.41 
 
 
481 aa  550  1e-155  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.141721  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1254  aldehyde dehydrogenase  59.61 
 
 
481 aa  548  1e-155  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3021  gamma-glutamyl-gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  62.09 
 
 
485 aa  545  1e-154  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.143518  normal  0.755617 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1974  NAD-dependent aldehyde dehydrogenase  57.51 
 
 
486 aa  536  1e-151  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.489378  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1430  aldehyde dehydrogenase  57.27 
 
 
487 aa  538  1e-151  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1251  Aldehyde Dehydrogenase  56.63 
 
 
480 aa  525  1e-148  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.019286 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2380  betaine-aldehyde dehydrogenase  57.02 
 
 
487 aa  475  1e-133  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0928  aldehyde dehydrogenase  51.26 
 
 
494 aa  447  1.0000000000000001e-124  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1561  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  47.07 
 
 
503 aa  417  9.999999999999999e-116  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4700  aldehyde dehydrogenase  44.75 
 
 
483 aa  386  1e-106  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0199533 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2465  Aldehyde Dehydrogenase  43.89 
 
 
485 aa  383  1e-105  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.146216  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4856  aldehyde dehydrogenase  45.11 
 
 
483 aa  380  1e-104  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.263653  normal  0.221142 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1381  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  44.23 
 
 
496 aa  379  1e-104  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.514457 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5372  aldehyde dehydrogenase family protein  45.57 
 
 
481 aa  377  1e-103  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.302622  normal  0.199595 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2860  aldehyde dehydrogenase  42.23 
 
 
494 aa  372  1e-102  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2837  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  42.65 
 
 
494 aa  372  1e-102  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000177336 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2843  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  42.23 
 
 
494 aa  372  1e-102  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.128159  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2450  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  42.02 
 
 
494 aa  372  1e-102  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2634  aldehyde dehydrogenase  41.81 
 
 
494 aa  372  1e-102  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0847  betaine-aldehyde dehydrogenase  43.34 
 
 
494 aa  374  1e-102  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00938434  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1966  Aldehyde Dehydrogenase  44.9 
 
 
478 aa  372  1e-102  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.57596 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3841  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  43.58 
 
 
508 aa  374  1e-102  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.829655 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2504  Aldehyde Dehydrogenase  43.88 
 
 
497 aa  369  1e-101  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.98157  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2640  aldehyde dehydrogenase  42.44 
 
 
494 aa  372  1e-101  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.198513  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3759  Aldehyde Dehydrogenase  42.14 
 
 
490 aa  369  1e-101  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.304272 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2556  aldehyde dehydrogenase  42.02 
 
 
494 aa  369  1e-101  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.271873  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2882  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  42.02 
 
 
494 aa  370  1e-101  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.198602  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7156  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  43.49 
 
 
494 aa  370  1e-101  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2831  aldehyde dehydrogenase  42.44 
 
 
494 aa  372  1e-101  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.217262  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0886  Aldehyde Dehydrogenase  42.62 
 
 
473 aa  370  1e-101  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5214  betaine-aldehyde dehydrogenase  43.63 
 
 
488 aa  366  1e-100  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2591  aldehyde dehydrogenase  42.02 
 
 
494 aa  368  1e-100  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0986  betaine-aldehyde dehydrogenase  45.47 
 
 
481 aa  366  1e-100  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.669194  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6025  Aldehyde Dehydrogenase  43.4 
 
 
483 aa  368  1e-100  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.181581 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3562  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  44.38 
 
 
494 aa  364  2e-99  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.37194  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2738  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  43.33 
 
 
488 aa  362  7.0000000000000005e-99  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.525641  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3376  aldehyde dehydrogenase  43.84 
 
 
488 aa  362  8e-99  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.399948  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5622  aldehyde dehydrogenase  42.8 
 
 
488 aa  362  1e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.216133 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1868  Retinal dehydrogenase  42.89 
 
 
492 aa  361  1e-98  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1036  aldehyde dehydrogenase  44.4 
 
 
494 aa  361  2e-98  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.922959  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7306  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  41.65 
 
 
496 aa  361  2e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.508329 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3431  betaine-aldehyde dehydrogenase  43.54 
 
 
488 aa  361  2e-98  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1480  aldehyde dehydrogenase  40.42 
 
 
490 aa  361  2e-98  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0515859  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6072  aldehyde dehydrogenase  44.38 
 
 
488 aa  360  3e-98  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2904  aldehyde dehydrogenase  46.02 
 
 
494 aa  359  5e-98  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.399829  normal  0.436531 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4086  aldehyde dehydrogenase  43.33 
 
 
488 aa  359  5e-98  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.515709  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1745  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  42.07 
 
 
498 aa  358  9e-98  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4323  aldehyde dehydrogenase  41.09 
 
 
503 aa  358  1.9999999999999998e-97  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.181761 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4941  betaine-aldehyde dehydrogenase  41.4 
 
 
498 aa  356  3.9999999999999996e-97  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2260  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  44.68 
 
 
484 aa  355  6.999999999999999e-97  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0443  aldehyde dehydrogenase  44.09 
 
 
477 aa  355  1e-96  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.451373  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6130  Betaine-aldehyde dehydrogenase  42.74 
 
 
492 aa  354  2e-96  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1655  aldehyde dehydrogenase (NAD)  41.77 
 
 
494 aa  354  2e-96  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0330388 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3646  aldehyde dehydrogenase family protein  41.81 
 
 
493 aa  353  2.9999999999999997e-96  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.196663 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3257  aldehyde dehydrogenase  41.77 
 
 
494 aa  353  2.9999999999999997e-96  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.536879  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2229  aldehyde dehydrogenase  41.47 
 
 
494 aa  353  2.9999999999999997e-96  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.545234  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1948  benzaldehyde dehydrogenase  41.96 
 
 
492 aa  353  4e-96  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  unclonable  0.000000544418 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1510  gamma-glutamyl-gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  43.79 
 
 
495 aa  353  4e-96  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0085  Aldehyde dehydrogenase (NAD(+))  43.04 
 
 
493 aa  353  4e-96  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3662  aldehyde dehydrogenase (NAD)  41.56 
 
 
494 aa  352  5.9999999999999994e-96  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>