More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_1254 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008686  Pden_1254  aldehyde dehydrogenase  100 
 
 
481 aa  957    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2174  aldehyde dehydrogenase  61.22 
 
 
479 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000019217 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1095  Aldehyde Dehydrogenase  61.36 
 
 
479 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3401  betaine-aldehyde dehydrogenase  61.39 
 
 
479 aa  580  1e-164  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1430  aldehyde dehydrogenase  63.77 
 
 
487 aa  576  1.0000000000000001e-163  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1974  NAD-dependent aldehyde dehydrogenase  61.41 
 
 
486 aa  568  1e-161  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.489378  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2344  Aldehyde Dehydrogenase  59.79 
 
 
477 aa  565  1e-160  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.754482  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1357  aldehyde dehydrogenase  60.75 
 
 
487 aa  567  1e-160  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1966  Aldehyde Dehydrogenase  60.89 
 
 
477 aa  561  1.0000000000000001e-159  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.150614  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1756  aldehyde dehydrogenase  60.47 
 
 
477 aa  559  1e-158  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0603102  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3585  betaine-aldehyde dehydrogenase  61.41 
 
 
477 aa  558  1e-158  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.863463  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2664  aldehyde dehydrogenase  60 
 
 
480 aa  555  1e-157  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0216707  normal  0.214781 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2290  aldehyde dehydrogenase  58.37 
 
 
486 aa  557  1e-157  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.176448  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4949  aldehyde dehydrogenase  56.9 
 
 
477 aa  555  1e-156  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.986503  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2350  aldehyde dehydrogenase  59.92 
 
 
478 aa  549  1e-155  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.944535  normal  0.84057 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1286  aldehyde dehydrogenase  57.57 
 
 
490 aa  548  1e-155  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2422  aldehyde dehydrogenase  61.39 
 
 
479 aa  545  1e-154  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.283723 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1014  aldehyde dehydrogenase family protein  57.14 
 
 
497 aa  546  1e-154  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5745  aldehyde dehydrogenase  61.81 
 
 
479 aa  547  1e-154  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0583119  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2566  Aldehyde Dehydrogenase  60.95 
 
 
478 aa  545  1e-154  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2418  aldehyde dehydrogenase  61.6 
 
 
479 aa  546  1e-154  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4882  aldehyde dehydrogenase  60.38 
 
 
477 aa  548  1e-154  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.895119  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1806  aldehyde dehydrogenase  61.6 
 
 
479 aa  546  1e-154  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2161  Aldehyde Dehydrogenase  60.74 
 
 
478 aa  543  1e-153  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.046835  normal  0.828531 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0956  aldehyde dehydrogenase family protein  56.72 
 
 
497 aa  544  1e-153  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2463  aldehyde dehydrogenase  61.18 
 
 
479 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.32545  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2328  aldehyde dehydrogenase  61.18 
 
 
479 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2614  aldehyde dehydrogenase  60.26 
 
 
478 aa  535  1e-151  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0677  aldehyde dehydrogenase  59.61 
 
 
478 aa  533  1e-150  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.663172  normal  0.354632 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0735  aldehyde dehydrogenase family protein  59.7 
 
 
479 aa  531  1e-149  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1251  Aldehyde Dehydrogenase  60.04 
 
 
480 aa  530  1e-149  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.019286 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1083  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  59.7 
 
 
479 aa  531  1e-149  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2278  aldehyde dehydrogenase family protein  59.7 
 
 
479 aa  531  1e-149  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1235  aldehyde dehydrogenase family protein  59.7 
 
 
479 aa  530  1e-149  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3006  aldehyde dehydrogenase family protein  59.7 
 
 
479 aa  531  1e-149  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1077  NAD-dependent aldehyde dehydrogenases  59.7 
 
 
479 aa  530  1e-149  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0877  aldehyde dehydrogenase family protein  60.55 
 
 
479 aa  530  1e-149  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.928456  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1591  aldehyde dehydrogenase family protein  59.7 
 
 
479 aa  531  1e-149  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0874  aldehyde dehydrogenase  61.39 
 
 
479 aa  527  1e-148  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.476262  normal  0.570338 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0091  betaine-aldehyde dehydrogenase  59.28 
 
 
482 aa  522  1e-147  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3004  aldehyde dehydrogenase  57.51 
 
 
477 aa  524  1e-147  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.638791  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5904  aldehyde dehydrogenase  56.51 
 
 
482 aa  518  1e-146  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.474261 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0776  betaine-aldehyde dehydrogenase  58.3 
 
 
481 aa  518  1e-146  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.141721  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5539  aldehyde dehydrogenase  56.51 
 
 
482 aa  518  1e-146  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3021  gamma-glutamyl-gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  58.4 
 
 
485 aa  512  1e-144  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.143518  normal  0.755617 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1691  aldehyde dehydrogenase  57.08 
 
 
478 aa  502  1e-141  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.246162 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2380  betaine-aldehyde dehydrogenase  52.93 
 
 
487 aa  442  1e-123  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0928  aldehyde dehydrogenase  46.33 
 
 
494 aa  395  1e-109  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1561  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  46.91 
 
 
503 aa  387  1e-106  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3841  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  45.02 
 
 
508 aa  362  1e-98  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.829655 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0886  Aldehyde Dehydrogenase  43.01 
 
 
473 aa  357  1.9999999999999998e-97  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4323  aldehyde dehydrogenase  43.42 
 
 
503 aa  355  6.999999999999999e-97  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.181761 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2823  betaine aldehyde dehydrogenase  44.09 
 
 
491 aa  355  1e-96  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4432  Aldehyde Dehydrogenase  43.84 
 
 
492 aa  354  2e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0316709  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1745  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  43.19 
 
 
498 aa  352  7e-96  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6025  Aldehyde Dehydrogenase  44.37 
 
 
483 aa  347  2e-94  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.181581 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2504  Aldehyde Dehydrogenase  42.46 
 
 
497 aa  347  3e-94  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.98157  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4856  aldehyde dehydrogenase  43.63 
 
 
483 aa  346  5e-94  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.263653  normal  0.221142 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1381  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  41.98 
 
 
496 aa  345  8.999999999999999e-94  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.514457 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1036  aldehyde dehydrogenase  44 
 
 
494 aa  343  2.9999999999999997e-93  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.922959  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0129  betaine aldehyde dehydrogenase  42.26 
 
 
494 aa  342  1e-92  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00429668  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3257  aldehyde dehydrogenase  41.61 
 
 
494 aa  340  2.9999999999999998e-92  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.536879  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5622  aldehyde dehydrogenase  44.21 
 
 
488 aa  338  9e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.216133 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3569  aldehyde dehydrogenase  41.49 
 
 
494 aa  338  1.9999999999999998e-91  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1868  Retinal dehydrogenase  43.19 
 
 
492 aa  338  1.9999999999999998e-91  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2290  betaine-aldehyde dehydrogenase  40.59 
 
 
503 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.109533 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3662  aldehyde dehydrogenase (NAD)  41.19 
 
 
494 aa  337  1.9999999999999998e-91  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1655  aldehyde dehydrogenase (NAD)  41.28 
 
 
494 aa  337  2.9999999999999997e-91  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0330388 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2599  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  40.21 
 
 
490 aa  337  2.9999999999999997e-91  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.225795  normal  0.197804 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7156  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  44.23 
 
 
494 aa  337  3.9999999999999995e-91  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1966  Aldehyde Dehydrogenase  42.58 
 
 
478 aa  336  5.999999999999999e-91  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.57596 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3348  aldehyde dehydrogenase  40.76 
 
 
494 aa  335  1e-90  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0219223  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3313  aldehyde dehydrogenase  40.76 
 
 
494 aa  335  1e-90  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3263  aldehyde dehydrogenase  40.76 
 
 
494 aa  335  1e-90  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3609  aldehyde dehydrogenase  40.76 
 
 
494 aa  335  1e-90  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2465  Aldehyde Dehydrogenase  41.03 
 
 
485 aa  335  1e-90  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.146216  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3562  aldehyde dehydrogenase (NAD)  40.76 
 
 
494 aa  335  1e-90  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00134581 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0443  aldehyde dehydrogenase  43.37 
 
 
477 aa  333  3e-90  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.451373  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0744  Betaine-aldehyde dehydrogenase  42.86 
 
 
496 aa  332  6e-90  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2738  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  43.79 
 
 
488 aa  332  6e-90  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.525641  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2407  aldehyde dehydrogenase  41.7 
 
 
493 aa  332  7.000000000000001e-90  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.830868  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6130  Betaine-aldehyde dehydrogenase  43.19 
 
 
492 aa  332  9e-90  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1948  benzaldehyde dehydrogenase  44.42 
 
 
492 aa  332  9e-90  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  unclonable  0.000000544418 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1004  betaine-aldehyde dehydrogenase  40.42 
 
 
492 aa  331  1e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.460845  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4086  aldehyde dehydrogenase  44 
 
 
488 aa  332  1e-89  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.515709  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2673  aldehyde dehydrogenase family protein  41.49 
 
 
493 aa  330  2e-89  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0828689  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2213  aldehyde dehydrogenase  42.98 
 
 
490 aa  331  2e-89  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.00475065  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3759  Aldehyde Dehydrogenase  38.4 
 
 
490 aa  331  2e-89  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.304272 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3431  betaine-aldehyde dehydrogenase  44 
 
 
488 aa  331  2e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3439  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  42.37 
 
 
493 aa  330  3e-89  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.383483  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2260  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  43.74 
 
 
484 aa  330  3e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0049  betaine-aldehyde dehydrogenase  42.19 
 
 
505 aa  330  3e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5214  betaine-aldehyde dehydrogenase  43.37 
 
 
488 aa  330  4e-89  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4700  aldehyde dehydrogenase  40.98 
 
 
483 aa  330  4e-89  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0199533 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2257  aldehyde dehydrogenase  41.7 
 
 
493 aa  330  5.0000000000000004e-89  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7306  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  42.05 
 
 
496 aa  329  7e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.508329 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2229  aldehyde dehydrogenase  40.64 
 
 
494 aa  328  9e-89  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.545234  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3909  gamma-glutamyl-gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  45.7 
 
 
487 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1480  aldehyde dehydrogenase  39.07 
 
 
490 aa  328  1.0000000000000001e-88  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0515859  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2831  aldehyde dehydrogenase  39.74 
 
 
494 aa  328  1.0000000000000001e-88  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.217262  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>