More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A3401 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009080  BMA10247_1591  aldehyde dehydrogenase family protein  82.05 
 
 
479 aa  789    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0874  aldehyde dehydrogenase  85.8 
 
 
479 aa  785    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.476262  normal  0.570338 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2350  aldehyde dehydrogenase  76.05 
 
 
478 aa  740    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.944535  normal  0.84057 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0735  aldehyde dehydrogenase family protein  82.05 
 
 
479 aa  789    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4882  aldehyde dehydrogenase  73.84 
 
 
477 aa  691    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.895119  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1756  aldehyde dehydrogenase  75.11 
 
 
477 aa  735    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0603102  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2614  aldehyde dehydrogenase  73.95 
 
 
478 aa  726    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1235  aldehyde dehydrogenase family protein  82.05 
 
 
479 aa  787    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2328  aldehyde dehydrogenase  86.22 
 
 
479 aa  800    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2161  Aldehyde Dehydrogenase  75.84 
 
 
478 aa  739    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.046835  normal  0.828531 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2422  aldehyde dehydrogenase  86.43 
 
 
479 aa  811    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.283723 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5745  aldehyde dehydrogenase  86.43 
 
 
479 aa  811    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0583119  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1095  Aldehyde Dehydrogenase  96.66 
 
 
479 aa  938    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2278  aldehyde dehydrogenase family protein  82.05 
 
 
479 aa  789    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2664  aldehyde dehydrogenase  72.78 
 
 
480 aa  704    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0216707  normal  0.214781 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3006  aldehyde dehydrogenase family protein  82.05 
 
 
479 aa  789    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0877  aldehyde dehydrogenase family protein  84.34 
 
 
479 aa  800    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.928456  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3585  betaine-aldehyde dehydrogenase  71.94 
 
 
477 aa  696    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.863463  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2290  aldehyde dehydrogenase  73 
 
 
486 aa  728    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.176448  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3401  betaine-aldehyde dehydrogenase  100 
 
 
479 aa  965    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2174  aldehyde dehydrogenase  88.73 
 
 
479 aa  872    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000019217 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2344  Aldehyde Dehydrogenase  75.74 
 
 
477 aa  748    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.754482  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2566  Aldehyde Dehydrogenase  76.68 
 
 
478 aa  744    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1083  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  82.05 
 
 
479 aa  789    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2463  aldehyde dehydrogenase  86.22 
 
 
479 aa  800    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.32545  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1966  Aldehyde Dehydrogenase  75.53 
 
 
477 aa  737    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.150614  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0677  aldehyde dehydrogenase  76.05 
 
 
478 aa  742    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.663172  normal  0.354632 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1077  NAD-dependent aldehyde dehydrogenases  82.05 
 
 
479 aa  786    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1691  aldehyde dehydrogenase  71 
 
 
478 aa  649    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.246162 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1806  aldehyde dehydrogenase  86.43 
 
 
479 aa  811    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2418  aldehyde dehydrogenase  86.43 
 
 
479 aa  811    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3004  aldehyde dehydrogenase  72.03 
 
 
477 aa  694    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.638791  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0091  betaine-aldehyde dehydrogenase  66.39 
 
 
482 aa  624  1e-178  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1014  aldehyde dehydrogenase family protein  63.08 
 
 
497 aa  616  1e-175  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1286  aldehyde dehydrogenase  63.08 
 
 
490 aa  617  1e-175  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5904  aldehyde dehydrogenase  64.15 
 
 
482 aa  614  1e-175  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.474261 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5539  aldehyde dehydrogenase  64.15 
 
 
482 aa  614  1e-175  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0956  aldehyde dehydrogenase family protein  62.45 
 
 
497 aa  609  1e-173  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4949  aldehyde dehydrogenase  59.49 
 
 
477 aa  590  1e-167  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.986503  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1254  aldehyde dehydrogenase  61.39 
 
 
481 aa  580  1e-164  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3021  gamma-glutamyl-gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  65.33 
 
 
485 aa  578  1e-164  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.143518  normal  0.755617 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1357  aldehyde dehydrogenase  61.1 
 
 
487 aa  565  1e-160  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0776  betaine-aldehyde dehydrogenase  62.03 
 
 
481 aa  564  1.0000000000000001e-159  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.141721  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1974  NAD-dependent aldehyde dehydrogenase  60.47 
 
 
486 aa  559  1e-158  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.489378  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1251  Aldehyde Dehydrogenase  59.38 
 
 
480 aa  551  1e-155  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.019286 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1430  aldehyde dehydrogenase  57.61 
 
 
487 aa  535  1e-151  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2380  betaine-aldehyde dehydrogenase  55.06 
 
 
487 aa  481  1e-135  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0928  aldehyde dehydrogenase  53.14 
 
 
494 aa  467  9.999999999999999e-131  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1561  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  47.16 
 
 
503 aa  419  1e-116  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2465  Aldehyde Dehydrogenase  42.77 
 
 
485 aa  377  1e-103  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.146216  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2407  aldehyde dehydrogenase  43.01 
 
 
493 aa  371  1e-101  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.830868  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3841  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  43.83 
 
 
508 aa  370  1e-101  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.829655 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1948  benzaldehyde dehydrogenase  44.33 
 
 
492 aa  367  1e-100  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  unclonable  0.000000544418 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5622  aldehyde dehydrogenase  43.76 
 
 
488 aa  366  1e-100  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.216133 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1942  gamma-glutamyl-gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  44.07 
 
 
495 aa  366  1e-100  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2843  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  41.54 
 
 
494 aa  368  1e-100  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.128159  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2738  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  43.84 
 
 
488 aa  367  1e-100  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.525641  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0986  betaine-aldehyde dehydrogenase  44.94 
 
 
481 aa  365  1e-100  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.669194  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2450  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  41.13 
 
 
494 aa  368  1e-100  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4856  aldehyde dehydrogenase  43.83 
 
 
483 aa  367  1e-100  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.263653  normal  0.221142 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1381  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  42.98 
 
 
496 aa  367  1e-100  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.514457 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3439  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  43.16 
 
 
493 aa  365  1e-99  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.383483  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2065  gamma-glutamyl-gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  44.7 
 
 
498 aa  365  1e-99  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5372  aldehyde dehydrogenase family protein  43.97 
 
 
481 aa  364  2e-99  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.302622  normal  0.199595 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1966  Aldehyde Dehydrogenase  42.58 
 
 
478 aa  364  2e-99  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.57596 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1510  gamma-glutamyl-gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  44.07 
 
 
495 aa  364  2e-99  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2262  aldehyde dehydrogenase  42.58 
 
 
493 aa  363  3e-99  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0085  Aldehyde dehydrogenase (NAD(+))  43.58 
 
 
493 aa  363  3e-99  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5214  betaine-aldehyde dehydrogenase  44.03 
 
 
488 aa  363  3e-99  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01277  gamma-Glu-gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase, NAD(P)H-dependent  43.66 
 
 
495 aa  363  4e-99  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2346  Aldehyde Dehydrogenase  43.66 
 
 
495 aa  363  4e-99  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0952724  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3646  aldehyde dehydrogenase family protein  42.58 
 
 
493 aa  363  4e-99  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.196663 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1415  gamma-glutamyl-gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  43.66 
 
 
495 aa  363  4e-99  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2084  aldehyde dehydrogenase  42.58 
 
 
493 aa  363  4e-99  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01288  hypothetical protein  43.66 
 
 
495 aa  363  4e-99  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2673  aldehyde dehydrogenase family protein  42.37 
 
 
493 aa  363  5.0000000000000005e-99  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0828689  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1536  gamma-glutamyl-gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  43.66 
 
 
495 aa  362  9e-99  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3233  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  42.16 
 
 
493 aa  361  1e-98  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.436611  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2837  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  41.13 
 
 
494 aa  362  1e-98  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000177336 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0847  betaine-aldehyde dehydrogenase  43.86 
 
 
494 aa  361  1e-98  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00938434  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2634  aldehyde dehydrogenase  40.08 
 
 
494 aa  361  2e-98  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2640  aldehyde dehydrogenase  40.92 
 
 
494 aa  361  2e-98  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.198513  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2325  gamma-glutamyl-gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  43.45 
 
 
495 aa  361  2e-98  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1868  Retinal dehydrogenase  41.75 
 
 
492 aa  360  2e-98  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2831  aldehyde dehydrogenase  40.92 
 
 
494 aa  361  2e-98  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.217262  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3431  betaine-aldehyde dehydrogenase  43.51 
 
 
488 aa  360  3e-98  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1822  gamma-glutamyl-gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  43.45 
 
 
495 aa  360  3e-98  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0935717 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4323  aldehyde dehydrogenase  41.93 
 
 
503 aa  360  3e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.181761 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2257  aldehyde dehydrogenase  42.28 
 
 
493 aa  359  6e-98  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1036  aldehyde dehydrogenase  43.16 
 
 
494 aa  359  6e-98  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.922959  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4700  aldehyde dehydrogenase  42.92 
 
 
483 aa  359  7e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0199533 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4086  aldehyde dehydrogenase  43.31 
 
 
488 aa  359  8e-98  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.515709  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2290  betaine-aldehyde dehydrogenase  40.97 
 
 
503 aa  358  9.999999999999999e-98  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.109533 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2860  aldehyde dehydrogenase  40.29 
 
 
494 aa  358  9.999999999999999e-98  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2556  aldehyde dehydrogenase  40.71 
 
 
494 aa  358  9.999999999999999e-98  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.271873  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2882  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  40.5 
 
 
494 aa  358  9.999999999999999e-98  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.198602  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1745  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  42.19 
 
 
498 aa  358  9.999999999999999e-98  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6025  Aldehyde Dehydrogenase  42.83 
 
 
483 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.181581 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2591  aldehyde dehydrogenase  40.5 
 
 
494 aa  358  1.9999999999999998e-97  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0886  Aldehyde Dehydrogenase  40.93 
 
 
473 aa  358  1.9999999999999998e-97  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>