More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECD_01277 on replicon CP001509
Organism: Escherichia coli BL21(DE3)



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009800  EcHS_A1415  gamma-glutamyl-gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  100 
 
 
495 aa  1014    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01277  gamma-Glu-gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase, NAD(P)H-dependent  100 
 
 
495 aa  1014    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2346  Aldehyde Dehydrogenase  100 
 
 
495 aa  1014    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0952724  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2065  gamma-glutamyl-gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  70.68 
 
 
498 aa  736    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1822  gamma-glutamyl-gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  98.59 
 
 
495 aa  1000    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0935717 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1510  gamma-glutamyl-gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  98.38 
 
 
495 aa  999    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1942  gamma-glutamyl-gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  98.38 
 
 
495 aa  1000    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2325  gamma-glutamyl-gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  99.19 
 
 
495 aa  1007    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01288  hypothetical protein  100 
 
 
495 aa  1014    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1536  gamma-glutamyl-gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  98.79 
 
 
495 aa  1003    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2648  aldehyde dehydrogenase  57.87 
 
 
498 aa  584  1.0000000000000001e-165  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.868356  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0227  aldehyde dehydrogenase  58.86 
 
 
499 aa  580  1e-164  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0967  aldehyde dehydrogenase  56.65 
 
 
498 aa  580  1e-164  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.593803  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3021  aldehyde dehydrogenase  56.85 
 
 
498 aa  581  1e-164  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0092  aldehyde dehydrogenase family protein  58.25 
 
 
497 aa  577  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.769215  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5330  aldehyde dehydrogenase  58.86 
 
 
497 aa  575  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0557529 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5278  aldehyde dehydrogenase family protein  58.66 
 
 
497 aa  573  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2372  Betaine-aldehyde dehydrogenase  57.87 
 
 
495 aa  572  1.0000000000000001e-162  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.169396  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5534  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  57.23 
 
 
497 aa  571  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0937134  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5188  aldehyde dehydrogenase  58.86 
 
 
526 aa  574  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.536573  normal  0.0718586 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1187  aldehyde dehydrogenase  56.03 
 
 
498 aa  568  1e-161  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00220575  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1093  aldehyde dehydrogenase  56.03 
 
 
498 aa  568  1e-161  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0180881  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3034  aldehyde dehydrogenase  56.53 
 
 
499 aa  569  1e-161  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.329193  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6087  putative aldehyde dehydrogenase  57.43 
 
 
497 aa  565  1e-160  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0192  aldehyde dehydrogenase  57.64 
 
 
497 aa  566  1e-160  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000810218 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3105  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  56.24 
 
 
498 aa  568  1e-160  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.791112  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3202  Aldehyde Dehydrogenase  56.03 
 
 
498 aa  567  1e-160  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.394681 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1085  aldehyde dehydrogenase  56.24 
 
 
498 aa  567  1e-160  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000455021  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1153  aldehyde dehydrogenase  56.03 
 
 
498 aa  567  1e-160  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00734271  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1045  aldehyde dehydrogenase (NAD(+))  56.28 
 
 
503 aa  567  1e-160  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.154048  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3008  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  56.24 
 
 
498 aa  567  1e-160  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.227807  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3496  aldehyde dehydrogenase  55.21 
 
 
498 aa  561  1.0000000000000001e-159  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48030  aldehyde dehydrogenase (NAD+)  59.71 
 
 
497 aa  564  1.0000000000000001e-159  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70140  putative aldehyde dehydrogenase  57.43 
 
 
497 aa  564  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.643605  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2926  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  56.03 
 
 
498 aa  563  1.0000000000000001e-159  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0937  aldehyde dehydrogenase  55.1 
 
 
499 aa  560  1e-158  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.370684  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0237  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  56.42 
 
 
497 aa  560  1e-158  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1115  aldehyde dehydrogenase  54.77 
 
 
502 aa  551  1e-155  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00211349  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2123  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  56.44 
 
 
496 aa  547  1e-154  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.57663 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1623  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  57.14 
 
 
499 aa  544  1e-153  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.207083  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3527  aldehyde dehydrogenase  54.4 
 
 
495 aa  539  9.999999999999999e-153  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.000694209  normal  0.0931426 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1737  aldehyde dehydrogenase  53.67 
 
 
498 aa  538  9.999999999999999e-153  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000892172 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4933  aldehyde dehydrogenase  53.54 
 
 
497 aa  531  1e-150  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1187  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  54.02 
 
 
509 aa  535  1e-150  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3567  aldehyde dehydrogenase  54.93 
 
 
497 aa  518  1e-146  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1942  aldehyde dehydrogenase family protein  54.93 
 
 
496 aa  521  1e-146  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0945  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  54.53 
 
 
497 aa  520  1e-146  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.587312  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4669  Aldehyde Dehydrogenase  54.12 
 
 
497 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.395716  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2026  aldehyde dehydrogenase family protein  54.53 
 
 
496 aa  514  1e-144  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0642  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  54.53 
 
 
496 aa  514  1e-144  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0734  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  54.53 
 
 
528 aa  514  1e-144  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0834633  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1330  Aldehyde Dehydrogenase  55.65 
 
 
498 aa  508  1e-143  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.174379  normal  0.217301 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7675  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  53.61 
 
 
496 aa  508  1e-143  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.235077  normal  0.331249 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0049  betaine-aldehyde dehydrogenase  52.76 
 
 
505 aa  508  1e-143  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3249  aldehyde dehydrogenase  49.5 
 
 
497 aa  506  9.999999999999999e-143  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0656585 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2872  aldehyde dehydrogenase  50.2 
 
 
496 aa  507  9.999999999999999e-143  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.442211  normal  0.721273 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1869  aldehyde dehydrogenase  53.28 
 
 
496 aa  506  9.999999999999999e-143  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2589  aldehyde dehydrogenase family protein  49.09 
 
 
497 aa  503  1e-141  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.675648  normal  0.340951 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2053  aldehyde dehydrogenase family protein  50.71 
 
 
499 aa  504  1e-141  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1909  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  52.55 
 
 
499 aa  502  1e-141  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.295691 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3127  aldehyde dehydrogenase  48.69 
 
 
497 aa  501  1e-140  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0305  putative aldehyde dehydrogenase  51.32 
 
 
496 aa  494  9.999999999999999e-139  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02680  putative aldehyde dehydrogenase  51.52 
 
 
496 aa  494  9.999999999999999e-139  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.24739 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0566  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  51.33 
 
 
504 aa  493  9.999999999999999e-139  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6339  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  54.33 
 
 
496 aa  491  1e-137  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6073  betaine-aldehyde dehydrogenase  52.81 
 
 
496 aa  490  1e-137  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.972484  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3010  aldehyde dehydrogenase  53.92 
 
 
496 aa  486  1e-136  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2725  aldehyde dehydrogenase  49.27 
 
 
493 aa  485  1e-136  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2376  aldehyde dehydrogenase  53.92 
 
 
496 aa  487  1e-136  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2990  aldehyde dehydrogenase  53.92 
 
 
496 aa  487  1e-136  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3037  aldehyde dehydrogenase  54.33 
 
 
496 aa  482  1e-135  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2900  aldehyde dehydrogenase  54.53 
 
 
496 aa  483  1e-135  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2545  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  50.6 
 
 
511 aa  484  1e-135  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.572579 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2984  aldehyde dehydrogenase  54.33 
 
 
496 aa  483  1e-135  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0298  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  51.94 
 
 
499 aa  480  1e-134  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3859  aldehyde dehydrogenase  49.6 
 
 
497 aa  473  1e-132  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6645  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  50.2 
 
 
501 aa  475  1e-132  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.217332  normal  0.0894525 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0356  aldehyde dehydrogenase  51.66 
 
 
489 aa  469  1.0000000000000001e-131  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.69961  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3955  aldehyde dehydrogenase  49.49 
 
 
495 aa  465  9.999999999999999e-131  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.768123  normal  0.683477 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4432  Aldehyde Dehydrogenase  50.84 
 
 
492 aa  462  1e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0316709  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1741  betaine-aldehyde dehydrogenase  51.66 
 
 
504 aa  459  9.999999999999999e-129  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0495652  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1171  aldehyde dehydrogenase family protein  51.05 
 
 
492 aa  455  1e-127  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.304276  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1074  gamma-glutamyl-gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  51.05 
 
 
492 aa  455  1e-127  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.178667  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6864  aldehyde dehydrogenase  47.05 
 
 
497 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0403228  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1371  aldehyde dehydrogenase  47.36 
 
 
500 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0762191 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3533  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  48.16 
 
 
495 aa  449  1e-125  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.185726  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3507  aldehyde dehydrogenase  48.63 
 
 
494 aa  451  1e-125  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.190202  decreased coverage  0.0000753817 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2460  aldehyde dehydrogenase  49.8 
 
 
499 aa  451  1e-125  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.399277  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3176  betaine-aldehyde dehydrogenase  48.16 
 
 
495 aa  449  1e-125  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.762089  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2110  aldehyde dehydrogenase  46.25 
 
 
502 aa  445  1.0000000000000001e-124  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0052069  normal  0.609482 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2836  aldehyde dehydrogenase  48.57 
 
 
495 aa  447  1.0000000000000001e-124  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.123667  normal  0.548421 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5279  Aldehyde Dehydrogenase  45.9 
 
 
505 aa  444  1e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4003  aldehyde dehydrogenase  45.47 
 
 
498 aa  437  1e-121  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4835  Betaine-aldehyde dehydrogenase  46.19 
 
 
505 aa  437  1e-121  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0460635 
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4607  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  46.3 
 
 
505 aa  436  1e-121  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4109  aldehyde dehydrogenase  44.28 
 
 
496 aa  434  1e-120  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4752  aldehyde dehydrogenase  47.12 
 
 
501 aa  431  1e-119  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.33696  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3064  aldehyde dehydrogenase family protein  43.98 
 
 
505 aa  430  1e-119  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0192942  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31630  NAD-dependent aldehyde dehydrogenase  44.76 
 
 
491 aa  429  1e-119  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2504  Aldehyde Dehydrogenase  46.41 
 
 
497 aa  429  1e-119  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.98157  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>