More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_5372 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_5372  aldehyde dehydrogenase family protein  100 
 
 		 481 aa  981    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.302622  normal  0.199595 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001293  aldehyde dehydrogenase  62.79 
 
 		 478 aa  605  9.999999999999999e-173  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0986  betaine-aldehyde dehydrogenase  55.18 
 
 		 481 aa  506  9.999999999999999e-143  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.669194  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2465  Aldehyde Dehydrogenase  44.12 
 
 		 485 aa  390  1e-107  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.146216  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2174  aldehyde dehydrogenase  43.97 
 
 		 479 aa  370  1e-101  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000019217 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0677  aldehyde dehydrogenase  45.57 
 
 		 478 aa  367  1e-100  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.663172  normal  0.354632 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3401  betaine-aldehyde dehydrogenase  43.97 
 
 		 479 aa  364  2e-99  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1561  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  42.19 
 
 		 503 aa  362  8e-99  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1095  Aldehyde Dehydrogenase  42.92 
 
 		 479 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1014  aldehyde dehydrogenase family protein  41.88 
 
 		 497 aa  358  9.999999999999999e-98  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5904  aldehyde dehydrogenase  43.04 
 
 		 482 aa  357  2.9999999999999997e-97  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.474261 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5539  aldehyde dehydrogenase  43.04 
 
 		 482 aa  357  2.9999999999999997e-97  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1286  aldehyde dehydrogenase  41.96 
 
 		 490 aa  353  2.9999999999999997e-96  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2614  aldehyde dehydrogenase  43.41 
 
 		 478 aa  353  5e-96  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2566  Aldehyde Dehydrogenase  43.07 
 
 		 478 aa  352  1e-95  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0956  aldehyde dehydrogenase family protein  41.67 
 
 		 497 aa  351  1e-95  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2161  Aldehyde Dehydrogenase  42.86 
 
 		 478 aa  350  3e-95  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.046835  normal  0.828531 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1974  NAD-dependent aldehyde dehydrogenase  43.43 
 
 		 486 aa  347  2e-94  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.489378  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2350  aldehyde dehydrogenase  42.83 
 
 		 478 aa  346  6e-94  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.944535  normal  0.84057 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4196  Aldehyde Dehydrogenase  40.72 
 
 		 483 aa  343  2.9999999999999997e-93  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.115052  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5745  aldehyde dehydrogenase  43.34 
 
 		 479 aa  343  5e-93  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0583119  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2422  aldehyde dehydrogenase  42.92 
 
 		 479 aa  340  2e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.283723 
 
 
-
 
NC_006691  CNF03900  aldehyde dehydrogenase (alddh), putative  39.58 
 
 		 506 aa  341  2e-92  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2418  aldehyde dehydrogenase  42.71 
 
 		 479 aa  339  8e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1806  aldehyde dehydrogenase  42.71 
 
 		 479 aa  339  8e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0877  aldehyde dehydrogenase family protein  43.55 
 
 		 479 aa  338  9e-92  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.928456  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0874  aldehyde dehydrogenase  43.34 
 
 		 479 aa  337  3.9999999999999995e-91  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.476262  normal  0.570338 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0847  betaine-aldehyde dehydrogenase  40.93 
 
 		 494 aa  336  5e-91  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00938434  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1966  Aldehyde Dehydrogenase  41.54 
 
 		 477 aa  335  1e-90  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.150614  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1083  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  42.49 
 
 		 479 aa  334  2e-90  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3006  aldehyde dehydrogenase family protein  42.49 
 
 		 479 aa  334  2e-90  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0735  aldehyde dehydrogenase family protein  42.49 
 
 		 479 aa  334  2e-90  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1591  aldehyde dehydrogenase family protein  42.49 
 
 		 479 aa  334  2e-90  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2278  aldehyde dehydrogenase family protein  42.49 
 
 		 479 aa  334  2e-90  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2664  aldehyde dehydrogenase  41.92 
 
 		 480 aa  335  2e-90  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0216707  normal  0.214781 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1235  aldehyde dehydrogenase family protein  42.49 
 
 		 479 aa  333  3e-90  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1756  aldehyde dehydrogenase  41.59 
 
 		 477 aa  333  3e-90  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0603102  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4500  aldehyde dehydrogenase  41.98 
 
 		 496 aa  333  4e-90  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.947339  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1077  NAD-dependent aldehyde dehydrogenases  42.49 
 
 		 479 aa  333  5e-90  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2837  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  38.05 
 
 		 494 aa  332  8e-90  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000177336 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2640  aldehyde dehydrogenase  38.05 
 
 		 494 aa  332  1e-89  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.198513  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2344  Aldehyde Dehydrogenase  41.14 
 
 		 477 aa  331  1e-89  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.754482  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3759  Aldehyde Dehydrogenase  38.54 
 
 		 490 aa  332  1e-89  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.304272 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2831  aldehyde dehydrogenase  38.05 
 
 		 494 aa  332  1e-89  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.217262  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3585  betaine-aldehyde dehydrogenase  39.53 
 
 		 477 aa  332  1e-89  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.863463  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2556  aldehyde dehydrogenase  37.84 
 
 		 494 aa  331  2e-89  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.271873  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2843  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  37.97 
 
 		 494 aa  331  2e-89  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.128159  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2450  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  37.97 
 
 		 494 aa  330  2e-89  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2860  aldehyde dehydrogenase  37.84 
 
 		 494 aa  330  4e-89  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2463  aldehyde dehydrogenase  43.34 
 
 		 479 aa  330  4e-89  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.32545  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2328  aldehyde dehydrogenase  43.34 
 
 		 479 aa  330  4e-89  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2882  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  37.84 
 
 		 494 aa  329  5.0000000000000004e-89  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.198602  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2591  aldehyde dehydrogenase  37.63 
 
 		 494 aa  329  7e-89  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1480  aldehyde dehydrogenase  38.99 
 
 		 490 aa  328  9e-89  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0515859  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2634  aldehyde dehydrogenase  36.89 
 
 		 494 aa  328  1.0000000000000001e-88  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2290  aldehyde dehydrogenase  39.67 
 
 		 486 aa  327  3e-88  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.176448  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1948  benzaldehyde dehydrogenase  39.71 
 
 		 492 aa  325  1e-87  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000544418 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6025  Aldehyde Dehydrogenase  40.85 
 
 		 483 aa  323  3e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.181581 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1381  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  40.38 
 
 		 496 aa  324  3e-87  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.514457 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4655  betaine-aldehyde dehydrogenase  42.22 
 
 		 505 aa  323  3e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.402279  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3713  betaine-aldehyde dehydrogenase  42.22 
 
 		 505 aa  323  3e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.448124  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1251  Aldehyde Dehydrogenase  42.68 
 
 		 480 aa  323  4e-87  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.019286 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4591  Betaine-aldehyde dehydrogenase  37.87 
 
 		 486 aa  323  5e-87  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5649  aldehyde dehydrogenase  42.22 
 
 		 505 aa  323  6e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.327669 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4882  aldehyde dehydrogenase  41.16 
 
 		 477 aa  321  1.9999999999999998e-86  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.895119  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2837  Aldehyde Dehydrogenase  36.59 
 
 		 502 aa  320  1.9999999999999998e-86  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4984  aldehyde dehydrogenase  42.09 
 
 		 503 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.355806  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1357  aldehyde dehydrogenase  41.68 
 
 		 487 aa  320  3e-86  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0886  Aldehyde Dehydrogenase  37.76 
 
 		 473 aa  319  7e-86  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3004  aldehyde dehydrogenase  40.26 
 
 		 477 aa  318  1e-85  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.638791  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4700  aldehyde dehydrogenase  39.34 
 
 		 483 aa  318  1e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0199533 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0091  betaine-aldehyde dehydrogenase  41.24 
 
 		 482 aa  317  2e-85  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1535  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  38.77 
 
 		 493 aa  317  3e-85  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.31089  normal  0.378909 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1276  aldehyde dehydrogenase  36.4 
 
 		 497 aa  317  3e-85  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.420346  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5622  aldehyde dehydrogenase  38.7 
 
 		 488 aa  316  6e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.216133 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5628  aldehyde dehydrogenase  41 
 
 		 505 aa  316  7e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.439175  normal  0.0149056 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2862  Aldehyde Dehydrogenase  39.35 
 
 		 505 aa  314  1.9999999999999998e-84  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0096  betaine aldehyde dehydrogenase  37.21 
 
 		 491 aa  314  1.9999999999999998e-84  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1556  Retinal dehydrogenase  38.08 
 
 		 490 aa  315  1.9999999999999998e-84  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2487  aldehyde dehydrogenase family protein  38.16 
 
 		 503 aa  313  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2476  aldehyde dehydrogenase  37.21 
 
 		 497 aa  314  2.9999999999999996e-84  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.124158  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1430  aldehyde dehydrogenase  41.88 
 
 		 487 aa  314  2.9999999999999996e-84  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5845  betaine-aldehyde dehydrogenase  41.56 
 
 		 505 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.924295  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0776  betaine-aldehyde dehydrogenase  39.87 
 
 		 481 aa  313  5.999999999999999e-84  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.141721  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0292  hypothetical protein  37.76 
 
 		 488 aa  312  6.999999999999999e-84  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1254  aldehyde dehydrogenase  40.62 
 
 		 481 aa  312  7.999999999999999e-84  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0744  Betaine-aldehyde dehydrogenase  39.08 
 
 		 496 aa  311  2e-83  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0308  hypothetical protein  37.34 
 
 		 488 aa  311  2e-83  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3176  aldehyde dehydrogenase  37.18 
 
 		 490 aa  310  2.9999999999999997e-83  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000139941  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3841  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  41.16 
 
 		 508 aa  310  4e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.829655 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0515  aldehyde dehydrogenase  43 
 
 		 511 aa  310  4e-83  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.423959  normal  0.408285 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2599  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  37 
 
 		 490 aa  310  5e-83  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.225795  normal  0.197804 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2257  aldehyde dehydrogenase  38.69 
 
 		 493 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2177  betaine aldehyde dehydrogenase  35.76 
 
 		 496 aa  307  2.0000000000000002e-82  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6130  Betaine-aldehyde dehydrogenase  37.95 
 
 		 492 aa  308  2.0000000000000002e-82  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0958  aldehyde dehydrogenase  36.84 
 
 		 492 aa  307  2.0000000000000002e-82  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.938749  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1868  Retinal dehydrogenase  38.99 
 
 		 492 aa  307  2.0000000000000002e-82  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2260  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  40.62 
 
 		 484 aa  308  2.0000000000000002e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1745  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  37.42 
 
 		 498 aa  308  2.0000000000000002e-82  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3646  aldehyde dehydrogenase family protein  38.69 
 
 		 493 aa  307  3e-82  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.196663 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>