More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_0515 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_0515  aldehyde dehydrogenase  100 
 
 		 511 aa  1035    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.423959  normal  0.408285 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4827  aldehyde dehydrogenase  67.94 
 
 		 512 aa  603  1.0000000000000001e-171  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.422195 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5649  aldehyde dehydrogenase  59.76 
 
 		 505 aa  578  1e-164  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.327669 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4655  betaine-aldehyde dehydrogenase  59.56 
 
 		 505 aa  577  1.0000000000000001e-163  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.402279  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3713  betaine-aldehyde dehydrogenase  59.56 
 
 		 505 aa  577  1.0000000000000001e-163  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.448124  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4984  aldehyde dehydrogenase  59.43 
 
 		 503 aa  565  1e-160  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.355806  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5628  aldehyde dehydrogenase  58.95 
 
 		 505 aa  558  1e-158  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.439175  normal  0.0149056 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3524  aldehyde dehydrogenase  55.29 
 
 		 505 aa  560  1e-158  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00723314  normal  0.875866 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5845  betaine-aldehyde dehydrogenase  58.95 
 
 		 505 aa  560  1e-158  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.924295  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5124  putative aldehyde dehydrogenase family protein  58.9 
 
 		 509 aa  544  1e-153  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.982748  normal  0.331095 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1881  aldehyde dehydrogenase family protein  55.29 
 
 		 505 aa  541  9.999999999999999e-153  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0365503  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1706  betaine-aldehyde dehydrogenase  59.67 
 
 		 519 aa  539  9.999999999999999e-153  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.615626  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6374  betaine-aldehyde dehydrogenase  53.58 
 
 		 503 aa  530  1e-149  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5279  aldehyde dehydrogenase  52.59 
 
 		 503 aa  523  1e-147  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5499  Aldehyde Dehydrogenase  60.59 
 
 		 509 aa  517  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.333371  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3333  Aldehyde Dehydrogenase  49.47 
 
 		 515 aa  433  1e-120  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1745  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  43.9 
 
 		 498 aa  431  1e-119  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3592  aldehyde dehydrogenase  50.11 
 
 		 515 aa  420  1e-116  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5622  aldehyde dehydrogenase  43.56 
 
 		 488 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.216133 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0085  Aldehyde dehydrogenase (NAD(+))  43.71 
 
 		 493 aa  400  9.999999999999999e-111  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3909  gamma-glutamyl-gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  43.76 
 
 		 487 aa  396  1e-109  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6072  aldehyde dehydrogenase  42.08 
 
 		 488 aa  395  1e-108  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4086  aldehyde dehydrogenase  41.88 
 
 		 488 aa  394  1e-108  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.515709  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5214  betaine-aldehyde dehydrogenase  43.07 
 
 		 488 aa  393  1e-108  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3431  betaine-aldehyde dehydrogenase  41.88 
 
 		 488 aa  394  1e-108  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2738  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  41.67 
 
 		 488 aa  392  1e-107  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.525641  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6789  Aldehyde Dehydrogenase  44.19 
 
 		 495 aa  389  1e-107  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.772669  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3376  aldehyde dehydrogenase  43.29 
 
 		 488 aa  391  1e-107  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.399948  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1164  betaine-aldehyde dehydrogenase  41.45 
 
 		 512 aa  388  1e-106  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.278559  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1250  aldehyde dehydrogenase  43.57 
 
 		 503 aa  386  1e-106  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.790003 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2407  aldehyde dehydrogenase  42.22 
 
 		 493 aa  382  1e-105  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.830868  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6130  Betaine-aldehyde dehydrogenase  43.43 
 
 		 492 aa  383  1e-105  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2673  aldehyde dehydrogenase family protein  42 
 
 		 493 aa  382  1e-104  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0828689  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2213  aldehyde dehydrogenase  42.92 
 
 		 490 aa  380  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.00475065  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1480  aldehyde dehydrogenase  39.96 
 
 		 490 aa  382  1e-104  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0515859  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4075  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  45.76 
 
 		 496 aa  380  1e-104  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.234292 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3646  aldehyde dehydrogenase family protein  42.22 
 
 		 493 aa  378  1e-103  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.196663 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2262  aldehyde dehydrogenase  42.22 
 
 		 493 aa  377  1e-103  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3233  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  41.63 
 
 		 493 aa  377  1e-103  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.436611  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4700  aldehyde dehydrogenase  42.74 
 
 		 483 aa  378  1e-103  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0199533 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3439  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  41.79 
 
 		 493 aa  377  1e-103  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.383483  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1655  aldehyde dehydrogenase (NAD)  38.4 
 
 		 494 aa  374  1e-102  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0330388 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6025  Aldehyde Dehydrogenase  44.95 
 
 		 483 aa  372  1e-102  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.181581 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2882  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  39.4 
 
 		 494 aa  372  1e-102  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.198602  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2634  aldehyde dehydrogenase  39 
 
 		 494 aa  372  1e-102  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2860  aldehyde dehydrogenase  39.6 
 
 		 494 aa  375  1e-102  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3569  aldehyde dehydrogenase  38.4 
 
 		 494 aa  372  1e-102  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4941  betaine-aldehyde dehydrogenase  41.08 
 
 		 498 aa  372  1e-102  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4697  aldehyde dehydrogenase  40.46 
 
 		 496 aa  374  1e-102  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.754003  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2640  aldehyde dehydrogenase  39.4 
 
 		 494 aa  372  1e-102  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.198513  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3348  aldehyde dehydrogenase  38.6 
 
 		 494 aa  374  1e-102  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0219223  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2591  aldehyde dehydrogenase  39.4 
 
 		 494 aa  374  1e-102  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3313  aldehyde dehydrogenase  38.6 
 
 		 494 aa  374  1e-102  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3263  aldehyde dehydrogenase  38.6 
 
 		 494 aa  374  1e-102  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2084  aldehyde dehydrogenase  42 
 
 		 493 aa  375  1e-102  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2843  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  39 
 
 		 494 aa  373  1e-102  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.128159  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3662  aldehyde dehydrogenase (NAD)  38.4 
 
 		 494 aa  373  1e-102  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2257  aldehyde dehydrogenase  41.58 
 
 		 493 aa  373  1e-102  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2837  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  39.2 
 
 		 494 aa  372  1e-102  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000177336 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2831  aldehyde dehydrogenase  39.4 
 
 		 494 aa  372  1e-102  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.217262  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3609  aldehyde dehydrogenase  38.6 
 
 		 494 aa  374  1e-102  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3562  aldehyde dehydrogenase (NAD)  38.6 
 
 		 494 aa  374  1e-102  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00134581 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1006  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  42.67 
 
 		 491 aa  372  1e-102  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.179638  normal  0.457717 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3257  aldehyde dehydrogenase  38.2 
 
 		 494 aa  374  1e-102  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.536879  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2260  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  45.99 
 
 		 484 aa  375  1e-102  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2450  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  39.2 
 
 		 494 aa  375  1e-102  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2229  aldehyde dehydrogenase  38.8 
 
 		 494 aa  374  1e-102  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.545234  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1147  betaine aldehyde dehydrogenase  43.43 
 
 		 488 aa  371  1e-101  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2556  aldehyde dehydrogenase  39.2 
 
 		 494 aa  371  1e-101  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.271873  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2837  Aldehyde Dehydrogenase  41.82 
 
 		 502 aa  370  1e-101  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3577  betaine-aldehyde dehydrogenase  40.55 
 
 		 491 aa  370  1e-101  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.162462  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2862  Aldehyde Dehydrogenase  42.53 
 
 		 505 aa  369  1e-101  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3759  Aldehyde Dehydrogenase  41.29 
 
 		 490 aa  369  1e-101  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.304272 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1556  Retinal dehydrogenase  42.15 
 
 		 490 aa  371  1e-101  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6088  aldehyde dehydrogenase  41.21 
 
 		 487 aa  369  1e-101  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2720  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  42.83 
 
 		 496 aa  369  1e-101  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.133505  normal  0.10056 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1381  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  41.34 
 
 		 496 aa  372  1e-101  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.514457 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0804  aldehyde dehydrogenase  44.86 
 
 		 500 aa  370  1e-101  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0886  Aldehyde Dehydrogenase  40.38 
 
 		 473 aa  370  1e-101  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0292  hypothetical protein  40.08 
 
 		 488 aa  367  1e-100  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2290  betaine-aldehyde dehydrogenase  41.05 
 
 		 503 aa  366  1e-100  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.109533 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3685  betaine-aldehyde dehydrogenase  40.17 
 
 		 495 aa  367  1e-100  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.236919  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1868  Retinal dehydrogenase  41.97 
 
 		 492 aa  368  1e-100  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4856  aldehyde dehydrogenase  43.5 
 
 		 483 aa  368  1e-100  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.263653  normal  0.221142 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2504  Aldehyde Dehydrogenase  40.38 
 
 		 497 aa  367  1e-100  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.98157  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6251  aldehyde dehydrogenase  39.75 
 
 		 487 aa  366  1e-100  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.392289 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2487  aldehyde dehydrogenase family protein  41.49 
 
 		 503 aa  365  1e-99  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0158  aldehyde dehydrogenase  38.4 
 
 		 495 aa  364  2e-99  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4241  aldehyde dehydrogenase  39.54 
 
 		 498 aa  364  2e-99  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0153  aldehyde dehydrogenase  38.4 
 
 		 495 aa  364  2e-99  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18440  Aldehyde dehydrogenase family protein  40.12 
 
 		 499 aa  363  4e-99  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.931316  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0308  hypothetical protein  39.87 
 
 		 488 aa  363  5.0000000000000005e-99  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5435  aldehyde dehydrogenase  43.71 
 
 		 504 aa  362  7.0000000000000005e-99  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.846738  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5173  Aldehyde Dehydrogenase  42.11 
 
 		 503 aa  361  1e-98  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1004  betaine-aldehyde dehydrogenase  39.08 
 
 		 492 aa  359  7e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.460845  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3841  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  42.19 
 
 		 508 aa  359  8e-98  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.829655 
 
 
-
 
NC_006691  CNF03900  aldehyde dehydrogenase (alddh), putative  41.81 
 
 		 506 aa  358  9.999999999999999e-98  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3599  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  42.37 
 
 		 496 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.152099  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6123  aldehyde dehydrogenase  42.82 
 
 		 493 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4323  aldehyde dehydrogenase  39.58 
 
 		 503 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.181761 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>