More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_5845 on replicon NC_008392
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010557  BamMC406_5628  aldehyde dehydrogenase  98.22 
 
 		 505 aa  994    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.439175  normal  0.0149056 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4655  betaine-aldehyde dehydrogenase  97.62 
 
 		 505 aa  970    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.402279  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6374  betaine-aldehyde dehydrogenase  67.94 
 
 		 503 aa  689    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5279  aldehyde dehydrogenase  67.94 
 
 		 503 aa  680    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5499  Aldehyde Dehydrogenase  73.47 
 
 		 509 aa  642    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.333371  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4984  aldehyde dehydrogenase  81.33 
 
 		 503 aa  807    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.355806  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5124  putative aldehyde dehydrogenase family protein  69.37 
 
 		 509 aa  661    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.982748  normal  0.331095 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3713  betaine-aldehyde dehydrogenase  97.62 
 
 		 505 aa  970    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.448124  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5649  aldehyde dehydrogenase  97.43 
 
 		 505 aa  967    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.327669 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5845  betaine-aldehyde dehydrogenase  100 
 
 		 505 aa  1015    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.924295  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3524  aldehyde dehydrogenase  58.84 
 
 		 505 aa  600  1e-170  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00723314  normal  0.875866 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1881  aldehyde dehydrogenase family protein  60 
 
 		 505 aa  576  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0365503  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0515  aldehyde dehydrogenase  58.95 
 
 		 511 aa  567  1e-160  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.423959  normal  0.408285 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1706  betaine-aldehyde dehydrogenase  59.59 
 
 		 519 aa  540  9.999999999999999e-153  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.615626  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4827  aldehyde dehydrogenase  60.64 
 
 		 512 aa  518  1e-146  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.422195 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3333  Aldehyde Dehydrogenase  53.83 
 
 		 515 aa  471  1.0000000000000001e-131  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3592  aldehyde dehydrogenase  53.21 
 
 		 515 aa  450  1e-125  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2738  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  45.95 
 
 		 488 aa  409  1e-113  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.525641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1745  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  43.76 
 
 		 498 aa  406  1.0000000000000001e-112  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3376  aldehyde dehydrogenase  46.06 
 
 		 488 aa  402  1e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.399948  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4086  aldehyde dehydrogenase  44.91 
 
 		 488 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.515709  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3431  betaine-aldehyde dehydrogenase  44.91 
 
 		 488 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0085  Aldehyde dehydrogenase (NAD(+))  49.3 
 
 		 493 aa  402  9.999999999999999e-111  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5214  betaine-aldehyde dehydrogenase  44.7 
 
 		 488 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6072  aldehyde dehydrogenase  45.44 
 
 		 488 aa  396  1e-109  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6130  Betaine-aldehyde dehydrogenase  44.35 
 
 		 492 aa  396  1e-109  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5622  aldehyde dehydrogenase  43.45 
 
 		 488 aa  394  1e-108  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.216133 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2504  Aldehyde Dehydrogenase  44.73 
 
 		 497 aa  392  1e-108  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.98157  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2262  aldehyde dehydrogenase  44.4 
 
 		 493 aa  391  1e-107  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3348  aldehyde dehydrogenase  41.53 
 
 		 494 aa  389  1e-107  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0219223  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3313  aldehyde dehydrogenase  41.53 
 
 		 494 aa  389  1e-107  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3263  aldehyde dehydrogenase  41.53 
 
 		 494 aa  389  1e-107  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3257  aldehyde dehydrogenase  41.53 
 
 		 494 aa  390  1e-107  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.536879  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3662  aldehyde dehydrogenase (NAD)  41.53 
 
 		 494 aa  389  1e-107  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3562  aldehyde dehydrogenase (NAD)  41.53 
 
 		 494 aa  389  1e-107  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00134581 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2257  aldehyde dehydrogenase  43.98 
 
 		 493 aa  389  1e-107  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3609  aldehyde dehydrogenase  41.53 
 
 		 494 aa  389  1e-107  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2229  aldehyde dehydrogenase  41.73 
 
 		 494 aa  389  1e-107  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.545234  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1164  betaine-aldehyde dehydrogenase  42.27 
 
 		 512 aa  389  1e-107  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.278559  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1655  aldehyde dehydrogenase (NAD)  41.73 
 
 		 494 aa  390  1e-107  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0330388 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3646  aldehyde dehydrogenase family protein  43.98 
 
 		 493 aa  386  1e-106  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.196663 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3569  aldehyde dehydrogenase  41.73 
 
 		 494 aa  388  1e-106  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2084  aldehyde dehydrogenase  43.98 
 
 		 493 aa  384  1e-105  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0886  Aldehyde Dehydrogenase  43.86 
 
 		 473 aa  384  1e-105  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2673  aldehyde dehydrogenase family protein  42.95 
 
 		 493 aa  384  1e-105  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0828689  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1556  Retinal dehydrogenase  44.06 
 
 		 490 aa  384  1e-105  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2407  aldehyde dehydrogenase  42.95 
 
 		 493 aa  384  1e-105  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.830868  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3909  gamma-glutamyl-gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  45.99 
 
 		 487 aa  382  1e-105  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4941  betaine-aldehyde dehydrogenase  41.54 
 
 		 498 aa  380  1e-104  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1480  aldehyde dehydrogenase  41.18 
 
 		 490 aa  381  1e-104  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0515859  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1966  Aldehyde Dehydrogenase  42.98 
 
 		 478 aa  379  1e-104  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.57596 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3233  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  42.53 
 
 		 493 aa  376  1e-103  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.436611  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3439  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  42.32 
 
 		 493 aa  377  1e-103  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.383483  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2591  aldehyde dehydrogenase  41.26 
 
 		 494 aa  372  1e-102  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2213  aldehyde dehydrogenase  42.92 
 
 		 490 aa  372  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.00475065  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2450  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  41.05 
 
 		 494 aa  373  1e-102  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2843  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  41.26 
 
 		 494 aa  372  1e-101  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.128159  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2640  aldehyde dehydrogenase  41.05 
 
 		 494 aa  370  1e-101  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.198513  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2556  aldehyde dehydrogenase  41.05 
 
 		 494 aa  370  1e-101  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.271873  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF03900  aldehyde dehydrogenase (alddh), putative  41.09 
 
 		 506 aa  372  1e-101  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2837  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  40.84 
 
 		 494 aa  369  1e-101  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000177336 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2831  aldehyde dehydrogenase  41.05 
 
 		 494 aa  370  1e-101  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.217262  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2634  aldehyde dehydrogenase  41.05 
 
 		 494 aa  370  1e-101  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1250  aldehyde dehydrogenase  46.53 
 
 		 503 aa  371  1e-101  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.790003 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0744  Betaine-aldehyde dehydrogenase  42.33 
 
 		 496 aa  369  1e-101  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2599  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  42.98 
 
 		 490 aa  370  1e-101  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.225795  normal  0.197804 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3759  Aldehyde Dehydrogenase  43.41 
 
 		 490 aa  372  1e-101  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.304272 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4697  aldehyde dehydrogenase  39.79 
 
 		 496 aa  369  1e-101  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.754003  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2860  aldehyde dehydrogenase  40.84 
 
 		 494 aa  369  1e-100  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0292  hypothetical protein  41.21 
 
 		 488 aa  365  1e-100  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1493  aldehyde dehydrogenase family protein  42.65 
 
 		 488 aa  366  1e-100  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1868  Retinal dehydrogenase  44.16 
 
 		 492 aa  368  1e-100  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6789  Aldehyde Dehydrogenase  44.47 
 
 		 495 aa  368  1e-100  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.772669  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1381  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  43.76 
 
 		 496 aa  367  1e-100  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.514457 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2882  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  41.05 
 
 		 494 aa  368  1e-100  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.198602  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0308  hypothetical protein  41 
 
 		 488 aa  363  4e-99  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5587  Aldehyde Dehydrogenase  41.08 
 
 		 487 aa  363  4e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.347373  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6088  aldehyde dehydrogenase  41.94 
 
 		 487 aa  362  7.0000000000000005e-99  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4856  aldehyde dehydrogenase  42.43 
 
 		 483 aa  362  8e-99  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.263653  normal  0.221142 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6546  Betaine-aldehyde dehydrogenase  40.87 
 
 		 487 aa  362  1e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.173146  normal  0.885428 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6251  aldehyde dehydrogenase  40.87 
 
 		 487 aa  360  2e-98  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.392289 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2720  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  42.74 
 
 		 496 aa  360  4e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.133505  normal  0.10056 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0804  aldehyde dehydrogenase  45.41 
 
 		 500 aa  359  5e-98  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1527  transposase, IS605 OrfB family  45.52 
 
 		 421 aa  360  5e-98  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2710  betaine aldehyde dehydrogenase  43.08 
 
 		 487 aa  359  6e-98  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4323  aldehyde dehydrogenase  39.75 
 
 		 503 aa  359  7e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.181761 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4075  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  47.06 
 
 		 496 aa  358  9e-98  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.234292 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6025  Aldehyde Dehydrogenase  42.86 
 
 		 483 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.181581 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5505  Aldehyde Dehydrogenase  41.15 
 
 		 504 aa  357  1.9999999999999998e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000574808 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2605  aldehyde dehydrogenase  42.04 
 
 		 494 aa  356  6.999999999999999e-97  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000129908  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18440  Aldehyde dehydrogenase family protein  39.71 
 
 		 499 aa  355  1e-96  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.931316  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2290  betaine-aldehyde dehydrogenase  40 
 
 		 503 aa  353  2.9999999999999997e-96  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.109533 
 
 
-
 
NC_006686  CND02060  Aldehyde dehydrogenase (ALDDH), putative  41.95 
 
 		 495 aa  353  4e-96  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4241  aldehyde dehydrogenase  39.83 
 
 		 498 aa  353  4e-96  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1535  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  41.49 
 
 		 493 aa  353  4e-96  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.31089  normal  0.378909 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00554  Aldehyde dehydrogenase (ALDDH)(ALDH)(EC 1.2.1.3) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P08157]  42.16 
 
 		 497 aa  353  5e-96  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.534945  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4824  aldehyde dehydrogenase  41.61 
 
 		 492 aa  353  5e-96  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.00512486  normal  0.364288 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2260  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  44.76 
 
 		 484 aa  352  5.9999999999999994e-96  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2487  aldehyde dehydrogenase family protein  39.75 
 
 		 503 aa  352  8e-96  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3577  betaine-aldehyde dehydrogenase  40.97 
 
 		 491 aa  351  1e-95  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.162462  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>