More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_1881 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004578  PSPTO_1881  aldehyde dehydrogenase family protein  100 
 
 
505 aa  1031    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0365503  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3524  aldehyde dehydrogenase  96.04 
 
 
505 aa  996    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00723314  normal  0.875866 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5124  putative aldehyde dehydrogenase family protein  61.29 
 
 
509 aa  593  1e-168  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.982748  normal  0.331095 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5649  aldehyde dehydrogenase  60.21 
 
 
505 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.327669 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4655  betaine-aldehyde dehydrogenase  60 
 
 
505 aa  584  1.0000000000000001e-165  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.402279  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3713  betaine-aldehyde dehydrogenase  60 
 
 
505 aa  584  1.0000000000000001e-165  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.448124  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4984  aldehyde dehydrogenase  59.88 
 
 
503 aa  579  1e-164  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.355806  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5845  betaine-aldehyde dehydrogenase  60 
 
 
505 aa  571  1.0000000000000001e-162  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.924295  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5628  aldehyde dehydrogenase  60.21 
 
 
505 aa  570  1e-161  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.439175  normal  0.0149056 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5499  Aldehyde Dehydrogenase  63.08 
 
 
509 aa  566  1e-160  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.333371  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5279  aldehyde dehydrogenase  55.44 
 
 
503 aa  551  1e-155  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6374  betaine-aldehyde dehydrogenase  54.64 
 
 
503 aa  544  1e-153  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0515  aldehyde dehydrogenase  55.29 
 
 
511 aa  539  9.999999999999999e-153  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.423959  normal  0.408285 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1706  betaine-aldehyde dehydrogenase  56.26 
 
 
519 aa  515  1.0000000000000001e-145  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.615626  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4827  aldehyde dehydrogenase  58.35 
 
 
512 aa  493  9.999999999999999e-139  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.422195 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3333  Aldehyde Dehydrogenase  48.28 
 
 
515 aa  420  1e-116  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3592  aldehyde dehydrogenase  48.28 
 
 
515 aa  407  1.0000000000000001e-112  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2407  aldehyde dehydrogenase  45.43 
 
 
493 aa  403  1e-111  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.830868  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2673  aldehyde dehydrogenase family protein  44.99 
 
 
493 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0828689  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5622  aldehyde dehydrogenase  42.8 
 
 
488 aa  402  9.999999999999999e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.216133 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3646  aldehyde dehydrogenase family protein  45.01 
 
 
493 aa  396  1e-109  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.196663 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3909  gamma-glutamyl-gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  43.89 
 
 
487 aa  396  1e-109  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2084  aldehyde dehydrogenase  45.23 
 
 
493 aa  395  1e-109  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2262  aldehyde dehydrogenase  44.79 
 
 
493 aa  396  1e-109  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5214  betaine-aldehyde dehydrogenase  42.8 
 
 
488 aa  394  1e-108  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2257  aldehyde dehydrogenase  45.01 
 
 
493 aa  395  1e-108  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3233  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  44.12 
 
 
493 aa  390  1e-107  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.436611  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2738  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  42.53 
 
 
488 aa  391  1e-107  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.525641  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3431  betaine-aldehyde dehydrogenase  42.11 
 
 
488 aa  389  1e-107  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3376  aldehyde dehydrogenase  42.71 
 
 
488 aa  391  1e-107  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.399948  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3439  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  43.88 
 
 
493 aa  391  1e-107  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.383483  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6072  aldehyde dehydrogenase  42.28 
 
 
488 aa  389  1e-107  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4086  aldehyde dehydrogenase  42.11 
 
 
488 aa  388  1e-106  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.515709  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6130  Betaine-aldehyde dehydrogenase  42.29 
 
 
492 aa  386  1e-106  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1004  betaine-aldehyde dehydrogenase  41.93 
 
 
492 aa  379  1e-104  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.460845  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1745  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  42.5 
 
 
498 aa  380  1e-104  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1164  betaine-aldehyde dehydrogenase  41.14 
 
 
512 aa  379  1e-103  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.278559  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0183  betaine-aldehyde dehydrogenase  42.37 
 
 
499 aa  372  1e-102  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.352909  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7067  Aldehyde Dehydrogenase  42.58 
 
 
496 aa  374  1e-102  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.340689  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3569  aldehyde dehydrogenase  41.83 
 
 
494 aa  369  1e-101  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3257  aldehyde dehydrogenase  41.61 
 
 
494 aa  370  1e-101  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.536879  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1006  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  41.08 
 
 
491 aa  370  1e-101  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.179638  normal  0.457717 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3562  aldehyde dehydrogenase (NAD)  41.83 
 
 
494 aa  367  1e-100  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00134581 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3662  aldehyde dehydrogenase (NAD)  41.4 
 
 
494 aa  367  1e-100  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1655  aldehyde dehydrogenase (NAD)  41.4 
 
 
494 aa  367  1e-100  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0330388 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1556  Retinal dehydrogenase  43.27 
 
 
490 aa  367  1e-100  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3348  aldehyde dehydrogenase  41.83 
 
 
494 aa  367  1e-100  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0219223  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3313  aldehyde dehydrogenase  41.83 
 
 
494 aa  367  1e-100  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3263  aldehyde dehydrogenase  41.83 
 
 
494 aa  367  1e-100  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF03900  aldehyde dehydrogenase (alddh), putative  41.14 
 
 
506 aa  366  1e-100  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3759  Aldehyde Dehydrogenase  42.42 
 
 
490 aa  368  1e-100  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.304272 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6025  Aldehyde Dehydrogenase  44.11 
 
 
483 aa  367  1e-100  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.181581 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3609  aldehyde dehydrogenase  41.83 
 
 
494 aa  367  1e-100  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1480  aldehyde dehydrogenase  38.77 
 
 
490 aa  366  1e-100  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0515859  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4700  aldehyde dehydrogenase  43.42 
 
 
483 aa  365  1e-100  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0199533 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2260  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  45.35 
 
 
484 aa  365  1e-99  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0886  Aldehyde Dehydrogenase  40.98 
 
 
473 aa  364  2e-99  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4241  aldehyde dehydrogenase  41.53 
 
 
498 aa  362  6e-99  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4941  betaine-aldehyde dehydrogenase  41.65 
 
 
498 aa  362  8e-99  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4856  aldehyde dehydrogenase  43.88 
 
 
483 aa  361  2e-98  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.263653  normal  0.221142 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0292  hypothetical protein  40.17 
 
 
488 aa  360  4e-98  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3992  betaine-aldehyde dehydrogenase  41.36 
 
 
496 aa  360  4e-98  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.254336  normal  0.0553876 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1381  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  41.61 
 
 
496 aa  359  5e-98  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.514457 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3577  betaine-aldehyde dehydrogenase  43.68 
 
 
491 aa  359  6e-98  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.162462  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2599  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  41.83 
 
 
490 aa  358  9e-98  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.225795  normal  0.197804 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2634  aldehyde dehydrogenase  40.34 
 
 
494 aa  358  9.999999999999999e-98  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4697  aldehyde dehydrogenase  37.98 
 
 
496 aa  358  9.999999999999999e-98  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.754003  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2450  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  40.34 
 
 
494 aa  358  9.999999999999999e-98  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0085  Aldehyde dehydrogenase (NAD(+))  39.57 
 
 
493 aa  358  9.999999999999999e-98  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2860  aldehyde dehydrogenase  40.55 
 
 
494 aa  358  1.9999999999999998e-97  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2843  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  40.34 
 
 
494 aa  357  1.9999999999999998e-97  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.128159  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1493  aldehyde dehydrogenase family protein  42 
 
 
488 aa  358  1.9999999999999998e-97  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2882  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  40.34 
 
 
494 aa  356  6.999999999999999e-97  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.198602  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2229  aldehyde dehydrogenase  40.34 
 
 
494 aa  355  8.999999999999999e-97  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.545234  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1527  transposase, IS605 OrfB family  44.17 
 
 
421 aa  355  1e-96  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1476  betaine aldehyde dehydrogenase  38.4 
 
 
490 aa  355  1e-96  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2640  aldehyde dehydrogenase  40.13 
 
 
494 aa  355  1e-96  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.198513  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2591  aldehyde dehydrogenase  40.13 
 
 
494 aa  355  1e-96  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2556  aldehyde dehydrogenase  40.13 
 
 
494 aa  355  1e-96  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.271873  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0308  hypothetical protein  39.75 
 
 
488 aa  355  1e-96  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2831  aldehyde dehydrogenase  40.13 
 
 
494 aa  355  1e-96  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.217262  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2837  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  39.92 
 
 
494 aa  354  2e-96  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000177336 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4824  aldehyde dehydrogenase  41.27 
 
 
492 aa  353  2.9999999999999997e-96  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.00512486  normal  0.364288 
 
 
-
 
NC_006686  CND02060  Aldehyde dehydrogenase (ALDDH), putative  40.51 
 
 
495 aa  353  2.9999999999999997e-96  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3841  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  42.01 
 
 
508 aa  353  2.9999999999999997e-96  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.829655 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4075  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  43.06 
 
 
496 aa  353  4e-96  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.234292 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1113  betaine-aldehyde dehydrogenase  42.79 
 
 
496 aa  353  5e-96  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.016361  normal  0.253072 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2504  Aldehyde Dehydrogenase  41 
 
 
497 aa  353  5.9999999999999994e-96  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.98157  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4701  betaine-aldehyde dehydrogenase  43.03 
 
 
496 aa  353  5.9999999999999994e-96  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00415207  normal  0.173855 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3666  betaine-aldehyde dehydrogenase  43.03 
 
 
496 aa  353  5.9999999999999994e-96  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6789  Aldehyde Dehydrogenase  42.17 
 
 
495 aa  352  7e-96  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.772669  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6411  aldehyde dehydrogenase  40.04 
 
 
493 aa  351  1e-95  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.599394 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2487  aldehyde dehydrogenase family protein  39.55 
 
 
503 aa  352  1e-95  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18440  Aldehyde dehydrogenase family protein  40.37 
 
 
499 aa  352  1e-95  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.931316  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2720  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  43.17 
 
 
496 aa  351  1e-95  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.133505  normal  0.10056 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5599  betaine-aldehyde dehydrogenase  42.79 
 
 
496 aa  352  1e-95  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0279735  normal  0.51588 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6251  aldehyde dehydrogenase  39.08 
 
 
487 aa  350  2e-95  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.392289 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3685  betaine-aldehyde dehydrogenase  41.15 
 
 
495 aa  351  2e-95  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.236919  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4095  betaine-aldehyde dehydrogenase  40.33 
 
 
496 aa  351  2e-95  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0181544  normal  0.594125 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4560  betaine-aldehyde dehydrogenase  42.55 
 
 
496 aa  349  6e-95  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.288864  hitchhiker  0.00438962 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>