More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_6411 on replicon NC_008392
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008392  Bamb_6411  aldehyde dehydrogenase  100 
 
 
493 aa  1011    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.599394 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6123  aldehyde dehydrogenase  98.78 
 
 
493 aa  999    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6789  Aldehyde Dehydrogenase  58.42 
 
 
495 aa  560  1e-158  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.772669  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6831  aldehyde dehydrogenase  55.38 
 
 
493 aa  549  1e-155  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0174  aldehyde dehydrogenase  57.81 
 
 
493 aa  548  1e-155  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.437593  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4824  aldehyde dehydrogenase  57.4 
 
 
492 aa  548  1e-155  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.00512486  normal  0.364288 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4697  aldehyde dehydrogenase  53.05 
 
 
496 aa  525  1e-148  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.754003  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1164  betaine-aldehyde dehydrogenase  53.25 
 
 
512 aa  523  1e-147  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.278559  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2673  aldehyde dehydrogenase family protein  52.55 
 
 
493 aa  520  1e-146  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0828689  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2720  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  52.67 
 
 
496 aa  518  1e-146  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.133505  normal  0.10056 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4941  betaine-aldehyde dehydrogenase  53.25 
 
 
498 aa  520  1e-146  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2407  aldehyde dehydrogenase  52.34 
 
 
493 aa  518  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.830868  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3233  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  52.75 
 
 
493 aa  516  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.436611  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3646  aldehyde dehydrogenase family protein  52.34 
 
 
493 aa  512  1e-144  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.196663 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2257  aldehyde dehydrogenase  52.14 
 
 
493 aa  514  1e-144  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2084  aldehyde dehydrogenase  52.34 
 
 
493 aa  511  1e-144  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2262  aldehyde dehydrogenase  52.14 
 
 
493 aa  509  1e-143  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3439  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  51.93 
 
 
493 aa  511  1e-143  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.383483  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1006  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  52.36 
 
 
491 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.179638  normal  0.457717 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4075  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  54.49 
 
 
496 aa  497  1e-139  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.234292 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0085  Aldehyde dehydrogenase (NAD(+))  52.35 
 
 
493 aa  487  1e-136  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4323  aldehyde dehydrogenase  47.38 
 
 
503 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.181761 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2290  betaine-aldehyde dehydrogenase  47.26 
 
 
503 aa  464  1e-129  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.109533 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6088  aldehyde dehydrogenase  49.9 
 
 
487 aa  452  1.0000000000000001e-126  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2524  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  47.46 
 
 
509 aa  454  1.0000000000000001e-126  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.70277  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1250  aldehyde dehydrogenase  49.18 
 
 
503 aa  444  1e-123  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.790003 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6251  aldehyde dehydrogenase  48.68 
 
 
487 aa  440  9.999999999999999e-123  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.392289 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4156  aldehyde dehydrogenase  45.45 
 
 
487 aa  439  9.999999999999999e-123  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.335298 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5505  Aldehyde Dehydrogenase  47.96 
 
 
504 aa  437  1e-121  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000574808 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5587  Aldehyde Dehydrogenase  46.44 
 
 
487 aa  432  1e-120  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.347373  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2476  aldehyde dehydrogenase  42.94 
 
 
497 aa  430  1e-119  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.124158  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6546  Betaine-aldehyde dehydrogenase  46.03 
 
 
487 aa  429  1e-119  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.173146  normal  0.885428 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3759  Aldehyde Dehydrogenase  47.16 
 
 
490 aa  428  1e-118  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.304272 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2213  aldehyde dehydrogenase  45.34 
 
 
490 aa  424  1e-117  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.00475065  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1480  aldehyde dehydrogenase  45.93 
 
 
490 aa  417  9.999999999999999e-116  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0515859  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4856  aldehyde dehydrogenase  45.11 
 
 
483 aa  413  1e-114  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.263653  normal  0.221142 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1004  betaine-aldehyde dehydrogenase  42.15 
 
 
492 aa  409  1e-113  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.460845  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5622  aldehyde dehydrogenase  44.05 
 
 
488 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.216133 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2599  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  45.88 
 
 
490 aa  406  1.0000000000000001e-112  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.225795  normal  0.197804 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1745  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  43.34 
 
 
498 aa  405  1e-111  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1556  Retinal dehydrogenase  44.4 
 
 
490 aa  405  1e-111  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4700  aldehyde dehydrogenase  43.54 
 
 
483 aa  404  1e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0199533 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3841  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  46.04 
 
 
508 aa  402  1e-111  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.829655 
 
 
-
 
NC_006686  CND02060  Aldehyde dehydrogenase (ALDDH), putative  46.84 
 
 
495 aa  399  9.999999999999999e-111  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2504  Aldehyde Dehydrogenase  46.64 
 
 
497 aa  402  9.999999999999999e-111  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.98157  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2640  aldehyde dehydrogenase  43.06 
 
 
494 aa  397  1e-109  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.198513  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2837  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  42.86 
 
 
494 aa  396  1e-109  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000177336 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4086  aldehyde dehydrogenase  44 
 
 
488 aa  396  1e-109  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.515709  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3431  betaine-aldehyde dehydrogenase  44.21 
 
 
488 aa  397  1e-109  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2738  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  43.79 
 
 
488 aa  395  1e-109  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.525641  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2831  aldehyde dehydrogenase  43.06 
 
 
494 aa  397  1e-109  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.217262  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6025  Aldehyde Dehydrogenase  43.75 
 
 
483 aa  397  1e-109  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.181581 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1970  aldehyde dehydrogenase  41.82 
 
 
494 aa  396  1e-109  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0798984  normal  0.254214 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1535  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  45.49 
 
 
493 aa  395  1e-109  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.31089  normal  0.378909 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5214  betaine-aldehyde dehydrogenase  44.21 
 
 
488 aa  397  1e-109  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6123  aldehyde dehydrogenase  43.27 
 
 
489 aa  394  1e-108  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2860  aldehyde dehydrogenase  42.65 
 
 
494 aa  394  1e-108  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2088  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  47.14 
 
 
498 aa  392  1e-108  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.917173 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2591  aldehyde dehydrogenase  42.65 
 
 
494 aa  394  1e-108  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2556  aldehyde dehydrogenase  42.65 
 
 
494 aa  394  1e-108  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.271873  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2634  aldehyde dehydrogenase  43.1 
 
 
494 aa  393  1e-108  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2450  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  42.95 
 
 
494 aa  393  1e-108  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2882  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  42.86 
 
 
494 aa  394  1e-108  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.198602  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6130  Betaine-aldehyde dehydrogenase  43.51 
 
 
492 aa  394  1e-108  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3909  gamma-glutamyl-gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  46.14 
 
 
487 aa  392  1e-108  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01689  aldehyde dehydrogenase family (Eurofung)  43.62 
 
 
501 aa  389  1e-107  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.259255 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0886  Aldehyde Dehydrogenase  44.12 
 
 
473 aa  390  1e-107  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3376  aldehyde dehydrogenase  44 
 
 
488 aa  390  1e-107  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.399948  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2843  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  43.1 
 
 
494 aa  391  1e-107  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.128159  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_29563  Aldehyde dehydrogenase  44.61 
 
 
495 aa  390  1e-107  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.161421  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6072  aldehyde dehydrogenase  44.42 
 
 
488 aa  387  1e-106  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0308  hypothetical protein  43.48 
 
 
488 aa  387  1e-106  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0292  hypothetical protein  43.27 
 
 
488 aa  387  1e-106  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6756  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  42.77 
 
 
503 aa  388  1e-106  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.569452 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0744  Betaine-aldehyde dehydrogenase  43.33 
 
 
496 aa  387  1e-106  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0804  aldehyde dehydrogenase  45.82 
 
 
500 aa  385  1e-106  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4241  aldehyde dehydrogenase  42.83 
 
 
498 aa  383  1e-105  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3257  aldehyde dehydrogenase  43.7 
 
 
494 aa  384  1e-105  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.536879  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2823  betaine aldehyde dehydrogenase  43.06 
 
 
491 aa  384  1e-105  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7156  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  45.45 
 
 
494 aa  382  1e-105  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7067  Aldehyde Dehydrogenase  42.64 
 
 
496 aa  382  1e-105  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.340689  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1655  aldehyde dehydrogenase (NAD)  42.74 
 
 
494 aa  382  1e-105  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0330388 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00554  Aldehyde dehydrogenase (ALDDH)(ALDH)(EC 1.2.1.3) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P08157]  44.26 
 
 
497 aa  381  1e-104  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.534945  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3569  aldehyde dehydrogenase  43.28 
 
 
494 aa  380  1e-104  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3562  aldehyde dehydrogenase (NAD)  43.07 
 
 
494 aa  379  1e-104  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00134581 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3348  aldehyde dehydrogenase  43.07 
 
 
494 aa  379  1e-104  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0219223  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3313  aldehyde dehydrogenase  43.07 
 
 
494 aa  379  1e-104  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3263  aldehyde dehydrogenase  43.07 
 
 
494 aa  379  1e-104  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0152  Aldehyde Dehydrogenase  43.69 
 
 
510 aa  379  1e-104  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2229  aldehyde dehydrogenase  43.07 
 
 
494 aa  379  1e-104  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.545234  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2605  aldehyde dehydrogenase  42.71 
 
 
494 aa  379  1e-104  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000129908  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3159  betaine-aldehyde dehydrogenase  42.5 
 
 
484 aa  380  1e-104  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3609  aldehyde dehydrogenase  43.07 
 
 
494 aa  379  1e-104  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1868  Retinal dehydrogenase  43.45 
 
 
492 aa  380  1e-104  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0183  betaine-aldehyde dehydrogenase  42.86 
 
 
499 aa  380  1e-104  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.352909  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2260  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  44.38 
 
 
484 aa  379  1e-104  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3662  aldehyde dehydrogenase (NAD)  43.28 
 
 
494 aa  380  1e-104  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1381  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  43.46 
 
 
496 aa  379  1e-104  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.514457 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2311  betaine aldehyde dehydrogenase  43.1 
 
 
483 aa  376  1e-103  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3957  aldehyde dehydrogenase  41.13 
 
 
489 aa  377  1e-103  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>