More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_3524 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004578  PSPTO_1881  aldehyde dehydrogenase family protein  96.04 
 
 
505 aa  967    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0365503  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3524  aldehyde dehydrogenase  100 
 
 
505 aa  1031    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00723314  normal  0.875866 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5124  putative aldehyde dehydrogenase family protein  60.44 
 
 
509 aa  593  1e-168  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.982748  normal  0.331095 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5649  aldehyde dehydrogenase  59.04 
 
 
505 aa  587  1e-166  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.327669 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4655  betaine-aldehyde dehydrogenase  58.84 
 
 
505 aa  588  1e-166  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.402279  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3713  betaine-aldehyde dehydrogenase  58.84 
 
 
505 aa  588  1e-166  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.448124  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4984  aldehyde dehydrogenase  60.08 
 
 
503 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.355806  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5628  aldehyde dehydrogenase  59.04 
 
 
505 aa  574  1.0000000000000001e-162  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.439175  normal  0.0149056 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5845  betaine-aldehyde dehydrogenase  58.84 
 
 
505 aa  574  1.0000000000000001e-162  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.924295  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5499  Aldehyde Dehydrogenase  63.49 
 
 
509 aa  570  1e-161  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.333371  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5279  aldehyde dehydrogenase  55.94 
 
 
503 aa  548  1e-155  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6374  betaine-aldehyde dehydrogenase  56.13 
 
 
503 aa  542  1e-153  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0515  aldehyde dehydrogenase  55.29 
 
 
511 aa  541  9.999999999999999e-153  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.423959  normal  0.408285 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1706  betaine-aldehyde dehydrogenase  56.26 
 
 
519 aa  513  1e-144  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.615626  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4827  aldehyde dehydrogenase  58.35 
 
 
512 aa  493  9.999999999999999e-139  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.422195 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3333  Aldehyde Dehydrogenase  47.76 
 
 
515 aa  419  1e-116  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2407  aldehyde dehydrogenase  45.43 
 
 
493 aa  402  1e-111  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.830868  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3592  aldehyde dehydrogenase  47.65 
 
 
515 aa  404  1e-111  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5622  aldehyde dehydrogenase  42.8 
 
 
488 aa  402  9.999999999999999e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.216133 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2673  aldehyde dehydrogenase family protein  44.99 
 
 
493 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0828689  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3646  aldehyde dehydrogenase family protein  45.23 
 
 
493 aa  398  1e-109  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.196663 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2262  aldehyde dehydrogenase  44.79 
 
 
493 aa  396  1e-109  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2084  aldehyde dehydrogenase  45.45 
 
 
493 aa  398  1e-109  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3909  gamma-glutamyl-gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  43.96 
 
 
487 aa  397  1e-109  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2738  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  42.95 
 
 
488 aa  397  1e-109  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.525641  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5214  betaine-aldehyde dehydrogenase  42.41 
 
 
488 aa  396  1e-109  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3376  aldehyde dehydrogenase  42.49 
 
 
488 aa  394  1e-108  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.399948  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3233  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  42.86 
 
 
493 aa  392  1e-108  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.436611  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6072  aldehyde dehydrogenase  42.68 
 
 
488 aa  392  1e-108  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2257  aldehyde dehydrogenase  43.31 
 
 
493 aa  395  1e-108  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3431  betaine-aldehyde dehydrogenase  42.11 
 
 
488 aa  390  1e-107  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4086  aldehyde dehydrogenase  42.11 
 
 
488 aa  390  1e-107  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.515709  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3439  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  43.88 
 
 
493 aa  391  1e-107  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.383483  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6130  Betaine-aldehyde dehydrogenase  42.5 
 
 
492 aa  387  1e-106  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1745  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  43.12 
 
 
498 aa  382  1e-105  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1004  betaine-aldehyde dehydrogenase  41.93 
 
 
492 aa  380  1e-104  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.460845  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1164  betaine-aldehyde dehydrogenase  41.14 
 
 
512 aa  379  1e-104  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.278559  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7067  Aldehyde Dehydrogenase  43.22 
 
 
496 aa  379  1e-104  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.340689  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0183  betaine-aldehyde dehydrogenase  43.22 
 
 
499 aa  378  1e-103  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.352909  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1480  aldehyde dehydrogenase  39.62 
 
 
490 aa  373  1e-102  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0515859  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF03900  aldehyde dehydrogenase (alddh), putative  41.14 
 
 
506 aa  370  1e-101  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6025  Aldehyde Dehydrogenase  44.57 
 
 
483 aa  369  1e-101  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.181581 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1006  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  41.19 
 
 
491 aa  369  1e-101  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.179638  normal  0.457717 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0886  Aldehyde Dehydrogenase  41.19 
 
 
473 aa  368  1e-100  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2260  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  45.58 
 
 
484 aa  366  1e-100  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4241  aldehyde dehydrogenase  42.16 
 
 
498 aa  368  1e-100  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1556  Retinal dehydrogenase  42.37 
 
 
490 aa  365  1e-99  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3257  aldehyde dehydrogenase  40.98 
 
 
494 aa  365  1e-99  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.536879  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1655  aldehyde dehydrogenase (NAD)  41.19 
 
 
494 aa  364  2e-99  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0330388 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3992  betaine-aldehyde dehydrogenase  42.18 
 
 
496 aa  364  2e-99  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.254336  normal  0.0553876 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3348  aldehyde dehydrogenase  41.61 
 
 
494 aa  364  2e-99  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0219223  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3313  aldehyde dehydrogenase  41.61 
 
 
494 aa  364  2e-99  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3263  aldehyde dehydrogenase  41.61 
 
 
494 aa  364  2e-99  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3562  aldehyde dehydrogenase (NAD)  41.61 
 
 
494 aa  364  2e-99  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00134581 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3609  aldehyde dehydrogenase  41.61 
 
 
494 aa  364  2e-99  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1381  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  42.04 
 
 
496 aa  364  2e-99  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.514457 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3662  aldehyde dehydrogenase (NAD)  41.19 
 
 
494 aa  364  2e-99  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1493  aldehyde dehydrogenase family protein  43.1 
 
 
488 aa  363  3e-99  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0085  Aldehyde dehydrogenase (NAD(+))  40.22 
 
 
493 aa  364  3e-99  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3569  aldehyde dehydrogenase  41.19 
 
 
494 aa  363  4e-99  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3577  betaine-aldehyde dehydrogenase  44.57 
 
 
491 aa  363  4e-99  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.162462  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2450  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  40.76 
 
 
494 aa  363  5.0000000000000005e-99  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2634  aldehyde dehydrogenase  40.76 
 
 
494 aa  362  9e-99  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4941  betaine-aldehyde dehydrogenase  41.43 
 
 
498 aa  361  1e-98  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2860  aldehyde dehydrogenase  40.76 
 
 
494 aa  361  1e-98  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0292  hypothetical protein  40.17 
 
 
488 aa  361  1e-98  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4856  aldehyde dehydrogenase  43.42 
 
 
483 aa  361  2e-98  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.263653  normal  0.221142 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3759  Aldehyde Dehydrogenase  42.12 
 
 
490 aa  361  2e-98  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.304272 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4700  aldehyde dehydrogenase  42.96 
 
 
483 aa  360  4e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0199533 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2843  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  40.55 
 
 
494 aa  360  5e-98  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.128159  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2882  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  40.55 
 
 
494 aa  359  6e-98  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.198602  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2591  aldehyde dehydrogenase  40.34 
 
 
494 aa  358  9.999999999999999e-98  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2556  aldehyde dehydrogenase  40.34 
 
 
494 aa  358  9.999999999999999e-98  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.271873  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5599  betaine-aldehyde dehydrogenase  41.58 
 
 
496 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0279735  normal  0.51588 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2640  aldehyde dehydrogenase  40.34 
 
 
494 aa  358  1.9999999999999998e-97  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.198513  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND02060  Aldehyde dehydrogenase (ALDDH), putative  41.1 
 
 
495 aa  357  1.9999999999999998e-97  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1113  betaine-aldehyde dehydrogenase  41.36 
 
 
496 aa  358  1.9999999999999998e-97  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.016361  normal  0.253072 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2831  aldehyde dehydrogenase  40.34 
 
 
494 aa  358  1.9999999999999998e-97  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.217262  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2837  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  40.13 
 
 
494 aa  358  1.9999999999999998e-97  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000177336 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1476  betaine aldehyde dehydrogenase  39.01 
 
 
490 aa  358  1.9999999999999998e-97  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2599  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  41.51 
 
 
490 aa  358  1.9999999999999998e-97  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.225795  normal  0.197804 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4095  betaine-aldehyde dehydrogenase  41.15 
 
 
496 aa  358  1.9999999999999998e-97  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0181544  normal  0.594125 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4701  betaine-aldehyde dehydrogenase  41.58 
 
 
496 aa  357  2.9999999999999997e-97  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00415207  normal  0.173855 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3666  betaine-aldehyde dehydrogenase  41.58 
 
 
496 aa  357  2.9999999999999997e-97  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4697  aldehyde dehydrogenase  37.78 
 
 
496 aa  356  5e-97  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.754003  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18440  Aldehyde dehydrogenase family protein  40.16 
 
 
499 aa  356  5.999999999999999e-97  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.931316  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0308  hypothetical protein  39.75 
 
 
488 aa  356  6.999999999999999e-97  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6789  Aldehyde Dehydrogenase  42.4 
 
 
495 aa  355  7.999999999999999e-97  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.772669  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3685  betaine-aldehyde dehydrogenase  41.81 
 
 
495 aa  355  1e-96  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.236919  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4560  betaine-aldehyde dehydrogenase  40.74 
 
 
496 aa  355  1e-96  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.288864  hitchhiker  0.00438962 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4824  aldehyde dehydrogenase  41.27 
 
 
492 aa  354  2e-96  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.00512486  normal  0.364288 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1315  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  41.88 
 
 
496 aa  354  2e-96  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.953752  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1242  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  41.67 
 
 
496 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1328  aldehyde dehydrogenase family protein  41.88 
 
 
496 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2502  aldehyde dehydrogenase family protein  41.67 
 
 
496 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0980  aldehyde dehydrogenase family protein  41.88 
 
 
496 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.340649  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0587  aldehyde dehydrogenase family protein  41.88 
 
 
496 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4075  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  43.29 
 
 
496 aa  353  2.9999999999999997e-96  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.234292 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0311  aldehyde dehydrogenase family protein  41.88 
 
 
496 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0753946  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2229  aldehyde dehydrogenase  39.92 
 
 
494 aa  353  5e-96  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.545234  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>