More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_2407 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002947  PP_3646  aldehyde dehydrogenase family protein  89.66 
 
 
493 aa  913    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.196663 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2257  aldehyde dehydrogenase  90.26 
 
 
493 aa  919    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2673  aldehyde dehydrogenase family protein  97.97 
 
 
493 aa  982    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0828689  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2407  aldehyde dehydrogenase  100 
 
 
493 aa  1003    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.830868  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3233  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  93.1 
 
 
493 aa  943    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.436611  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2084  aldehyde dehydrogenase  89.66 
 
 
493 aa  911    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2262  aldehyde dehydrogenase  90.47 
 
 
493 aa  917    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3439  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  91.48 
 
 
493 aa  938    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.383483  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6088  aldehyde dehydrogenase  57.23 
 
 
487 aa  573  1.0000000000000001e-162  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6251  aldehyde dehydrogenase  55.8 
 
 
487 aa  567  1e-160  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.392289 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6546  Betaine-aldehyde dehydrogenase  55.19 
 
 
487 aa  552  1e-156  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.173146  normal  0.885428 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2213  aldehyde dehydrogenase  55.19 
 
 
490 aa  551  1e-156  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.00475065  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5587  Aldehyde Dehydrogenase  55.19 
 
 
487 aa  551  1e-156  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.347373  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4824  aldehyde dehydrogenase  54.25 
 
 
492 aa  538  1e-151  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.00512486  normal  0.364288 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2290  betaine-aldehyde dehydrogenase  50.61 
 
 
503 aa  529  1e-149  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.109533 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0085  Aldehyde dehydrogenase (NAD(+))  52.35 
 
 
493 aa  530  1e-149  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4323  aldehyde dehydrogenase  50.71 
 
 
503 aa  525  1e-147  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.181761 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6123  aldehyde dehydrogenase  52.86 
 
 
489 aa  517  1.0000000000000001e-145  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1970  aldehyde dehydrogenase  52.66 
 
 
494 aa  513  1e-144  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0798984  normal  0.254214 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4941  betaine-aldehyde dehydrogenase  49.7 
 
 
498 aa  513  1e-144  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6789  Aldehyde Dehydrogenase  52.83 
 
 
495 aa  510  1e-143  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.772669  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4697  aldehyde dehydrogenase  48.58 
 
 
496 aa  506  9.999999999999999e-143  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.754003  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4156  aldehyde dehydrogenase  50.31 
 
 
487 aa  503  1e-141  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.335298 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1006  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  51.22 
 
 
491 aa  500  1e-140  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.179638  normal  0.457717 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2524  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  50 
 
 
509 aa  500  1e-140  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.70277  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2476  aldehyde dehydrogenase  47.96 
 
 
497 aa  493  9.999999999999999e-139  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.124158  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6123  aldehyde dehydrogenase  52.14 
 
 
493 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5505  Aldehyde Dehydrogenase  50.1 
 
 
504 aa  492  9.999999999999999e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000574808 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6411  aldehyde dehydrogenase  52.34 
 
 
493 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.599394 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0174  aldehyde dehydrogenase  52.94 
 
 
493 aa  489  1e-137  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.437593  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2720  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  50.41 
 
 
496 aa  485  1e-136  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.133505  normal  0.10056 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1164  betaine-aldehyde dehydrogenase  47.36 
 
 
512 aa  486  1e-136  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.278559  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4075  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  52.86 
 
 
496 aa  481  1e-134  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.234292 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6831  aldehyde dehydrogenase  47.77 
 
 
493 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1480  aldehyde dehydrogenase  47.51 
 
 
490 aa  463  1e-129  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0515859  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6756  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  48.35 
 
 
503 aa  458  9.999999999999999e-129  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.569452 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1556  Retinal dehydrogenase  47.38 
 
 
490 aa  453  1.0000000000000001e-126  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1745  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  47.26 
 
 
498 aa  455  1.0000000000000001e-126  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2599  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  46.14 
 
 
490 aa  441  9.999999999999999e-123  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.225795  normal  0.197804 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3759  Aldehyde Dehydrogenase  46.12 
 
 
490 aa  441  9.999999999999999e-123  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.304272 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1381  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  47.07 
 
 
496 aa  435  1e-121  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.514457 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2605  aldehyde dehydrogenase  47.26 
 
 
494 aa  434  1e-120  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000129908  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0886  Aldehyde Dehydrogenase  46.85 
 
 
473 aa  434  1e-120  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1250  aldehyde dehydrogenase  47.34 
 
 
503 aa  429  1e-119  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.790003 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1004  betaine-aldehyde dehydrogenase  44.61 
 
 
492 aa  429  1e-119  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.460845  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6130  Betaine-aldehyde dehydrogenase  45.44 
 
 
492 aa  426  1e-118  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3577  betaine-aldehyde dehydrogenase  45.44 
 
 
491 aa  425  1e-118  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.162462  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2504  Aldehyde Dehydrogenase  46.43 
 
 
497 aa  427  1e-118  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.98157  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6025  Aldehyde Dehydrogenase  45.23 
 
 
483 aa  422  1e-117  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.181581 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4241  aldehyde dehydrogenase  46.56 
 
 
498 aa  422  1e-117  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0308  hypothetical protein  46.17 
 
 
488 aa  423  1e-117  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0292  hypothetical protein  46.17 
 
 
488 aa  425  1e-117  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2738  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  46.23 
 
 
488 aa  424  1e-117  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.525641  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1493  aldehyde dehydrogenase family protein  46.89 
 
 
488 aa  423  1e-117  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5622  aldehyde dehydrogenase  45.62 
 
 
488 aa  422  1e-117  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.216133 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6072  aldehyde dehydrogenase  46.65 
 
 
488 aa  420  1e-116  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0129  betaine aldehyde dehydrogenase  46.68 
 
 
494 aa  419  1e-116  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00429668  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1868  Retinal dehydrogenase  45.02 
 
 
492 aa  420  1e-116  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3165  Betaine-aldehyde dehydrogenase  44.4 
 
 
492 aa  420  1e-116  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4086  aldehyde dehydrogenase  45.82 
 
 
488 aa  419  1e-116  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.515709  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3431  betaine-aldehyde dehydrogenase  45.82 
 
 
488 aa  418  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5214  betaine-aldehyde dehydrogenase  45.61 
 
 
488 aa  418  9.999999999999999e-116  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2837  Aldehyde Dehydrogenase  42.15 
 
 
502 aa  414  1e-114  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7067  Aldehyde Dehydrogenase  45.74 
 
 
496 aa  412  1e-114  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.340689  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3841  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  45.4 
 
 
508 aa  414  1e-114  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.829655 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7156  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  47.57 
 
 
494 aa  412  1e-114  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3376  aldehyde dehydrogenase  45.4 
 
 
488 aa  413  1e-114  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.399948  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1838  Aldehyde Dehydrogenase  46.3 
 
 
494 aa  412  1e-114  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4856  aldehyde dehydrogenase  45.21 
 
 
483 aa  414  1e-114  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.263653  normal  0.221142 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2882  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  43.72 
 
 
494 aa  410  1e-113  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.198602  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2860  aldehyde dehydrogenase  43.72 
 
 
494 aa  409  1e-113  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2843  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  43.51 
 
 
494 aa  410  1e-113  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.128159  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2640  aldehyde dehydrogenase  43.72 
 
 
494 aa  409  1e-113  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.198513  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3348  aldehyde dehydrogenase  44.03 
 
 
494 aa  409  1e-113  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0219223  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3313  aldehyde dehydrogenase  44.03 
 
 
494 aa  409  1e-113  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3263  aldehyde dehydrogenase  44.03 
 
 
494 aa  409  1e-113  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2837  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  43.51 
 
 
494 aa  409  1e-113  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000177336 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2831  aldehyde dehydrogenase  43.72 
 
 
494 aa  409  1e-113  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.217262  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3609  aldehyde dehydrogenase  44.03 
 
 
494 aa  409  1e-113  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0183  betaine-aldehyde dehydrogenase  45.3 
 
 
499 aa  409  1e-113  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.352909  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4502  Aldehyde Dehydrogenase  44.91 
 
 
500 aa  410  1e-113  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.319143  normal  0.917567 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2634  aldehyde dehydrogenase  43.31 
 
 
494 aa  409  1e-113  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31700  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  45.68 
 
 
495 aa  411  1e-113  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.465703  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2450  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  43.1 
 
 
494 aa  409  1e-113  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4634  Aldehyde Dehydrogenase  44.91 
 
 
500 aa  410  1e-113  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.20636  normal  0.0898533 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3562  aldehyde dehydrogenase (NAD)  44.03 
 
 
494 aa  409  1e-113  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00134581 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0311  aldehyde dehydrogenase family protein  46.68 
 
 
496 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0753946  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5173  Aldehyde Dehydrogenase  45.07 
 
 
503 aa  408  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3662  aldehyde dehydrogenase (NAD)  43.82 
 
 
494 aa  406  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0980  aldehyde dehydrogenase family protein  46.68 
 
 
496 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.340649  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2591  aldehyde dehydrogenase  43.51 
 
 
494 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2556  aldehyde dehydrogenase  43.31 
 
 
494 aa  406  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.271873  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1328  aldehyde dehydrogenase family protein  46.68 
 
 
496 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2502  aldehyde dehydrogenase family protein  46.68 
 
 
496 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1242  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  46.68 
 
 
496 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5435  aldehyde dehydrogenase  45.21 
 
 
504 aa  407  1.0000000000000001e-112  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.846738  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1655  aldehyde dehydrogenase (NAD)  43.82 
 
 
494 aa  406  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0330388 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0587  aldehyde dehydrogenase family protein  46.68 
 
 
496 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1535  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  45.27 
 
 
493 aa  406  1.0000000000000001e-112  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.31089  normal  0.378909 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3909  gamma-glutamyl-gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  46.79 
 
 
487 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>