More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_3233 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_3646  aldehyde dehydrogenase family protein  90.26 
 
 		 493 aa  909    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.196663 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2673  aldehyde dehydrogenase family protein  92.7 
 
 		 493 aa  935    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0828689  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2407  aldehyde dehydrogenase  93.1 
 
 		 493 aa  943    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.830868  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3233  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  100 
 
 		 493 aa  1001    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.436611  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2084  aldehyde dehydrogenase  90.26 
 
 		 493 aa  907    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2262  aldehyde dehydrogenase  90.47 
 
 		 493 aa  909    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3439  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  91.68 
 
 		 493 aa  931    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.383483  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2257  aldehyde dehydrogenase  90.26 
 
 		 493 aa  913    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6088  aldehyde dehydrogenase  56.42 
 
 		 487 aa  569  1e-161  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6251  aldehyde dehydrogenase  55.8 
 
 		 487 aa  563  1.0000000000000001e-159  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.392289 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6546  Betaine-aldehyde dehydrogenase  54.58 
 
 		 487 aa  545  1e-154  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.173146  normal  0.885428 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2213  aldehyde dehydrogenase  54.79 
 
 		 490 aa  544  1e-153  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.00475065  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5587  Aldehyde Dehydrogenase  54.38 
 
 		 487 aa  545  1e-153  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.347373  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4824  aldehyde dehydrogenase  54.45 
 
 		 492 aa  536  1e-151  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.00512486  normal  0.364288 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0085  Aldehyde dehydrogenase (NAD(+))  53.96 
 
 		 493 aa  534  1e-150  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4323  aldehyde dehydrogenase  50.61 
 
 		 503 aa  527  1e-148  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.181761 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2290  betaine-aldehyde dehydrogenase  50.81 
 
 		 503 aa  522  1e-147  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.109533 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1970  aldehyde dehydrogenase  53.07 
 
 		 494 aa  517  1.0000000000000001e-145  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0798984  normal  0.254214 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6789  Aldehyde Dehydrogenase  53.75 
 
 		 495 aa  513  1e-144  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.772669  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6123  aldehyde dehydrogenase  51.84 
 
 		 489 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2524  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  50 
 
 		 509 aa  502  1e-141  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.70277  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1006  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  51.43 
 
 		 491 aa  498  1e-140  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.179638  normal  0.457717 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4156  aldehyde dehydrogenase  50.31 
 
 		 487 aa  498  1e-139  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.335298 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2476  aldehyde dehydrogenase  48.67 
 
 		 497 aa  498  1e-139  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.124158  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5505  Aldehyde Dehydrogenase  50.1 
 
 		 504 aa  491  9.999999999999999e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000574808 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6411  aldehyde dehydrogenase  52.75 
 
 		 493 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.599394 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4697  aldehyde dehydrogenase  47.76 
 
 		 496 aa  491  1e-137  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.754003  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6123  aldehyde dehydrogenase  52.75 
 
 		 493 aa  491  1e-137  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0174  aldehyde dehydrogenase  53.35 
 
 		 493 aa  489  1e-137  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.437593  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4941  betaine-aldehyde dehydrogenase  47.67 
 
 		 498 aa  489  1e-137  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2720  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  50.41 
 
 		 496 aa  485  1e-136  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.133505  normal  0.10056 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1164  betaine-aldehyde dehydrogenase  47.15 
 
 		 512 aa  481  1e-135  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.278559  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4075  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  53.27 
 
 		 496 aa  481  1e-134  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.234292 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1480  aldehyde dehydrogenase  48.76 
 
 		 490 aa  473  1e-132  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0515859  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6831  aldehyde dehydrogenase  47.46 
 
 		 493 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1556  Retinal dehydrogenase  47.7 
 
 		 490 aa  452  1.0000000000000001e-126  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6756  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  47.83 
 
 		 503 aa  450  1e-125  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.569452 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1745  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  46.62 
 
 		 498 aa  440  9.999999999999999e-123  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3759  Aldehyde Dehydrogenase  46.65 
 
 		 490 aa  441  9.999999999999999e-123  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.304272 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1004  betaine-aldehyde dehydrogenase  44.54 
 
 		 492 aa  438  9.999999999999999e-123  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.460845  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2599  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  46.67 
 
 		 490 aa  439  9.999999999999999e-123  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.225795  normal  0.197804 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0886  Aldehyde Dehydrogenase  46.64 
 
 		 473 aa  432  1e-120  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1381  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  46.44 
 
 		 496 aa  432  1e-120  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.514457 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1250  aldehyde dehydrogenase  48.74 
 
 		 503 aa  432  1e-120  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.790003 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1493  aldehyde dehydrogenase family protein  47.72 
 
 		 488 aa  430  1e-119  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4241  aldehyde dehydrogenase  46.99 
 
 		 498 aa  426  1e-118  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2504  Aldehyde Dehydrogenase  46.64 
 
 		 497 aa  424  1e-117  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.98157  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3577  betaine-aldehyde dehydrogenase  45.44 
 
 		 491 aa  423  1e-117  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.162462  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1868  Retinal dehydrogenase  45.85 
 
 		 492 aa  422  1e-117  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2605  aldehyde dehydrogenase  45.78 
 
 		 494 aa  419  1e-116  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000129908  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3165  Betaine-aldehyde dehydrogenase  44.93 
 
 		 492 aa  421  1e-116  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0129  betaine aldehyde dehydrogenase  46.36 
 
 		 494 aa  420  1e-116  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00429668  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6130  Betaine-aldehyde dehydrogenase  44.99 
 
 		 492 aa  419  1e-116  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3348  aldehyde dehydrogenase  45.07 
 
 		 494 aa  417  9.999999999999999e-116  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0219223  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3313  aldehyde dehydrogenase  45.07 
 
 		 494 aa  417  9.999999999999999e-116  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3263  aldehyde dehydrogenase  45.07 
 
 		 494 aa  417  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3562  aldehyde dehydrogenase (NAD)  45.07 
 
 		 494 aa  417  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00134581 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2738  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  45.4 
 
 		 488 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.525641  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3609  aldehyde dehydrogenase  45.07 
 
 		 494 aa  417  9.999999999999999e-116  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1655  aldehyde dehydrogenase (NAD)  44.86 
 
 		 494 aa  416  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0330388 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3662  aldehyde dehydrogenase (NAD)  44.86 
 
 		 494 aa  415  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0311  aldehyde dehydrogenase family protein  47.51 
 
 		 496 aa  414  1e-114  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0753946  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0980  aldehyde dehydrogenase family protein  47.51 
 
 		 496 aa  414  1e-114  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.340649  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3569  aldehyde dehydrogenase  44.86 
 
 		 494 aa  413  1e-114  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7067  Aldehyde Dehydrogenase  45.93 
 
 		 496 aa  412  1e-114  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.340689  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1315  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  47.51 
 
 		 496 aa  414  1e-114  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.953752  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1242  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  47.51 
 
 		 496 aa  414  1e-114  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6072  aldehyde dehydrogenase  46.03 
 
 		 488 aa  414  1e-114  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6025  Aldehyde Dehydrogenase  45.55 
 
 		 483 aa  414  1e-114  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.181581 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1328  aldehyde dehydrogenase family protein  47.51 
 
 		 496 aa  414  1e-114  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2502  aldehyde dehydrogenase family protein  47.51 
 
 		 496 aa  414  1e-114  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4502  Aldehyde Dehydrogenase  45.95 
 
 		 500 aa  414  1e-114  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.319143  normal  0.917567 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5622  aldehyde dehydrogenase  45 
 
 		 488 aa  413  1e-114  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.216133 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3257  aldehyde dehydrogenase  44.65 
 
 		 494 aa  412  1e-114  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.536879  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0587  aldehyde dehydrogenase family protein  47.51 
 
 		 496 aa  414  1e-114  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4634  Aldehyde Dehydrogenase  45.95 
 
 		 500 aa  414  1e-114  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.20636  normal  0.0898533 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2634  aldehyde dehydrogenase  43.31 
 
 		 494 aa  409  1e-113  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2882  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  43.63 
 
 		 494 aa  410  1e-113  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.198602  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2860  aldehyde dehydrogenase  43.63 
 
 		 494 aa  410  1e-113  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2640  aldehyde dehydrogenase  43.63 
 
 		 494 aa  409  1e-113  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.198513  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0308  hypothetical protein  44.1 
 
 		 488 aa  409  1e-113  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0292  hypothetical protein  44.1 
 
 		 488 aa  411  1e-113  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3431  betaine-aldehyde dehydrogenase  45.19 
 
 		 488 aa  410  1e-113  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2837  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  43.42 
 
 		 494 aa  409  1e-113  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000177336 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2831  aldehyde dehydrogenase  43.63 
 
 		 494 aa  409  1e-113  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.217262  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0183  betaine-aldehyde dehydrogenase  45.51 
 
 		 499 aa  411  1e-113  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.352909  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31700  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  45.55 
 
 		 495 aa  409  1e-113  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.465703  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4086  aldehyde dehydrogenase  45.19 
 
 		 488 aa  411  1e-113  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.515709  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5214  betaine-aldehyde dehydrogenase  44.77 
 
 		 488 aa  409  1e-113  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2591  aldehyde dehydrogenase  43.42 
 
 		 494 aa  408  1.0000000000000001e-112  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2556  aldehyde dehydrogenase  43.22 
 
 		 494 aa  406  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.271873  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3841  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  45.19 
 
 		 508 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.829655 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1113  betaine-aldehyde dehydrogenase  46.38 
 
 		 496 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.016361  normal  0.253072 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2450  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  43.01 
 
 		 494 aa  406  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4560  betaine-aldehyde dehydrogenase  46.47 
 
 		 496 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.288864  hitchhiker  0.00438962 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4856  aldehyde dehydrogenase  45.53 
 
 		 483 aa  405  1.0000000000000001e-112  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.263653  normal  0.221142 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1535  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  45.64 
 
 		 493 aa  407  1.0000000000000001e-112  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.31089  normal  0.378909 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2229  aldehyde dehydrogenase  43.61 
 
 		 494 aa  405  1.0000000000000001e-112  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.545234  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5435  aldehyde dehydrogenase  45.62 
 
 		 504 aa  408  1.0000000000000001e-112  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.846738  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3376  aldehyde dehydrogenase  44.77 
 
 		 488 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.399948  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>