More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_6088 on replicon NC_011988
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011988  Avi_6088  aldehyde dehydrogenase  100 
 
 		 487 aa  993    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2213  aldehyde dehydrogenase  70.14 
 
 		 490 aa  718    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.00475065  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6251  aldehyde dehydrogenase  81.72 
 
 		 487 aa  840    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.392289 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6123  aldehyde dehydrogenase  67.28 
 
 		 489 aa  681    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6546  Betaine-aldehyde dehydrogenase  84.6 
 
 		 487 aa  858    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.173146  normal  0.885428 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5587  Aldehyde Dehydrogenase  85.01 
 
 		 487 aa  862    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.347373  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4156  aldehyde dehydrogenase  58.52 
 
 		 487 aa  594  1e-168  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.335298 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2673  aldehyde dehydrogenase family protein  57.23 
 
 		 493 aa  574  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0828689  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2407  aldehyde dehydrogenase  57.23 
 
 		 493 aa  573  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.830868  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3646  aldehyde dehydrogenase family protein  56.62 
 
 		 493 aa  568  1e-161  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.196663 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2257  aldehyde dehydrogenase  56.42 
 
 		 493 aa  570  1e-161  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3233  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  56.42 
 
 		 493 aa  569  1e-161  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.436611  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3439  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  56.82 
 
 		 493 aa  570  1e-161  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.383483  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2084  aldehyde dehydrogenase  56.42 
 
 		 493 aa  565  1e-160  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2262  aldehyde dehydrogenase  56.21 
 
 		 493 aa  567  1e-160  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2476  aldehyde dehydrogenase  53.37 
 
 		 497 aa  544  1e-153  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.124158  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1970  aldehyde dehydrogenase  50.92 
 
 		 494 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0798984  normal  0.254214 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4824  aldehyde dehydrogenase  50.3 
 
 		 492 aa  459  9.999999999999999e-129  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.00512486  normal  0.364288 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0174  aldehyde dehydrogenase  51.52 
 
 		 493 aa  449  1e-125  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.437593  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1006  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  48.07 
 
 		 491 aa  443  1e-123  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.179638  normal  0.457717 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6831  aldehyde dehydrogenase  47.98 
 
 		 493 aa  444  1e-123  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2720  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  47.74 
 
 		 496 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.133505  normal  0.10056 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0085  Aldehyde dehydrogenase (NAD(+))  47.44 
 
 		 493 aa  437  1e-121  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4941  betaine-aldehyde dehydrogenase  45.86 
 
 		 498 aa  434  1e-120  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6789  Aldehyde Dehydrogenase  47.98 
 
 		 495 aa  434  1e-120  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.772669  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4697  aldehyde dehydrogenase  44.44 
 
 		 496 aa  431  1e-119  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.754003  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6411  aldehyde dehydrogenase  49.9 
 
 		 493 aa  428  1e-119  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.599394 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4075  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  49.79 
 
 		 496 aa  422  1e-117  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.234292 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6123  aldehyde dehydrogenase  49.49 
 
 		 493 aa  424  1e-117  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2290  betaine-aldehyde dehydrogenase  44.51 
 
 		 503 aa  419  1e-116  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.109533 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4323  aldehyde dehydrogenase  44.4 
 
 		 503 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.181761 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2524  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  45.82 
 
 		 509 aa  412  1e-114  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.70277  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1004  betaine-aldehyde dehydrogenase  43.12 
 
 		 492 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.460845  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1868  Retinal dehydrogenase  46.11 
 
 		 492 aa  399  9.999999999999999e-111  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1480  aldehyde dehydrogenase  43.98 
 
 		 490 aa  401  9.999999999999999e-111  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0515859  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1164  betaine-aldehyde dehydrogenase  41.99 
 
 		 512 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.278559  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5505  Aldehyde Dehydrogenase  44.72 
 
 		 504 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000574808 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1250  aldehyde dehydrogenase  46.12 
 
 		 503 aa  395  1e-109  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.790003 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6756  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  43.61 
 
 		 503 aa  398  1e-109  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.569452 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1556  Retinal dehydrogenase  43.67 
 
 		 490 aa  397  1e-109  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2882  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  42.86 
 
 		 494 aa  395  1e-109  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.198602  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2860  aldehyde dehydrogenase  42.65 
 
 		 494 aa  395  1e-108  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2640  aldehyde dehydrogenase  42.65 
 
 		 494 aa  393  1e-108  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.198513  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2831  aldehyde dehydrogenase  42.65 
 
 		 494 aa  393  1e-108  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.217262  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1381  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  43.28 
 
 		 496 aa  393  1e-108  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.514457 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2837  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  42.44 
 
 		 494 aa  392  1e-108  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000177336 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2450  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  42.02 
 
 		 494 aa  390  1e-107  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2591  aldehyde dehydrogenase  42.23 
 
 		 494 aa  391  1e-107  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2556  aldehyde dehydrogenase  42.44 
 
 		 494 aa  391  1e-107  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.271873  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2634  aldehyde dehydrogenase  42.02 
 
 		 494 aa  389  1e-107  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2504  Aldehyde Dehydrogenase  43.67 
 
 		 497 aa  391  1e-107  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.98157  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2843  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  42.23 
 
 		 494 aa  391  1e-107  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.128159  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3759  Aldehyde Dehydrogenase  44.42 
 
 		 490 aa  385  1e-106  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.304272 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2738  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  42.56 
 
 		 488 aa  388  1e-106  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.525641  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2599  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  44.35 
 
 		 490 aa  385  1e-106  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.225795  normal  0.197804 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4086  aldehyde dehydrogenase  42.98 
 
 		 488 aa  383  1e-105  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.515709  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0308  hypothetical protein  41.89 
 
 		 488 aa  384  1e-105  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2605  aldehyde dehydrogenase  44.3 
 
 		 494 aa  382  1e-105  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000129908  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3431  betaine-aldehyde dehydrogenase  42.98 
 
 		 488 aa  383  1e-105  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5622  aldehyde dehydrogenase  41.98 
 
 		 488 aa  384  1e-105  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.216133 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5214  betaine-aldehyde dehydrogenase  42.15 
 
 		 488 aa  384  1e-105  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1655  aldehyde dehydrogenase (NAD)  42.19 
 
 		 494 aa  379  1e-104  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0330388 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0886  Aldehyde Dehydrogenase  42.32 
 
 		 473 aa  380  1e-104  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3348  aldehyde dehydrogenase  42.41 
 
 		 494 aa  380  1e-104  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0219223  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3313  aldehyde dehydrogenase  42.41 
 
 		 494 aa  380  1e-104  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3263  aldehyde dehydrogenase  42.41 
 
 		 494 aa  380  1e-104  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0292  hypothetical protein  41.56 
 
 		 488 aa  382  1e-104  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3609  aldehyde dehydrogenase  42.41 
 
 		 494 aa  380  1e-104  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5435  aldehyde dehydrogenase  43.84 
 
 		 504 aa  381  1e-104  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.846738  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3562  aldehyde dehydrogenase (NAD)  42.41 
 
 		 494 aa  380  1e-104  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00134581 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3569  aldehyde dehydrogenase  42.19 
 
 		 494 aa  377  1e-103  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3662  aldehyde dehydrogenase (NAD)  42.19 
 
 		 494 aa  378  1e-103  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6130  Betaine-aldehyde dehydrogenase  42.13 
 
 		 492 aa  377  1e-103  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3376  aldehyde dehydrogenase  41.74 
 
 		 488 aa  376  1e-103  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.399948  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3257  aldehyde dehydrogenase  41.77 
 
 		 494 aa  376  1e-103  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.536879  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1745  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  43.16 
 
 		 498 aa  373  1e-102  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2229  aldehyde dehydrogenase  41.39 
 
 		 494 aa  374  1e-102  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.545234  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6072  aldehyde dehydrogenase  42.56 
 
 		 488 aa  375  1e-102  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1493  aldehyde dehydrogenase family protein  43.97 
 
 		 488 aa  365  1e-100  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1535  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  42.39 
 
 		 493 aa  366  1e-100  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.31089  normal  0.378909 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4511  betaine aldehyde dehydrogenase  44.72 
 
 		 489 aa  366  1e-100  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.644708 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5036  betaine aldehyde dehydrogenase  44.31 
 
 		 489 aa  364  2e-99  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.418531  normal  0.930048 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4856  aldehyde dehydrogenase  44.12 
 
 		 483 aa  364  2e-99  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.263653  normal  0.221142 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_29563  Aldehyde dehydrogenase  40.3 
 
 		 495 aa  363  5.0000000000000005e-99  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.161421  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0744  Betaine-aldehyde dehydrogenase  41.8 
 
 		 496 aa  363  5.0000000000000005e-99  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2946  aldehyde dehydrogenase  43.82 
 
 		 497 aa  363  5.0000000000000005e-99  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.264552 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3909  gamma-glutamyl-gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  42.53 
 
 		 487 aa  362  8e-99  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3047  Aldehyde Dehydrogenase  41.79 
 
 		 508 aa  362  9e-99  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND02060  Aldehyde dehydrogenase (ALDDH), putative  42.43 
 
 		 495 aa  361  1e-98  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3599  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  44.23 
 
 		 496 aa  360  3e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.152099  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2306  aldehyde dehydrogenase  43.38 
 
 		 497 aa  359  8e-98  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.445313  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3463  aldehyde dehydrogenase  43.38 
 
 		 497 aa  358  9.999999999999999e-98  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.506857  normal  0.23094 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0515  aldehyde dehydrogenase  40.92 
 
 		 511 aa  358  9.999999999999999e-98  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.423959  normal  0.408285 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6025  Aldehyde Dehydrogenase  43.49 
 
 		 483 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.181581 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0129  betaine aldehyde dehydrogenase  39.51 
 
 		 494 aa  358  1.9999999999999998e-97  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00429668  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5649  aldehyde dehydrogenase  42.36 
 
 		 505 aa  357  2.9999999999999997e-97  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.327669 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5173  Aldehyde Dehydrogenase  40.34 
 
 		 503 aa  357  2.9999999999999997e-97  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0804  aldehyde dehydrogenase  43.51 
 
 		 500 aa  357  3.9999999999999996e-97  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31700  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  41.77 
 
 		 495 aa  356  5e-97  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.465703  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2474  aldehyde dehydrogenase  43.17 
 
 		 497 aa  356  5e-97  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.109881  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>