More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_4323 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011368  Rleg2_5505  Aldehyde Dehydrogenase  74.4 
 
 		 504 aa  770    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000574808 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2290  betaine-aldehyde dehydrogenase  77.73 
 
 		 503 aa  823    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.109533 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2524  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  77.73 
 
 		 509 aa  814    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.70277  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4323  aldehyde dehydrogenase  100 
 
 		 503 aa  1036    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.181761 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3233  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  50.61 
 
 		 493 aa  527  1e-148  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.436611  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2407  aldehyde dehydrogenase  50.71 
 
 		 493 aa  525  1e-147  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.830868  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2673  aldehyde dehydrogenase family protein  50.31 
 
 		 493 aa  521  1e-146  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0828689  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3439  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  50.61 
 
 		 493 aa  521  1e-146  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.383483  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0085  Aldehyde dehydrogenase (NAD(+))  52.14 
 
 		 493 aa  513  1e-144  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2257  aldehyde dehydrogenase  49.08 
 
 		 493 aa  510  1e-143  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2262  aldehyde dehydrogenase  49.08 
 
 		 493 aa  505  9.999999999999999e-143  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2084  aldehyde dehydrogenase  48.88 
 
 		 493 aa  504  1e-141  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3646  aldehyde dehydrogenase family protein  48.88 
 
 		 493 aa  504  1e-141  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.196663 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4941  betaine-aldehyde dehydrogenase  46.42 
 
 		 498 aa  465  9.999999999999999e-131  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1164  betaine-aldehyde dehydrogenase  45.81 
 
 		 512 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.278559  normal  1 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4697  aldehyde dehydrogenase  44.58 
 
 		 496 aa  454  1.0000000000000001e-126  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.754003  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6789  Aldehyde Dehydrogenase  46.45 
 
 		 495 aa  454  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.772669  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4824  aldehyde dehydrogenase  47.76 
 
 		 492 aa  452  1.0000000000000001e-126  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.00512486  normal  0.364288 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6123  aldehyde dehydrogenase  47.38 
 
 		 493 aa  449  1e-125  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0174  aldehyde dehydrogenase  48.25 
 
 		 493 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.437593  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1006  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  47.13 
 
 		 491 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.179638  normal  0.457717 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6411  aldehyde dehydrogenase  47.38 
 
 		 493 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.599394 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4075  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  47.79 
 
 		 496 aa  429  1e-119  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.234292 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1970  aldehyde dehydrogenase  45.38 
 
 		 494 aa  431  1e-119  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0798984  normal  0.254214 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6831  aldehyde dehydrogenase  46.01 
 
 		 493 aa  431  1e-119  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1250  aldehyde dehydrogenase  44.67 
 
 		 503 aa  426  1e-118  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.790003 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2720  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  45.11 
 
 		 496 aa  422  1e-117  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.133505  normal  0.10056 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5587  Aldehyde Dehydrogenase  44.6 
 
 		 487 aa  420  1e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.347373  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6546  Betaine-aldehyde dehydrogenase  44.6 
 
 		 487 aa  419  1e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.173146  normal  0.885428 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2213  aldehyde dehydrogenase  46.44 
 
 		 490 aa  421  1e-116  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.00475065  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6088  aldehyde dehydrogenase  44.4 
 
 		 487 aa  416  9.999999999999999e-116  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6756  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  44.03 
 
 		 503 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.569452 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1004  betaine-aldehyde dehydrogenase  44.21 
 
 		 492 aa  408  1.0000000000000001e-112  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.460845  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1480  aldehyde dehydrogenase  43.4 
 
 		 490 aa  406  1.0000000000000001e-112  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0515859  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6251  aldehyde dehydrogenase  42.57 
 
 		 487 aa  407  1.0000000000000001e-112  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.392289 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2476  aldehyde dehydrogenase  40.04 
 
 		 497 aa  399  9.999999999999999e-111  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.124158  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4241  aldehyde dehydrogenase  43.31 
 
 		 498 aa  398  1e-109  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6130  Betaine-aldehyde dehydrogenase  43.51 
 
 		 492 aa  397  1e-109  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4156  aldehyde dehydrogenase  42.3 
 
 		 487 aa  395  1e-109  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.335298 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1493  aldehyde dehydrogenase family protein  44.28 
 
 		 488 aa  395  1e-108  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4430  betaine aldehyde dehydrogenase, NAD-dependent  47.52 
 
 		 496 aa  394  1e-108  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.81725  normal  0.345273 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4856  aldehyde dehydrogenase  44.94 
 
 		 483 aa  393  1e-108  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.263653  normal  0.221142 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0183  betaine-aldehyde dehydrogenase  43.1 
 
 		 499 aa  389  1e-107  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.352909  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7067  Aldehyde Dehydrogenase  43.74 
 
 		 496 aa  390  1e-107  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.340689  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3431  betaine-aldehyde dehydrogenase  44.01 
 
 		 488 aa  389  1e-107  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4700  aldehyde dehydrogenase  44.3 
 
 		 483 aa  386  1e-106  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0199533 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1315  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  44.92 
 
 		 496 aa  386  1e-106  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.953752  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2502  aldehyde dehydrogenase family protein  44.92 
 
 		 496 aa  385  1e-106  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6123  aldehyde dehydrogenase  43.44 
 
 		 489 aa  388  1e-106  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5622  aldehyde dehydrogenase  42.36 
 
 		 488 aa  388  1e-106  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.216133 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5214  betaine-aldehyde dehydrogenase  43.6 
 
 		 488 aa  387  1e-106  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1242  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  44.92 
 
 		 496 aa  385  1e-106  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4086  aldehyde dehydrogenase  43.8 
 
 		 488 aa  387  1e-106  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.515709  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1328  aldehyde dehydrogenase family protein  44.92 
 
 		 496 aa  384  1e-105  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0311  aldehyde dehydrogenase family protein  44.92 
 
 		 496 aa  384  1e-105  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0753946  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2738  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  42.77 
 
 		 488 aa  383  1e-105  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.525641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0980  aldehyde dehydrogenase family protein  44.92 
 
 		 496 aa  384  1e-105  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.340649  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3376  aldehyde dehydrogenase  43.6 
 
 		 488 aa  384  1e-105  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.399948  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0587  aldehyde dehydrogenase family protein  44.92 
 
 		 496 aa  384  1e-105  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0804  aldehyde dehydrogenase  43.78 
 
 		 500 aa  382  1e-105  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5435  aldehyde dehydrogenase  43.12 
 
 		 504 aa  385  1e-105  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.846738  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2154  aldehyde dehydrogenase  39.71 
 
 		 489 aa  379  1e-104  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1745  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  41.93 
 
 		 498 aa  380  1e-104  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6025  Aldehyde Dehydrogenase  43.35 
 
 		 483 aa  381  1e-104  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.181581 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2450  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  41.27 
 
 		 494 aa  380  1e-104  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3759  Aldehyde Dehydrogenase  41.44 
 
 		 490 aa  381  1e-104  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.304272 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2843  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  41.27 
 
 		 494 aa  380  1e-104  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.128159  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1556  Retinal dehydrogenase  42.74 
 
 		 490 aa  381  1e-104  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07430  hypothetical protein  39.42 
 
 		 481 aa  379  1e-104  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.782737  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2837  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  40.66 
 
 		 494 aa  376  1e-103  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000177336 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1948  benzaldehyde dehydrogenase  42.06 
 
 		 492 aa  376  1e-103  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000544418 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2882  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  40.41 
 
 		 494 aa  376  1e-103  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.198602  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2640  aldehyde dehydrogenase  40.86 
 
 		 494 aa  376  1e-103  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.198513  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2831  aldehyde dehydrogenase  40.86 
 
 		 494 aa  376  1e-103  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.217262  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6072  aldehyde dehydrogenase  43.18 
 
 		 488 aa  378  1e-103  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5599  betaine-aldehyde dehydrogenase  45.87 
 
 		 496 aa  376  1e-103  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0279735  normal  0.51588 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2504  Aldehyde Dehydrogenase  42.54 
 
 		 497 aa  378  1e-103  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.98157  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2860  aldehyde dehydrogenase  40.2 
 
 		 494 aa  375  1e-102  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2591  aldehyde dehydrogenase  40.45 
 
 		 494 aa  374  1e-102  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2556  aldehyde dehydrogenase  40.66 
 
 		 494 aa  374  1e-102  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.271873  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1759  aldehyde dehydrogenase B  39.12 
 
 		 486 aa  373  1e-102  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1138  5-carboxy-2-hydroxymuconate semialdehyde dehydrogenase  43.98 
 
 		 487 aa  373  1e-102  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.75141  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0940  5-carboxymethyl-2-hydroxymuconate semialdehyde dehydrogenase  43.98 
 
 		 487 aa  372  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3992  betaine-aldehyde dehydrogenase  44.9 
 
 		 496 aa  373  1e-102  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.254336  normal  0.0553876 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2265  5-carboxymethyl-2-hydroxymuconate semialdehyde dehydrogenase  44.19 
 
 		 487 aa  373  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2634  aldehyde dehydrogenase  40.41 
 
 		 494 aa  375  1e-102  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7156  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  43.7 
 
 		 494 aa  375  1e-102  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3909  gamma-glutamyl-gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  44.84 
 
 		 487 aa  373  1e-102  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1113  betaine-aldehyde dehydrogenase  45.63 
 
 		 496 aa  374  1e-102  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.016361  normal  0.253072 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4560  betaine-aldehyde dehydrogenase  45.87 
 
 		 496 aa  374  1e-102  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.288864  hitchhiker  0.00438962 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1025  5-carboxymethyl-2-hydroxymuconate semialdehyde dehydrogenase  43.98 
 
 		 487 aa  372  1e-102  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.230435  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1061  5-carboxymethyl-2-hydroxymuconate semialdehyde dehydrogenase  42.86 
 
 		 488 aa  372  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0102  5-carboxymethyl-2-hydroxymuconate semialdehyde dehydrogenase  43.98 
 
 		 487 aa  373  1e-102  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.371818  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0338  5-carboxymethyl-2-hydroxymuconate semialdehyde dehydrogenase  42.8 
 
 		 513 aa  375  1e-102  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1511  5-carboxymethyl-2-hydroxymuconate semialdehyde dehydrogenase  43.98 
 
 		 487 aa  373  1e-102  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0625314  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1535  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  41.84 
 
 		 493 aa  374  1e-102  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.31089  normal  0.378909 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13620  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  41.72 
 
 		 497 aa  374  1e-102  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1197  5-carboxymethyl-2-hydroxymuconate semialdehyde dehydrogenase  42.86 
 
 		 488 aa  372  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.692139 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1212  5-carboxymethyl-2-hydroxymuconate semialdehyde dehydrogenase  42.86 
 
 		 488 aa  372  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3841  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  43.4 
 
 		 508 aa  375  1e-102  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.829655 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>