More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_1948 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_1948  benzaldehyde dehydrogenase  100 
 
 		 492 aa  1007    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000544418 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0443  aldehyde dehydrogenase  60.08 
 
 		 477 aa  521  1e-146  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.451373  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4287  aldehyde dehydrogenase  49.58 
 
 		 473 aa  417  9.999999999999999e-116  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.323555 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4941  betaine-aldehyde dehydrogenase  46.48 
 
 		 498 aa  406  1.0000000000000001e-112  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4697  aldehyde dehydrogenase  46.7 
 
 		 496 aa  404  1e-111  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.754003  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1164  betaine-aldehyde dehydrogenase  45.67 
 
 		 512 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.278559  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4323  aldehyde dehydrogenase  42.47 
 
 		 503 aa  394  1e-108  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.181761 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2465  Aldehyde Dehydrogenase  43.42 
 
 		 485 aa  388  1e-106  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.146216  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1745  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  44.94 
 
 		 498 aa  388  1e-106  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1561  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  46.78 
 
 		 503 aa  386  1e-106  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2487  aldehyde dehydrogenase family protein  43.04 
 
 		 503 aa  382  1e-105  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4591  Betaine-aldehyde dehydrogenase  43.67 
 
 		 486 aa  385  1e-105  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0085  Aldehyde dehydrogenase (NAD(+))  43.42 
 
 		 493 aa  383  1e-105  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0308  hypothetical protein  42.83 
 
 		 488 aa  384  1e-105  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18440  Aldehyde dehydrogenase family protein  42.62 
 
 		 499 aa  383  1e-105  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.931316  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1480  aldehyde dehydrogenase  43.16 
 
 		 490 aa  383  1e-105  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0515859  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2174  aldehyde dehydrogenase  45.17 
 
 		 479 aa  385  1e-105  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000019217 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3401  betaine-aldehyde dehydrogenase  44.75 
 
 		 479 aa  383  1e-105  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1095  Aldehyde Dehydrogenase  44.33 
 
 		 479 aa  380  1e-104  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0292  hypothetical protein  42.41 
 
 		 488 aa  380  1e-104  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2407  aldehyde dehydrogenase  42.28 
 
 		 493 aa  379  1e-104  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.830868  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3233  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  41.7 
 
 		 493 aa  380  1e-104  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.436611  normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3848  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  42.62 
 
 		 501 aa  379  1e-104  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0362745  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6789  Aldehyde Dehydrogenase  47.78 
 
 		 495 aa  379  1e-104  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.772669  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2673  aldehyde dehydrogenase family protein  42.07 
 
 		 493 aa  375  1e-103  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0828689  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2664  aldehyde dehydrogenase  43.87 
 
 		 480 aa  375  1e-103  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0216707  normal  0.214781 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1006  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  44.3 
 
 		 491 aa  377  1e-103  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.179638  normal  0.457717 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1381  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  42.68 
 
 		 496 aa  377  1e-103  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.514457 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1966  Aldehyde Dehydrogenase  42.77 
 
 		 478 aa  378  1e-103  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.57596 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_09034  aldehyde dehydrogenase ALDH (AFU_orthologue; AFUA_8G02310)  44.67 
 
 		 511 aa  373  1e-102  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.699324  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1966  Aldehyde Dehydrogenase  44.42 
 
 		 477 aa  372  1e-102  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.150614  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6025  Aldehyde Dehydrogenase  43.76 
 
 		 483 aa  374  1e-102  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.181581 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4061  Aldehyde dehydrogenase (NAD(+))  44.56 
 
 		 505 aa  372  1e-102  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3047  Aldehyde Dehydrogenase  43.25 
 
 		 508 aa  372  1e-102  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1756  aldehyde dehydrogenase  44.21 
 
 		 477 aa  370  1e-101  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0603102  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2720  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  45.88 
 
 		 496 aa  371  1e-101  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.133505  normal  0.10056 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3562  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  41.8 
 
 		 494 aa  369  1e-101  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.37194  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2555  betaine aldehyde dehydrogenase  43.37 
 
 		 490 aa  365  1e-100  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0789453  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2904  aldehyde dehydrogenase  42.3 
 
 		 494 aa  366  1e-100  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.399829  normal  0.436531 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5505  Aldehyde Dehydrogenase  42.94 
 
 		 504 aa  367  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000574808 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4824  aldehyde dehydrogenase  43.63 
 
 		 492 aa  366  1e-100  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.00512486  normal  0.364288 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4700  aldehyde dehydrogenase  42.77 
 
 		 483 aa  365  1e-100  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0199533 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2257  aldehyde dehydrogenase  41.44 
 
 		 493 aa  365  1e-100  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5745  aldehyde dehydrogenase  44.54 
 
 		 479 aa  365  1e-100  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0583119  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2290  betaine-aldehyde dehydrogenase  39.96 
 
 		 503 aa  366  1e-100  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.109533 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4196  Aldehyde Dehydrogenase  43.46 
 
 		 483 aa  368  1e-100  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.115052  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2524  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  40.98 
 
 		 509 aa  366  1e-100  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.70277  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2154  aldehyde dehydrogenase  40.78 
 
 		 489 aa  365  1e-99  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3439  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  40.5 
 
 		 493 aa  365  1e-99  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.383483  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0886  Aldehyde Dehydrogenase  41.86 
 
 		 473 aa  364  2e-99  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4086  aldehyde dehydrogenase  40.59 
 
 		 488 aa  364  2e-99  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.515709  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3822  Aldehyde Dehydrogenase  44.4 
 
 		 498 aa  364  2e-99  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.21672  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3431  betaine-aldehyde dehydrogenase  40.59 
 
 		 488 aa  364  2e-99  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0744  Betaine-aldehyde dehydrogenase  42.62 
 
 		 496 aa  363  4e-99  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2422  aldehyde dehydrogenase  44.33 
 
 		 479 aa  362  7.0000000000000005e-99  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.283723 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5904  aldehyde dehydrogenase  42.29 
 
 		 482 aa  362  8e-99  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.474261 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5539  aldehyde dehydrogenase  42.29 
 
 		 482 aa  362  8e-99  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0482  betaine aldehyde dehydrogenase  43.12 
 
 		 490 aa  362  9e-99  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2614  aldehyde dehydrogenase  42.59 
 
 		 478 aa  362  1e-98  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2862  Aldehyde Dehydrogenase  42.21 
 
 		 505 aa  361  1e-98  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3646  aldehyde dehydrogenase family protein  41.01 
 
 		 493 aa  361  2e-98  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.196663 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2084  aldehyde dehydrogenase  41.23 
 
 		 493 aa  360  2e-98  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2738  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  40.38 
 
 		 488 aa  361  2e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.525641  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0677  aldehyde dehydrogenase  42.59 
 
 		 478 aa  361  2e-98  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.663172  normal  0.354632 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4733  Aldehyde Dehydrogenase  40.98 
 
 		 506 aa  360  2e-98  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.29898  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2380  betaine-aldehyde dehydrogenase  45.44 
 
 		 487 aa  361  2e-98  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0777  betaine aldehyde dehydrogenase  44.65 
 
 		 487 aa  361  2e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.549042  normal  0.0734216 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2418  aldehyde dehydrogenase  44.12 
 
 		 479 aa  360  3e-98  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2262  aldehyde dehydrogenase  41.23 
 
 		 493 aa  360  3e-98  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4882  aldehyde dehydrogenase  44.19 
 
 		 477 aa  360  3e-98  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.895119  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1147  betaine aldehyde dehydrogenase  43.92 
 
 		 488 aa  360  3e-98  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4856  aldehyde dehydrogenase  43.68 
 
 		 483 aa  360  3e-98  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.263653  normal  0.221142 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1806  aldehyde dehydrogenase  44.12 
 
 		 479 aa  360  3e-98  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0847  betaine-aldehyde dehydrogenase  40.93 
 
 		 494 aa  359  7e-98  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00938434  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01689  aldehyde dehydrogenase family (Eurofung)  42.62 
 
 		 501 aa  358  9.999999999999999e-98  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.259255 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5622  aldehyde dehydrogenase  40.08 
 
 		 488 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.216133 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2344  Aldehyde Dehydrogenase  42.05 
 
 		 477 aa  358  9.999999999999999e-98  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.754482  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1004  betaine-aldehyde dehydrogenase  42 
 
 		 492 aa  357  2.9999999999999997e-97  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.460845  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5214  betaine-aldehyde dehydrogenase  39.96 
 
 		 488 aa  357  3.9999999999999996e-97  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5124  putative aldehyde dehydrogenase family protein  46.83 
 
 		 509 aa  357  3.9999999999999996e-97  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.982748  normal  0.331095 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4763  Aldehyde Dehydrogenase  40.88 
 
 		 500 aa  356  5.999999999999999e-97  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0563  betaine aldehyde dehydrogenase  44.44 
 
 		 487 aa  355  7.999999999999999e-97  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.886348  normal  0.578799 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2504  Aldehyde Dehydrogenase  41.01 
 
 		 497 aa  355  1e-96  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.98157  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5435  aldehyde dehydrogenase  43.63 
 
 		 504 aa  355  1e-96  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.846738  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2837  Aldehyde Dehydrogenase  40.21 
 
 		 502 aa  355  1e-96  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6756  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  41.53 
 
 		 503 aa  355  1e-96  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.569452 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1591  betaine aldehyde dehydrogenase  42.32 
 
 		 489 aa  355  1e-96  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1535  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  42.06 
 
 		 493 aa  355  1e-96  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.31089  normal  0.378909 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4241  aldehyde dehydrogenase  41.63 
 
 		 498 aa  355  1e-96  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6130  Betaine-aldehyde dehydrogenase  41.65 
 
 		 492 aa  355  1e-96  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3569  aldehyde dehydrogenase  40.95 
 
 		 494 aa  354  2e-96  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3257  aldehyde dehydrogenase  40.94 
 
 		 494 aa  354  2e-96  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.536879  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0986  betaine-aldehyde dehydrogenase  41.14 
 
 		 481 aa  354  2e-96  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.669194  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4012  Aldehyde Dehydrogenase  42.77 
 
 		 508 aa  354  2e-96  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3376  aldehyde dehydrogenase  39.75 
 
 		 488 aa  354  2e-96  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.399948  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0149  aldehyde dehydrogenase  41.45 
 
 		 507 aa  354  2e-96  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.1483 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5059  betaine aldehyde dehydrogenase  42.53 
 
 		 489 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0560116 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70950  betaine aldehyde dehydrogenase  41.68 
 
 		 490 aa  353  2.9999999999999997e-96  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.934353 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0050  phenylacetaldehyde dehydrogenase  43.8 
 
 		 501 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6831  aldehyde dehydrogenase  42.68 
 
 		 493 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>