More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_0986 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007908  Rfer_0986  betaine-aldehyde dehydrogenase  100 
 
 
481 aa  979    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.669194  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5372  aldehyde dehydrogenase family protein  55.18 
 
 
481 aa  522  1e-147  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.302622  normal  0.199595 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001293  aldehyde dehydrogenase  49.47 
 
 
478 aa  447  1.0000000000000001e-124  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2465  Aldehyde Dehydrogenase  47.42 
 
 
485 aa  427  1e-118  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.146216  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1561  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  46.35 
 
 
503 aa  413  1e-114  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2450  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  44.51 
 
 
494 aa  399  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2634  aldehyde dehydrogenase  43.33 
 
 
494 aa  395  1e-109  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2843  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  44.51 
 
 
494 aa  396  1e-109  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.128159  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1381  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  45.78 
 
 
496 aa  395  1e-109  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.514457 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2174  aldehyde dehydrogenase  45.26 
 
 
479 aa  392  1e-108  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000019217 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2860  aldehyde dehydrogenase  43.53 
 
 
494 aa  393  1e-108  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2640  aldehyde dehydrogenase  43.74 
 
 
494 aa  395  1e-108  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.198513  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2591  aldehyde dehydrogenase  43.33 
 
 
494 aa  393  1e-108  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2556  aldehyde dehydrogenase  43.53 
 
 
494 aa  393  1e-108  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.271873  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2837  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  43.53 
 
 
494 aa  394  1e-108  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000177336 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2831  aldehyde dehydrogenase  43.74 
 
 
494 aa  395  1e-108  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.217262  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2882  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  43.53 
 
 
494 aa  392  1e-108  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.198602  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3759  Aldehyde Dehydrogenase  44.4 
 
 
490 aa  390  1e-107  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.304272 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0886  Aldehyde Dehydrogenase  44.7 
 
 
473 aa  390  1e-107  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1556  Retinal dehydrogenase  44.4 
 
 
490 aa  387  1e-106  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1095  Aldehyde Dehydrogenase  44.51 
 
 
479 aa  387  1e-106  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1480  aldehyde dehydrogenase  42.86 
 
 
490 aa  388  1e-106  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0515859  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3401  betaine-aldehyde dehydrogenase  44.94 
 
 
479 aa  385  1e-106  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5904  aldehyde dehydrogenase  43.96 
 
 
482 aa  382  1e-105  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.474261 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5539  aldehyde dehydrogenase  43.96 
 
 
482 aa  382  1e-105  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2599  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  43.76 
 
 
490 aa  380  1e-104  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.225795  normal  0.197804 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3562  aldehyde dehydrogenase (NAD)  42.16 
 
 
494 aa  375  1e-103  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00134581 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2350  aldehyde dehydrogenase  44.51 
 
 
478 aa  377  1e-103  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.944535  normal  0.84057 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3569  aldehyde dehydrogenase  42.37 
 
 
494 aa  377  1e-103  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1014  aldehyde dehydrogenase family protein  42.41 
 
 
497 aa  377  1e-103  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3348  aldehyde dehydrogenase  42.16 
 
 
494 aa  375  1e-103  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0219223  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3313  aldehyde dehydrogenase  42.16 
 
 
494 aa  375  1e-103  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3263  aldehyde dehydrogenase  42.16 
 
 
494 aa  375  1e-103  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2504  Aldehyde Dehydrogenase  43.86 
 
 
497 aa  378  1e-103  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.98157  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3609  aldehyde dehydrogenase  42.16 
 
 
494 aa  375  1e-103  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1655  aldehyde dehydrogenase (NAD)  42.37 
 
 
494 aa  377  1e-103  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0330388 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3662  aldehyde dehydrogenase (NAD)  42.16 
 
 
494 aa  375  1e-103  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3257  aldehyde dehydrogenase  42.16 
 
 
494 aa  374  1e-102  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.536879  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1745  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  42.86 
 
 
498 aa  374  1e-102  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2904  aldehyde dehydrogenase  44.82 
 
 
494 aa  373  1e-102  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.399829  normal  0.436531 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2566  Aldehyde Dehydrogenase  44.3 
 
 
478 aa  374  1e-102  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0677  aldehyde dehydrogenase  45.47 
 
 
478 aa  374  1e-102  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.663172  normal  0.354632 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2161  Aldehyde Dehydrogenase  43.67 
 
 
478 aa  372  1e-101  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.046835  normal  0.828531 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2229  aldehyde dehydrogenase  42.32 
 
 
494 aa  370  1e-101  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.545234  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4196  Aldehyde Dehydrogenase  44.73 
 
 
483 aa  370  1e-101  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.115052  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1286  aldehyde dehydrogenase  42.62 
 
 
490 aa  371  1e-101  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4700  aldehyde dehydrogenase  44.87 
 
 
483 aa  367  1e-100  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0199533 
 
 
-
 
NC_006691  CNF03900  aldehyde dehydrogenase (alddh), putative  42.74 
 
 
506 aa  368  1e-100  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0956  aldehyde dehydrogenase family protein  41.98 
 
 
497 aa  368  1e-100  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3562  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  43.76 
 
 
494 aa  365  1e-100  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.37194  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4061  Aldehyde dehydrogenase (NAD(+))  43.88 
 
 
505 aa  367  1e-100  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1948  benzaldehyde dehydrogenase  41.98 
 
 
492 aa  364  2e-99  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  unclonable  0.000000544418 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2614  aldehyde dehydrogenase  44.21 
 
 
478 aa  363  3e-99  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0085  Aldehyde dehydrogenase (NAD(+))  43.16 
 
 
493 aa  363  5.0000000000000005e-99  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1164  betaine-aldehyde dehydrogenase  42.37 
 
 
512 aa  360  2e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.278559  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4655  betaine-aldehyde dehydrogenase  45.55 
 
 
505 aa  359  7e-98  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.402279  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3713  betaine-aldehyde dehydrogenase  45.55 
 
 
505 aa  359  7e-98  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.448124  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0744  Betaine-aldehyde dehydrogenase  41.86 
 
 
496 aa  359  8e-98  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1868  Retinal dehydrogenase  43.43 
 
 
492 aa  358  8e-98  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2407  aldehyde dehydrogenase  42.68 
 
 
493 aa  358  9e-98  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.830868  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5649  aldehyde dehydrogenase  45.55 
 
 
505 aa  357  2.9999999999999997e-97  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.327669 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3585  betaine-aldehyde dehydrogenase  42.53 
 
 
477 aa  357  2.9999999999999997e-97  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.863463  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6025  Aldehyde Dehydrogenase  44.02 
 
 
483 aa  357  2.9999999999999997e-97  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.181581 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2673  aldehyde dehydrogenase family protein  42.47 
 
 
493 aa  356  3.9999999999999996e-97  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0828689  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5745  aldehyde dehydrogenase  44.38 
 
 
479 aa  354  2e-96  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0583119  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2380  betaine-aldehyde dehydrogenase  46.53 
 
 
487 aa  354  2e-96  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1476  betaine aldehyde dehydrogenase  41.1 
 
 
490 aa  354  2.9999999999999997e-96  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND02060  Aldehyde dehydrogenase (ALDDH), putative  45.03 
 
 
495 aa  353  4e-96  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0776  betaine-aldehyde dehydrogenase  44.02 
 
 
481 aa  353  4e-96  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.141721  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3233  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  42.8 
 
 
493 aa  352  8e-96  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.436611  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2422  aldehyde dehydrogenase  43.75 
 
 
479 aa  352  1e-95  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.283723 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4856  aldehyde dehydrogenase  43.01 
 
 
483 aa  352  1e-95  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.263653  normal  0.221142 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5435  aldehyde dehydrogenase  41.47 
 
 
504 aa  350  3e-95  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.846738  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00554  Aldehyde dehydrogenase (ALDDH)(ALDH)(EC 1.2.1.3) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P08157]  42.8 
 
 
497 aa  349  5e-95  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.534945  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0874  aldehyde dehydrogenase  44 
 
 
479 aa  350  5e-95  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.476262  normal  0.570338 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2418  aldehyde dehydrogenase  43.54 
 
 
479 aa  350  5e-95  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1806  aldehyde dehydrogenase  43.54 
 
 
479 aa  350  5e-95  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4591  Betaine-aldehyde dehydrogenase  41.67 
 
 
486 aa  349  6e-95  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1535  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  41.29 
 
 
493 aa  349  7e-95  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.31089  normal  0.378909 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05500  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  44.28 
 
 
479 aa  348  1e-94  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4949  aldehyde dehydrogenase  41.15 
 
 
477 aa  348  1e-94  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.986503  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2257  aldehyde dehydrogenase  41.53 
 
 
493 aa  347  3e-94  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2328  aldehyde dehydrogenase  44.38 
 
 
479 aa  347  3e-94  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2463  aldehyde dehydrogenase  44.38 
 
 
479 aa  347  3e-94  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.32545  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3439  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  41.74 
 
 
493 aa  347  3e-94  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.383483  normal 
 
 
-
 
NC_006681  CNL05070  Aldehyde dehydrogenase (ALDDH), putative  41.77 
 
 
524 aa  347  4e-94  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3646  aldehyde dehydrogenase family protein  41.74 
 
 
493 aa  346  5e-94  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.196663 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1966  Aldehyde Dehydrogenase  42.79 
 
 
477 aa  346  5e-94  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.150614  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_63844  mitochondrial aldehyde dehydrogenase  42.56 
 
 
501 aa  346  5e-94  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.704992  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2160  betaine-aldehyde dehydrogenase  40.88 
 
 
496 aa  345  8e-94  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2262  aldehyde dehydrogenase  41.74 
 
 
493 aa  345  8e-94  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5622  aldehyde dehydrogenase  42.14 
 
 
488 aa  345  1e-93  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.216133 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0443  aldehyde dehydrogenase  46.27 
 
 
477 aa  345  1e-93  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.451373  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4984  aldehyde dehydrogenase  44.04 
 
 
503 aa  345  1e-93  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.355806  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2720  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  41.1 
 
 
496 aa  345  1e-93  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.133505  normal  0.10056 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4941  betaine-aldehyde dehydrogenase  41.1 
 
 
498 aa  345  1e-93  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2084  aldehyde dehydrogenase  41.74 
 
 
493 aa  344  2e-93  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_29563  Aldehyde dehydrogenase  40.47 
 
 
495 aa  344  2e-93  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.161421  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3006  aldehyde dehydrogenase family protein  42.19 
 
 
479 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1083  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  42.19 
 
 
479 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>