More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_05500 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_0364  betaine-aldehyde dehydrogenase  77.36 
 
 
478 aa  746    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0827  aldehyde dehydrogenase  77.68 
 
 
476 aa  766    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0476667 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0798  Aldehyde Dehydrogenase  78.27 
 
 
483 aa  752    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3529  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  77.05 
 
 
484 aa  759    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1348  Betaine-aldehyde dehydrogenase  76.53 
 
 
817 aa  742    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.534066 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0778  Betaine-aldehyde dehydrogenase  79.37 
 
 
474 aa  777    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3248  Betaine-aldehyde dehydrogenase  75.9 
 
 
476 aa  725    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4391  Betaine-aldehyde dehydrogenase  76.96 
 
 
480 aa  731    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.436342  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0851  Aldehyde Dehydrogenase  77.89 
 
 
480 aa  767    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0771  aldehyde dehydrogenase  77.31 
 
 
476 aa  770    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.302759 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0742  Betaine-aldehyde dehydrogenase  76.36 
 
 
478 aa  760    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0209  Aldehyde Dehydrogenase  75.37 
 
 
477 aa  707    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00353417 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05500  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  100 
 
 
479 aa  976    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2233  Aldehyde dehydrogenase (NAD(+))  59.01 
 
 
788 aa  548  1e-154  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.635265  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2836  aldehyde dehydrogenase  55.49 
 
 
798 aa  528  1e-149  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.177288  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3794  aldehyde dehydrogenase  58.41 
 
 
783 aa  513  1e-144  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0313  aldehyde dehydrogenase  56.55 
 
 
792 aa  504  1e-141  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3740  aldehyde dehydrogenase  55.6 
 
 
791 aa  496  1e-139  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.977934  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3348  hypothetical protein  54.89 
 
 
792 aa  495  1e-139  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.330757 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2689  aldehyde dehydrogenase  57.68 
 
 
798 aa  496  1e-139  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.583529 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3472  betaine-aldehyde dehydrogenase  55.6 
 
 
791 aa  493  9.999999999999999e-139  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.27044  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3017  aldehyde dehydrogenase  56 
 
 
780 aa  488  1e-137  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.828934  normal  0.325686 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0786  aldehyde dehydrogenase  55.79 
 
 
779 aa  488  1e-136  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0096  aldehyde dehydrogenase  56.21 
 
 
780 aa  479  1e-134  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.493554  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1274  betaine-aldehyde dehydrogenase  53.3 
 
 
798 aa  468  9.999999999999999e-131  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.117551 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4653  aldehyde dehydrogenase  52.45 
 
 
797 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.197887  normal  0.568756 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5195  Aldehyde dehydrogenase (NAD(+))  54.19 
 
 
787 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.157706  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1400  betaine-aldehyde dehydrogenase  53.3 
 
 
796 aa  458  9.999999999999999e-129  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.346772  normal  0.232291 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2504  Aldehyde Dehydrogenase  50.21 
 
 
497 aa  455  1e-127  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.98157  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7827  putative membrane-anchored aldehyde dehydrogenase protein  53.02 
 
 
795 aa  453  1.0000000000000001e-126  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.568371  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2599  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  48.76 
 
 
490 aa  449  1e-125  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.225795  normal  0.197804 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2281  Aldehyde dehydrogenase (NAD(+))  53.42 
 
 
795 aa  446  1.0000000000000001e-124  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.392437 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3898  aldehyde dehydrogenase  54.53 
 
 
776 aa  448  1.0000000000000001e-124  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1556  Retinal dehydrogenase  49.78 
 
 
490 aa  444  1e-123  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0886  Aldehyde Dehydrogenase  48.82 
 
 
473 aa  442  1e-123  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4632  aldehyde dehydrogenase  54.67 
 
 
794 aa  432  1e-120  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.698936  normal  0.244217 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2229  aldehyde dehydrogenase  48.2 
 
 
494 aa  434  1e-120  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.545234  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3759  Aldehyde Dehydrogenase  47.64 
 
 
490 aa  429  1e-119  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.304272 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2605  aldehyde dehydrogenase  47.54 
 
 
494 aa  419  1e-116  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000129908  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1868  Retinal dehydrogenase  48.17 
 
 
492 aa  421  1e-116  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3662  aldehyde dehydrogenase (NAD)  46.3 
 
 
494 aa  419  1e-116  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3569  aldehyde dehydrogenase  46.3 
 
 
494 aa  418  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3348  aldehyde dehydrogenase  46.19 
 
 
494 aa  417  9.999999999999999e-116  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0219223  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3313  aldehyde dehydrogenase  46.19 
 
 
494 aa  417  9.999999999999999e-116  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3263  aldehyde dehydrogenase  46.19 
 
 
494 aa  417  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3562  aldehyde dehydrogenase (NAD)  46.19 
 
 
494 aa  417  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00134581 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3609  aldehyde dehydrogenase  46.19 
 
 
494 aa  417  9.999999999999999e-116  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1655  aldehyde dehydrogenase (NAD)  46.09 
 
 
494 aa  417  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0330388 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1381  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  47.32 
 
 
496 aa  417  9.999999999999999e-116  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.514457 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3257  aldehyde dehydrogenase  45.88 
 
 
494 aa  417  9.999999999999999e-116  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.536879  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2843  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  45.68 
 
 
494 aa  412  1e-114  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.128159  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2860  aldehyde dehydrogenase  45.47 
 
 
494 aa  409  1e-113  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1745  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  48.05 
 
 
498 aa  411  1e-113  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1480  aldehyde dehydrogenase  45.86 
 
 
490 aa  409  1e-113  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0515859  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2882  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  45.68 
 
 
494 aa  410  1e-113  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.198602  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2634  aldehyde dehydrogenase  45.47 
 
 
494 aa  409  1e-113  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2450  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  45.26 
 
 
494 aa  411  1e-113  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2837  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  45.47 
 
 
494 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000177336 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2640  aldehyde dehydrogenase  45.47 
 
 
494 aa  408  1.0000000000000001e-112  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.198513  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2591  aldehyde dehydrogenase  45.26 
 
 
494 aa  405  1.0000000000000001e-112  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF03900  aldehyde dehydrogenase (alddh), putative  44.66 
 
 
506 aa  405  1.0000000000000001e-112  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2831  aldehyde dehydrogenase  45.47 
 
 
494 aa  408  1.0000000000000001e-112  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.217262  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4700  aldehyde dehydrogenase  46.34 
 
 
483 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0199533 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2556  aldehyde dehydrogenase  45.05 
 
 
494 aa  404  1e-111  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.271873  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1527  transposase, IS605 OrfB family  50.5 
 
 
421 aa  403  1e-111  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3841  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  45.84 
 
 
508 aa  405  1e-111  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.829655 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_29563  Aldehyde dehydrogenase  43.66 
 
 
495 aa  402  1e-111  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.161421  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01689  aldehyde dehydrogenase family (Eurofung)  46.17 
 
 
501 aa  401  9.999999999999999e-111  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.259255 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6025  Aldehyde Dehydrogenase  46.78 
 
 
483 aa  398  1e-109  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.181581 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4856  aldehyde dehydrogenase  46.34 
 
 
483 aa  397  1e-109  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.263653  normal  0.221142 
 
 
-
 
NC_006686  CND02060  Aldehyde dehydrogenase (ALDDH), putative  45.57 
 
 
495 aa  394  1e-108  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2487  aldehyde dehydrogenase family protein  46.27 
 
 
503 aa  389  1e-107  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0129  betaine aldehyde dehydrogenase  46.22 
 
 
494 aa  390  1e-107  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00429668  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2738  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  44.18 
 
 
488 aa  386  1e-106  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.525641  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1244  Aldehyde Dehydrogenase  43.16 
 
 
490 aa  388  1e-106  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00471898  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0744  Betaine-aldehyde dehydrogenase  45.65 
 
 
496 aa  385  1e-106  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0158  aldehyde dehydrogenase  43.37 
 
 
495 aa  382  1e-105  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18440  Aldehyde dehydrogenase family protein  46.15 
 
 
499 aa  382  1e-105  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.931316  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0153  aldehyde dehydrogenase  43.37 
 
 
495 aa  382  1e-105  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0958  aldehyde dehydrogenase  43.79 
 
 
492 aa  379  1e-104  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.938749  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3159  betaine-aldehyde dehydrogenase  44.47 
 
 
484 aa  381  1e-104  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4086  aldehyde dehydrogenase  44.18 
 
 
488 aa  381  1e-104  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.515709  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3431  betaine-aldehyde dehydrogenase  43.97 
 
 
488 aa  379  1e-104  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2837  Aldehyde Dehydrogenase  43.39 
 
 
502 aa  381  1e-104  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2862  Aldehyde Dehydrogenase  43.99 
 
 
505 aa  378  1e-103  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6130  Betaine-aldehyde dehydrogenase  43.62 
 
 
492 aa  376  1e-103  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3376  aldehyde dehydrogenase  44.18 
 
 
488 aa  377  1e-103  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.399948  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5214  betaine-aldehyde dehydrogenase  43.32 
 
 
488 aa  377  1e-103  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2154  aldehyde dehydrogenase  42.37 
 
 
489 aa  375  1e-102  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2823  betaine aldehyde dehydrogenase  44.86 
 
 
491 aa  375  1e-102  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5036  betaine aldehyde dehydrogenase  43.97 
 
 
489 aa  372  1e-102  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.418531  normal  0.930048 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3562  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  43.07 
 
 
494 aa  374  1e-102  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.37194  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5435  aldehyde dehydrogenase  45.34 
 
 
504 aa  374  1e-102  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.846738  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2053  aldehyde dehydrogenase family protein  42.35 
 
 
499 aa  370  1e-101  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3881  Aldehyde Dehydrogenase  45.87 
 
 
507 aa  370  1e-101  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.159111 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1515  betaine aldehyde dehydrogenase  41.93 
 
 
494 aa  370  1e-101  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1476  betaine aldehyde dehydrogenase  43.04 
 
 
490 aa  369  1e-101  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5622  aldehyde dehydrogenase  42.89 
 
 
488 aa  370  1e-101  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.216133 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4511  betaine aldehyde dehydrogenase  43.97 
 
 
489 aa  371  1e-101  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.644708 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3586  aldehyde dehydrogenase  45.21 
 
 
501 aa  369  1e-101  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.615905 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>