More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_3017 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_3017  aldehyde dehydrogenase  100 
 
 		 780 aa  1568    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.828934  normal  0.325686 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3472  betaine-aldehyde dehydrogenase  55.79 
 
 		 791 aa  779    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.27044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7827  putative membrane-anchored aldehyde dehydrogenase protein  61.88 
 
 		 795 aa  930    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.568371  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3794  aldehyde dehydrogenase  61.02 
 
 		 783 aa  908    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3348  hypothetical protein  55.42 
 
 		 792 aa  793    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.330757 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3740  aldehyde dehydrogenase  55.67 
 
 		 791 aa  777    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.977934  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5195  Aldehyde dehydrogenase (NAD(+))  62.28 
 
 		 787 aa  909    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.157706  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2281  Aldehyde dehydrogenase (NAD(+))  60.78 
 
 		 795 aa  899    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.392437 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0786  aldehyde dehydrogenase  68.97 
 
 		 779 aa  1068    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1400  betaine-aldehyde dehydrogenase  62.08 
 
 		 796 aa  917    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.346772  normal  0.232291 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1274  betaine-aldehyde dehydrogenase  60.62 
 
 		 798 aa  924    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.117551 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4632  aldehyde dehydrogenase  61.1 
 
 		 794 aa  903    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.698936  normal  0.244217 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0096  aldehyde dehydrogenase  70.33 
 
 		 780 aa  1104    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.493554  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2233  Aldehyde dehydrogenase (NAD(+))  61.86 
 
 		 788 aa  937    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.635265  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0313  aldehyde dehydrogenase  60.63 
 
 		 792 aa  891    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2836  aldehyde dehydrogenase  57.99 
 
 		 798 aa  903    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.177288  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4653  aldehyde dehydrogenase  62.38 
 
 		 797 aa  919    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.197887  normal  0.568756 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3898  aldehyde dehydrogenase  56.32 
 
 		 776 aa  765    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2689  aldehyde dehydrogenase  57.14 
 
 		 798 aa  813    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.583529 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1348  Betaine-aldehyde dehydrogenase  45.12 
 
 		 817 aa  594  1e-168  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.534066 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0851  Aldehyde Dehydrogenase  57.76 
 
 		 480 aa  509  9.999999999999999e-143  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0778  Betaine-aldehyde dehydrogenase  55.83 
 
 		 474 aa  500  1e-140  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3529  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  54.7 
 
 		 484 aa  502  1e-140  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0742  Betaine-aldehyde dehydrogenase  54.89 
 
 		 478 aa  491  1e-137  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05500  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  56 
 
 		 479 aa  488  1e-136  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0771  aldehyde dehydrogenase  54.93 
 
 		 476 aa  485  1e-135  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.302759 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0827  aldehyde dehydrogenase  54.93 
 
 		 476 aa  483  1e-135  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0476667 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0364  betaine-aldehyde dehydrogenase  53.89 
 
 		 478 aa  484  1e-135  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0798  Aldehyde Dehydrogenase  54.4 
 
 		 483 aa  479  1e-134  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0209  Aldehyde Dehydrogenase  53.22 
 
 		 477 aa  472  1.0000000000000001e-131  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00353417 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3248  Betaine-aldehyde dehydrogenase  52.81 
 
 		 476 aa  462  1e-129  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4391  Betaine-aldehyde dehydrogenase  54.36 
 
 		 480 aa  462  9.999999999999999e-129  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.436342  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1381  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  46.68 
 
 		 496 aa  382  1e-105  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.514457 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2504  Aldehyde Dehydrogenase  47.46 
 
 		 497 aa  382  1e-104  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.98157  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2599  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  45.27 
 
 		 490 aa  372  1e-101  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.225795  normal  0.197804 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6130  Betaine-aldehyde dehydrogenase  43.59 
 
 		 492 aa  368  1e-100  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2229  aldehyde dehydrogenase  45.91 
 
 		 494 aa  366  1e-100  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.545234  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3348  aldehyde dehydrogenase  44.8 
 
 		 494 aa  365  1e-99  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0219223  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3313  aldehyde dehydrogenase  44.8 
 
 		 494 aa  365  1e-99  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3263  aldehyde dehydrogenase  44.8 
 
 		 494 aa  365  1e-99  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3562  aldehyde dehydrogenase (NAD)  44.8 
 
 		 494 aa  365  1e-99  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00134581 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3609  aldehyde dehydrogenase  44.8 
 
 		 494 aa  365  1e-99  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3662  aldehyde dehydrogenase (NAD)  45.26 
 
 		 494 aa  365  2e-99  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3569  aldehyde dehydrogenase  45.26 
 
 		 494 aa  364  4e-99  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1868  Retinal dehydrogenase  44.54 
 
 		 492 aa  364  4e-99  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1655  aldehyde dehydrogenase (NAD)  44.59 
 
 		 494 aa  364  4e-99  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0330388 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0886  Aldehyde Dehydrogenase  45.34 
 
 		 473 aa  363  6e-99  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3257  aldehyde dehydrogenase  44.83 
 
 		 494 aa  362  1e-98  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.536879  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0272  aldehyde dehydrogenase  45.88 
 
 		 517 aa  361  4e-98  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1556  Retinal dehydrogenase  42.89 
 
 		 490 aa  360  5e-98  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3759  Aldehyde Dehydrogenase  44.74 
 
 		 490 aa  360  5e-98  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.304272 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0265  aldehyde dehydrogenase  45.47 
 
 		 512 aa  359  9.999999999999999e-98  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00113994 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2605  aldehyde dehydrogenase  44.44 
 
 		 494 aa  355  2e-96  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000129908  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01689  aldehyde dehydrogenase family (Eurofung)  43.01 
 
 		 501 aa  354  2.9999999999999997e-96  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.259255 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5622  aldehyde dehydrogenase  41.58 
 
 		 488 aa  352  1e-95  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.216133 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2487  aldehyde dehydrogenase family protein  44.78 
 
 		 503 aa  352  2e-95  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5435  aldehyde dehydrogenase  44.06 
 
 		 504 aa  351  2e-95  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.846738  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2738  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  42.27 
 
 		 488 aa  349  9e-95  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.525641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1745  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  44.69 
 
 		 498 aa  348  2e-94  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0958  aldehyde dehydrogenase  40.96 
 
 		 492 aa  348  2e-94  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.938749  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2154  aldehyde dehydrogenase  38.71 
 
 		 489 aa  348  3e-94  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2862  Aldehyde Dehydrogenase  44.69 
 
 		 505 aa  345  2e-93  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF03900  aldehyde dehydrogenase (alddh), putative  40.7 
 
 		 506 aa  344  2.9999999999999997e-93  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4086  aldehyde dehydrogenase  41.63 
 
 		 488 aa  344  4e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.515709  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3376  aldehyde dehydrogenase  41.85 
 
 		 488 aa  344  4e-93  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.399948  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5214  betaine-aldehyde dehydrogenase  41.42 
 
 		 488 aa  344  4e-93  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0158  aldehyde dehydrogenase  39.87 
 
 		 495 aa  343  5.999999999999999e-93  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0153  aldehyde dehydrogenase  39.87 
 
 		 495 aa  343  5.999999999999999e-93  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_29563  Aldehyde dehydrogenase  40.81 
 
 		 495 aa  343  5.999999999999999e-93  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.161421  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3431  betaine-aldehyde dehydrogenase  41.63 
 
 		 488 aa  343  7e-93  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1759  aldehyde dehydrogenase B  39.48 
 
 		 486 aa  342  2e-92  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2295  2-hydroxymuconic semialdehyde dehydrogenase  43.01 
 
 		 491 aa  342  2e-92  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18440  Aldehyde dehydrogenase family protein  43.28 
 
 		 499 aa  342  2e-92  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.931316  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6072  aldehyde dehydrogenase  41.85 
 
 		 488 aa  341  2.9999999999999998e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2837  Aldehyde Dehydrogenase  39.2 
 
 		 502 aa  341  4e-92  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1966  Aldehyde Dehydrogenase  43.3 
 
 		 478 aa  341  4e-92  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.57596 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1480  aldehyde dehydrogenase  40.85 
 
 		 490 aa  339  9.999999999999999e-92  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0515859  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2860  aldehyde dehydrogenase  42.4 
 
 		 494 aa  338  1.9999999999999998e-91  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2882  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  42.4 
 
 		 494 aa  338  1.9999999999999998e-91  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.198602  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2640  aldehyde dehydrogenase  41.75 
 
 		 494 aa  338  2.9999999999999997e-91  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.198513  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2831  aldehyde dehydrogenase  41.75 
 
 		 494 aa  338  2.9999999999999997e-91  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.217262  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2837  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  41.75 
 
 		 494 aa  338  2.9999999999999997e-91  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000177336 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2843  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  42.61 
 
 		 494 aa  337  5e-91  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.128159  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1515  betaine aldehyde dehydrogenase  39.79 
 
 		 494 aa  337  7e-91  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2556  aldehyde dehydrogenase  41.54 
 
 		 494 aa  336  1e-90  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.271873  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2591  aldehyde dehydrogenase  41.97 
 
 		 494 aa  335  2e-90  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3788  aldehyde dehydrogenase  42.59 
 
 		 510 aa  335  2e-90  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3909  gamma-glutamyl-gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  42.7 
 
 		 487 aa  335  2e-90  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2634  aldehyde dehydrogenase  41.97 
 
 		 494 aa  335  3e-90  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1995  Aldehyde dehydrogenase (NAD(+))  43.79 
 
 		 492 aa  335  3e-90  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.964387 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2450  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  41.97 
 
 		 494 aa  334  4e-90  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0732  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  44.66 
 
 		 501 aa  334  4e-90  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.207318  normal  0.0607885 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0685  betaine-aldehyde dehydrogenase  41.06 
 
 		 485 aa  333  5e-90  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1326  elongation factor P (EF-P)  39.36 
 
 		 491 aa  333  9e-90  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1527  transposase, IS605 OrfB family  45.25 
 
 		 421 aa  333  1e-89  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3047  Aldehyde Dehydrogenase  42.25 
 
 		 508 aa  332  1e-89  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7502  Betaine-aldehyde dehydrogenase  45.8 
 
 		 482 aa  333  1e-89  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0563  betaine aldehyde dehydrogenase  39.71 
 
 		 487 aa  331  4e-89  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.886348  normal  0.578799 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1622  Betaine-aldehyde dehydrogenase  42.46 
 
 		 478 aa  330  5.0000000000000004e-89  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3881  Aldehyde Dehydrogenase  44.16 
 
 		 507 aa  330  7e-89  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.159111 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>