More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_3740 on replicon NC_007494
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010623  Bphy_4653  aldehyde dehydrogenase  54.32 
 
 
797 aa  775    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.197887  normal  0.568756 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3740  aldehyde dehydrogenase  100 
 
 
791 aa  1578    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.977934  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3348  hypothetical protein  93.06 
 
 
792 aa  1428    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.330757 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2836  aldehyde dehydrogenase  61.31 
 
 
798 aa  973    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.177288  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0786  aldehyde dehydrogenase  53.28 
 
 
779 aa  781    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7827  putative membrane-anchored aldehyde dehydrogenase protein  56.02 
 
 
795 aa  786    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.568371  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1400  betaine-aldehyde dehydrogenase  54.3 
 
 
796 aa  762    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.346772  normal  0.232291 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1274  betaine-aldehyde dehydrogenase  53.73 
 
 
798 aa  763    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.117551 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3794  aldehyde dehydrogenase  57.2 
 
 
783 aa  844    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0096  aldehyde dehydrogenase  54.8 
 
 
780 aa  820    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.493554  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3472  betaine-aldehyde dehydrogenase  98.86 
 
 
791 aa  1565    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.27044  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2281  Aldehyde dehydrogenase (NAD(+))  54.16 
 
 
795 aa  777    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.392437 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4632  aldehyde dehydrogenase  53.47 
 
 
794 aa  757    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.698936  normal  0.244217 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0313  aldehyde dehydrogenase  60.66 
 
 
792 aa  914    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2233  Aldehyde dehydrogenase (NAD(+))  53.64 
 
 
788 aa  810    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.635265  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5195  Aldehyde dehydrogenase (NAD(+))  55.02 
 
 
787 aa  766    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.157706  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3898  aldehyde dehydrogenase  57.58 
 
 
776 aa  792    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3017  aldehyde dehydrogenase  55.42 
 
 
780 aa  809    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.828934  normal  0.325686 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2689  aldehyde dehydrogenase  57.47 
 
 
798 aa  841    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.583529 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1348  Betaine-aldehyde dehydrogenase  45.38 
 
 
817 aa  592  1e-168  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.534066 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05500  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  55.6 
 
 
479 aa  513  1e-144  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0742  Betaine-aldehyde dehydrogenase  55.28 
 
 
478 aa  510  1e-143  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3529  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  54.36 
 
 
484 aa  501  1e-140  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0851  Aldehyde Dehydrogenase  56.28 
 
 
480 aa  498  1e-139  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0778  Betaine-aldehyde dehydrogenase  54.81 
 
 
474 aa  494  9.999999999999999e-139  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0364  betaine-aldehyde dehydrogenase  53.96 
 
 
478 aa  484  1e-135  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3248  Betaine-aldehyde dehydrogenase  55.65 
 
 
476 aa  483  1e-135  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0798  Aldehyde Dehydrogenase  54.3 
 
 
483 aa  479  1e-134  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0827  aldehyde dehydrogenase  53.14 
 
 
476 aa  478  1e-133  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0476667 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0771  aldehyde dehydrogenase  53.56 
 
 
476 aa  478  1e-133  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.302759 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4391  Betaine-aldehyde dehydrogenase  53.33 
 
 
480 aa  468  9.999999999999999e-131  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.436342  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0209  Aldehyde Dehydrogenase  53.54 
 
 
477 aa  464  1e-129  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00353417 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0886  Aldehyde Dehydrogenase  47.64 
 
 
473 aa  416  9.999999999999999e-116  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2229  aldehyde dehydrogenase  45.06 
 
 
494 aa  399  9.999999999999999e-111  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.545234  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3348  aldehyde dehydrogenase  44.64 
 
 
494 aa  399  9.999999999999999e-111  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0219223  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3313  aldehyde dehydrogenase  44.64 
 
 
494 aa  399  9.999999999999999e-111  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3263  aldehyde dehydrogenase  44.64 
 
 
494 aa  399  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3257  aldehyde dehydrogenase  44.85 
 
 
494 aa  401  9.999999999999999e-111  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.536879  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2504  Aldehyde Dehydrogenase  46.44 
 
 
497 aa  402  9.999999999999999e-111  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.98157  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3609  aldehyde dehydrogenase  44.64 
 
 
494 aa  399  9.999999999999999e-111  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3562  aldehyde dehydrogenase (NAD)  44.64 
 
 
494 aa  399  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00134581 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3569  aldehyde dehydrogenase  44.42 
 
 
494 aa  397  1e-109  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3662  aldehyde dehydrogenase (NAD)  44.42 
 
 
494 aa  398  1e-109  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1655  aldehyde dehydrogenase (NAD)  44.64 
 
 
494 aa  399  1e-109  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0330388 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1381  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  45.28 
 
 
496 aa  390  1e-107  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.514457 
 
 
-
 
NC_006691  CNF03900  aldehyde dehydrogenase (alddh), putative  42.7 
 
 
506 aa  379  1e-104  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2599  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  44.59 
 
 
490 aa  382  1e-104  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.225795  normal  0.197804 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3788  aldehyde dehydrogenase  45.45 
 
 
510 aa  379  1e-103  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0265  aldehyde dehydrogenase  46.4 
 
 
512 aa  376  1e-103  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00113994 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1556  Retinal dehydrogenase  44.37 
 
 
490 aa  377  1e-103  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3759  Aldehyde Dehydrogenase  44.15 
 
 
490 aa  375  1e-102  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.304272 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0272  aldehyde dehydrogenase  45.97 
 
 
517 aa  372  1e-101  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0732  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  43.62 
 
 
501 aa  369  1e-101  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.207318  normal  0.0607885 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0958  aldehyde dehydrogenase  42.09 
 
 
492 aa  369  1e-100  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.938749  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1759  aldehyde dehydrogenase B  40.56 
 
 
486 aa  368  1e-100  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0158  aldehyde dehydrogenase  42.35 
 
 
495 aa  364  4e-99  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0153  aldehyde dehydrogenase  42.35 
 
 
495 aa  364  4e-99  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2487  aldehyde dehydrogenase family protein  45.11 
 
 
503 aa  363  6e-99  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2904  aldehyde dehydrogenase  42.2 
 
 
494 aa  361  3e-98  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.399829  normal  0.436531 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1868  Retinal dehydrogenase  43.4 
 
 
492 aa  361  3e-98  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3159  betaine-aldehyde dehydrogenase  42.83 
 
 
484 aa  360  8e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1480  aldehyde dehydrogenase  41.33 
 
 
490 aa  358  2.9999999999999997e-97  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0515859  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3848  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  44.47 
 
 
501 aa  357  5e-97  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0362745  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2843  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  39.91 
 
 
494 aa  356  1e-96  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.128159  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18440  Aldehyde dehydrogenase family protein  42.3 
 
 
499 aa  355  1e-96  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.931316  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1745  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  43.44 
 
 
498 aa  355  2e-96  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2450  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  39.7 
 
 
494 aa  355  2e-96  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2738  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  41.88 
 
 
488 aa  355  2.9999999999999997e-96  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.525641  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3562  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  41.45 
 
 
494 aa  354  4e-96  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.37194  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0744  Betaine-aldehyde dehydrogenase  42.55 
 
 
496 aa  353  5.9999999999999994e-96  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3586  aldehyde dehydrogenase  43.23 
 
 
501 aa  351  3e-95  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.615905 
 
 
-
 
NC_006681  CNL05070  Aldehyde dehydrogenase (ALDDH), putative  42.32 
 
 
524 aa  351  3e-95  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4086  aldehyde dehydrogenase  41.67 
 
 
488 aa  350  4e-95  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.515709  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3431  betaine-aldehyde dehydrogenase  41.67 
 
 
488 aa  350  5e-95  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5622  aldehyde dehydrogenase  41.24 
 
 
488 aa  350  6e-95  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.216133 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2640  aldehyde dehydrogenase  39.27 
 
 
494 aa  350  8e-95  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.198513  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2831  aldehyde dehydrogenase  39.27 
 
 
494 aa  350  8e-95  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.217262  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2837  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  39.27 
 
 
494 aa  349  9e-95  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000177336 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00554  Aldehyde dehydrogenase (ALDDH)(ALDH)(EC 1.2.1.3) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P08157]  42.22 
 
 
497 aa  349  1e-94  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.534945  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2860  aldehyde dehydrogenase  39.06 
 
 
494 aa  349  1e-94  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2556  aldehyde dehydrogenase  39.06 
 
 
494 aa  349  1e-94  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.271873  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2591  aldehyde dehydrogenase  39.06 
 
 
494 aa  348  2e-94  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3376  aldehyde dehydrogenase  42.52 
 
 
488 aa  348  2e-94  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.399948  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1018  Aldehyde Dehydrogenase  41.36 
 
 
510 aa  348  2e-94  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5214  betaine-aldehyde dehydrogenase  41.88 
 
 
488 aa  348  2e-94  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3909  gamma-glutamyl-gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  43.84 
 
 
487 aa  347  4e-94  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2882  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  39.06 
 
 
494 aa  347  5e-94  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.198602  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2634  aldehyde dehydrogenase  38.63 
 
 
494 aa  347  7e-94  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0129  betaine aldehyde dehydrogenase  40.13 
 
 
494 aa  346  8e-94  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00429668  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1036  aldehyde dehydrogenase  42.18 
 
 
494 aa  346  8.999999999999999e-94  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.922959  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1244  Aldehyde Dehydrogenase  40.3 
 
 
490 aa  346  1e-93  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00471898  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_29563  Aldehyde dehydrogenase  39.57 
 
 
495 aa  345  2e-93  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.161421  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1838  Aldehyde Dehydrogenase  41.03 
 
 
494 aa  344  2.9999999999999997e-93  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1527  transposase, IS605 OrfB family  44.67 
 
 
421 aa  343  5.999999999999999e-93  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3881  Aldehyde Dehydrogenase  45.01 
 
 
507 aa  343  5.999999999999999e-93  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.159111 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2837  Aldehyde Dehydrogenase  40.8 
 
 
502 aa  343  1e-92  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4503  aldehyde dehydrogenase  43.04 
 
 
484 aa  343  1e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1326  elongation factor P (EF-P)  39.19 
 
 
491 aa  343  1e-92  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2605  aldehyde dehydrogenase  40.38 
 
 
494 aa  342  2e-92  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000129908  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3176  aldehyde dehydrogenase  38.98 
 
 
490 aa  342  2e-92  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000139941  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>