More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_4632 on replicon NC_009620
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009050  Rsph17029_3472  betaine-aldehyde dehydrogenase  53.34 
 
 		 791 aa  780    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.27044  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4653  aldehyde dehydrogenase  67.96 
 
 		 797 aa  1038    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.197887  normal  0.568756 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7827  putative membrane-anchored aldehyde dehydrogenase protein  74.09 
 
 		 795 aa  1139    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.568371  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5195  Aldehyde dehydrogenase (NAD(+))  69.04 
 
 		 787 aa  1032    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.157706  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4632  aldehyde dehydrogenase  100 
 
 		 794 aa  1602    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.698936  normal  0.244217 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3740  aldehyde dehydrogenase  53.47 
 
 		 791 aa  781    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.977934  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2689  aldehyde dehydrogenase  57.7 
 
 		 798 aa  848    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.583529 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2281  Aldehyde dehydrogenase (NAD(+))  82.01 
 
 		 795 aa  1267    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.392437 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2836  aldehyde dehydrogenase  58.11 
 
 		 798 aa  936    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.177288  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0786  aldehyde dehydrogenase  58.4 
 
 		 779 aa  895    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1400  betaine-aldehyde dehydrogenase  68.76 
 
 		 796 aa  1033    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.346772  normal  0.232291 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1274  betaine-aldehyde dehydrogenase  67.96 
 
 		 798 aa  1046    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.117551 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0096  aldehyde dehydrogenase  59.68 
 
 		 780 aa  945    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.493554  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0313  aldehyde dehydrogenase  59.95 
 
 		 792 aa  921    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3794  aldehyde dehydrogenase  62.29 
 
 		 783 aa  981    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3348  hypothetical protein  54.41 
 
 		 792 aa  795    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.330757 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3017  aldehyde dehydrogenase  60.53 
 
 		 780 aa  950    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.828934  normal  0.325686 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2233  Aldehyde dehydrogenase (NAD(+))  59.97 
 
 		 788 aa  947    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.635265  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3898  aldehyde dehydrogenase  53.26 
 
 		 776 aa  723    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1348  Betaine-aldehyde dehydrogenase  45.64 
 
 		 817 aa  619  1e-176  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.534066 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3529  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  55.09 
 
 		 484 aa  505  1e-141  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0778  Betaine-aldehyde dehydrogenase  56.39 
 
 		 474 aa  502  1e-140  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0827  aldehyde dehydrogenase  54.07 
 
 		 476 aa  499  1e-140  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0476667 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0364  betaine-aldehyde dehydrogenase  56.43 
 
 		 478 aa  498  1e-139  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0851  Aldehyde Dehydrogenase  53.97 
 
 		 480 aa  493  9.999999999999999e-139  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0771  aldehyde dehydrogenase  54.7 
 
 		 476 aa  494  9.999999999999999e-139  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.302759 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0742  Betaine-aldehyde dehydrogenase  53.77 
 
 		 478 aa  494  9.999999999999999e-139  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0209  Aldehyde Dehydrogenase  55.02 
 
 		 477 aa  492  1e-137  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00353417 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05500  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  55.53 
 
 		 479 aa  485  1e-135  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0798  Aldehyde Dehydrogenase  54.6 
 
 		 483 aa  479  1e-133  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4391  Betaine-aldehyde dehydrogenase  55.24 
 
 		 480 aa  476  1e-132  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.436342  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3248  Betaine-aldehyde dehydrogenase  55.75 
 
 		 476 aa  466  9.999999999999999e-131  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1381  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  48.5 
 
 		 496 aa  416  9.999999999999999e-116  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.514457 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2504  Aldehyde Dehydrogenase  47.37 
 
 		 497 aa  416  1e-114  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.98157  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0886  Aldehyde Dehydrogenase  46.91 
 
 		 473 aa  404  1e-111  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2599  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  46.35 
 
 		 490 aa  405  1e-111  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.225795  normal  0.197804 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2229  aldehyde dehydrogenase  45.2 
 
 		 494 aa  395  1e-108  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.545234  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3348  aldehyde dehydrogenase  44.99 
 
 		 494 aa  392  1e-107  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0219223  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3313  aldehyde dehydrogenase  44.99 
 
 		 494 aa  392  1e-107  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3263  aldehyde dehydrogenase  44.99 
 
 		 494 aa  392  1e-107  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3609  aldehyde dehydrogenase  44.99 
 
 		 494 aa  392  1e-107  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3562  aldehyde dehydrogenase (NAD)  44.99 
 
 		 494 aa  392  1e-107  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00134581 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3257  aldehyde dehydrogenase  45.2 
 
 		 494 aa  392  1e-107  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.536879  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3662  aldehyde dehydrogenase (NAD)  44.56 
 
 		 494 aa  388  1e-106  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3569  aldehyde dehydrogenase  44.56 
 
 		 494 aa  389  1e-106  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1556  Retinal dehydrogenase  45.28 
 
 		 490 aa  389  1e-106  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1655  aldehyde dehydrogenase (NAD)  44.78 
 
 		 494 aa  389  1e-106  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0330388 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3759  Aldehyde Dehydrogenase  44.21 
 
 		 490 aa  384  1e-105  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.304272 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2882  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  43.43 
 
 		 494 aa  383  1e-105  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.198602  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2843  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  43.64 
 
 		 494 aa  384  1e-105  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.128159  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2860  aldehyde dehydrogenase  43.22 
 
 		 494 aa  382  1e-104  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2640  aldehyde dehydrogenase  42.36 
 
 		 494 aa  382  1e-104  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.198513  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2556  aldehyde dehydrogenase  42.16 
 
 		 494 aa  381  1e-104  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.271873  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2831  aldehyde dehydrogenase  42.36 
 
 		 494 aa  382  1e-104  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.217262  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2634  aldehyde dehydrogenase  42.8 
 
 		 494 aa  380  1e-104  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2837  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  42.36 
 
 		 494 aa  382  1e-104  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000177336 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2450  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  43.01 
 
 		 494 aa  380  1e-104  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2591  aldehyde dehydrogenase  43.01 
 
 		 494 aa  379  1e-103  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2605  aldehyde dehydrogenase  43.66 
 
 		 494 aa  372  1e-101  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000129908  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1868  Retinal dehydrogenase  43.1 
 
 		 492 aa  368  1e-100  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2154  aldehyde dehydrogenase  40.9 
 
 		 489 aa  369  1e-100  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3881  Aldehyde Dehydrogenase  45.33 
 
 		 507 aa  367  1e-100  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.159111 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0958  aldehyde dehydrogenase  44.35 
 
 		 492 aa  366  1e-100  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.938749  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1480  aldehyde dehydrogenase  41.3 
 
 		 490 aa  369  1e-100  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0515859  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1745  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  43.07 
 
 		 498 aa  359  9e-98  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1759  aldehyde dehydrogenase B  41.36 
 
 		 486 aa  359  9.999999999999999e-98  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2487  aldehyde dehydrogenase family protein  43.61 
 
 		 503 aa  355  1e-96  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5435  aldehyde dehydrogenase  43.72 
 
 		 504 aa  355  2e-96  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.846738  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0096  betaine aldehyde dehydrogenase  43 
 
 		 491 aa  354  4e-96  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4862  Betaine-aldehyde dehydrogenase  46.2 
 
 		 498 aa  354  4e-96  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_29563  Aldehyde dehydrogenase  42.07 
 
 		 495 aa  353  5e-96  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.161421  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13620  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  42.55 
 
 		 497 aa  352  1e-95  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006691  CNF03900  aldehyde dehydrogenase (alddh), putative  42.25 
 
 		 506 aa  352  1e-95  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0272  aldehyde dehydrogenase  44.96 
 
 		 517 aa  352  1e-95  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3841  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  42.95 
 
 		 508 aa  352  2e-95  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.829655 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5267  aldehyde dehydrogenase  44.44 
 
 		 493 aa  350  4e-95  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3793  aldehyde dehydrogenase B  42.65 
 
 		 512 aa  349  1e-94  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00554  Aldehyde dehydrogenase (ALDDH)(ALDH)(EC 1.2.1.3) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P08157]  42.92 
 
 		 497 aa  348  2e-94  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.534945  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0732  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  41.91 
 
 		 501 aa  348  2e-94  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.207318  normal  0.0607885 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4958  aldehyde dehydrogenase B  42.65 
 
 		 512 aa  348  2e-94  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4086  aldehyde dehydrogenase B  42.44 
 
 		 512 aa  347  5e-94  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4003  aldehyde dehydrogenase B  42.44 
 
 		 512 aa  347  5e-94  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3915  aldehyde dehydrogenase B  42.44 
 
 		 512 aa  347  5e-94  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0125  aldehyde dehydrogenase  42.44 
 
 		 512 aa  347  5e-94  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5622  aldehyde dehydrogenase  40.76 
 
 		 488 aa  347  7e-94  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.216133 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2837  Aldehyde Dehydrogenase  40.86 
 
 		 502 aa  346  8e-94  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0265  aldehyde dehydrogenase  44.33 
 
 		 512 aa  346  8e-94  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00113994 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2738  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  40.98 
 
 		 488 aa  345  1e-93  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.525641  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3879  aldehyde dehydrogenase B  42.44 
 
 		 512 aa  345  2e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.565501  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3350  aldehyde dehydrogenase  41.77 
 
 		 502 aa  345  2e-93  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.222349  normal  0.605531 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4065  aldehyde dehydrogenase B  42.24 
 
 		 512 aa  345  2e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4003  aldehyde dehydrogenase B  42.24 
 
 		 512 aa  345  2e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.646434 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3894  aldehyde dehydrogenase B  42.24 
 
 		 512 aa  345  2e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4086  aldehyde dehydrogenase  40.98 
 
 		 488 aa  345  2e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.515709  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3431  betaine-aldehyde dehydrogenase  40.98 
 
 		 488 aa  345  2e-93  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03443  aldehyde dehydrogenase B  42.41 
 
 		 512 aa  344  2.9999999999999997e-93  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0120  Aldehyde Dehydrogenase  42.24 
 
 		 512 aa  345  2.9999999999999997e-93  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03394  hypothetical protein  42.41 
 
 		 512 aa  344  2.9999999999999997e-93  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5214  betaine-aldehyde dehydrogenase  40.98 
 
 		 488 aa  344  4e-93  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3958  aldehyde dehydrogenase B  42.03 
 
 		 512 aa  343  5.999999999999999e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.159408  normal  0.706216 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>