More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_4391 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_3248  Betaine-aldehyde dehydrogenase  77 
 
 
476 aa  725    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0771  aldehyde dehydrogenase  80.59 
 
 
476 aa  789    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.302759 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0209  Aldehyde Dehydrogenase  79.54 
 
 
477 aa  755    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00353417 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1348  Betaine-aldehyde dehydrogenase  72.3 
 
 
817 aa  696    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.534066 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4391  Betaine-aldehyde dehydrogenase  100 
 
 
480 aa  970    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.436342  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0742  Betaine-aldehyde dehydrogenase  77.26 
 
 
478 aa  763    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05500  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  76.96 
 
 
479 aa  758    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3529  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  77.31 
 
 
484 aa  772    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0364  betaine-aldehyde dehydrogenase  78.2 
 
 
478 aa  756    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0778  Betaine-aldehyde dehydrogenase  79.75 
 
 
474 aa  780    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0851  Aldehyde Dehydrogenase  76.26 
 
 
480 aa  754    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0798  Aldehyde Dehydrogenase  79.87 
 
 
483 aa  754    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0827  aldehyde dehydrogenase  81.65 
 
 
476 aa  792    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0476667 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2233  Aldehyde dehydrogenase (NAD(+))  57.2 
 
 
788 aa  546  1e-154  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.635265  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3794  aldehyde dehydrogenase  56.36 
 
 
783 aa  512  1e-144  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2836  aldehyde dehydrogenase  52.7 
 
 
798 aa  505  9.999999999999999e-143  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.177288  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0313  aldehyde dehydrogenase  56.46 
 
 
792 aa  508  9.999999999999999e-143  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2689  aldehyde dehydrogenase  54.82 
 
 
798 aa  493  9.999999999999999e-139  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.583529 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0096  aldehyde dehydrogenase  56.09 
 
 
780 aa  489  1e-137  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.493554  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3017  aldehyde dehydrogenase  54.36 
 
 
780 aa  483  1e-135  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.828934  normal  0.325686 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0786  aldehyde dehydrogenase  54.09 
 
 
779 aa  476  1e-133  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3348  hypothetical protein  54.51 
 
 
792 aa  476  1e-133  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.330757 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3740  aldehyde dehydrogenase  53.96 
 
 
791 aa  469  1.0000000000000001e-131  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.977934  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1274  betaine-aldehyde dehydrogenase  54.51 
 
 
798 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.117551 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3472  betaine-aldehyde dehydrogenase  53.96 
 
 
791 aa  466  9.999999999999999e-131  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.27044  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5195  Aldehyde dehydrogenase (NAD(+))  54.8 
 
 
787 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.157706  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1400  betaine-aldehyde dehydrogenase  54.58 
 
 
796 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.346772  normal  0.232291 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2504  Aldehyde Dehydrogenase  51.4 
 
 
497 aa  456  1e-127  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.98157  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4653  aldehyde dehydrogenase  54.96 
 
 
797 aa  457  1e-127  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.197887  normal  0.568756 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7827  putative membrane-anchored aldehyde dehydrogenase protein  54.85 
 
 
795 aa  451  1e-125  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.568371  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2281  Aldehyde dehydrogenase (NAD(+))  53.78 
 
 
795 aa  446  1.0000000000000001e-124  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.392437 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1556  Retinal dehydrogenase  48.55 
 
 
490 aa  444  1e-123  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4632  aldehyde dehydrogenase  56.11 
 
 
794 aa  442  1e-123  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.698936  normal  0.244217 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3898  aldehyde dehydrogenase  55.31 
 
 
776 aa  442  1e-123  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2599  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  48.13 
 
 
490 aa  440  9.999999999999999e-123  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.225795  normal  0.197804 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3759  Aldehyde Dehydrogenase  47.15 
 
 
490 aa  432  1e-120  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.304272 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0886  Aldehyde Dehydrogenase  48.06 
 
 
473 aa  426  1e-118  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1868  Retinal dehydrogenase  47.73 
 
 
492 aa  422  1e-117  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1381  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  48.28 
 
 
496 aa  424  1e-117  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.514457 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_29563  Aldehyde dehydrogenase  44.73 
 
 
495 aa  415  9.999999999999999e-116  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.161421  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2229  aldehyde dehydrogenase  47.41 
 
 
494 aa  414  1e-114  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.545234  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1745  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  47.1 
 
 
498 aa  410  1e-113  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3569  aldehyde dehydrogenase  46.67 
 
 
494 aa  408  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3348  aldehyde dehydrogenase  46.34 
 
 
494 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0219223  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3313  aldehyde dehydrogenase  46.34 
 
 
494 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3263  aldehyde dehydrogenase  46.34 
 
 
494 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2605  aldehyde dehydrogenase  46.12 
 
 
494 aa  405  1.0000000000000001e-112  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000129908  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3609  aldehyde dehydrogenase  46.34 
 
 
494 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3562  aldehyde dehydrogenase (NAD)  46.34 
 
 
494 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00134581 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3662  aldehyde dehydrogenase (NAD)  46.45 
 
 
494 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3257  aldehyde dehydrogenase  46.24 
 
 
494 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.536879  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF03900  aldehyde dehydrogenase (alddh), putative  44.02 
 
 
506 aa  402  1e-111  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1655  aldehyde dehydrogenase (NAD)  46.24 
 
 
494 aa  405  1e-111  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0330388 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2487  aldehyde dehydrogenase family protein  47.86 
 
 
503 aa  401  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3841  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  46.2 
 
 
508 aa  399  9.999999999999999e-111  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.829655 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2837  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  44.3 
 
 
494 aa  397  1e-109  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000177336 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2860  aldehyde dehydrogenase  43.87 
 
 
494 aa  396  1e-109  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2640  aldehyde dehydrogenase  44.3 
 
 
494 aa  397  1e-109  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.198513  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2591  aldehyde dehydrogenase  44.3 
 
 
494 aa  397  1e-109  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2556  aldehyde dehydrogenase  44.09 
 
 
494 aa  395  1e-109  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.271873  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2843  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  44.09 
 
 
494 aa  398  1e-109  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.128159  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2831  aldehyde dehydrogenase  44.3 
 
 
494 aa  397  1e-109  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.217262  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2882  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  44.09 
 
 
494 aa  397  1e-109  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.198602  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2450  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  43.87 
 
 
494 aa  397  1e-109  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2634  aldehyde dehydrogenase  43.87 
 
 
494 aa  396  1e-109  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18440  Aldehyde dehydrogenase family protein  46.44 
 
 
499 aa  394  1e-108  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.931316  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4856  aldehyde dehydrogenase  46.25 
 
 
483 aa  393  1e-108  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.263653  normal  0.221142 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1480  aldehyde dehydrogenase  43.04 
 
 
490 aa  392  1e-108  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0515859  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4700  aldehyde dehydrogenase  44.52 
 
 
483 aa  390  1e-107  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0199533 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0153  aldehyde dehydrogenase  42.68 
 
 
495 aa  389  1e-107  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0158  aldehyde dehydrogenase  42.68 
 
 
495 aa  389  1e-107  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01689  aldehyde dehydrogenase family (Eurofung)  45.11 
 
 
501 aa  386  1e-106  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.259255 
 
 
-
 
NC_006686  CND02060  Aldehyde dehydrogenase (ALDDH), putative  43.49 
 
 
495 aa  386  1e-106  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6025  Aldehyde Dehydrogenase  45.16 
 
 
483 aa  385  1e-106  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.181581 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1527  transposase, IS605 OrfB family  48.64 
 
 
421 aa  388  1e-106  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3350  aldehyde dehydrogenase  44.94 
 
 
502 aa  382  1e-105  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.222349  normal  0.605531 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5622  aldehyde dehydrogenase  43.9 
 
 
488 aa  383  1e-105  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.216133 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0744  Betaine-aldehyde dehydrogenase  45.01 
 
 
496 aa  383  1e-105  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3881  Aldehyde Dehydrogenase  47.98 
 
 
507 aa  383  1e-105  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.159111 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00554  Aldehyde dehydrogenase (ALDDH)(ALDH)(EC 1.2.1.3) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P08157]  43.44 
 
 
497 aa  381  1e-104  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.534945  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2738  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  45.09 
 
 
488 aa  382  1e-104  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.525641  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0958  aldehyde dehydrogenase  43.34 
 
 
492 aa  380  1e-104  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.938749  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6130  Betaine-aldehyde dehydrogenase  45.2 
 
 
492 aa  377  1e-103  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3376  aldehyde dehydrogenase  45.3 
 
 
488 aa  375  1e-102  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.399948  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5435  aldehyde dehydrogenase  46.71 
 
 
504 aa  372  1e-102  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.846738  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0732  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  44.02 
 
 
501 aa  373  1e-102  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.207318  normal  0.0607885 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3955  aldehyde dehydrogenase  45.59 
 
 
495 aa  373  1e-102  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.768123  normal  0.683477 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4086  aldehyde dehydrogenase  44.44 
 
 
488 aa  372  1e-102  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.515709  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1036  aldehyde dehydrogenase  44.66 
 
 
494 aa  375  1e-102  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.922959  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5214  betaine-aldehyde dehydrogenase  44.23 
 
 
488 aa  374  1e-102  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1018  Aldehyde Dehydrogenase  43.31 
 
 
510 aa  370  1e-101  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3159  betaine-aldehyde dehydrogenase  44.85 
 
 
484 aa  370  1e-101  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2837  Aldehyde Dehydrogenase  41.94 
 
 
502 aa  370  1e-101  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3909  gamma-glutamyl-gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  45.82 
 
 
487 aa  372  1e-101  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2904  aldehyde dehydrogenase  43.04 
 
 
494 aa  369  1e-101  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.399829  normal  0.436531 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6072  aldehyde dehydrogenase  44.75 
 
 
488 aa  370  1e-101  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3431  betaine-aldehyde dehydrogenase  44.23 
 
 
488 aa  370  1e-101  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2084  aldehyde dehydrogenase  42.35 
 
 
497 aa  368  1e-100  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2154  aldehyde dehydrogenase  40 
 
 
489 aa  367  1e-100  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0292  hypothetical protein  42.07 
 
 
488 aa  366  1e-100  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>