More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_7827 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009050  Rsph17029_3472  betaine-aldehyde dehydrogenase  55.76 
 
 
791 aa  805    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.27044  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7827  putative membrane-anchored aldehyde dehydrogenase protein  100 
 
 
795 aa  1602    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.568371  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4653  aldehyde dehydrogenase  71.34 
 
 
797 aa  1103    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.197887  normal  0.568756 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3740  aldehyde dehydrogenase  56.02 
 
 
791 aa  806    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.977934  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3348  hypothetical protein  57 
 
 
792 aa  832    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.330757 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2233  Aldehyde dehydrogenase (NAD(+))  64 
 
 
788 aa  1011    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.635265  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5195  Aldehyde dehydrogenase (NAD(+))  70.39 
 
 
787 aa  1082    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.157706  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0786  aldehyde dehydrogenase  58.62 
 
 
779 aa  898    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2281  Aldehyde dehydrogenase (NAD(+))  74.97 
 
 
795 aa  1148    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.392437 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3794  aldehyde dehydrogenase  62.21 
 
 
783 aa  980    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1400  betaine-aldehyde dehydrogenase  70.75 
 
 
796 aa  1080    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.346772  normal  0.232291 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1274  betaine-aldehyde dehydrogenase  69.79 
 
 
798 aa  1101    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.117551 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2689  aldehyde dehydrogenase  57.2 
 
 
798 aa  848    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.583529 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0096  aldehyde dehydrogenase  61.61 
 
 
780 aa  953    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.493554  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0313  aldehyde dehydrogenase  62.99 
 
 
792 aa  965    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2836  aldehyde dehydrogenase  60.5 
 
 
798 aa  976    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.177288  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3017  aldehyde dehydrogenase  63.22 
 
 
780 aa  970    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.828934  normal  0.325686 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3898  aldehyde dehydrogenase  54.91 
 
 
776 aa  746    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4632  aldehyde dehydrogenase  74.09 
 
 
794 aa  1135    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.698936  normal  0.244217 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1348  Betaine-aldehyde dehydrogenase  44.98 
 
 
817 aa  603  1.0000000000000001e-171  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.534066 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0778  Betaine-aldehyde dehydrogenase  57.8 
 
 
474 aa  506  9.999999999999999e-143  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0364  betaine-aldehyde dehydrogenase  54.79 
 
 
478 aa  506  9.999999999999999e-143  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3529  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  54.89 
 
 
484 aa  504  1e-141  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0209  Aldehyde Dehydrogenase  55.02 
 
 
477 aa  490  1e-137  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00353417 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0771  aldehyde dehydrogenase  54.7 
 
 
476 aa  489  1e-137  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.302759 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0851  Aldehyde Dehydrogenase  54.6 
 
 
480 aa  491  1e-137  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05500  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  53.65 
 
 
479 aa  487  1e-136  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0827  aldehyde dehydrogenase  53.86 
 
 
476 aa  488  1e-136  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0476667 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0742  Betaine-aldehyde dehydrogenase  53.35 
 
 
478 aa  483  1e-135  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3248  Betaine-aldehyde dehydrogenase  54.6 
 
 
476 aa  478  1e-133  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0798  Aldehyde Dehydrogenase  53.8 
 
 
483 aa  476  1e-132  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4391  Betaine-aldehyde dehydrogenase  55.12 
 
 
480 aa  467  9.999999999999999e-131  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.436342  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2504  Aldehyde Dehydrogenase  49.04 
 
 
497 aa  420  1e-116  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.98157  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1381  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  49.57 
 
 
496 aa  416  9.999999999999999e-116  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.514457 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0886  Aldehyde Dehydrogenase  47.97 
 
 
473 aa  401  9.999999999999999e-111  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2599  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  44.85 
 
 
490 aa  395  1e-108  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.225795  normal  0.197804 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3348  aldehyde dehydrogenase  44.64 
 
 
494 aa  383  1e-105  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0219223  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3313  aldehyde dehydrogenase  44.64 
 
 
494 aa  383  1e-105  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3263  aldehyde dehydrogenase  44.64 
 
 
494 aa  383  1e-105  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3609  aldehyde dehydrogenase  44.64 
 
 
494 aa  383  1e-105  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2229  aldehyde dehydrogenase  44.85 
 
 
494 aa  384  1e-105  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.545234  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3562  aldehyde dehydrogenase (NAD)  44.64 
 
 
494 aa  383  1e-105  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00134581 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3257  aldehyde dehydrogenase  44.64 
 
 
494 aa  384  1e-105  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.536879  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3569  aldehyde dehydrogenase  44.54 
 
 
494 aa  380  1e-104  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1655  aldehyde dehydrogenase (NAD)  44.42 
 
 
494 aa  382  1e-104  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0330388 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1556  Retinal dehydrogenase  43.99 
 
 
490 aa  380  1e-104  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3759  Aldehyde Dehydrogenase  43.78 
 
 
490 aa  382  1e-104  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.304272 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3662  aldehyde dehydrogenase (NAD)  44.21 
 
 
494 aa  382  1e-104  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2487  aldehyde dehydrogenase family protein  45.24 
 
 
503 aa  368  1e-100  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0732  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  44.47 
 
 
501 aa  369  1e-100  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.207318  normal  0.0607885 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0074  Aldehyde dehydrogenase (NAD(+))  43.75 
 
 
512 aa  367  1e-100  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3879  aldehyde dehydrogenase B  44.4 
 
 
512 aa  365  1e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.565501  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1480  aldehyde dehydrogenase  41.86 
 
 
490 aa  365  1e-99  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0515859  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4003  aldehyde dehydrogenase B  44.19 
 
 
512 aa  365  2e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.646434 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4856  aldehyde dehydrogenase  45.04 
 
 
483 aa  365  2e-99  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.263653  normal  0.221142 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3894  aldehyde dehydrogenase B  44.19 
 
 
512 aa  365  2e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4065  aldehyde dehydrogenase B  44.19 
 
 
512 aa  365  2e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4700  aldehyde dehydrogenase  42.83 
 
 
483 aa  364  3e-99  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0199533 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1868  Retinal dehydrogenase  42.89 
 
 
492 aa  364  3e-99  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6025  Aldehyde Dehydrogenase  43.42 
 
 
483 aa  364  4e-99  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.181581 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3958  aldehyde dehydrogenase B  43.98 
 
 
512 aa  363  5.0000000000000005e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.159408  normal  0.706216 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2605  aldehyde dehydrogenase  43.23 
 
 
494 aa  363  6e-99  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000129908  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0958  aldehyde dehydrogenase  44.52 
 
 
492 aa  362  1e-98  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.938749  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3881  Aldehyde Dehydrogenase  45.12 
 
 
507 aa  362  1e-98  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.159111 
 
 
-
 
NC_006691  CNF03900  aldehyde dehydrogenase (alddh), putative  43.16 
 
 
506 aa  362  2e-98  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0058  Aldehyde dehydrogenase (NAD(+))  43.93 
 
 
511 aa  362  2e-98  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.491701  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3793  aldehyde dehydrogenase B  43.98 
 
 
512 aa  361  2e-98  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2154  aldehyde dehydrogenase  39.61 
 
 
489 aa  360  7e-98  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0120  Aldehyde Dehydrogenase  43.78 
 
 
512 aa  360  8e-98  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4086  aldehyde dehydrogenase B  43.78 
 
 
512 aa  359  9.999999999999999e-98  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3915  aldehyde dehydrogenase B  43.78 
 
 
512 aa  359  9.999999999999999e-98  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0125  aldehyde dehydrogenase  43.78 
 
 
512 aa  359  9.999999999999999e-98  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4003  aldehyde dehydrogenase B  43.78 
 
 
512 aa  359  9.999999999999999e-98  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03394  hypothetical protein  43.84 
 
 
512 aa  358  1.9999999999999998e-97  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03443  aldehyde dehydrogenase B  43.84 
 
 
512 aa  358  1.9999999999999998e-97  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3047  Aldehyde Dehydrogenase  42.8 
 
 
508 aa  358  1.9999999999999998e-97  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4158  Aldehyde dehydrogenase (NAD(+))  42.89 
 
 
511 aa  358  1.9999999999999998e-97  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6130  Betaine-aldehyde dehydrogenase  43.04 
 
 
492 aa  358  1.9999999999999998e-97  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2843  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  42.06 
 
 
494 aa  358  1.9999999999999998e-97  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.128159  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0143  lactaldehyde dehydrogenase  43.63 
 
 
512 aa  358  2.9999999999999997e-97  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.973594 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4958  aldehyde dehydrogenase B  43.84 
 
 
512 aa  358  2.9999999999999997e-97  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1742  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  41.9 
 
 
506 aa  357  5.999999999999999e-97  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.17535  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2882  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  41.63 
 
 
494 aa  356  7.999999999999999e-97  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.198602  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2860  aldehyde dehydrogenase  41.63 
 
 
494 aa  356  1e-96  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3586  aldehyde dehydrogenase  43.86 
 
 
501 aa  355  2e-96  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.615905 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2450  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  41.42 
 
 
494 aa  355  2e-96  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1008  aldehyde dehydrogenase  42.71 
 
 
506 aa  355  2e-96  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5622  aldehyde dehydrogenase  42.31 
 
 
488 aa  355  2e-96  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.216133 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2872  Aldehyde dehydrogenase (NAD(+))  42.57 
 
 
506 aa  354  2.9999999999999997e-96  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3788  aldehyde dehydrogenase  42.98 
 
 
510 aa  353  5e-96  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2634  aldehyde dehydrogenase  41.2 
 
 
494 aa  353  5.9999999999999994e-96  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5435  aldehyde dehydrogenase  43.5 
 
 
504 aa  353  8.999999999999999e-96  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.846738  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1278  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  42.37 
 
 
492 aa  353  8.999999999999999e-96  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.000390072  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2640  aldehyde dehydrogenase  41.2 
 
 
494 aa  352  1e-95  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.198513  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2831  aldehyde dehydrogenase  41.2 
 
 
494 aa  352  1e-95  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.217262  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2837  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  41.2 
 
 
494 aa  352  1e-95  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000177336 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1745  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  43.44 
 
 
498 aa  352  2e-95  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1759  aldehyde dehydrogenase B  40.64 
 
 
486 aa  351  2e-95  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4440  Aldehyde dehydrogenase (NAD(+))  42.47 
 
 
511 aa  351  3e-95  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5056  aldehyde dehydrogenase  44.54 
 
 
501 aa  351  3e-95  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>