More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_2160 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_2160  betaine-aldehyde dehydrogenase  100 
 
 
496 aa  1003    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1933  Betaine-aldehyde dehydrogenase  53.97 
 
 
509 aa  545  1e-154  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.592937  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4544  Betaine-aldehyde dehydrogenase  55.72 
 
 
493 aa  500  1e-140  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10200  NAD-dependent aldehyde dehydrogenase  52.99 
 
 
493 aa  495  1e-139  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0137  betaine-aldehyde dehydrogenase  47.79 
 
 
503 aa  438  1e-121  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.313146  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0116  Aldehyde Dehydrogenase  47.08 
 
 
503 aa  433  1e-120  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.288418  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18440  Aldehyde dehydrogenase family protein  42.62 
 
 
499 aa  400  9.999999999999999e-111  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.931316  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4757  aldehyde dehydrogenase  46.45 
 
 
506 aa  397  1e-109  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1381  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  44.01 
 
 
496 aa  389  1e-107  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.514457 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2487  aldehyde dehydrogenase family protein  41.16 
 
 
503 aa  387  1e-106  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3562  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  45.68 
 
 
494 aa  383  1e-105  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.37194  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2904  aldehyde dehydrogenase  45.28 
 
 
494 aa  380  1e-104  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.399829  normal  0.436531 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3047  Aldehyde Dehydrogenase  42.05 
 
 
508 aa  379  1e-104  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1480  aldehyde dehydrogenase  41.34 
 
 
490 aa  379  1e-104  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0515859  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2738  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  42.5 
 
 
488 aa  378  1e-103  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.525641  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5214  betaine-aldehyde dehydrogenase  42.71 
 
 
488 aa  377  1e-103  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1556  Retinal dehydrogenase  41.88 
 
 
490 aa  375  1e-103  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4086  aldehyde dehydrogenase  41.88 
 
 
488 aa  373  1e-102  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.515709  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3376  aldehyde dehydrogenase  42.71 
 
 
488 aa  373  1e-102  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.399948  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3431  betaine-aldehyde dehydrogenase  41.88 
 
 
488 aa  372  1e-102  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4012  Aldehyde Dehydrogenase  41.03 
 
 
508 aa  369  1e-101  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3759  Aldehyde Dehydrogenase  41.01 
 
 
490 aa  371  1e-101  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.304272 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5622  aldehyde dehydrogenase  42.08 
 
 
488 aa  367  1e-100  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.216133 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0085  Aldehyde dehydrogenase (NAD(+))  42.56 
 
 
493 aa  368  1e-100  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2450  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  38.64 
 
 
494 aa  365  1e-99  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1745  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  42.26 
 
 
498 aa  365  1e-99  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6072  aldehyde dehydrogenase  42.5 
 
 
488 aa  364  2e-99  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2599  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  40.62 
 
 
490 aa  364  2e-99  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.225795  normal  0.197804 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3348  aldehyde dehydrogenase  40.5 
 
 
494 aa  363  3e-99  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0219223  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3313  aldehyde dehydrogenase  40.5 
 
 
494 aa  363  3e-99  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3263  aldehyde dehydrogenase  40.5 
 
 
494 aa  363  3e-99  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3609  aldehyde dehydrogenase  40.5 
 
 
494 aa  363  3e-99  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3562  aldehyde dehydrogenase (NAD)  40.5 
 
 
494 aa  363  3e-99  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00134581 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2843  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  38.64 
 
 
494 aa  363  4e-99  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.128159  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3662  aldehyde dehydrogenase (NAD)  40.71 
 
 
494 aa  362  8e-99  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3569  aldehyde dehydrogenase  40.71 
 
 
494 aa  361  2e-98  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1655  aldehyde dehydrogenase (NAD)  40.29 
 
 
494 aa  361  2e-98  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0330388 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2591  aldehyde dehydrogenase  38.43 
 
 
494 aa  360  2e-98  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2882  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  38.43 
 
 
494 aa  361  2e-98  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.198602  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1966  Aldehyde Dehydrogenase  41.42 
 
 
478 aa  361  2e-98  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.57596 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2504  Aldehyde Dehydrogenase  40.92 
 
 
497 aa  360  3e-98  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.98157  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2860  aldehyde dehydrogenase  38.22 
 
 
494 aa  360  3e-98  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0886  Aldehyde Dehydrogenase  40.17 
 
 
473 aa  360  3e-98  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2640  aldehyde dehydrogenase  38.67 
 
 
494 aa  360  4e-98  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.198513  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2831  aldehyde dehydrogenase  38.67 
 
 
494 aa  360  4e-98  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.217262  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2465  Aldehyde Dehydrogenase  42.19 
 
 
485 aa  359  5e-98  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.146216  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2837  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  38.46 
 
 
494 aa  360  5e-98  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000177336 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3257  aldehyde dehydrogenase  40.5 
 
 
494 aa  359  7e-98  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.536879  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3909  gamma-glutamyl-gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  42.71 
 
 
487 aa  359  7e-98  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2913  aldehyde dehydrogenase  40.82 
 
 
506 aa  358  8e-98  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.701952  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2556  aldehyde dehydrogenase  38.67 
 
 
494 aa  358  9.999999999999999e-98  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.271873  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2634  aldehyde dehydrogenase  38.02 
 
 
494 aa  358  9.999999999999999e-98  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0252  Aldehyde Dehydrogenase  39.79 
 
 
506 aa  357  3.9999999999999996e-97  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000571584 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0158  aldehyde dehydrogenase  37.55 
 
 
495 aa  356  3.9999999999999996e-97  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2229  aldehyde dehydrogenase  40.29 
 
 
494 aa  356  3.9999999999999996e-97  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.545234  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0153  aldehyde dehydrogenase  37.55 
 
 
495 aa  356  3.9999999999999996e-97  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1838  Aldehyde Dehydrogenase  39.5 
 
 
494 aa  355  6.999999999999999e-97  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0251  aldehyde dehydrogenase  39.59 
 
 
506 aa  355  1e-96  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0248  aldehyde dehydrogenase  39.59 
 
 
506 aa  355  1e-96  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0248  aldehyde dehydrogenase  39.59 
 
 
506 aa  355  1e-96  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0364  aldehyde dehydrogenase  39.38 
 
 
506 aa  354  2e-96  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.601797  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2339  aldehyde dehydrogenase  39.68 
 
 
506 aa  353  2.9999999999999997e-96  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0958  aldehyde dehydrogenase  38.16 
 
 
492 aa  353  4e-96  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.938749  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3867  aldehyde dehydrogenase  39.74 
 
 
488 aa  352  8e-96  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.587475  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1874  aldehyde dehydrogenase  39.67 
 
 
506 aa  351  1e-95  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.880789  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3233  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  41.29 
 
 
493 aa  350  2e-95  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.436611  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0269  aldehyde dehydrogenase (NAD(+))  38.76 
 
 
506 aa  351  2e-95  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00438264 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4061  Aldehyde dehydrogenase (NAD(+))  41.25 
 
 
505 aa  350  4e-95  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1868  Retinal dehydrogenase  40.5 
 
 
492 aa  349  6e-95  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3942  aldehyde dehydrogenase  38.19 
 
 
506 aa  349  6e-95  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0249  aldehyde dehydrogenase  38.76 
 
 
506 aa  349  6e-95  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000168976 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3772  aldehyde dehydrogenase  38.76 
 
 
506 aa  349  6e-95  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2862  Aldehyde Dehydrogenase  39.16 
 
 
505 aa  349  8e-95  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4480  aldehyde dehydrogenase  38.56 
 
 
506 aa  348  9e-95  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6130  Betaine-aldehyde dehydrogenase  41.16 
 
 
492 aa  348  1e-94  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0250  aldehyde dehydrogenase  38.56 
 
 
506 aa  348  1e-94  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000231621 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3435  aldehyde dehydrogenase  39.79 
 
 
506 aa  348  1e-94  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.256643 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4697  aldehyde dehydrogenase  40.13 
 
 
496 aa  347  3e-94  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.754003  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3463  aldehyde dehydrogenase  42.59 
 
 
497 aa  347  3e-94  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.506857  normal  0.23094 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1004  betaine-aldehyde dehydrogenase  39.17 
 
 
492 aa  346  4e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.460845  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3439  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  40.87 
 
 
493 aa  347  4e-94  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.383483  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04229  5-carboxy-2-hydroxymuconate semialdehyde dehydrogenase  38.82 
 
 
488 aa  346  6e-94  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04195  hypothetical protein  38.82 
 
 
488 aa  346  6e-94  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3703  5-carboxymethyl-2-hydroxymuconate semialdehyde dehydrogenase  39.03 
 
 
488 aa  346  6e-94  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.195699 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1177  5-carboxymethyl-2-hydroxymuconate semialdehyde dehydrogenase  38.61 
 
 
488 aa  345  7e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.585771  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2254  aldehyde dehydrogenase  39.43 
 
 
506 aa  345  8e-94  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0344  aldehyde dehydrogenase  38.89 
 
 
541 aa  345  8e-94  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1759  aldehyde dehydrogenase B  37.34 
 
 
486 aa  345  8.999999999999999e-94  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3586  aldehyde dehydrogenase  42.18 
 
 
501 aa  345  8.999999999999999e-94  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.615905 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3574  aldehyde dehydrogenase  38.97 
 
 
506 aa  345  1e-93  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3822  Aldehyde Dehydrogenase  42.28 
 
 
498 aa  345  1e-93  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.21672  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1471  betaine-aldehyde dehydrogenase  42.49 
 
 
490 aa  345  1e-93  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00283478  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2474  aldehyde dehydrogenase  42.8 
 
 
497 aa  345  1e-93  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.109881  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2946  aldehyde dehydrogenase  42.8 
 
 
497 aa  345  1e-93  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.264552 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1197  5-carboxymethyl-2-hydroxymuconate semialdehyde dehydrogenase  38.16 
 
 
488 aa  344  2e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.692139 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1061  5-carboxymethyl-2-hydroxymuconate semialdehyde dehydrogenase  38.16 
 
 
488 aa  344  2e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4889  5-carboxymethyl-2-hydroxymuconate semialdehyde dehydrogenase  38.82 
 
 
488 aa  344  2e-93  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2306  aldehyde dehydrogenase  42.39 
 
 
497 aa  344  2e-93  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.445313  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4583  5-carboxymethyl-2-hydroxymuconate semialdehyde dehydrogenase  38.82 
 
 
488 aa  344  2e-93  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1212  5-carboxymethyl-2-hydroxymuconate semialdehyde dehydrogenase  38.16 
 
 
488 aa  344  2e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>