More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_2463 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_2664  aldehyde dehydrogenase  73.1 
 
 		 480 aa  685    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0216707  normal  0.214781 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3006  aldehyde dehydrogenase family protein  83.51 
 
 		 479 aa  785    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2350  aldehyde dehydrogenase  76.68 
 
 		 478 aa  726    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.944535  normal  0.84057 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1077  NAD-dependent aldehyde dehydrogenases  83.51 
 
 		 479 aa  785    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1591  aldehyde dehydrogenase family protein  83.51 
 
 		 479 aa  785    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0735  aldehyde dehydrogenase family protein  83.51 
 
 		 479 aa  785    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1756  aldehyde dehydrogenase  73.84 
 
 		 477 aa  717    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0603102  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0874  aldehyde dehydrogenase  94.36 
 
 		 479 aa  859    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.476262  normal  0.570338 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2174  aldehyde dehydrogenase  83.09 
 
 		 479 aa  820    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000019217 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2614  aldehyde dehydrogenase  75.42 
 
 		 478 aa  719    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1095  Aldehyde Dehydrogenase  86.01 
 
 		 479 aa  843    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1235  aldehyde dehydrogenase family protein  83.72 
 
 		 479 aa  788    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2278  aldehyde dehydrogenase family protein  83.51 
 
 		 479 aa  785    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2566  Aldehyde Dehydrogenase  77.94 
 
 		 478 aa  740    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5745  aldehyde dehydrogenase  96.03 
 
 		 479 aa  892    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0583119  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4882  aldehyde dehydrogenase  74.32 
 
 		 477 aa  690    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.895119  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2328  aldehyde dehydrogenase  99.79 
 
 		 479 aa  960    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3004  aldehyde dehydrogenase  71.3 
 
 		 477 aa  673    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.638791  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0877  aldehyde dehydrogenase family protein  84.55 
 
 		 479 aa  792    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.928456  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3585  betaine-aldehyde dehydrogenase  73.21 
 
 		 477 aa  704    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.863463  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2290  aldehyde dehydrogenase  72.57 
 
 		 486 aa  718    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.176448  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3401  betaine-aldehyde dehydrogenase  86.22 
 
 		 479 aa  840    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1083  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  83.51 
 
 		 479 aa  785    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2161  Aldehyde Dehydrogenase  77.31 
 
 		 478 aa  734    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.046835  normal  0.828531 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1966  Aldehyde Dehydrogenase  74.26 
 
 		 477 aa  720    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.150614  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2422  aldehyde dehydrogenase  96.66 
 
 		 479 aa  899    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.283723 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2344  Aldehyde Dehydrogenase  74.26 
 
 		 477 aa  730    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.754482  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0677  aldehyde dehydrogenase  77.31 
 
 		 478 aa  735    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.663172  normal  0.354632 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1691  aldehyde dehydrogenase  70.5 
 
 		 478 aa  644    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.246162 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1806  aldehyde dehydrogenase  96.45 
 
 		 479 aa  897    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2463  aldehyde dehydrogenase  100 
 
 		 479 aa  962    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.32545  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2418  aldehyde dehydrogenase  96.45 
 
 		 479 aa  897    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5904  aldehyde dehydrogenase  66.88 
 
 		 482 aa  632  1e-180  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.474261 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5539  aldehyde dehydrogenase  66.88 
 
 		 482 aa  632  1e-180  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0091  betaine-aldehyde dehydrogenase  65.14 
 
 		 482 aa  607  9.999999999999999e-173  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1286  aldehyde dehydrogenase  62.03 
 
 		 490 aa  606  9.999999999999999e-173  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1014  aldehyde dehydrogenase family protein  60.97 
 
 		 497 aa  601  1e-170  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0956  aldehyde dehydrogenase family protein  60.34 
 
 		 497 aa  593  1e-168  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4949  aldehyde dehydrogenase  58.64 
 
 		 477 aa  579  1e-164  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.986503  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3021  gamma-glutamyl-gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  65.54 
 
 		 485 aa  573  1.0000000000000001e-162  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.143518  normal  0.755617 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0776  betaine-aldehyde dehydrogenase  62.21 
 
 		 481 aa  570  1e-161  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.141721  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1254  aldehyde dehydrogenase  61.18 
 
 		 481 aa  568  1e-161  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1357  aldehyde dehydrogenase  60.25 
 
 		 487 aa  555  1e-157  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1251  Aldehyde Dehydrogenase  58.75 
 
 		 480 aa  543  1e-153  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.019286 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1974  NAD-dependent aldehyde dehydrogenase  58.56 
 
 		 486 aa  540  9.999999999999999e-153  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.489378  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1430  aldehyde dehydrogenase  56.3 
 
 		 487 aa  523  1e-147  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2380  betaine-aldehyde dehydrogenase  55.08 
 
 		 487 aa  471  1.0000000000000001e-131  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0928  aldehyde dehydrogenase  51.88 
 
 		 494 aa  451  1e-125  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1561  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  47.37 
 
 		 503 aa  414  1e-114  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2465  Aldehyde Dehydrogenase  42.98 
 
 		 485 aa  382  1e-105  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.146216  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3841  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  45.3 
 
 		 508 aa  373  1e-102  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.829655 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4856  aldehyde dehydrogenase  44.73 
 
 		 483 aa  372  1e-102  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.263653  normal  0.221142 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4700  aldehyde dehydrogenase  44.12 
 
 		 483 aa  370  1e-101  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0199533 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5622  aldehyde dehydrogenase  43.34 
 
 		 488 aa  367  1e-100  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.216133 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6025  Aldehyde Dehydrogenase  44.81 
 
 		 483 aa  367  1e-100  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.181581 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2599  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  41.09 
 
 		 490 aa  364  2e-99  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.225795  normal  0.197804 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0085  Aldehyde dehydrogenase (NAD(+))  44 
 
 		 493 aa  362  6e-99  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1536  gamma-glutamyl-gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  43.87 
 
 		 495 aa  362  6e-99  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5214  betaine-aldehyde dehydrogenase  42.98 
 
 		 488 aa  362  7.0000000000000005e-99  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1942  gamma-glutamyl-gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  43.87 
 
 		 495 aa  361  1e-98  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01277  gamma-Glu-gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase, NAD(P)H-dependent  43.66 
 
 		 495 aa  360  2e-98  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2346  Aldehyde Dehydrogenase  43.66 
 
 		 495 aa  360  2e-98  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0952724  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1415  gamma-glutamyl-gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  43.66 
 
 		 495 aa  360  2e-98  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01288  hypothetical protein  43.66 
 
 		 495 aa  360  2e-98  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1510  gamma-glutamyl-gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  43.66 
 
 		 495 aa  360  4e-98  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2738  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  42.26 
 
 		 488 aa  359  6e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.525641  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2325  gamma-glutamyl-gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  43.45 
 
 		 495 aa  358  9.999999999999999e-98  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0886  Aldehyde Dehydrogenase  41.56 
 
 		 473 aa  357  1.9999999999999998e-97  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2407  aldehyde dehydrogenase  41.53 
 
 		 493 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.830868  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2260  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  45.7 
 
 		 484 aa  358  1.9999999999999998e-97  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1381  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  42.89 
 
 		 496 aa  357  1.9999999999999998e-97  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.514457 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2450  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  40.71 
 
 		 494 aa  357  1.9999999999999998e-97  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3376  aldehyde dehydrogenase  42.98 
 
 		 488 aa  357  2.9999999999999997e-97  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.399948  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5372  aldehyde dehydrogenase family protein  43.55 
 
 		 481 aa  356  5.999999999999999e-97  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.302622  normal  0.199595 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4323  aldehyde dehydrogenase  41.51 
 
 		 503 aa  356  5.999999999999999e-97  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.181761 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1948  benzaldehyde dehydrogenase  43.49 
 
 		 492 aa  355  6.999999999999999e-97  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000544418 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0986  betaine-aldehyde dehydrogenase  44.38 
 
 		 481 aa  355  8.999999999999999e-97  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.669194  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2837  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  41.13 
 
 		 494 aa  355  8.999999999999999e-97  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000177336 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2634  aldehyde dehydrogenase  40.29 
 
 		 494 aa  355  1e-96  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2640  aldehyde dehydrogenase  40.92 
 
 		 494 aa  355  1e-96  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.198513  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2843  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  40.71 
 
 		 494 aa  355  1e-96  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.128159  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2831  aldehyde dehydrogenase  40.92 
 
 		 494 aa  355  1e-96  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.217262  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3439  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  42.05 
 
 		 493 aa  354  2e-96  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.383483  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1822  gamma-glutamyl-gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  43.24 
 
 		 495 aa  354  2e-96  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0935717 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2904  aldehyde dehydrogenase  43.82 
 
 		 494 aa  354  2e-96  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.399829  normal  0.436531 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3562  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  42.98 
 
 		 494 aa  354  2e-96  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.37194  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3233  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  41.31 
 
 		 493 aa  353  2.9999999999999997e-96  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.436611  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2860  aldehyde dehydrogenase  40.5 
 
 		 494 aa  352  5.9999999999999994e-96  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2556  aldehyde dehydrogenase  40.5 
 
 		 494 aa  352  5.9999999999999994e-96  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.271873  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7306  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  41.05 
 
 		 496 aa  353  5.9999999999999994e-96  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.508329 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3431  betaine-aldehyde dehydrogenase  41.93 
 
 		 488 aa  352  7e-96  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1480  aldehyde dehydrogenase  39.53 
 
 		 490 aa  352  1e-95  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0515859  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1036  aldehyde dehydrogenase  43.07 
 
 		 494 aa  352  1e-95  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.922959  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2882  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  40.5 
 
 		 494 aa  352  1e-95  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.198602  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1868  Retinal dehydrogenase  40.71 
 
 		 492 aa  351  1e-95  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2673  aldehyde dehydrogenase family protein  41.1 
 
 		 493 aa  350  2e-95  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0828689  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4086  aldehyde dehydrogenase  41.72 
 
 		 488 aa  350  2e-95  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.515709  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2591  aldehyde dehydrogenase  40.29 
 
 		 494 aa  351  2e-95  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6072  aldehyde dehydrogenase  42.14 
 
 		 488 aa  350  3e-95  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3646  aldehyde dehydrogenase family protein  41.31 
 
 		 493 aa  349  7e-95  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.196663 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>