More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_0928 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_0928  aldehyde dehydrogenase  100 
 
 		 494 aa  985    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1014  aldehyde dehydrogenase family protein  55.23 
 
 		 497 aa  518  1e-146  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0956  aldehyde dehydrogenase family protein  54.39 
 
 		 497 aa  509  1e-143  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1286  aldehyde dehydrogenase  54.39 
 
 		 490 aa  507  9.999999999999999e-143  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0776  betaine-aldehyde dehydrogenase  54.34 
 
 		 481 aa  494  9.999999999999999e-139  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.141721  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1095  Aldehyde Dehydrogenase  53.14 
 
 		 479 aa  487  1e-136  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2174  aldehyde dehydrogenase  52.93 
 
 		 479 aa  483  1e-135  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000019217 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3401  betaine-aldehyde dehydrogenase  53.14 
 
 		 479 aa  482  1e-135  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3021  gamma-glutamyl-gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  55.53 
 
 		 485 aa  470  1.0000000000000001e-131  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.143518  normal  0.755617 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2350  aldehyde dehydrogenase  51.26 
 
 		 478 aa  457  1e-127  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.944535  normal  0.84057 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2566  Aldehyde Dehydrogenase  51.94 
 
 		 478 aa  453  1.0000000000000001e-126  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1966  Aldehyde Dehydrogenase  50.96 
 
 		 477 aa  452  1.0000000000000001e-126  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.150614  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2161  Aldehyde Dehydrogenase  50.63 
 
 		 478 aa  452  1.0000000000000001e-126  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.046835  normal  0.828531 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2664  aldehyde dehydrogenase  51.29 
 
 		 480 aa  449  1e-125  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0216707  normal  0.214781 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4882  aldehyde dehydrogenase  52.88 
 
 		 477 aa  449  1e-125  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.895119  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1756  aldehyde dehydrogenase  50.96 
 
 		 477 aa  451  1e-125  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0603102  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2614  aldehyde dehydrogenase  52.37 
 
 		 478 aa  448  1.0000000000000001e-124  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2344  Aldehyde Dehydrogenase  49.15 
 
 		 477 aa  447  1.0000000000000001e-124  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.754482  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3585  betaine-aldehyde dehydrogenase  49.27 
 
 		 477 aa  446  1.0000000000000001e-124  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.863463  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0677  aldehyde dehydrogenase  51.26 
 
 		 478 aa  447  1.0000000000000001e-124  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.663172  normal  0.354632 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2422  aldehyde dehydrogenase  52.51 
 
 		 479 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.283723 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1806  aldehyde dehydrogenase  52.51 
 
 		 479 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2418  aldehyde dehydrogenase  52.51 
 
 		 479 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5745  aldehyde dehydrogenase  52.3 
 
 		 479 aa  444  1e-123  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0583119  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2290  aldehyde dehydrogenase  49.04 
 
 		 486 aa  439  9.999999999999999e-123  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.176448  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2328  aldehyde dehydrogenase  51.88 
 
 		 479 aa  436  1e-121  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2463  aldehyde dehydrogenase  51.88 
 
 		 479 aa  436  1e-121  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.32545  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0735  aldehyde dehydrogenase family protein  52.09 
 
 		 479 aa  432  1e-120  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2278  aldehyde dehydrogenase family protein  52.09 
 
 		 479 aa  432  1e-120  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1235  aldehyde dehydrogenase family protein  52.51 
 
 		 479 aa  432  1e-120  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1591  aldehyde dehydrogenase family protein  52.09 
 
 		 479 aa  432  1e-120  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0877  aldehyde dehydrogenase family protein  53.56 
 
 		 479 aa  435  1e-120  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.928456  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1083  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  52.09 
 
 		 479 aa  432  1e-120  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3006  aldehyde dehydrogenase family protein  52.09 
 
 		 479 aa  432  1e-120  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0874  aldehyde dehydrogenase  52.09 
 
 		 479 aa  431  1e-119  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.476262  normal  0.570338 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1077  NAD-dependent aldehyde dehydrogenases  52.51 
 
 		 479 aa  431  1e-119  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3004  aldehyde dehydrogenase  49.36 
 
 		 477 aa  426  1e-118  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.638791  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5904  aldehyde dehydrogenase  48.72 
 
 		 482 aa  426  1e-118  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.474261 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5539  aldehyde dehydrogenase  48.72 
 
 		 482 aa  426  1e-118  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1974  NAD-dependent aldehyde dehydrogenase  47.6 
 
 		 486 aa  415  9.999999999999999e-116  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.489378  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1691  aldehyde dehydrogenase  50.21 
 
 		 478 aa  415  1e-114  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.246162 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1357  aldehyde dehydrogenase  44.56 
 
 		 487 aa  409  1e-113  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1254  aldehyde dehydrogenase  46.33 
 
 		 481 aa  410  1e-113  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4949  aldehyde dehydrogenase  44.42 
 
 		 477 aa  404  1e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.986503  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0091  betaine-aldehyde dehydrogenase  46.07 
 
 		 482 aa  397  1e-109  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1251  Aldehyde Dehydrogenase  46.36 
 
 		 480 aa  390  1e-107  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.019286 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1430  aldehyde dehydrogenase  45.65 
 
 		 487 aa  388  1e-106  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2380  betaine-aldehyde dehydrogenase  47.71 
 
 		 487 aa  385  1e-106  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1561  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  39.31 
 
 		 503 aa  336  3.9999999999999995e-91  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1966  Aldehyde Dehydrogenase  38.96 
 
 		 478 aa  323  5e-87  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.57596 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1381  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  39.09 
 
 		 496 aa  321  1.9999999999999998e-86  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.514457 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1036  aldehyde dehydrogenase  39.06 
 
 		 494 aa  320  3e-86  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.922959  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1480  aldehyde dehydrogenase  37.37 
 
 		 490 aa  318  2e-85  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0515859  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1745  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  37.24 
 
 		 498 aa  315  9.999999999999999e-85  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2465  Aldehyde Dehydrogenase  37.8 
 
 		 485 aa  315  9.999999999999999e-85  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.146216  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4856  aldehyde dehydrogenase  39.87 
 
 		 483 aa  313  3.9999999999999997e-84  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.263653  normal  0.221142 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3841  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  41.45 
 
 		 508 aa  310  4e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.829655 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6025  Aldehyde Dehydrogenase  40.56 
 
 		 483 aa  309  9e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.181581 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0744  Betaine-aldehyde dehydrogenase  37.6 
 
 		 496 aa  306  7e-82  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2504  Aldehyde Dehydrogenase  37.76 
 
 		 497 aa  306  8.000000000000001e-82  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.98157  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4323  aldehyde dehydrogenase  37.58 
 
 		 503 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.181761 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0886  Aldehyde Dehydrogenase  36.74 
 
 		 473 aa  304  3.0000000000000004e-81  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4700  aldehyde dehydrogenase  39.87 
 
 		 483 aa  302  9e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0199533 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2823  betaine aldehyde dehydrogenase  35.4 
 
 		 491 aa  301  2e-80  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0096  betaine aldehyde dehydrogenase  35.98 
 
 		 491 aa  300  3e-80  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4196  Aldehyde Dehydrogenase  37.01 
 
 		 483 aa  298  2e-79  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.115052  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2673  aldehyde dehydrogenase family protein  37.24 
 
 		 493 aa  298  2e-79  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0828689  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2290  betaine-aldehyde dehydrogenase  35.83 
 
 		 503 aa  296  4e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.109533 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3439  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  37.66 
 
 		 493 aa  296  8e-79  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.383483  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7306  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  37.08 
 
 		 496 aa  295  1e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.508329 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1216  aldehyde dehydrogenase  39.15 
 
 		 498 aa  295  1e-78  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2262  aldehyde dehydrogenase  37.03 
 
 		 493 aa  294  2e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2407  aldehyde dehydrogenase  37.03 
 
 		 493 aa  294  2e-78  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.830868  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2837  Aldehyde Dehydrogenase  33.05 
 
 		 502 aa  294  2e-78  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2599  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  34.68 
 
 		 490 aa  295  2e-78  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.225795  normal  0.197804 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2862  Aldehyde Dehydrogenase  35.94 
 
 		 505 aa  293  6e-78  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1948  benzaldehyde dehydrogenase  38.45 
 
 		 492 aa  293  7e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000544418 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2260  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  41.61 
 
 		 484 aa  293  7e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3646  aldehyde dehydrogenase family protein  36.82 
 
 		 493 aa  292  9e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.196663 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7156  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  38.49 
 
 		 494 aa  292  1e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0986  betaine-aldehyde dehydrogenase  36.46 
 
 		 481 aa  291  2e-77  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.669194  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2084  aldehyde dehydrogenase  37.03 
 
 		 493 aa  291  2e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2450  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  33.82 
 
 		 494 aa  290  4e-77  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00554  Aldehyde dehydrogenase (ALDDH)(ALDH)(EC 1.2.1.3) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P08157]  36.04 
 
 		 497 aa  290  5.0000000000000004e-77  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.534945  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2843  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  34.23 
 
 		 494 aa  289  6e-77  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.128159  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1556  Retinal dehydrogenase  34.81 
 
 		 490 aa  289  7e-77  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1006  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  35.7 
 
 		 491 aa  289  7e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.179638  normal  0.457717 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3759  Aldehyde Dehydrogenase  34.01 
 
 		 490 aa  289  8e-77  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.304272 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0129  betaine aldehyde dehydrogenase  35.71 
 
 		 494 aa  289  9e-77  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00429668  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2634  aldehyde dehydrogenase  33.82 
 
 		 494 aa  289  9e-77  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0316  Aldehyde Dehydrogenase  37.24 
 
 		 496 aa  288  1e-76  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1868  Retinal dehydrogenase  35.97 
 
 		 492 aa  286  4e-76  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2640  aldehyde dehydrogenase  34.02 
 
 		 494 aa  287  4e-76  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.198513  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2831  aldehyde dehydrogenase  34.02 
 
 		 494 aa  287  4e-76  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.217262  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0847  betaine-aldehyde dehydrogenase  37.18 
 
 		 494 aa  287  4e-76  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00938434  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2837  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  33.82 
 
 		 494 aa  286  5e-76  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000177336 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3233  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  36.82 
 
 		 493 aa  286  5e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.436611  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2257  aldehyde dehydrogenase  36.19 
 
 		 493 aa  286  5.999999999999999e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3226  aldehyde dehydrogenase  37.27 
 
 		 493 aa  286  5.999999999999999e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18440  Aldehyde dehydrogenase family protein  34.86 
 
 		 499 aa  286  7e-76  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.931316  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>