More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_3226 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003910  CPS_0096  betaine aldehyde dehydrogenase  67.08 
 
 
491 aa  694    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4844  Aldehyde Dehydrogenase  68.79 
 
 
496 aa  687    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.256973  normal  0.013402 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3226  aldehyde dehydrogenase  100 
 
 
493 aa  988    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5267  aldehyde dehydrogenase  92.09 
 
 
493 aa  921    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0292  hypothetical protein  52.54 
 
 
488 aa  502  1e-141  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1535  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  53.5 
 
 
493 aa  504  1e-141  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.31089  normal  0.378909 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0308  hypothetical protein  52.33 
 
 
488 aa  501  1e-140  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6720  betaine-aldehyde dehydrogenase  54.83 
 
 
490 aa  474  1e-132  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_50750  predicted protein  50.1 
 
 
523 aa  465  9.999999999999999e-131  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0113332 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2823  betaine aldehyde dehydrogenase  47.54 
 
 
491 aa  462  1e-129  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3176  aldehyde dehydrogenase  46.42 
 
 
490 aa  456  1e-127  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000139941  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2843  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  47.37 
 
 
494 aa  449  1e-125  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.128159  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2504  Aldehyde Dehydrogenase  48.73 
 
 
497 aa  446  1.0000000000000001e-124  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.98157  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4470  betaine-aldehyde dehydrogenase  48.23 
 
 
483 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.740479  normal  0.387365 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2450  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  46.95 
 
 
494 aa  447  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0708  betaine-aldehyde dehydrogenase, putative  50.11 
 
 
476 aa  442  1e-123  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2634  aldehyde dehydrogenase  46.32 
 
 
494 aa  442  1e-123  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2640  aldehyde dehydrogenase  46.53 
 
 
494 aa  442  1e-123  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.198513  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2556  aldehyde dehydrogenase  46.53 
 
 
494 aa  442  1e-123  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.271873  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2837  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  46.74 
 
 
494 aa  442  1e-123  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000177336 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2831  aldehyde dehydrogenase  46.53 
 
 
494 aa  442  1e-123  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.217262  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0742  aldehyde dehydrogenase  50.11 
 
 
476 aa  444  1e-123  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0948493  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4475  aldehyde dehydrogenase  50.63 
 
 
476 aa  445  1e-123  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0744  Betaine-aldehyde dehydrogenase  50.82 
 
 
496 aa  444  1e-123  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2860  aldehyde dehydrogenase  46.11 
 
 
494 aa  439  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2591  aldehyde dehydrogenase  46.11 
 
 
494 aa  439  9.999999999999999e-123  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2882  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  46.32 
 
 
494 aa  439  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.198602  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2605  aldehyde dehydrogenase  48.11 
 
 
494 aa  438  9.999999999999999e-123  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000129908  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0886  Aldehyde Dehydrogenase  48.31 
 
 
473 aa  440  9.999999999999999e-123  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2837  Aldehyde Dehydrogenase  46.41 
 
 
502 aa  435  1e-121  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1476  betaine aldehyde dehydrogenase  44.31 
 
 
490 aa  438  1e-121  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1276  aldehyde dehydrogenase  46.31 
 
 
497 aa  436  1e-121  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.420346  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0129  betaine aldehyde dehydrogenase  46.63 
 
 
494 aa  432  1e-120  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00429668  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1480  aldehyde dehydrogenase  45.73 
 
 
490 aa  430  1e-119  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0515859  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2635  betaine aldehyde dehydrogenase  42.63 
 
 
496 aa  428  1e-119  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2689  betaine aldehyde dehydrogenase  42.63 
 
 
496 aa  428  1e-119  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0742  aldehyde dehydrogenase  49.89 
 
 
476 aa  430  1e-119  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3569  aldehyde dehydrogenase  45 
 
 
494 aa  426  1e-118  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3348  aldehyde dehydrogenase  45.21 
 
 
494 aa  427  1e-118  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0219223  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3313  aldehyde dehydrogenase  45.21 
 
 
494 aa  427  1e-118  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3263  aldehyde dehydrogenase  45.21 
 
 
494 aa  427  1e-118  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1868  Retinal dehydrogenase  47.69 
 
 
492 aa  426  1e-118  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3609  aldehyde dehydrogenase  45.21 
 
 
494 aa  427  1e-118  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3257  aldehyde dehydrogenase  44.79 
 
 
494 aa  425  1e-118  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.536879  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3562  aldehyde dehydrogenase (NAD)  45.21 
 
 
494 aa  427  1e-118  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00134581 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2599  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  46.12 
 
 
490 aa  427  1e-118  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.225795  normal  0.197804 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3759  Aldehyde Dehydrogenase  46.33 
 
 
490 aa  425  1e-118  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.304272 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01689  aldehyde dehydrogenase family (Eurofung)  46.5 
 
 
501 aa  422  1e-117  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.259255 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1655  aldehyde dehydrogenase (NAD)  44.79 
 
 
494 aa  424  1e-117  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0330388 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2177  betaine aldehyde dehydrogenase  42.97 
 
 
496 aa  422  1e-117  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2229  aldehyde dehydrogenase  45 
 
 
494 aa  425  1e-117  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.545234  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1381  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  47.79 
 
 
496 aa  422  1e-117  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.514457 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3662  aldehyde dehydrogenase (NAD)  44.79 
 
 
494 aa  424  1e-117  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00554  Aldehyde dehydrogenase (ALDDH)(ALDH)(EC 1.2.1.3) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P08157]  46.25 
 
 
497 aa  420  1e-116  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.534945  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1556  Retinal dehydrogenase  46.12 
 
 
490 aa  421  1e-116  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5405  Aldehyde Dehydrogenase  47.84 
 
 
529 aa  419  1e-116  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.264091  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3841  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  50.74 
 
 
508 aa  421  1e-116  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.829655 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31700  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  46.53 
 
 
495 aa  416  9.999999999999999e-116  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.465703  normal 
 
 
-
 
NC_006691  CNF03900  aldehyde dehydrogenase (alddh), putative  44.65 
 
 
506 aa  417  9.999999999999999e-116  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2862  Aldehyde Dehydrogenase  45.68 
 
 
505 aa  412  1e-114  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND02060  Aldehyde dehydrogenase (ALDDH), putative  46.12 
 
 
495 aa  412  1e-114  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3881  Aldehyde Dehydrogenase  49.69 
 
 
507 aa  414  1e-114  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.159111 
 
 
-
 
NC_006681  CNL05070  Aldehyde dehydrogenase (ALDDH), putative  45.15 
 
 
524 aa  405  1.0000000000000001e-112  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5835  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  47.13 
 
 
488 aa  406  1.0000000000000001e-112  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0846  aldehyde dehydrogenase  48.11 
 
 
493 aa  407  1.0000000000000001e-112  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0535  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  46.65 
 
 
487 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1745  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  45.05 
 
 
498 aa  407  1.0000000000000001e-112  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0050  phenylacetaldehyde dehydrogenase  50.84 
 
 
501 aa  404  1e-111  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_29563  Aldehyde dehydrogenase  44.07 
 
 
495 aa  402  1e-111  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.161421  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2758  Betaine-aldehyde dehydrogenase  43.3 
 
 
482 aa  399  9.999999999999999e-111  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2844  betaine-aldehyde dehydrogenase  46.56 
 
 
481 aa  401  9.999999999999999e-111  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_09034  aldehyde dehydrogenase ALDH (AFU_orthologue; AFUA_8G02310)  44.35 
 
 
511 aa  398  1e-109  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.699324  normal 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_63844  mitochondrial aldehyde dehydrogenase  43.4 
 
 
501 aa  395  1e-109  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.704992  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2904  aldehyde dehydrogenase  45.59 
 
 
494 aa  398  1e-109  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.399829  normal  0.436531 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4511  betaine aldehyde dehydrogenase  44.93 
 
 
489 aa  396  1e-109  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.644708 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5036  betaine aldehyde dehydrogenase  44.93 
 
 
489 aa  395  1e-108  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.418531  normal  0.930048 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4697  aldehyde dehydrogenase  43.78 
 
 
496 aa  392  1e-108  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.754003  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0482  betaine aldehyde dehydrogenase  44.47 
 
 
490 aa  395  1e-108  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4941  betaine-aldehyde dehydrogenase  45.89 
 
 
498 aa  394  1e-108  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3562  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  44.19 
 
 
494 aa  393  1e-108  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.37194  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6025  Aldehyde Dehydrogenase  45.99 
 
 
483 aa  389  1e-107  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.181581 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1625  aldehyde dehydrogenase  46.63 
 
 
491 aa  389  1e-107  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0732  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  45.82 
 
 
501 aa  389  1e-107  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.207318  normal  0.0607885 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0265  aldehyde dehydrogenase  49.9 
 
 
512 aa  391  1e-107  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00113994 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4074  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  48.12 
 
 
499 aa  390  1e-107  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22530  NAD-dependent aldehyde dehydrogenase  44.79 
 
 
493 aa  391  1e-107  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0499556  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3725  betaine-aldehyde dehydrogenase  46.01 
 
 
502 aa  389  1e-107  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7524  Betaine-aldehyde dehydrogenase  47.29 
 
 
488 aa  391  1e-107  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.389404  normal  0.953662 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1561  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  46.33 
 
 
503 aa  389  1e-107  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4862  Betaine-aldehyde dehydrogenase  47.8 
 
 
498 aa  387  1e-106  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1759  aldehyde dehydrogenase B  42.22 
 
 
486 aa  387  1e-106  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3350  aldehyde dehydrogenase  45.8 
 
 
502 aa  388  1e-106  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.222349  normal  0.605531 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5622  aldehyde dehydrogenase  43.63 
 
 
488 aa  387  1e-106  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.216133 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1018  Aldehyde Dehydrogenase  44.98 
 
 
510 aa  387  1e-106  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3686  Aldehyde Dehydrogenase  45.59 
 
 
498 aa  387  1e-106  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3586  aldehyde dehydrogenase  46.97 
 
 
501 aa  386  1e-106  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.615905 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5059  betaine aldehyde dehydrogenase  45.09 
 
 
489 aa  388  1e-106  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0560116 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4700  aldehyde dehydrogenase  44.94 
 
 
483 aa  387  1e-106  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0199533 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4856  aldehyde dehydrogenase  46.2 
 
 
483 aa  387  1e-106  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.263653  normal  0.221142 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4196  Aldehyde Dehydrogenase  46.11 
 
 
483 aa  386  1e-106  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.115052  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>