More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_0742 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002947  PP_0708  betaine-aldehyde dehydrogenase, putative  98.95 
 
 
476 aa  958    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4475  aldehyde dehydrogenase  92.23 
 
 
476 aa  897    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0742  aldehyde dehydrogenase  100 
 
 
476 aa  968    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0948493  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0742  aldehyde dehydrogenase  97.06 
 
 
476 aa  922    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2844  betaine-aldehyde dehydrogenase  53.72 
 
 
481 aa  473  1e-132  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6720  betaine-aldehyde dehydrogenase  53.7 
 
 
490 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4470  betaine-aldehyde dehydrogenase  52.84 
 
 
483 aa  465  9.999999999999999e-131  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.740479  normal  0.387365 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5267  aldehyde dehydrogenase  50.31 
 
 
493 aa  442  1e-123  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3226  aldehyde dehydrogenase  50.11 
 
 
493 aa  444  1e-123  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4844  Aldehyde Dehydrogenase  48.96 
 
 
496 aa  433  1e-120  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.256973  normal  0.013402 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0096  betaine aldehyde dehydrogenase  47.08 
 
 
491 aa  429  1e-119  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_50750  predicted protein  43.29 
 
 
523 aa  392  1e-108  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0113332 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5200  aldehyde dehydrogenase  46.83 
 
 
493 aa  384  1e-105  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0153  aldehyde dehydrogenase  42.8 
 
 
495 aa  369  1e-101  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0158  aldehyde dehydrogenase  42.8 
 
 
495 aa  369  1e-101  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2788  betaine-aldehyde dehydrogenase  45.99 
 
 
493 aa  368  1e-100  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01689  aldehyde dehydrogenase family (Eurofung)  40 
 
 
501 aa  364  2e-99  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.259255 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2465  Aldehyde Dehydrogenase  43.62 
 
 
485 aa  363  3e-99  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.146216  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_09034  aldehyde dehydrogenase ALDH (AFU_orthologue; AFUA_8G02310)  41.78 
 
 
511 aa  354  2e-96  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.699324  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2233  Aldehyde dehydrogenase (NAD(+))  42.3 
 
 
788 aa  353  4e-96  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.635265  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0129  betaine aldehyde dehydrogenase  40.25 
 
 
494 aa  353  4e-96  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00429668  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2758  Betaine-aldehyde dehydrogenase  40.47 
 
 
482 aa  351  2e-95  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2823  betaine aldehyde dehydrogenase  40.08 
 
 
491 aa  349  7e-95  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND02060  Aldehyde dehydrogenase (ALDDH), putative  41.04 
 
 
495 aa  348  1e-94  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4700  aldehyde dehydrogenase  42.61 
 
 
483 aa  347  2e-94  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0199533 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1939  aldehyde dehydrogenase  43.88 
 
 
501 aa  346  4e-94  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1276  aldehyde dehydrogenase  38.78 
 
 
497 aa  345  1e-93  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.420346  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31700  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  41.77 
 
 
495 aa  344  2e-93  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.465703  normal 
 
 
-
 
NC_006681  CNL05070  Aldehyde dehydrogenase (ALDDH), putative  40.67 
 
 
524 aa  343  2.9999999999999997e-93  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3176  aldehyde dehydrogenase  39.71 
 
 
490 aa  342  5.999999999999999e-93  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000139941  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1708  Betaine-aldehyde dehydrogenase  43.52 
 
 
494 aa  342  8e-93  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0778  Betaine-aldehyde dehydrogenase  43.53 
 
 
474 aa  342  1e-92  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2836  aldehyde dehydrogenase  40.04 
 
 
798 aa  342  1e-92  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.177288  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0886  Aldehyde Dehydrogenase  40.64 
 
 
473 aa  342  1e-92  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1966  Aldehyde Dehydrogenase  42.55 
 
 
478 aa  341  1e-92  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.57596 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2635  betaine aldehyde dehydrogenase  37.24 
 
 
496 aa  341  2e-92  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2689  betaine aldehyde dehydrogenase  37.24 
 
 
496 aa  341  2e-92  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2599  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  39.79 
 
 
490 aa  340  4e-92  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.225795  normal  0.197804 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1535  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  40.84 
 
 
493 aa  339  5.9999999999999996e-92  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.31089  normal  0.378909 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2177  betaine aldehyde dehydrogenase  37.03 
 
 
496 aa  338  9e-92  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2720  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  41.76 
 
 
496 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.133505  normal  0.10056 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1476  betaine aldehyde dehydrogenase  38.38 
 
 
490 aa  338  1.9999999999999998e-91  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6025  Aldehyde Dehydrogenase  42.61 
 
 
483 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.181581 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2837  Aldehyde Dehydrogenase  40.38 
 
 
502 aa  337  2.9999999999999997e-91  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3759  Aldehyde Dehydrogenase  39.16 
 
 
490 aa  337  2.9999999999999997e-91  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.304272 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2450  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  39.15 
 
 
494 aa  335  7.999999999999999e-91  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4860  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  39.7 
 
 
491 aa  335  9e-91  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0955697 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1244  Aldehyde Dehydrogenase  38.61 
 
 
490 aa  335  1e-90  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00471898  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2843  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  39.15 
 
 
494 aa  335  1e-90  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.128159  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3047  Aldehyde Dehydrogenase  40.34 
 
 
508 aa  334  2e-90  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18440  Aldehyde dehydrogenase family protein  40.25 
 
 
499 aa  334  2e-90  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.931316  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0308  hypothetical protein  38.61 
 
 
488 aa  333  4e-90  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0292  hypothetical protein  38.61 
 
 
488 aa  333  5e-90  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05500  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  41.06 
 
 
479 aa  332  7.000000000000001e-90  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1556  Retinal dehydrogenase  38.74 
 
 
490 aa  332  7.000000000000001e-90  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2487  aldehyde dehydrogenase family protein  40.37 
 
 
503 aa  332  1e-89  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4824  aldehyde dehydrogenase  41.21 
 
 
492 aa  332  1e-89  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.00512486  normal  0.364288 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0958  aldehyde dehydrogenase  39.71 
 
 
492 aa  332  1e-89  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.938749  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1348  Betaine-aldehyde dehydrogenase  39.83 
 
 
817 aa  331  2e-89  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.534066 
 
 
-
 
NC_006691  CNF03900  aldehyde dehydrogenase (alddh), putative  38.67 
 
 
506 aa  331  2e-89  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4856  aldehyde dehydrogenase  40.65 
 
 
483 aa  331  2e-89  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.263653  normal  0.221142 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0732  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  41.63 
 
 
501 aa  330  3e-89  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.207318  normal  0.0607885 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3841  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  41.24 
 
 
508 aa  330  5.0000000000000004e-89  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.829655 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3257  aldehyde dehydrogenase  39.03 
 
 
494 aa  329  6e-89  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.536879  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00554  Aldehyde dehydrogenase (ALDDH)(ALDH)(EC 1.2.1.3) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P08157]  40.19 
 
 
497 aa  329  8e-89  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.534945  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2084  aldehyde dehydrogenase  39.66 
 
 
497 aa  328  9e-89  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2640  aldehyde dehydrogenase  39.11 
 
 
494 aa  328  9e-89  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.198513  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2837  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  38.9 
 
 
494 aa  328  9e-89  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000177336 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2831  aldehyde dehydrogenase  39.11 
 
 
494 aa  328  9e-89  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.217262  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3569  aldehyde dehydrogenase  39.37 
 
 
494 aa  328  1.0000000000000001e-88  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3348  aldehyde dehydrogenase  38.82 
 
 
494 aa  328  1.0000000000000001e-88  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0219223  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2591  aldehyde dehydrogenase  39.11 
 
 
494 aa  328  1.0000000000000001e-88  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3313  aldehyde dehydrogenase  38.82 
 
 
494 aa  328  1.0000000000000001e-88  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3263  aldehyde dehydrogenase  38.82 
 
 
494 aa  328  1.0000000000000001e-88  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5835  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  39.62 
 
 
488 aa  328  1.0000000000000001e-88  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3662  aldehyde dehydrogenase (NAD)  39.03 
 
 
494 aa  328  1.0000000000000001e-88  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2882  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  39.11 
 
 
494 aa  328  1.0000000000000001e-88  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.198602  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3609  aldehyde dehydrogenase  38.82 
 
 
494 aa  328  1.0000000000000001e-88  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1745  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  41.03 
 
 
498 aa  328  1.0000000000000001e-88  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3562  aldehyde dehydrogenase (NAD)  38.82 
 
 
494 aa  328  1.0000000000000001e-88  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00134581 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2556  aldehyde dehydrogenase  38.9 
 
 
494 aa  328  2.0000000000000001e-88  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.271873  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4061  Aldehyde dehydrogenase (NAD(+))  40.46 
 
 
505 aa  327  2.0000000000000001e-88  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0364  betaine-aldehyde dehydrogenase  41.21 
 
 
478 aa  328  2.0000000000000001e-88  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1655  aldehyde dehydrogenase (NAD)  38.82 
 
 
494 aa  328  2.0000000000000001e-88  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0330388 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1868  Retinal dehydrogenase  38.24 
 
 
492 aa  328  2.0000000000000001e-88  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2860  aldehyde dehydrogenase  38.9 
 
 
494 aa  327  3e-88  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2689  aldehyde dehydrogenase  40.62 
 
 
798 aa  327  4.0000000000000003e-88  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.583529 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2504  Aldehyde Dehydrogenase  39.83 
 
 
497 aa  326  6e-88  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.98157  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2634  aldehyde dehydrogenase  38.3 
 
 
494 aa  326  6e-88  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0851  Aldehyde Dehydrogenase  41.08 
 
 
480 aa  325  1e-87  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1480  aldehyde dehydrogenase  37.61 
 
 
490 aa  325  1e-87  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0515859  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0744  Betaine-aldehyde dehydrogenase  40.13 
 
 
496 aa  325  1e-87  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2904  aldehyde dehydrogenase  38.74 
 
 
494 aa  325  1e-87  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.399829  normal  0.436531 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3194  betaine-aldehyde dehydrogenase  44.27 
 
 
453 aa  323  3e-87  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3909  gamma-glutamyl-gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  41.3 
 
 
487 aa  323  6e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5036  betaine aldehyde dehydrogenase  39.2 
 
 
489 aa  322  7e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.418531  normal  0.930048 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2260  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  42.83 
 
 
484 aa  322  9.000000000000001e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2229  aldehyde dehydrogenase  38.19 
 
 
494 aa  321  9.999999999999999e-87  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.545234  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0265  aldehyde dehydrogenase  42.5 
 
 
512 aa  322  9.999999999999999e-87  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00113994 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4511  betaine aldehyde dehydrogenase  39.2 
 
 
489 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.644708 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>