More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_0742 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_0708  betaine-aldehyde dehydrogenase, putative  97.06 
 
 		 476 aa  946    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0742  aldehyde dehydrogenase  100 
 
 		 476 aa  967    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0742  aldehyde dehydrogenase  97.06 
 
 		 476 aa  944    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0948493  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4475  aldehyde dehydrogenase  93.28 
 
 		 476 aa  909    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6720  betaine-aldehyde dehydrogenase  53.49 
 
 		 490 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2844  betaine-aldehyde dehydrogenase  52.87 
 
 		 481 aa  469  1.0000000000000001e-131  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4470  betaine-aldehyde dehydrogenase  52.63 
 
 		 483 aa  467  9.999999999999999e-131  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.740479  normal  0.387365 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3226  aldehyde dehydrogenase  49.89 
 
 		 493 aa  442  1e-123  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5267  aldehyde dehydrogenase  50.52 
 
 		 493 aa  444  1e-123  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4844  Aldehyde Dehydrogenase  48.96 
 
 		 496 aa  429  1e-119  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.256973  normal  0.013402 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0096  betaine aldehyde dehydrogenase  46.88 
 
 		 491 aa  423  1e-117  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_50750  predicted protein  43.51 
 
 		 523 aa  395  1e-109  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0113332 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5200  aldehyde dehydrogenase  47.51 
 
 		 493 aa  390  1e-107  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2788  betaine-aldehyde dehydrogenase  46.46 
 
 		 493 aa  375  1e-102  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0153  aldehyde dehydrogenase  42.58 
 
 		 495 aa  367  1e-100  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0158  aldehyde dehydrogenase  42.58 
 
 		 495 aa  367  1e-100  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01689  aldehyde dehydrogenase family (Eurofung)  39.79 
 
 		 501 aa  360  4e-98  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.259255 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2465  Aldehyde Dehydrogenase  43.4 
 
 		 485 aa  358  9e-98  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.146216  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0129  betaine aldehyde dehydrogenase  40.46 
 
 		 494 aa  353  4e-96  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00429668  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2758  Betaine-aldehyde dehydrogenase  40.59 
 
 		 482 aa  352  5.9999999999999994e-96  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2823  betaine aldehyde dehydrogenase  40.5 
 
 		 491 aa  351  1e-95  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_09034  aldehyde dehydrogenase ALDH (AFU_orthologue; AFUA_8G02310)  41.58 
 
 		 511 aa  351  2e-95  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.699324  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2233  Aldehyde dehydrogenase (NAD(+))  42.08 
 
 		 788 aa  350  3e-95  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.635265  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1939  aldehyde dehydrogenase  44 
 
 		 501 aa  346  5e-94  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2689  betaine aldehyde dehydrogenase  37.87 
 
 		 496 aa  346  7e-94  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2635  betaine aldehyde dehydrogenase  37.87 
 
 		 496 aa  346  7e-94  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4700  aldehyde dehydrogenase  42.67 
 
 		 483 aa  345  1e-93  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0199533 
 
 
-
 
NC_006681  CNL05070  Aldehyde dehydrogenase (ALDDH), putative  41.09 
 
 		 524 aa  345  1e-93  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND02060  Aldehyde dehydrogenase (ALDDH), putative  41.04 
 
 		 495 aa  345  1e-93  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3176  aldehyde dehydrogenase  39.92 
 
 		 490 aa  345  1e-93  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000139941  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31700  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  42.19 
 
 		 495 aa  344  2e-93  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.465703  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1276  aldehyde dehydrogenase  38.16 
 
 		 497 aa  343  5e-93  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.420346  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1708  Betaine-aldehyde dehydrogenase  43.52 
 
 		 494 aa  342  5.999999999999999e-93  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1966  Aldehyde Dehydrogenase  42.77 
 
 		 478 aa  341  2e-92  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.57596 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0886  Aldehyde Dehydrogenase  40.85 
 
 		 473 aa  340  2.9999999999999998e-92  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1244  Aldehyde Dehydrogenase  39.03 
 
 		 490 aa  339  7e-92  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00471898  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2837  Aldehyde Dehydrogenase  40.17 
 
 		 502 aa  339  7e-92  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2836  aldehyde dehydrogenase  39.83 
 
 		 798 aa  337  1.9999999999999998e-91  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.177288  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6025  Aldehyde Dehydrogenase  42.89 
 
 		 483 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.181581 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2599  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  40.21 
 
 		 490 aa  338  1.9999999999999998e-91  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.225795  normal  0.197804 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2720  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  41.98 
 
 		 496 aa  337  3.9999999999999995e-91  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.133505  normal  0.10056 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1535  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  40.72 
 
 		 493 aa  336  3.9999999999999995e-91  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.31089  normal  0.378909 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1476  betaine aldehyde dehydrogenase  38.59 
 
 		 490 aa  336  5e-91  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0778  Betaine-aldehyde dehydrogenase  43.1 
 
 		 474 aa  336  5.999999999999999e-91  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2177  betaine aldehyde dehydrogenase  36.82 
 
 		 496 aa  336  7e-91  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0308  hypothetical protein  39.03 
 
 		 488 aa  334  2e-90  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0292  hypothetical protein  39.03 
 
 		 488 aa  334  2e-90  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF03900  aldehyde dehydrogenase (alddh), putative  38.88 
 
 		 506 aa  334  2e-90  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4860  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  39.49 
 
 		 491 aa  334  2e-90  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0955697 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4824  aldehyde dehydrogenase  41.84 
 
 		 492 aa  333  3e-90  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.00512486  normal  0.364288 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18440  Aldehyde dehydrogenase family protein  40.21 
 
 		 499 aa  333  5e-90  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.931316  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4856  aldehyde dehydrogenase  41.38 
 
 		 483 aa  332  8e-90  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.263653  normal  0.221142 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1348  Betaine-aldehyde dehydrogenase  40.25 
 
 		 817 aa  332  9e-90  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.534066 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0732  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  42.26 
 
 		 501 aa  332  9e-90  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.207318  normal  0.0607885 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2487  aldehyde dehydrogenase family protein  40.76 
 
 		 503 aa  332  1e-89  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3759  Aldehyde Dehydrogenase  39.16 
 
 		 490 aa  332  1e-89  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.304272 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0265  aldehyde dehydrogenase  43.1 
 
 		 512 aa  330  3e-89  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00113994 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5835  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  40.04 
 
 		 488 aa  330  3e-89  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2450  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  38.51 
 
 		 494 aa  330  4e-89  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3047  Aldehyde Dehydrogenase  39.5 
 
 		 508 aa  329  5.0000000000000004e-89  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0958  aldehyde dehydrogenase  39.71 
 
 		 492 aa  329  7e-89  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.938749  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2689  aldehyde dehydrogenase  41.29 
 
 		 798 aa  329  8e-89  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.583529 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1556  Retinal dehydrogenase  39.16 
 
 		 490 aa  329  9e-89  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2843  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  38.51 
 
 		 494 aa  328  1.0000000000000001e-88  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.128159  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4061  Aldehyde dehydrogenase (NAD(+))  40.46 
 
 		 505 aa  328  1.0000000000000001e-88  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00554  Aldehyde dehydrogenase (ALDDH)(ALDH)(EC 1.2.1.3) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P08157]  39.95 
 
 		 497 aa  328  2.0000000000000001e-88  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.534945  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3841  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  41.45 
 
 		 508 aa  328  2.0000000000000001e-88  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.829655 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3257  aldehyde dehydrogenase  39.24 
 
 		 494 aa  327  2.0000000000000001e-88  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.536879  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05500  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  40.64 
 
 		 479 aa  327  2.0000000000000001e-88  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3569  aldehyde dehydrogenase  39.24 
 
 		 494 aa  327  4.0000000000000003e-88  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3662  aldehyde dehydrogenase (NAD)  39.24 
 
 		 494 aa  326  5e-88  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2904  aldehyde dehydrogenase  39.32 
 
 		 494 aa  326  5e-88  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.399829  normal  0.436531 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1018  Aldehyde Dehydrogenase  40.38 
 
 		 510 aa  326  6e-88  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3348  aldehyde dehydrogenase  39.03 
 
 		 494 aa  326  6e-88  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0219223  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3313  aldehyde dehydrogenase  39.03 
 
 		 494 aa  326  6e-88  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3263  aldehyde dehydrogenase  39.03 
 
 		 494 aa  326  6e-88  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3562  aldehyde dehydrogenase (NAD)  39.03 
 
 		 494 aa  326  6e-88  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00134581 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3609  aldehyde dehydrogenase  39.03 
 
 		 494 aa  326  6e-88  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1480  aldehyde dehydrogenase  37.82 
 
 		 490 aa  325  7e-88  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0515859  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1745  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  41.03 
 
 		 498 aa  326  7e-88  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1655  aldehyde dehydrogenase (NAD)  39.03 
 
 		 494 aa  326  7e-88  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0330388 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2504  Aldehyde Dehydrogenase  40.8 
 
 		 497 aa  325  1e-87  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.98157  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2084  aldehyde dehydrogenase  39.45 
 
 		 497 aa  324  2e-87  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3909  gamma-glutamyl-gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  41.93 
 
 		 487 aa  324  2e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0744  Betaine-aldehyde dehydrogenase  39.92 
 
 		 496 aa  324  2e-87  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0364  betaine-aldehyde dehydrogenase  41.21 
 
 		 478 aa  323  5e-87  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2640  aldehyde dehydrogenase  38.48 
 
 		 494 aa  323  5e-87  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.198513  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2831  aldehyde dehydrogenase  38.48 
 
 		 494 aa  323  5e-87  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.217262  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49080  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  40.13 
 
 		 483 aa  323  6e-87  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.133526  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2591  aldehyde dehydrogenase  38.48 
 
 		 494 aa  323  6e-87  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2837  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  38.27 
 
 		 494 aa  322  7e-87  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000177336 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2904  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  38.66 
 
 		 482 aa  322  9.000000000000001e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2971  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  38.66 
 
 		 482 aa  322  9.000000000000001e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0217153 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2556  aldehyde dehydrogenase  38.27 
 
 		 494 aa  322  9.999999999999999e-87  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.271873  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2988  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  38.66 
 
 		 482 aa  322  9.999999999999999e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.853074  normal  0.0957266 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0535  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  41.61 
 
 		 487 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3092  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  38.66 
 
 		 482 aa  322  9.999999999999999e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2634  aldehyde dehydrogenase  37.87 
 
 		 494 aa  322  9.999999999999999e-87  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2882  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  38.48 
 
 		 494 aa  321  1.9999999999999998e-86  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.198602  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_63844  mitochondrial aldehyde dehydrogenase  37.21 
 
 		 501 aa  321  1.9999999999999998e-86  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.704992  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>