More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_1708 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014211  Ndas_5405  Aldehyde Dehydrogenase  66.26 
 
 
529 aa  637    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.264091  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31700  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  69.7 
 
 
495 aa  677    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.465703  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1708  Betaine-aldehyde dehydrogenase  100 
 
 
494 aa  984    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23260  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  68.3 
 
 
489 aa  670    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.869988  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2499  betaine-aldehyde dehydrogenase  65.85 
 
 
496 aa  632  1e-180  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.00184375  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1476  betaine aldehyde dehydrogenase  59.34 
 
 
490 aa  624  1e-177  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1625  aldehyde dehydrogenase  65.51 
 
 
491 aa  618  1e-176  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3725  betaine-aldehyde dehydrogenase  63.51 
 
 
502 aa  612  9.999999999999999e-175  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3083  betaine-aldehyde dehydrogenase  63.82 
 
 
499 aa  607  9.999999999999999e-173  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.36697 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2507  betaine-aldehyde dehydrogenase  65.03 
 
 
496 aa  606  9.999999999999999e-173  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.982399 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2462  betaine-aldehyde dehydrogenase  65.03 
 
 
496 aa  606  9.999999999999999e-173  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.1149  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1640  aldehyde dehydrogenase  65.24 
 
 
491 aa  601  1e-170  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.523327 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0129  betaine aldehyde dehydrogenase  59.55 
 
 
494 aa  595  1e-169  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00429668  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2823  betaine aldehyde dehydrogenase  58.11 
 
 
491 aa  576  1.0000000000000001e-163  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22530  NAD-dependent aldehyde dehydrogenase  60.12 
 
 
493 aa  571  1e-161  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0499556  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2635  betaine aldehyde dehydrogenase  54.34 
 
 
496 aa  563  1.0000000000000001e-159  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2689  betaine aldehyde dehydrogenase  54.34 
 
 
496 aa  563  1.0000000000000001e-159  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3686  Aldehyde Dehydrogenase  61.11 
 
 
498 aa  556  1e-157  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0856  Betaine-aldehyde dehydrogenase  58.99 
 
 
500 aa  555  1e-157  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.00161156  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2177  betaine aldehyde dehydrogenase  54.13 
 
 
496 aa  552  1e-156  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2393  Betaine-aldehyde dehydrogenase  63.99 
 
 
501 aa  552  1e-156  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.284219  hitchhiker  0.00642318 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3744  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  58.67 
 
 
507 aa  539  9.999999999999999e-153  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2793  Betaine-aldehyde dehydrogenase  59.11 
 
 
505 aa  527  1e-148  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3495  Aldehyde Dehydrogenase  58.44 
 
 
499 aa  524  1e-147  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5835  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  52.37 
 
 
488 aa  496  1e-139  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0535  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  52.67 
 
 
487 aa  489  1e-137  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1276  aldehyde dehydrogenase  49.79 
 
 
497 aa  490  1e-137  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.420346  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1939  aldehyde dehydrogenase  52.87 
 
 
501 aa  479  1e-134  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3024  aldehyde dehydrogenase  51.86 
 
 
489 aa  467  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.581367 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0292  hypothetical protein  47.11 
 
 
488 aa  459  9.999999999999999e-129  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0308  hypothetical protein  46.69 
 
 
488 aa  454  1.0000000000000001e-126  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3176  aldehyde dehydrogenase  46.42 
 
 
490 aa  439  9.999999999999999e-123  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000139941  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2758  Betaine-aldehyde dehydrogenase  45.57 
 
 
482 aa  416  9.999999999999999e-116  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2837  Aldehyde Dehydrogenase  44.07 
 
 
502 aa  414  1e-114  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3909  gamma-glutamyl-gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  48.65 
 
 
487 aa  413  1e-114  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00554  Aldehyde dehydrogenase (ALDDH)(ALDH)(EC 1.2.1.3) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P08157]  46.95 
 
 
497 aa  411  1e-113  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.534945  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0096  betaine aldehyde dehydrogenase  43.76 
 
 
491 aa  408  1e-113  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF03900  aldehyde dehydrogenase (alddh), putative  44.89 
 
 
506 aa  411  1e-113  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3646  aldehyde dehydrogenase family protein  45.21 
 
 
493 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.196663 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3788  aldehyde dehydrogenase  46.12 
 
 
510 aa  407  1.0000000000000001e-112  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2262  aldehyde dehydrogenase  45.53 
 
 
493 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3233  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  45 
 
 
493 aa  408  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.436611  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2720  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  45.8 
 
 
496 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.133505  normal  0.10056 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3439  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  45.42 
 
 
493 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.383483  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5622  aldehyde dehydrogenase  45.07 
 
 
488 aa  402  1e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.216133 
 
 
-
 
NC_006681  CNL05070  Aldehyde dehydrogenase (ALDDH), putative  46.19 
 
 
524 aa  402  1e-111  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0744  Betaine-aldehyde dehydrogenase  44.44 
 
 
496 aa  402  1e-111  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1556  Retinal dehydrogenase  45.47 
 
 
490 aa  404  1e-111  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1868  Retinal dehydrogenase  46.72 
 
 
492 aa  404  1e-111  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2084  aldehyde dehydrogenase  45 
 
 
493 aa  402  1e-111  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2257  aldehyde dehydrogenase  44.91 
 
 
493 aa  402  1e-111  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3431  betaine-aldehyde dehydrogenase  44.65 
 
 
488 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4086  aldehyde dehydrogenase  44.65 
 
 
488 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.515709  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2673  aldehyde dehydrogenase family protein  44.38 
 
 
493 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0828689  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1480  aldehyde dehydrogenase  41.68 
 
 
490 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0515859  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3759  Aldehyde Dehydrogenase  44.75 
 
 
490 aa  400  9.999999999999999e-111  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.304272 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1745  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  46.12 
 
 
498 aa  401  9.999999999999999e-111  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2599  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  45.05 
 
 
490 aa  400  9.999999999999999e-111  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.225795  normal  0.197804 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2407  aldehyde dehydrogenase  43.96 
 
 
493 aa  395  1e-109  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.830868  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2738  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  44.44 
 
 
488 aa  398  1e-109  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.525641  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4856  aldehyde dehydrogenase  46.97 
 
 
483 aa  395  1e-109  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.263653  normal  0.221142 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3226  aldehyde dehydrogenase  47.81 
 
 
493 aa  394  1e-108  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4824  aldehyde dehydrogenase  45.59 
 
 
492 aa  393  1e-108  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.00512486  normal  0.364288 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1018  Aldehyde Dehydrogenase  44.44 
 
 
510 aa  394  1e-108  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4700  aldehyde dehydrogenase  46.11 
 
 
483 aa  393  1e-108  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0199533 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5214  betaine-aldehyde dehydrogenase  44.03 
 
 
488 aa  392  1e-108  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6072  aldehyde dehydrogenase  44.86 
 
 
488 aa  390  1e-107  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5267  aldehyde dehydrogenase  47.18 
 
 
493 aa  391  1e-107  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1381  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  44.94 
 
 
496 aa  390  1e-107  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.514457 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2504  Aldehyde Dehydrogenase  45.17 
 
 
497 aa  389  1e-107  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.98157  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2837  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  44.17 
 
 
494 aa  386  1e-106  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000177336 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2860  aldehyde dehydrogenase  43.75 
 
 
494 aa  386  1e-106  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2640  aldehyde dehydrogenase  43.96 
 
 
494 aa  385  1e-106  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.198513  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND02060  Aldehyde dehydrogenase (ALDDH), putative  45.05 
 
 
495 aa  388  1e-106  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1054  Aldehyde Dehydrogenase  43.47 
 
 
513 aa  386  1e-106  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0152  Aldehyde Dehydrogenase  44.75 
 
 
510 aa  388  1e-106  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2843  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  43.54 
 
 
494 aa  387  1e-106  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.128159  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2831  aldehyde dehydrogenase  43.96 
 
 
494 aa  385  1e-106  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.217262  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3841  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  47.07 
 
 
508 aa  388  1e-106  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.829655 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2450  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  43.54 
 
 
494 aa  387  1e-106  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1535  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  43.09 
 
 
493 aa  387  1e-106  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.31089  normal  0.378909 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4844  Aldehyde Dehydrogenase  44.65 
 
 
496 aa  387  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.256973  normal  0.013402 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2882  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  43.75 
 
 
494 aa  385  1e-105  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.198602  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2591  aldehyde dehydrogenase  43.75 
 
 
494 aa  384  1e-105  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2634  aldehyde dehydrogenase  43.12 
 
 
494 aa  382  1e-105  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5059  betaine aldehyde dehydrogenase  45.45 
 
 
489 aa  383  1e-105  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0560116 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2605  aldehyde dehydrogenase  43.34 
 
 
494 aa  384  1e-105  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000129908  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6130  Betaine-aldehyde dehydrogenase  43.61 
 
 
492 aa  382  1e-105  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0886  Aldehyde Dehydrogenase  43.49 
 
 
473 aa  384  1e-105  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6025  Aldehyde Dehydrogenase  45.89 
 
 
483 aa  383  1e-105  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.181581 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1856  aldehyde dehydrogenase  46.15 
 
 
505 aa  384  1e-105  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.267986  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3562  aldehyde dehydrogenase (NAD)  42.65 
 
 
494 aa  380  1e-104  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00134581 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3348  aldehyde dehydrogenase  42.65 
 
 
494 aa  380  1e-104  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0219223  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3313  aldehyde dehydrogenase  42.65 
 
 
494 aa  380  1e-104  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2556  aldehyde dehydrogenase  43.54 
 
 
494 aa  381  1e-104  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.271873  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3263  aldehyde dehydrogenase  42.65 
 
 
494 aa  380  1e-104  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3609  aldehyde dehydrogenase  42.65 
 
 
494 aa  380  1e-104  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0265  aldehyde dehydrogenase  47.48 
 
 
512 aa  379  1e-104  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00113994 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2916  betaine aldehyde dehydrogenase  45.51 
 
 
490 aa  381  1e-104  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3572  betaine-aldehyde dehydrogenase  43.44 
 
 
506 aa  380  1e-104  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.532115  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>