More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_23260 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_1708  Betaine-aldehyde dehydrogenase  68.3 
 
 
494 aa  672    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31700  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  67.89 
 
 
495 aa  677    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.465703  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1476  betaine aldehyde dehydrogenase  61.4 
 
 
490 aa  652    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23260  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  100 
 
 
489 aa  993    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.869988  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5405  Aldehyde Dehydrogenase  63.86 
 
 
529 aa  634  1e-180  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.264091  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1625  aldehyde dehydrogenase  64.49 
 
 
491 aa  612  9.999999999999999e-175  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3725  betaine-aldehyde dehydrogenase  60.74 
 
 
502 aa  609  1e-173  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0129  betaine aldehyde dehydrogenase  59.26 
 
 
494 aa  603  1.0000000000000001e-171  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00429668  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1640  aldehyde dehydrogenase  65.03 
 
 
491 aa  598  1e-170  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.523327 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2499  betaine-aldehyde dehydrogenase  61.27 
 
 
496 aa  592  1e-168  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.00184375  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2823  betaine aldehyde dehydrogenase  57.44 
 
 
491 aa  587  1e-166  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22530  NAD-dependent aldehyde dehydrogenase  60.12 
 
 
493 aa  582  1.0000000000000001e-165  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0499556  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3083  betaine-aldehyde dehydrogenase  60.9 
 
 
499 aa  578  1e-164  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.36697 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2462  betaine-aldehyde dehydrogenase  60.86 
 
 
496 aa  573  1.0000000000000001e-162  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.1149  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2507  betaine-aldehyde dehydrogenase  60.86 
 
 
496 aa  573  1.0000000000000001e-162  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.982399 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2689  betaine aldehyde dehydrogenase  54.23 
 
 
496 aa  568  1e-161  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3686  Aldehyde Dehydrogenase  61.19 
 
 
498 aa  570  1e-161  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2635  betaine aldehyde dehydrogenase  54.23 
 
 
496 aa  568  1e-161  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2177  betaine aldehyde dehydrogenase  54.43 
 
 
496 aa  564  1.0000000000000001e-159  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0856  Betaine-aldehyde dehydrogenase  58.5 
 
 
500 aa  563  1.0000000000000001e-159  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.00161156  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3744  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  61.19 
 
 
507 aa  559  1e-158  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2393  Betaine-aldehyde dehydrogenase  63.11 
 
 
501 aa  558  1e-158  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.284219  hitchhiker  0.00642318 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3495  Aldehyde Dehydrogenase  60.37 
 
 
499 aa  547  1e-154  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2793  Betaine-aldehyde dehydrogenase  57.37 
 
 
505 aa  526  1e-148  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5835  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  54.12 
 
 
488 aa  514  1e-144  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1939  aldehyde dehydrogenase  52.98 
 
 
501 aa  491  1e-137  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1276  aldehyde dehydrogenase  48.56 
 
 
497 aa  488  1e-136  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.420346  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0292  hypothetical protein  49.07 
 
 
488 aa  487  1e-136  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0535  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  51.54 
 
 
487 aa  487  1e-136  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0308  hypothetical protein  48.66 
 
 
488 aa  480  1e-134  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3024  aldehyde dehydrogenase  52.37 
 
 
489 aa  474  1e-132  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.581367 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3176  aldehyde dehydrogenase  45.9 
 
 
490 aa  461  9.999999999999999e-129  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000139941  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2758  Betaine-aldehyde dehydrogenase  44.35 
 
 
482 aa  422  1e-117  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1556  Retinal dehydrogenase  45.17 
 
 
490 aa  414  1e-114  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2504  Aldehyde Dehydrogenase  44.35 
 
 
497 aa  408  1e-113  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.98157  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1535  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  44.21 
 
 
493 aa  410  1e-113  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.31089  normal  0.378909 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2837  Aldehyde Dehydrogenase  41.74 
 
 
502 aa  409  1e-113  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1018  Aldehyde Dehydrogenase  43.84 
 
 
510 aa  407  1.0000000000000001e-112  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3788  aldehyde dehydrogenase  43.94 
 
 
510 aa  407  1.0000000000000001e-112  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4844  Aldehyde Dehydrogenase  42.77 
 
 
496 aa  408  1.0000000000000001e-112  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.256973  normal  0.013402 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0096  betaine aldehyde dehydrogenase  40.37 
 
 
491 aa  402  1e-111  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF03900  aldehyde dehydrogenase (alddh), putative  43.33 
 
 
506 aa  404  1e-111  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1054  Aldehyde Dehydrogenase  43.47 
 
 
513 aa  402  1e-111  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1868  Retinal dehydrogenase  44.98 
 
 
492 aa  404  1e-111  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3759  Aldehyde Dehydrogenase  43.4 
 
 
490 aa  402  1e-111  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.304272 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2599  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  43.28 
 
 
490 aa  403  1e-111  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.225795  normal  0.197804 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5267  aldehyde dehydrogenase  43.35 
 
 
493 aa  397  1e-109  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0152  Aldehyde Dehydrogenase  43.32 
 
 
510 aa  396  1e-109  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0886  Aldehyde Dehydrogenase  42.98 
 
 
473 aa  397  1e-109  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0744  Betaine-aldehyde dehydrogenase  43.67 
 
 
496 aa  392  1e-108  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2634  aldehyde dehydrogenase  43.45 
 
 
494 aa  394  1e-108  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1381  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  44.61 
 
 
496 aa  393  1e-108  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.514457 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3226  aldehyde dehydrogenase  43.97 
 
 
493 aa  395  1e-108  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1480  aldehyde dehydrogenase  40.25 
 
 
490 aa  390  1e-107  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0515859  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2837  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  43.45 
 
 
494 aa  389  1e-107  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000177336 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2860  aldehyde dehydrogenase  43.24 
 
 
494 aa  389  1e-107  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2843  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  43.24 
 
 
494 aa  391  1e-107  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.128159  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2738  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  43.31 
 
 
488 aa  390  1e-107  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.525641  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2450  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  43.45 
 
 
494 aa  390  1e-107  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3431  betaine-aldehyde dehydrogenase  43.31 
 
 
488 aa  389  1e-107  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1515  betaine aldehyde dehydrogenase  44.49 
 
 
494 aa  390  1e-107  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5622  aldehyde dehydrogenase  42.68 
 
 
488 aa  390  1e-107  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.216133 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2882  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  43.04 
 
 
494 aa  387  1e-106  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.198602  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2916  betaine aldehyde dehydrogenase  43.75 
 
 
490 aa  388  1e-106  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3569  aldehyde dehydrogenase  41.51 
 
 
494 aa  385  1e-106  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2640  aldehyde dehydrogenase  43.24 
 
 
494 aa  388  1e-106  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.198513  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3348  aldehyde dehydrogenase  41.72 
 
 
494 aa  388  1e-106  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0219223  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2591  aldehyde dehydrogenase  43.04 
 
 
494 aa  386  1e-106  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3313  aldehyde dehydrogenase  41.72 
 
 
494 aa  388  1e-106  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2556  aldehyde dehydrogenase  43.45 
 
 
494 aa  388  1e-106  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.271873  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3263  aldehyde dehydrogenase  41.72 
 
 
494 aa  388  1e-106  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3257  aldehyde dehydrogenase  41.3 
 
 
494 aa  386  1e-106  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.536879  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3662  aldehyde dehydrogenase (NAD)  41.72 
 
 
494 aa  388  1e-106  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2831  aldehyde dehydrogenase  43.24 
 
 
494 aa  388  1e-106  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.217262  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3609  aldehyde dehydrogenase  41.72 
 
 
494 aa  388  1e-106  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3562  aldehyde dehydrogenase (NAD)  41.72 
 
 
494 aa  388  1e-106  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00134581 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1655  aldehyde dehydrogenase (NAD)  41.3 
 
 
494 aa  385  1e-106  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0330388 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4086  aldehyde dehydrogenase  43.1 
 
 
488 aa  388  1e-106  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.515709  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00554  Aldehyde dehydrogenase (ALDDH)(ALDH)(EC 1.2.1.3) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P08157]  41.77 
 
 
497 aa  382  1e-105  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.534945  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6072  aldehyde dehydrogenase  43.01 
 
 
488 aa  384  1e-105  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3909  gamma-glutamyl-gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  45.53 
 
 
487 aa  385  1e-105  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0265  aldehyde dehydrogenase  46.14 
 
 
512 aa  384  1e-105  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00113994 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2605  aldehyde dehydrogenase  41.23 
 
 
494 aa  385  1e-105  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000129908  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0846  aldehyde dehydrogenase  44.14 
 
 
493 aa  385  1e-105  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5214  betaine-aldehyde dehydrogenase  42.89 
 
 
488 aa  384  1e-105  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6130  Betaine-aldehyde dehydrogenase  42.3 
 
 
492 aa  381  1e-104  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3376  aldehyde dehydrogenase  43.45 
 
 
488 aa  380  1e-104  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.399948  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6158  betaine aldehyde dehydrogenase  43.61 
 
 
490 aa  379  1e-104  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7156  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  44.51 
 
 
494 aa  380  1e-104  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2904  aldehyde dehydrogenase  43.67 
 
 
494 aa  380  1e-104  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.399829  normal  0.436531 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2229  aldehyde dehydrogenase  41.09 
 
 
494 aa  381  1e-104  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.545234  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70950  betaine aldehyde dehydrogenase  43.4 
 
 
490 aa  379  1e-104  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.934353 
 
 
-
 
NC_006681  CNL05070  Aldehyde dehydrogenase (ALDDH), putative  40.82 
 
 
524 aa  375  1e-103  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3562  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  43.04 
 
 
494 aa  376  1e-103  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.37194  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0272  aldehyde dehydrogenase  45.07 
 
 
517 aa  378  1e-103  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5059  betaine aldehyde dehydrogenase  43.6 
 
 
489 aa  377  1e-103  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0560116 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0482  betaine aldehyde dehydrogenase  44.98 
 
 
490 aa  378  1e-103  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1527  transposase, IS605 OrfB family  46.94 
 
 
421 aa  372  1e-102  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2257  aldehyde dehydrogenase  41.72 
 
 
493 aa  374  1e-102  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2862  Aldehyde Dehydrogenase  40.04 
 
 
505 aa  373  1e-102  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>