More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_4475 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_0708  betaine-aldehyde dehydrogenase, putative  92.02 
 
 		 476 aa  898    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0742  aldehyde dehydrogenase  93.28 
 
 		 476 aa  889    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0742  aldehyde dehydrogenase  92.23 
 
 		 476 aa  897    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0948493  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4475  aldehyde dehydrogenase  100 
 
 		 476 aa  967    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2844  betaine-aldehyde dehydrogenase  53.93 
 
 		 481 aa  475  1e-133  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6720  betaine-aldehyde dehydrogenase  53.49 
 
 		 490 aa  464  1e-129  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4470  betaine-aldehyde dehydrogenase  51.16 
 
 		 483 aa  453  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.740479  normal  0.387365 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5267  aldehyde dehydrogenase  50.53 
 
 		 493 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3226  aldehyde dehydrogenase  50.63 
 
 		 493 aa  445  1e-123  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4844  Aldehyde Dehydrogenase  49.27 
 
 		 496 aa  437  1e-121  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.256973  normal  0.013402 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0096  betaine aldehyde dehydrogenase  47.5 
 
 		 491 aa  432  1e-120  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_50750  predicted protein  43.29 
 
 		 523 aa  399  9.999999999999999e-111  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0113332 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5200  aldehyde dehydrogenase  47.29 
 
 		 493 aa  383  1e-105  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2788  betaine-aldehyde dehydrogenase  46.34 
 
 		 493 aa  368  1e-100  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01689  aldehyde dehydrogenase family (Eurofung)  40 
 
 		 501 aa  364  2e-99  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.259255 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0158  aldehyde dehydrogenase  42.16 
 
 		 495 aa  357  1.9999999999999998e-97  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0153  aldehyde dehydrogenase  42.16 
 
 		 495 aa  357  1.9999999999999998e-97  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2758  Betaine-aldehyde dehydrogenase  40.64 
 
 		 482 aa  354  2e-96  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2465  Aldehyde Dehydrogenase  42.55 
 
 		 485 aa  353  2.9999999999999997e-96  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.146216  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0129  betaine aldehyde dehydrogenase  40.46 
 
 		 494 aa  352  7e-96  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00429668  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3176  aldehyde dehydrogenase  40.33 
 
 		 490 aa  350  2e-95  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000139941  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND02060  Aldehyde dehydrogenase (ALDDH), putative  41.25 
 
 		 495 aa  350  3e-95  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2823  betaine aldehyde dehydrogenase  40.08 
 
 		 491 aa  347  2e-94  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2720  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  43.3 
 
 		 496 aa  347  2e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.133505  normal  0.10056 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2233  Aldehyde dehydrogenase (NAD(+))  41.68 
 
 		 788 aa  346  4e-94  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.635265  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4700  aldehyde dehydrogenase  42.46 
 
 		 483 aa  347  4e-94  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0199533 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_09034  aldehyde dehydrogenase ALDH (AFU_orthologue; AFUA_8G02310)  40.77 
 
 		 511 aa  345  1e-93  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.699324  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6025  Aldehyde Dehydrogenase  43.1 
 
 		 483 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.181581 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2635  betaine aldehyde dehydrogenase  37.45 
 
 		 496 aa  343  4e-93  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31700  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  41.98 
 
 		 495 aa  343  4e-93  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.465703  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2689  betaine aldehyde dehydrogenase  37.45 
 
 		 496 aa  343  4e-93  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0778  Betaine-aldehyde dehydrogenase  43.75 
 
 		 474 aa  341  1e-92  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006681  CNL05070  Aldehyde dehydrogenase (ALDDH), putative  40.67 
 
 		 524 aa  341  2e-92  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0886  Aldehyde Dehydrogenase  40.85 
 
 		 473 aa  340  2.9999999999999998e-92  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1966  Aldehyde Dehydrogenase  42.13 
 
 		 478 aa  339  8e-92  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.57596 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1276  aldehyde dehydrogenase  38.16 
 
 		 497 aa  338  9e-92  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.420346  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1535  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  40.93 
 
 		 493 aa  338  9.999999999999999e-92  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.31089  normal  0.378909 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2836  aldehyde dehydrogenase  40.17 
 
 		 798 aa  336  5.999999999999999e-91  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.177288  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18440  Aldehyde dehydrogenase family protein  40.45 
 
 		 499 aa  336  7e-91  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.931316  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4860  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  39.92 
 
 		 491 aa  335  9e-91  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0955697 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2177  betaine aldehyde dehydrogenase  36.4 
 
 		 496 aa  335  1e-90  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2487  aldehyde dehydrogenase family protein  41.2 
 
 		 503 aa  334  2e-90  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1939  aldehyde dehydrogenase  43.04 
 
 		 501 aa  334  2e-90  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2837  Aldehyde Dehydrogenase  39.96 
 
 		 502 aa  333  3e-90  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF03900  aldehyde dehydrogenase (alddh), putative  38.67 
 
 		 506 aa  333  4e-90  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1244  Aldehyde Dehydrogenase  38.82 
 
 		 490 aa  333  6e-90  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00471898  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2599  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  39.58 
 
 		 490 aa  332  9e-90  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.225795  normal  0.197804 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0292  hypothetical protein  39.03 
 
 		 488 aa  331  2e-89  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5835  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  39.83 
 
 		 488 aa  330  3e-89  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2971  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  39.5 
 
 		 482 aa  330  3e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0217153 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3092  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  39.5 
 
 		 482 aa  330  3e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2904  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  39.5 
 
 		 482 aa  330  3e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4824  aldehyde dehydrogenase  41.42 
 
 		 492 aa  330  4e-89  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.00512486  normal  0.364288 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1476  betaine aldehyde dehydrogenase  38.17 
 
 		 490 aa  330  4e-89  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2988  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  39.5 
 
 		 482 aa  330  5.0000000000000004e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.853074  normal  0.0957266 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1708  Betaine-aldehyde dehydrogenase  42.46 
 
 		 494 aa  330  5.0000000000000004e-89  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0364  betaine-aldehyde dehydrogenase  41.59 
 
 		 478 aa  329  7e-89  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0744  Betaine-aldehyde dehydrogenase  40.55 
 
 		 496 aa  328  9e-89  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4856  aldehyde dehydrogenase  40.73 
 
 		 483 aa  328  9e-89  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.263653  normal  0.221142 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00554  Aldehyde dehydrogenase (ALDDH)(ALDH)(EC 1.2.1.3) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P08157]  39.72 
 
 		 497 aa  328  1.0000000000000001e-88  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.534945  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0308  hypothetical protein  38.61 
 
 		 488 aa  328  1.0000000000000001e-88  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3841  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  41.24 
 
 		 508 aa  328  1.0000000000000001e-88  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.829655 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0732  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  41.84 
 
 		 501 aa  327  2.0000000000000001e-88  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.207318  normal  0.0607885 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2260  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  43.32 
 
 		 484 aa  328  2.0000000000000001e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3047  Aldehyde Dehydrogenase  40.13 
 
 		 508 aa  327  3e-88  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3903  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  38.95 
 
 		 482 aa  326  5e-88  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.85959 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2781  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  38.95 
 
 		 482 aa  326  5e-88  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.610238 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1022  succinic semialdehyde dehydrogenase  38.95 
 
 		 482 aa  326  6e-88  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2941  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  38.95 
 
 		 482 aa  326  7e-88  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_63844  mitochondrial aldehyde dehydrogenase  37.63 
 
 		 501 aa  326  7e-88  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.704992  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1480  aldehyde dehydrogenase  38.16 
 
 		 490 aa  325  8.000000000000001e-88  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0515859  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1045  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  38.95 
 
 		 482 aa  325  8.000000000000001e-88  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05500  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  40.85 
 
 		 479 aa  325  9e-88  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1348  Betaine-aldehyde dehydrogenase  39.83 
 
 		 817 aa  325  9e-88  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.534066 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02517  succinate-semialdehyde dehydrogenase I, NADP-dependent  38.95 
 
 		 482 aa  325  1e-87  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02481  hypothetical protein  38.95 
 
 		 482 aa  325  1e-87  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2796  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  38.95 
 
 		 482 aa  325  1e-87  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1556  Retinal dehydrogenase  38.53 
 
 		 490 aa  323  4e-87  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0851  Aldehyde Dehydrogenase  41.08 
 
 		 480 aa  323  4e-87  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3759  Aldehyde Dehydrogenase  38.32 
 
 		 490 aa  323  5e-87  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.304272 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4061  Aldehyde dehydrogenase (NAD(+))  40.04 
 
 		 505 aa  323  5e-87  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2450  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  37.45 
 
 		 494 aa  321  9.999999999999999e-87  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0958  aldehyde dehydrogenase  39.5 
 
 		 492 aa  321  1.9999999999999998e-86  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.938749  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2904  aldehyde dehydrogenase  38.32 
 
 		 494 aa  320  3e-86  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.399829  normal  0.436531 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0265  aldehyde dehydrogenase  42.05 
 
 		 512 aa  320  3.9999999999999996e-86  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00113994 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3431  betaine-aldehyde dehydrogenase  38.99 
 
 		 488 aa  320  3.9999999999999996e-86  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4086  aldehyde dehydrogenase  38.99 
 
 		 488 aa  320  5e-86  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.515709  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2843  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  37.45 
 
 		 494 aa  320  5e-86  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.128159  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5036  betaine aldehyde dehydrogenase  38.99 
 
 		 489 aa  318  9e-86  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.418531  normal  0.930048 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49080  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  39.29 
 
 		 483 aa  318  1e-85  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.133526  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2084  aldehyde dehydrogenase  38.82 
 
 		 497 aa  318  1e-85  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3562  aldehyde dehydrogenase (NAD)  38.61 
 
 		 494 aa  318  1e-85  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00134581 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3348  aldehyde dehydrogenase  38.61 
 
 		 494 aa  318  1e-85  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0219223  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3313  aldehyde dehydrogenase  38.61 
 
 		 494 aa  318  1e-85  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3263  aldehyde dehydrogenase  38.61 
 
 		 494 aa  318  1e-85  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3257  aldehyde dehydrogenase  38.61 
 
 		 494 aa  318  1e-85  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.536879  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3609  aldehyde dehydrogenase  38.61 
 
 		 494 aa  318  1e-85  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1381  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  39.66 
 
 		 496 aa  318  1e-85  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.514457 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3569  aldehyde dehydrogenase  38.61 
 
 		 494 aa  318  2e-85  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4511  betaine aldehyde dehydrogenase  38.99 
 
 		 489 aa  317  2e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.644708 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>