More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH74115_3903 on replicon NC_011353
Organism: Escherichia coli O157:H7 str. EC4115



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_4681  succinic semialdehyde dehydrogenase  70.15 
 
 		 492 aa  700    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3222  succinic semialdehyde dehydrogenase  67.57 
 
 		 484 aa  695    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0492  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  69.5 
 
 		 489 aa  697    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.27369  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02517  succinate-semialdehyde dehydrogenase I, NADP-dependent  98.76 
 
 		 482 aa  972    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1022  succinic semialdehyde dehydrogenase  98.96 
 
 		 482 aa  976    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0213  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  82.37 
 
 		 480 aa  819    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.246043 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0173  succinic semialdehyde dehydrogenase  66.88 
 
 		 479 aa  664    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1756  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  64.86 
 
 		 491 aa  652    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0028  succinate-semialdehyde dehydrogenase oxidoreductase protein  64.6 
 
 		 497 aa  637    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2672  succinic semialdehyde dehydrogenase  64.66 
 
 		 492 aa  636    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.582581 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2941  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  99.38 
 
 		 482 aa  978    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5593  succinic semialdehyde dehydrogenase  66.53 
 
 		 484 aa  655    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3363  succinic semialdehyde dehydrogenase  69.29 
 
 		 489 aa  697    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.159343 
 
 
-
 
NC_004310  BR1640  succinate-semialdehyde dehydrogenase  66.6 
 
 		 483 aa  644    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.37932  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1275  succinate-semialdehyde dehydrogenase  70.75 
 
 		 482 aa  704    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2904  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  90.87 
 
 		 482 aa  896    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0300  succinate-semialdehyde dehydrogenase  80.08 
 
 		 480 aa  800    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4421  succinic semialdehyde dehydrogenase  66.67 
 
 		 479 aa  662    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0343  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  81.08 
 
 		 483 aa  817    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3187  succinic semialdehyde dehydrogenase  70.75 
 
 		 482 aa  724    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.450535  normal  0.0362336 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1481  succinate-semialdehyde dehydrogenase  69.29 
 
 		 489 aa  696    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.670932  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4850  succinic semialdehyde dehydrogenase  66.32 
 
 		 486 aa  682    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0951  succinic semialdehyde dehydrogenase  71.58 
 
 		 482 aa  729    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0091  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  80.08 
 
 		 480 aa  801    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0517  succinic semialdehyde dehydrogenase  62.92 
 
 		 486 aa  645    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000530591  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4908  succinic semialdehyde dehydrogenase  69.29 
 
 		 489 aa  695    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3748  succinate semialdehyde dehydrogenase  65.62 
 
 		 484 aa  647    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4617  succinic semialdehyde dehydrogenase  66.46 
 
 		 488 aa  656    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.224958  normal  0.233649 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4355  succinic semialdehyde dehydrogenase  65.83 
 
 		 493 aa  649    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00805728 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0237  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  82.16 
 
 		 480 aa  818    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4208  succinate semialdehyde dehydrogenase  72.92 
 
 		 500 aa  711    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.485625  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1568  succinate semialdehyde dehydrogenase  62.26 
 
 		 488 aa  635    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6301  succinic semialdehyde dehydrogenase  62.53 
 
 		 492 aa  635    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2207  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  66.04 
 
 		 480 aa  652    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.335018  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1820  succinate-semialdehyde dehydrogenase  69.5 
 
 		 489 aa  697    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2796  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  98.76 
 
 		 482 aa  972    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0187  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  81.74 
 
 		 480 aa  818    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1012  succinate semialdehyde dehydrogenase  64.66 
 
 		 511 aa  636    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.225997  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2971  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  90.87 
 
 		 482 aa  896    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0217153 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0279  succinate semialdehyde dehydrogenase  69.09 
 
 		 489 aa  698    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.89832  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3225  succinic semialdehyde dehydrogenase  64.86 
 
 		 486 aa  647    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00532289  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3395  succinate semialdehyde dehydrogenase  68.61 
 
 		 509 aa  699    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.610857  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1275  succinic semialdehyde dehydrogenase  65.34 
 
 		 483 aa  635    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2774  succinic semialdehyde dehydrogenase  70.89 
 
 		 486 aa  736    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2120  succinate-semialdehyde dehydrogenase  69.29 
 
 		 489 aa  696    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.71661  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5050  succinic semialdehyde dehydrogenase  64.58 
 
 		 485 aa  636    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.603107 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3903  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  100 
 
 		 482 aa  984    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.85959 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3722  succinic semialdehyde dehydrogenase  64.24 
 
 		 500 aa  649    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3095  succinic semialdehyde dehydrogenase  70.35 
 
 		 491 aa  680    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.628741  normal  0.0354959 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8306  succinic semialdehyde dehydrogenase  69.44 
 
 		 493 aa  697    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.985186  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1045  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  98.55 
 
 		 482 aa  970    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0231  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  81.7 
 
 		 483 aa  815    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0428  succinic semialdehyde dehydrogenase  73.39 
 
 		 486 aa  700    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49080  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  79.83 
 
 		 483 aa  807    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.133526  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4662  succinic semialdehyde dehydrogenase  70.62 
 
 		 493 aa  716    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1204  succinic semialdehyde dehydrogenase  70.33 
 
 		 482 aa  721    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.160081  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5115  succinate semialdehyde dehydrogenase  64.86 
 
 		 489 aa  667    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.891091 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0833  succinate semialdehyde dehydrogenase  68.19 
 
 		 486 aa  649    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.405715 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1588  succinate-semialdehyde dehydrogenase  66.39 
 
 		 483 aa  640    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.985863  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1976  succinate semialdehyde dehydrogenase  66.6 
 
 		 496 aa  686    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.275824  normal  0.526034 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0300  succinate semialdehyde dehydrogenase  67.71 
 
 		 486 aa  659    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.648676 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1691  succinic semialdehyde dehydrogenase  71.1 
 
 		 484 aa  737    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.943711  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3441  succinate semialdehyde dehydrogenase  68.14 
 
 		 479 aa  679    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.301737  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0909  succinic semialdehyde dehydrogenase  71.52 
 
 		 488 aa  717    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.107387  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3092  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  90.66 
 
 		 482 aa  894    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2125  succinate-semialdehyde dehydrogenase  69.5 
 
 		 489 aa  697    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.481281  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0100  succinic semialdehyde dehydrogenase  64.66 
 
 		 484 aa  648    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2291  succinate semialdehyde dehydrogenase  63.9 
 
 		 485 aa  644    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0394  succinic semialdehyde dehydrogenase  69.5 
 
 		 489 aa  697    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.41264  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3191  succinate semialdehyde dehydrogenase  69.02 
 
 		 483 aa  696    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4999  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  82.16 
 
 		 480 aa  822    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.354077  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4942  succinate-semialdehyde dehydrogenase I, NADP-dependent  61.41 
 
 		 482 aa  635    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.498743  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4518  succinic semialdehyde dehydrogenase  67.98 
 
 		 486 aa  651    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3399  succinic semialdehyde dehydrogenase  64.66 
 
 		 500 aa  650    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.547981  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0808  succinate-semialdehyde dehydrogenase  69.5 
 
 		 489 aa  697    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3004  succinic semialdehyde dehydrogenase  69.29 
 
 		 489 aa  695    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4443  succinic semialdehyde dehydrogenase  70.12 
 
 		 483 aa  686    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.094172 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1171  succinic semialdehyde dehydrogenase  70.33 
 
 		 482 aa  721    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0195542  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0112  succinic semialdehyde dehydrogenase  71.61 
 
 		 484 aa  715    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3342  succinic semialdehyde dehydrogenase  66.81 
 
 		 492 aa  657    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.420157  normal  0.140471 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1292  succinic semialdehyde dehydrogenase  71.82 
 
 		 485 aa  731    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00190928  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1113  succinic semialdehyde dehydrogenase  70.54 
 
 		 482 aa  723    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0228  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  82.16 
 
 		 480 aa  818    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.927727 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2913  succinate semialdehyde dehydrogenase  70.54 
 
 		 482 aa  706    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0320472  normal  0.673658 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2995  succinate semialdehyde dehydrogenase  70.54 
 
 		 482 aa  698    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0765297  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3004  succinic semialdehyde dehydrogenase  70.12 
 
 		 482 aa  719    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2988  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  91.08 
 
 		 482 aa  898    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.853074  normal  0.0957266 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4712  succinic semialdehyde dehydrogenase  69.29 
 
 		 489 aa  695    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2781  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  98.96 
 
 		 482 aa  976    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.610238 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03430  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  81.5 
 
 		 483 aa  822    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.59013  hitchhiker  1.44142e-17 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4305  succinic semialdehyde dehydrogenase  63.96 
 
 		 484 aa  640    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1099  succinic semialdehyde dehydrogenase  70.75 
 
 		 482 aa  726    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.681795  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5362  succinic semialdehyde dehydrogenase  69.29 
 
 		 489 aa  695    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0786  succinic semialdehyde dehydrogenase  69.44 
 
 		 493 aa  707    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0274  succinic semialdehyde dehydrogenase  69.65 
 
 		 492 aa  698    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2637  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)(+))  70.12 
 
 		 480 aa  676    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.602715  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3092  succinate semialdehyde dehydrogenase  70.54 
 
 		 482 aa  699    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.101414  normal  0.617954 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3193  succinic semialdehyde dehydrogenase  67.51 
 
 		 480 aa  644    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6540  succinic semialdehyde dehydrogenase  66.32 
 
 		 484 aa  650    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.142006 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5242  succinic semialdehyde dehydrogenase  69.09 
 
 		 489 aa  694    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.426538  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>