More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_4518 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009832  Spro_3095  succinic semialdehyde dehydrogenase  68.88 
 
 
491 aa  666    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.628741  normal  0.0354959 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0289  succinic semialdehyde dehydrogenase  63.35 
 
 
490 aa  643    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0228  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  69.17 
 
 
480 aa  697    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.927727 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1099  succinic semialdehyde dehydrogenase  66.88 
 
 
482 aa  674    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.681795  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02517  succinate-semialdehyde dehydrogenase I, NADP-dependent  67.78 
 
 
482 aa  686    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1022  succinic semialdehyde dehydrogenase  68.4 
 
 
482 aa  693    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0213  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  69.38 
 
 
480 aa  699    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.246043 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2971  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  67.98 
 
 
482 aa  689    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0217153 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1756  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  65.84 
 
 
491 aa  667    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0028  succinate-semialdehyde dehydrogenase oxidoreductase protein  66.67 
 
 
497 aa  644    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0492  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  85.45 
 
 
489 aa  849    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.27369  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1588  succinate-semialdehyde dehydrogenase  66.6 
 
 
483 aa  635    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.985863  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3363  succinic semialdehyde dehydrogenase  86.69 
 
 
489 aa  867    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.159343 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3903  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  67.98 
 
 
482 aa  689    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.85959 
 
 
-
 
NC_004310  BR1640  succinate-semialdehyde dehydrogenase  66.81 
 
 
483 aa  638    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.37932  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1275  succinate-semialdehyde dehydrogenase  67.92 
 
 
482 aa  657    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2402  succinic semialdehyde dehydrogenase  65.5 
 
 
490 aa  659    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.341651 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0300  succinate-semialdehyde dehydrogenase  69.17 
 
 
480 aa  694    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2781  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  68.4 
 
 
482 aa  692    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.610238 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0237  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  69.17 
 
 
480 aa  696    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1481  succinate-semialdehyde dehydrogenase  85.24 
 
 
489 aa  848    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.670932  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1093  succinic semialdehyde dehydrogenase  64.89 
 
 
486 aa  654    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2796  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  67.78 
 
 
482 aa  686    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0091  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  69.17 
 
 
480 aa  693    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1045  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  67.98 
 
 
482 aa  688    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0786  succinic semialdehyde dehydrogenase  69.36 
 
 
493 aa  697    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3748  succinate semialdehyde dehydrogenase  68.89 
 
 
484 aa  683    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3225  succinic semialdehyde dehydrogenase  75.93 
 
 
486 aa  754    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00532289  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0100  succinic semialdehyde dehydrogenase  67.15 
 
 
484 aa  681    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4617  succinic semialdehyde dehydrogenase  85.86 
 
 
488 aa  837    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.224958  normal  0.233649 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4208  succinate semialdehyde dehydrogenase  72.99 
 
 
500 aa  724    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.485625  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1691  succinic semialdehyde dehydrogenase  71.64 
 
 
484 aa  743    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.943711  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5660  succinate semialdehyde dehydrogenase  62.76 
 
 
484 aa  635    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2207  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  80.96 
 
 
480 aa  791    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.335018  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1820  succinate-semialdehyde dehydrogenase  85.45 
 
 
489 aa  849    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2941  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  68.61 
 
 
482 aa  694    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0187  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  68.19 
 
 
480 aa  693    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4443  succinic semialdehyde dehydrogenase  64.67 
 
 
483 aa  635    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.094172 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6772  succinate semialdehyde dehydrogenase  65.2 
 
 
502 aa  636    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0279  succinate semialdehyde dehydrogenase  86.9 
 
 
489 aa  867    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.89832  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3092  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  67.98 
 
 
482 aa  687    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3395  succinate semialdehyde dehydrogenase  71.84 
 
 
509 aa  729    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.610857  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0517  succinic semialdehyde dehydrogenase  63.98 
 
 
486 aa  662    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000530591  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0134  succinate semialdehyde dehydrogenase  68.26 
 
 
495 aa  644    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2120  succinate-semialdehyde dehydrogenase  85.65 
 
 
489 aa  853    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.71661  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4999  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  69.58 
 
 
480 aa  698    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.354077  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5050  succinic semialdehyde dehydrogenase  63.41 
 
 
485 aa  641    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.603107 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2774  succinic semialdehyde dehydrogenase  71.81 
 
 
486 aa  747    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0343  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  70.19 
 
 
483 aa  711    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1171  succinic semialdehyde dehydrogenase  66.67 
 
 
482 aa  668    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0195542  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2988  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  68.19 
 
 
482 aa  689    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.853074  normal  0.0957266 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0656  succinic semialdehyde dehydrogenase  68.11 
 
 
503 aa  690    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.131499 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6021  succinic semialdehyde dehydrogenase  67.01 
 
 
486 aa  653    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5242  succinic semialdehyde dehydrogenase  86.9 
 
 
489 aa  866    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.426538  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1568  succinate semialdehyde dehydrogenase  64.67 
 
 
488 aa  649    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4662  succinic semialdehyde dehydrogenase  70.06 
 
 
493 aa  702    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5115  succinate semialdehyde dehydrogenase  62.53 
 
 
489 aa  638    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.891091 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0833  succinate semialdehyde dehydrogenase  98.35 
 
 
486 aa  981    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.405715 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0112  succinic semialdehyde dehydrogenase  72.46 
 
 
484 aa  717    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1976  succinate semialdehyde dehydrogenase  67.63 
 
 
496 aa  683    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.275824  normal  0.526034 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0274  succinic semialdehyde dehydrogenase  68.6 
 
 
492 aa  682    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0300  succinate semialdehyde dehydrogenase  73.8 
 
 
486 aa  738    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.648676 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0666  succinate semialdehyde dehydrogenase  67.63 
 
 
492 aa  643    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.278436  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2904  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  67.98 
 
 
482 aa  689    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0909  succinic semialdehyde dehydrogenase  66.32 
 
 
488 aa  657    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.107387  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4518  succinic semialdehyde dehydrogenase  100 
 
 
486 aa  992    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2125  succinate-semialdehyde dehydrogenase  85.45 
 
 
489 aa  849    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.481281  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4850  succinic semialdehyde dehydrogenase  80.25 
 
 
486 aa  835    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1292  succinic semialdehyde dehydrogenase  70.39 
 
 
485 aa  715    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00190928  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0808  succinate-semialdehyde dehydrogenase  85.45 
 
 
489 aa  849    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3191  succinate semialdehyde dehydrogenase  67.29 
 
 
483 aa  665    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4908  succinic semialdehyde dehydrogenase  87.32 
 
 
489 aa  869    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4942  succinate-semialdehyde dehydrogenase I, NADP-dependent  65.83 
 
 
482 aa  670    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.498743  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3263  succinate semialdehyde dehydrogenase  65.84 
 
 
489 aa  641    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.132134 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4318  succinic semialdehyde dehydrogenase  65.83 
 
 
499 aa  645    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.140672 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1978  succinate semialdehyde dehydrogenase  66.26 
 
 
496 aa  642    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0648887  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3004  succinic semialdehyde dehydrogenase  87.32 
 
 
489 aa  869    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1204  succinic semialdehyde dehydrogenase  66.67 
 
 
482 aa  671    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.160081  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6301  succinic semialdehyde dehydrogenase  64.18 
 
 
492 aa  634    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0231  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  71.01 
 
 
483 aa  716    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1113  succinic semialdehyde dehydrogenase  66.88 
 
 
482 aa  671    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3722  succinic semialdehyde dehydrogenase  66.26 
 
 
500 aa  660    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0394  succinic semialdehyde dehydrogenase  85.45 
 
 
489 aa  849    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.41264  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3222  succinic semialdehyde dehydrogenase  64.8 
 
 
484 aa  657    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2913  succinate semialdehyde dehydrogenase  68.12 
 
 
482 aa  665    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0320472  normal  0.673658 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2995  succinate semialdehyde dehydrogenase  68.54 
 
 
482 aa  660    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0765297  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3004  succinic semialdehyde dehydrogenase  65.62 
 
 
482 aa  655    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2324  succinate semialdehyde dehydrogenase  65.98 
 
 
492 aa  636    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.832005  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4712  succinic semialdehyde dehydrogenase  87.11 
 
 
489 aa  868    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2637  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)(+))  70 
 
 
480 aa  652    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.602715  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3441  succinate semialdehyde dehydrogenase  68.13 
 
 
479 aa  679    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.301737  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03430  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  69.98 
 
 
483 aa  711    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.59013  hitchhiker  1.44142e-17 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2672  succinic semialdehyde dehydrogenase  66.6 
 
 
492 aa  636    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.582581 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0951  succinic semialdehyde dehydrogenase  65.62 
 
 
482 aa  660    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5362  succinic semialdehyde dehydrogenase  87.32 
 
 
489 aa  869    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1275  succinic semialdehyde dehydrogenase  66.81 
 
 
483 aa  644    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0213  succinic semialdehyde dehydrogenase  65.97 
 
 
492 aa  635    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.786998  normal  0.906241 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3092  succinate semialdehyde dehydrogenase  68.33 
 
 
482 aa  662    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.101414  normal  0.617954 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4305  succinic semialdehyde dehydrogenase  63.33 
 
 
484 aa  643    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0428  succinic semialdehyde dehydrogenase  71.69 
 
 
486 aa  680    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>