More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_1925 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_5320  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  55.72 
 
 
675 aa  719    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.248137  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1850  phenylacetic acid degradation protein paaN  54.65 
 
 
679 aa  736    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.8142  normal  0.547776 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3827  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  59.52 
 
 
678 aa  768    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.145671  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3053  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  51.75 
 
 
702 aa  653    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26540  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  55.26 
 
 
681 aa  727    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.212629 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0748  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  60.89 
 
 
675 aa  813    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.778513 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2485  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  52.14 
 
 
683 aa  678    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00712993  hitchhiker  0.00576818 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1910  phenylacetic acid degradation protein paaN  57.61 
 
 
686 aa  742    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0302284  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3636  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  84.49 
 
 
678 aa  1124    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.387162 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0658  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  56.27 
 
 
664 aa  710    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4152  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  57.89 
 
 
686 aa  759    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.39195  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0685  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  59.76 
 
 
674 aa  776    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3359  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  69.37 
 
 
685 aa  927    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.990834  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1832  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  86.54 
 
 
678 aa  1176    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0934  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  57.44 
 
 
691 aa  744    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0226  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  50.89 
 
 
683 aa  653    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.577017 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1913  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  52.17 
 
 
695 aa  650    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0600585  normal  0.0559603 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0437  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  59.22 
 
 
676 aa  775    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.68112 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1556  phenylacetic acid degradation protein paaN  56.07 
 
 
690 aa  732    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1925  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  100 
 
 
679 aa  1371    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0838003  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20290  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  50.44 
 
 
706 aa  649    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0650346  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3568  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  54.05 
 
 
682 aa  680    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.282162 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1515  phenylacetic acid degradation protein paaN  52.13 
 
 
686 aa  697    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.629181  normal  0.465185 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3255  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  51.09 
 
 
703 aa  662    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.607573  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4804  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  58.18 
 
 
686 aa  771    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.27422 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1226  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  54.26 
 
 
686 aa  657    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0907  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  72.19 
 
 
687 aa  973    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.338542  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0031  phenylacetic acid degradation protein paaN  55.92 
 
 
678 aa  730    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.300256  normal  0.45539 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2626  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  53.18 
 
 
684 aa  632  1e-180  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.574883  normal  0.162198 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3090  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  50.22 
 
 
684 aa  633  1e-180  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.748677  hitchhiker  0.00334678 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2639  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  53.04 
 
 
683 aa  631  1e-179  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.31992  normal  0.197677 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3270  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  52.73 
 
 
684 aa  626  1e-178  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.289293  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2489  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  52.58 
 
 
684 aa  625  1e-177  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.997274 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3071  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  52.18 
 
 
690 aa  622  1e-177  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.329771 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0094  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  52.01 
 
 
688 aa  619  1e-176  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0649  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  48.78 
 
 
683 aa  612  9.999999999999999e-175  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.940422  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1474  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  51.03 
 
 
681 aa  608  1e-173  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2268  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  51.97 
 
 
681 aa  609  1e-173  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2258  phenylacetic acid degradation protein paaN  51.67 
 
 
681 aa  605  9.999999999999999e-173  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1572  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  51.52 
 
 
681 aa  605  9.999999999999999e-173  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05275  aldehyde dehydrogenase  43.77 
 
 
836 aa  535  1e-150  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0895  aldehyde dehydrogenase  45.9 
 
 
531 aa  402  1e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.335826 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1420  aldehyde dehydrogenase  44.76 
 
 
531 aa  389  1e-107  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0677446  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2699  aldehyde dehydrogenase  44.97 
 
 
531 aa  386  1e-106  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3656  aldehyde dehydrogenase  45.74 
 
 
519 aa  378  1e-103  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1625  aldehyde dehydrogenase  43.85 
 
 
518 aa  373  1e-102  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0898756  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4944  Aldehyde Dehydrogenase  46.23 
 
 
517 aa  373  1e-102  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.141691  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0090  aldehyde dehydrogenase  45.56 
 
 
516 aa  372  1e-102  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2947  aldehyde dehydrogenase  45.86 
 
 
523 aa  369  1e-100  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.738502  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0217  aldehyde dehydrogenase  44.19 
 
 
520 aa  355  2e-96  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.286269  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1607  dehydratase  50.86 
 
 
515 aa  177  7e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.244807  normal  0.332328 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4593  aldehyde dehydrogenase  34.11 
 
 
487 aa  135  1.9999999999999998e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2916  betaine aldehyde dehydrogenase  29.65 
 
 
490 aa  127  8.000000000000001e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2830  betaine aldehyde dehydrogenase  29.45 
 
 
490 aa  124  5e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.143897  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2844  betaine-aldehyde dehydrogenase  29.27 
 
 
481 aa  124  7e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1779  aldehyde dehydrogenase  30.96 
 
 
485 aa  123  9.999999999999999e-27  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1018  Aldehyde Dehydrogenase  29.74 
 
 
510 aa  123  9.999999999999999e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0482  betaine aldehyde dehydrogenase  30.79 
 
 
490 aa  121  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0560  Aldehyde Dehydrogenase  28.85 
 
 
500 aa  121  4.9999999999999996e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5258  aldehyde dehydrogenase family protein  32.69 
 
 
496 aa  120  7e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0956812  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5168  aldehyde dehydrogenase  32.69 
 
 
496 aa  120  7e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.545651  normal  0.0529953 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0213  aldehyde dehydrogenase  33.01 
 
 
496 aa  120  7e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.225819  normal  0.287254 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1953  aldehyde dehydrogenase A  26.13 
 
 
479 aa  119  9.999999999999999e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5310  aldehyde dehydrogenase  32.69 
 
 
496 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.09139 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1270  delta-1-piperideine-6-carboxylate dehydrogenase  31.35 
 
 
529 aa  120  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1287  delta-1-piperideine-6-carboxylate dehydrogenase  31.35 
 
 
529 aa  120  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.195154 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0272  aldehyde dehydrogenase  29.12 
 
 
517 aa  119  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0265  aldehyde dehydrogenase  28.98 
 
 
512 aa  118  3e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00113994 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1891  piperideine-6-carboxylate dehydrogenase  28.79 
 
 
496 aa  118  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3788  aldehyde dehydrogenase  30.45 
 
 
510 aa  117  5e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2655  aldehyde dehydrogenase  28.63 
 
 
502 aa  118  5e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2230  Aldehyde Dehydrogenase  28 
 
 
479 aa  117  6e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0354043  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2196  aldehyde dehydrogenase  31.07 
 
 
475 aa  117  6e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2158  aldehyde dehydrogenase  31.07 
 
 
475 aa  117  6e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01370  aldehyde dehydrogenase A, NAD-linked  27.32 
 
 
479 aa  117  7.999999999999999e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3514  aldehyde dehydrogenase  28.79 
 
 
496 aa  117  7.999999999999999e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1498  aldehyde dehydrogenase A  27.5 
 
 
479 aa  117  7.999999999999999e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2243  aldehyde dehydrogenase A  27.5 
 
 
479 aa  117  7.999999999999999e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01382  hypothetical protein  27.32 
 
 
479 aa  117  7.999999999999999e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0875  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)(+))  28.69 
 
 
483 aa  117  8.999999999999998e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2689  aldehyde dehydrogenase  29.72 
 
 
798 aa  116  1.0000000000000001e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.583529 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6158  betaine aldehyde dehydrogenase  29.32 
 
 
490 aa  117  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1596  aldehyde dehydrogenase A  27.75 
 
 
479 aa  116  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0486  aldehyde dehydrogenase  33 
 
 
486 aa  115  3e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.577547  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0667  aldehyde dehydrogenase  33.33 
 
 
486 aa  115  3e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1297  delta-1-piperideine-6-carboxylate dehydrogenase  31.27 
 
 
530 aa  115  3e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.224438 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2239  aldehyde dehydrogenase  33.33 
 
 
486 aa  115  3e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0390454  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5599  betaine-aldehyde dehydrogenase  29.43 
 
 
496 aa  115  3e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0279735  normal  0.51588 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0742  aldehyde dehydrogenase  29.7 
 
 
476 aa  115  3e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2021  aldehyde dehydrogenase A  27.57 
 
 
479 aa  115  3e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000217871 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0569  aldehyde dehydrogenase  33.33 
 
 
486 aa  115  3e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.710627  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1757  aldehyde dehydrogenase A  27.57 
 
 
479 aa  115  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000249904 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2952  aldehyde dehydrogenase  27.49 
 
 
494 aa  115  4.0000000000000004e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.336434  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1292  putative aldehyde dehydrogenase  28.14 
 
 
494 aa  114  5e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1514  betaine aldehyde dehydrogenase  29.8 
 
 
490 aa  114  5e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0736273  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3666  betaine-aldehyde dehydrogenase  29.17 
 
 
496 aa  114  5e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4701  betaine-aldehyde dehydrogenase  29.17 
 
 
496 aa  114  5e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00415207  normal  0.173855 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5405  Aldehyde Dehydrogenase  28.6 
 
 
529 aa  114  5e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.264091  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1410  2-hydroxymuconic semialdehyde dehydrogenase  26.21 
 
 
488 aa  114  8.000000000000001e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4040  betaine-aldehyde dehydrogenase  27.4 
 
 
477 aa  114  9e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.71775 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>