More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_0226 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010322  PputGB1_2626  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  55.24 
 
 
684 aa  716    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.574883  normal  0.162198 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1474  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  55.99 
 
 
681 aa  726    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2258  phenylacetic acid degradation protein paaN  55.85 
 
 
681 aa  724    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3270  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  55.08 
 
 
684 aa  714    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.289293  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0031  phenylacetic acid degradation protein paaN  50.3 
 
 
678 aa  649    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.300256  normal  0.45539 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0226  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  100 
 
 
683 aa  1422    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.577017 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1850  phenylacetic acid degradation protein paaN  57.29 
 
 
679 aa  832    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.8142  normal  0.547776 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2489  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  55.23 
 
 
684 aa  714    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.997274 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1556  phenylacetic acid degradation protein paaN  55.78 
 
 
690 aa  771    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1925  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  50.89 
 
 
679 aa  652    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0838003  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3359  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  50.15 
 
 
685 aa  655    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.990834  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3568  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  54.8 
 
 
682 aa  722    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.282162 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1515  phenylacetic acid degradation protein paaN  57.16 
 
 
686 aa  805    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.629181  normal  0.465185 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5320  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  50.44 
 
 
675 aa  672    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.248137  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4152  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  53.03 
 
 
686 aa  701    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.39195  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1226  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  55.29 
 
 
686 aa  717    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0649  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  53.83 
 
 
683 aa  725    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.940422  normal 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3827  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  50.07 
 
 
678 aa  662    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.145671  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3636  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  51.04 
 
 
678 aa  645    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.387162 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0685  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  50.59 
 
 
674 aa  640    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1832  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  50.3 
 
 
678 aa  658    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0934  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  52.29 
 
 
691 aa  684    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1913  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  55.03 
 
 
695 aa  761    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0600585  normal  0.0559603 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0437  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  51.4 
 
 
676 aa  665    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.68112 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0748  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  51.04 
 
 
675 aa  672    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.778513 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1910  phenylacetic acid degradation protein paaN  50.3 
 
 
686 aa  654    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0302284  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26540  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  49.19 
 
 
681 aa  650    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.212629 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0907  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  51.63 
 
 
687 aa  675    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.338542  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05275  aldehyde dehydrogenase  50.36 
 
 
836 aa  637    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1572  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  55.7 
 
 
681 aa  724    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3071  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  55.36 
 
 
690 aa  738    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.329771 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2268  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  55.99 
 
 
681 aa  727    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2639  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  55.19 
 
 
683 aa  714    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.31992  normal  0.197677 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4804  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  53.47 
 
 
686 aa  718    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.27422 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3090  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  55.56 
 
 
684 aa  726    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.748677  hitchhiker  0.00334678 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0658  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  49.7 
 
 
664 aa  635  1e-180  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2485  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  48.16 
 
 
683 aa  610  1e-173  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00712993  hitchhiker  0.00576818 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3255  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  48.41 
 
 
703 aa  603  1.0000000000000001e-171  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.607573  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3053  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  48.77 
 
 
702 aa  597  1e-169  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20290  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  47.39 
 
 
706 aa  590  1e-167  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0650346  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0094  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  44.46 
 
 
688 aa  557  1e-157  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0895  aldehyde dehydrogenase  40.8 
 
 
531 aa  365  1e-99  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.335826 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4944  Aldehyde Dehydrogenase  40.82 
 
 
517 aa  357  3.9999999999999996e-97  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.141691  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1625  aldehyde dehydrogenase  38.27 
 
 
518 aa  342  1e-92  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0898756  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1420  aldehyde dehydrogenase  38.56 
 
 
531 aa  340  5.9999999999999996e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0677446  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2699  aldehyde dehydrogenase  37.89 
 
 
531 aa  336  7e-91  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2947  aldehyde dehydrogenase  38.83 
 
 
523 aa  336  1e-90  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.738502  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3656  aldehyde dehydrogenase  39.15 
 
 
519 aa  333  6e-90  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0090  aldehyde dehydrogenase  37.35 
 
 
516 aa  328  3e-88  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0217  aldehyde dehydrogenase  39.38 
 
 
520 aa  326  9e-88  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.286269  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0560  Aldehyde Dehydrogenase  28.12 
 
 
500 aa  141  4.999999999999999e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6772  succinate semialdehyde dehydrogenase  25.2 
 
 
502 aa  136  9.999999999999999e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1607  dehydratase  41.4 
 
 
515 aa  134  5e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.244807  normal  0.332328 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0158  aldehyde dehydrogenase  25.09 
 
 
495 aa  129  2.0000000000000002e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0153  aldehyde dehydrogenase  25.09 
 
 
495 aa  129  2.0000000000000002e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1779  aldehyde dehydrogenase  27.95 
 
 
485 aa  127  7e-28  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4428  succinic semialdehyde dehydrogenase  24.8 
 
 
499 aa  125  2e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.111659  normal  0.480153 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4318  succinic semialdehyde dehydrogenase  24.8 
 
 
499 aa  125  2e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.140672 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1104  aldehyde dehydrogenase  28.08 
 
 
474 aa  124  6e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.304588  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0742  aldehyde dehydrogenase  28.06 
 
 
476 aa  124  8e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0948493  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0272  aldehyde dehydrogenase  24.72 
 
 
517 aa  123  9.999999999999999e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2635  betaine aldehyde dehydrogenase  24.41 
 
 
496 aa  122  1.9999999999999998e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2689  betaine aldehyde dehydrogenase  24.41 
 
 
496 aa  122  1.9999999999999998e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0265  aldehyde dehydrogenase  25.83 
 
 
512 aa  121  3e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00113994 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5405  Aldehyde Dehydrogenase  26.5 
 
 
529 aa  121  3e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.264091  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1493  Aldehyde Dehydrogenase  25.7 
 
 
477 aa  121  3.9999999999999996e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0589665  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4080  betaine aldehyde dehydrogenase  25.77 
 
 
485 aa  121  4.9999999999999996e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10225  aldehyde dehydrogenase  26.96 
 
 
487 aa  120  9e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.749667  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1691  succinic semialdehyde dehydrogenase  25.91 
 
 
484 aa  120  9e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.943711  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2774  succinic semialdehyde dehydrogenase  25.7 
 
 
486 aa  120  9.999999999999999e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2465  Aldehyde Dehydrogenase  27.61 
 
 
485 aa  119  9.999999999999999e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.146216  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1868  succinic semialdehyde dehydrogenase  27.27 
 
 
486 aa  119  1.9999999999999998e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0212  Aldehyde Dehydrogenase  27.39 
 
 
484 aa  119  1.9999999999999998e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5242  succinic semialdehyde dehydrogenase  24.75 
 
 
489 aa  119  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.426538  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0708  betaine-aldehyde dehydrogenase, putative  27.27 
 
 
476 aa  118  3e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3788  aldehyde dehydrogenase  23.81 
 
 
510 aa  118  3e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4475  aldehyde dehydrogenase  27.04 
 
 
476 aa  119  3e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000636  NAD-dependent aldehyde dehydrogenase  25.74 
 
 
506 aa  119  3e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3399  succinic semialdehyde dehydrogenase  25.96 
 
 
500 aa  118  3e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.547981  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4712  succinic semialdehyde dehydrogenase  24.75 
 
 
489 aa  118  3e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3363  succinic semialdehyde dehydrogenase  25.2 
 
 
489 aa  118  3.9999999999999997e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.159343 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0544  Aldehyde Dehydrogenase_  25.11 
 
 
477 aa  118  3.9999999999999997e-25  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.257528  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0279  succinate semialdehyde dehydrogenase  24.75 
 
 
489 aa  117  5e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.89832  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0742  aldehyde dehydrogenase  26.73 
 
 
476 aa  117  6e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1018  Aldehyde Dehydrogenase  25 
 
 
510 aa  117  6.9999999999999995e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1093  succinic semialdehyde dehydrogenase  24.23 
 
 
486 aa  117  8.999999999999998e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4908  succinic semialdehyde dehydrogenase  24.75 
 
 
489 aa  116  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3004  succinic semialdehyde dehydrogenase  24.75 
 
 
489 aa  116  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5362  succinic semialdehyde dehydrogenase  24.75 
 
 
489 aa  116  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2991  succinic semialdehyde dehydrogenase  25.6 
 
 
485 aa  116  1.0000000000000001e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6539300000000001e-18 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0028  succinate-semialdehyde dehydrogenase oxidoreductase protein  25.25 
 
 
497 aa  115  2.0000000000000002e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4593  aldehyde dehydrogenase  27.23 
 
 
487 aa  115  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6113  Aldehyde Dehydrogenase  25.83 
 
 
466 aa  115  4.0000000000000004e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.401659  normal  0.835317 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3722  succinic semialdehyde dehydrogenase  25.35 
 
 
500 aa  115  4.0000000000000004e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1292  succinic semialdehyde dehydrogenase  25.6 
 
 
485 aa  115  4.0000000000000004e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00190928  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1554  aldehyde dehydrogenase  27.1 
 
 
498 aa  114  5e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.220201 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1290  succinate semialdehyde dehydrogenase  26.52 
 
 
482 aa  114  5e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3794  aldehyde dehydrogenase  25.77 
 
 
783 aa  114  6e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0096  betaine aldehyde dehydrogenase  26.86 
 
 
491 aa  114  6e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2373  succinic semialdehyde dehydrogenase  25.96 
 
 
486 aa  114  8.000000000000001e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.183716  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>