More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_2947 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012791  Vapar_0090  aldehyde dehydrogenase  76.6 
 
 
516 aa  749    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2699  aldehyde dehydrogenase  66.8 
 
 
531 aa  638    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2947  aldehyde dehydrogenase  100 
 
 
523 aa  1045    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.738502  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0217  aldehyde dehydrogenase  81.07 
 
 
520 aa  807    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.286269  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1625  aldehyde dehydrogenase  84.07 
 
 
518 aa  845    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0898756  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0895  aldehyde dehydrogenase  64.96 
 
 
531 aa  649    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.335826 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3656  aldehyde dehydrogenase  87.16 
 
 
519 aa  862    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1420  aldehyde dehydrogenase  66.8 
 
 
531 aa  634  1e-180  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0677446  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1850  phenylacetic acid degradation protein paaN  43.77 
 
 
679 aa  420  1e-116  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.8142  normal  0.547776 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5320  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  48.15 
 
 
675 aa  417  9.999999999999999e-116  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.248137  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26540  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  46.21 
 
 
681 aa  403  1e-111  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.212629 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1910  phenylacetic acid degradation protein paaN  47.37 
 
 
686 aa  400  9.999999999999999e-111  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0302284  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1556  phenylacetic acid degradation protein paaN  42.86 
 
 
690 aa  397  1e-109  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1515  phenylacetic acid degradation protein paaN  44.27 
 
 
686 aa  396  1e-109  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.629181  normal  0.465185 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2485  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  44.83 
 
 
683 aa  394  1e-108  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00712993  hitchhiker  0.00576818 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1832  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  46.18 
 
 
678 aa  392  1e-108  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4804  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  44.05 
 
 
686 aa  393  1e-108  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.27422 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4152  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  44.27 
 
 
686 aa  392  1e-107  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.39195  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3090  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  44.21 
 
 
684 aa  386  1e-106  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.748677  hitchhiker  0.00334678 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0437  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  43.66 
 
 
676 aa  384  1e-105  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.68112 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3359  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  47.59 
 
 
685 aa  385  1e-105  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.990834  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0907  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  46.26 
 
 
687 aa  383  1e-105  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.338542  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0748  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  44.14 
 
 
675 aa  380  1e-104  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.778513 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3827  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  44.47 
 
 
678 aa  381  1e-104  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.145671  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1925  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  45.86 
 
 
679 aa  376  1e-103  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0838003  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2258  phenylacetic acid degradation protein paaN  45.12 
 
 
681 aa  373  1e-102  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2268  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  45.12 
 
 
681 aa  375  1e-102  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1572  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  45.12 
 
 
681 aa  373  1e-102  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1474  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  45.12 
 
 
681 aa  374  1e-102  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0031  phenylacetic acid degradation protein paaN  43.8 
 
 
678 aa  371  1e-101  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.300256  normal  0.45539 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0094  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  43.02 
 
 
688 aa  372  1e-101  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1913  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  43.44 
 
 
695 aa  371  1e-101  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0600585  normal  0.0559603 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0934  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  43.08 
 
 
691 aa  369  1e-100  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3636  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  47.05 
 
 
678 aa  363  3e-99  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.387162 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0226  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  39.34 
 
 
683 aa  362  9e-99  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.577017 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0685  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  45.35 
 
 
674 aa  358  9.999999999999999e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05275  aldehyde dehydrogenase  39.18 
 
 
836 aa  355  7.999999999999999e-97  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3568  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  44.57 
 
 
682 aa  353  2.9999999999999997e-96  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.282162 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3071  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  42.8 
 
 
690 aa  352  8.999999999999999e-96  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.329771 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1226  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  46.62 
 
 
686 aa  350  5e-95  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0649  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  38.67 
 
 
683 aa  348  1e-94  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.940422  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20290  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  41.43 
 
 
706 aa  344  2.9999999999999997e-93  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0650346  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0658  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  42.3 
 
 
664 aa  344  2.9999999999999997e-93  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4944  Aldehyde Dehydrogenase  44.14 
 
 
517 aa  341  2e-92  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.141691  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3255  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  40.61 
 
 
703 aa  338  9.999999999999999e-92  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.607573  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3053  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  41.43 
 
 
702 aa  332  1e-89  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2639  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  43.95 
 
 
683 aa  323  5e-87  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.31992  normal  0.197677 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2626  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  43.16 
 
 
684 aa  318  1e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.574883  normal  0.162198 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2489  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  43.16 
 
 
684 aa  317  4e-85  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.997274 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3270  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  43.16 
 
 
684 aa  316  7e-85  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.289293  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1868  succinic semialdehyde dehydrogenase  28.77 
 
 
486 aa  125  3e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1459  aldehyde dehydrogenase  26.76 
 
 
505 aa  112  1.0000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2043  aldehyde dehydrogenase  27.74 
 
 
470 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000365  betaine aldehyde dehydrogenase  26.95 
 
 
486 aa  111  3e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4475  aldehyde dehydrogenase  27.09 
 
 
476 aa  111  3e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1779  aldehyde dehydrogenase  27.27 
 
 
485 aa  110  4.0000000000000004e-23  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2844  betaine-aldehyde dehydrogenase  27.35 
 
 
481 aa  111  4.0000000000000004e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0742  aldehyde dehydrogenase  26.15 
 
 
476 aa  109  1e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4208  succinate semialdehyde dehydrogenase  26.59 
 
 
500 aa  108  2e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.485625  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1415  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  25.45 
 
 
474 aa  108  2e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0272  aldehyde dehydrogenase  25.86 
 
 
517 aa  107  4e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0708  betaine-aldehyde dehydrogenase, putative  26.4 
 
 
476 aa  106  8e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0265  aldehyde dehydrogenase  26.77 
 
 
512 aa  106  1e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00113994 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2186  aldehyde dehydrogenase  27.19 
 
 
470 aa  105  1e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0362703  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1785  succinic semialdehyde dehydrogenase  28.64 
 
 
486 aa  106  1e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0231  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  27.69 
 
 
483 aa  105  2e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5114  betaine aldehyde dehydrogenase  26.19 
 
 
490 aa  105  2e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.502365  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1756  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  27.33 
 
 
491 aa  105  3e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0742  aldehyde dehydrogenase  26.4 
 
 
476 aa  104  4e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0948493  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1691  succinic semialdehyde dehydrogenase  26.08 
 
 
484 aa  103  6e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.943711  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2774  succinic semialdehyde dehydrogenase  25.62 
 
 
486 aa  103  6e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5243  betaine aldehyde dehydrogenase  27.29 
 
 
490 aa  103  9e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0991696  normal  0.0622571 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0402  betaine aldehyde dehydrogenase  26.19 
 
 
490 aa  102  1e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0786  succinic semialdehyde dehydrogenase  28.94 
 
 
493 aa  102  1e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7257  aldehyde dehydrogenase  26.16 
 
 
505 aa  103  1e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.548914  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4949  lactaldehyde dehydrogenase  25.81 
 
 
478 aa  102  1e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.206035 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2878  betaine-aldehyde dehydrogenase  26.27 
 
 
473 aa  102  2e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0192493  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5063  betaine aldehyde dehydrogenase  26.39 
 
 
490 aa  102  2e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.921344  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09240  Aldehyde dehydrogenase  27.51 
 
 
477 aa  102  2e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.904508  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4936  betaine aldehyde dehydrogenase  26.39 
 
 
490 aa  102  2e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.208261  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3064  aldehyde dehydrogenase family protein  26.3 
 
 
505 aa  102  2e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0192942  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0376  betaine aldehyde dehydrogenase  28.31 
 
 
489 aa  102  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0191896  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0958  aldehyde dehydrogenase  25.88 
 
 
492 aa  102  2e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.938749  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1836  betaine aldehyde dehydrogenase  28.31 
 
 
489 aa  102  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.422897  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2499  betaine-aldehyde dehydrogenase  27.6 
 
 
496 aa  102  2e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.00184375  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0829  aldehyde dehydrogenase  27.95 
 
 
503 aa  102  2e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0391046  unclonable  0.0000197255 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1818  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  24.35 
 
 
474 aa  102  2e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5279  Aldehyde Dehydrogenase  24.94 
 
 
505 aa  101  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2568  succinic semialdehyde dehydrogenase  26.95 
 
 
486 aa  101  3e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.951924  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5405  Aldehyde Dehydrogenase  26.12 
 
 
529 aa  101  4e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.264091  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4318  succinic semialdehyde dehydrogenase  28.09 
 
 
499 aa  100  4e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.140672 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3788  aldehyde dehydrogenase  26.35 
 
 
510 aa  100  4e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4428  succinic semialdehyde dehydrogenase  28.09 
 
 
499 aa  100  4e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.111659  normal  0.480153 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0951  succinic semialdehyde dehydrogenase  25.85 
 
 
482 aa  101  4e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3395  succinate semialdehyde dehydrogenase  25.97 
 
 
509 aa  100  5e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.610857  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4733  Aldehyde Dehydrogenase  23.68 
 
 
506 aa  100  5e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.29898  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4061  Aldehyde dehydrogenase (NAD(+))  24.69 
 
 
505 aa  100  5e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2232  succinic semialdehyde dehydrogenase  27.88 
 
 
490 aa  100  6e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.179886  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0554  aldehyde dehydrogenase  24.82 
 
 
476 aa  100  7e-20  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  unclonable  0.000000239131  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1682  betaine-aldehyde dehydrogenase  25.84 
 
 
502 aa  100  7e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>