More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_0685 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_2485  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  53.72 
 
 
683 aa  676    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00712993  hitchhiker  0.00576818 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0748  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  60.36 
 
 
675 aa  802    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.778513 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0031  phenylacetic acid degradation protein paaN  53.95 
 
 
678 aa  677    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.300256  normal  0.45539 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4152  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  59.97 
 
 
686 aa  781    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.39195  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3636  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  59.31 
 
 
678 aa  759    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.387162 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1850  phenylacetic acid degradation protein paaN  53.6 
 
 
679 aa  714    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.8142  normal  0.547776 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0658  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  57.1 
 
 
664 aa  709    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0685  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  100 
 
 
674 aa  1363    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1832  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  59.02 
 
 
678 aa  786    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1556  phenylacetic acid degradation protein paaN  56.39 
 
 
690 aa  735    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1925  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  59.76 
 
 
679 aa  783    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0838003  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0934  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  56.33 
 
 
691 aa  735    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1913  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  52.46 
 
 
695 aa  638    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0600585  normal  0.0559603 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0437  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  59.19 
 
 
676 aa  779    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.68112 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1515  phenylacetic acid degradation protein paaN  52.15 
 
 
686 aa  670    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.629181  normal  0.465185 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3359  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  60.95 
 
 
685 aa  794    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.990834  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3827  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  61.33 
 
 
678 aa  792    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.145671  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3568  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  53.18 
 
 
682 aa  652    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.282162 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3053  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  52.86 
 
 
702 aa  663    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1910  phenylacetic acid degradation protein paaN  58.22 
 
 
686 aa  733    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0302284  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3255  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  52.35 
 
 
703 aa  671    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.607573  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4804  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  57.53 
 
 
686 aa  756    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.27422 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0226  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  50.59 
 
 
683 aa  653    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.577017 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0907  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  62.74 
 
 
687 aa  815    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.338542  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26540  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  57.76 
 
 
681 aa  748    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.212629 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5320  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  56.78 
 
 
675 aa  721    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.248137  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3090  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  48.9 
 
 
684 aa  629  1e-179  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.748677  hitchhiker  0.00334678 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20290  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  50.88 
 
 
706 aa  630  1e-179  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0650346  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2626  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  51.56 
 
 
684 aa  626  1e-178  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.574883  normal  0.162198 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2639  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  51.71 
 
 
683 aa  625  1e-178  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.31992  normal  0.197677 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3270  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  51.56 
 
 
684 aa  622  1e-177  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.289293  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1226  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  53.4 
 
 
686 aa  624  1e-177  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2489  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  51.41 
 
 
684 aa  622  1e-177  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.997274 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0094  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  50.67 
 
 
688 aa  611  1e-173  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0649  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  46.9 
 
 
683 aa  611  1e-173  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.940422  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3071  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  49.34 
 
 
690 aa  608  9.999999999999999e-173  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.329771 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2268  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  48.74 
 
 
681 aa  594  1e-168  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1474  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  48.74 
 
 
681 aa  595  1e-168  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2258  phenylacetic acid degradation protein paaN  48.74 
 
 
681 aa  591  1e-167  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1572  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  48.6 
 
 
681 aa  591  1e-167  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05275  aldehyde dehydrogenase  46.22 
 
 
836 aa  564  1.0000000000000001e-159  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0895  aldehyde dehydrogenase  47.02 
 
 
531 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.335826 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2699  aldehyde dehydrogenase  46.38 
 
 
531 aa  395  1e-108  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1420  aldehyde dehydrogenase  47.93 
 
 
531 aa  392  1e-107  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0677446  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1625  aldehyde dehydrogenase  43.8 
 
 
518 aa  368  1e-100  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0898756  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3656  aldehyde dehydrogenase  44.73 
 
 
519 aa  363  8e-99  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0217  aldehyde dehydrogenase  45.12 
 
 
520 aa  360  6e-98  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.286269  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4944  Aldehyde Dehydrogenase  43.25 
 
 
517 aa  358  9.999999999999999e-98  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.141691  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0090  aldehyde dehydrogenase  45.12 
 
 
516 aa  356  7.999999999999999e-97  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2947  aldehyde dehydrogenase  45.35 
 
 
523 aa  350  4e-95  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.738502  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1607  dehydratase  50 
 
 
515 aa  176  9.999999999999999e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.244807  normal  0.332328 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0559  aldehyde dehydrogenase  29.93 
 
 
473 aa  125  4e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.088227  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1779  aldehyde dehydrogenase  27.1 
 
 
485 aa  124  5e-27  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31700  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  29.57 
 
 
495 aa  124  6e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.465703  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0742  aldehyde dehydrogenase  29.66 
 
 
476 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0948493  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0544  Aldehyde Dehydrogenase_  28.54 
 
 
477 aa  122  1.9999999999999998e-26  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.257528  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5405  Aldehyde Dehydrogenase  28.85 
 
 
529 aa  122  1.9999999999999998e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.264091  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4475  aldehyde dehydrogenase  30.13 
 
 
476 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000636  NAD-dependent aldehyde dehydrogenase  28.04 
 
 
506 aa  120  9e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0096  betaine aldehyde dehydrogenase  28.41 
 
 
491 aa  119  9.999999999999999e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0383  Aldehyde Dehydrogenase  27.27 
 
 
493 aa  120  9.999999999999999e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4470  betaine-aldehyde dehydrogenase  29.96 
 
 
483 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.740479  normal  0.387365 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0041  aldehyde dehydrogenase  28.46 
 
 
469 aa  119  1.9999999999999998e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.267288  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0742  aldehyde dehydrogenase  28.76 
 
 
476 aa  118  3e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0560  Aldehyde Dehydrogenase  29.82 
 
 
500 aa  118  3e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0708  betaine-aldehyde dehydrogenase, putative  29.21 
 
 
476 aa  117  5e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1827  Betaine-aldehyde dehydrogenase  28.44 
 
 
477 aa  117  6.9999999999999995e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0226189  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1708  Betaine-aldehyde dehydrogenase  29.66 
 
 
494 aa  117  7.999999999999999e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3788  aldehyde dehydrogenase  27.69 
 
 
510 aa  117  1.0000000000000001e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0212  Aldehyde Dehydrogenase  28.53 
 
 
484 aa  116  1.0000000000000001e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1410  2-hydroxymuconic semialdehyde dehydrogenase  25.9 
 
 
488 aa  116  2.0000000000000002e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0272  aldehyde dehydrogenase  29.82 
 
 
517 aa  115  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0265  aldehyde dehydrogenase  29.37 
 
 
512 aa  115  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00113994 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3159  betaine-aldehyde dehydrogenase  30.8 
 
 
484 aa  115  3e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1456  putative betaine aldehyde dehydrogenase (BADH) oxidoreductase protein  27.57 
 
 
478 aa  114  5e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.812422 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4340  aldehyde dehydrogenase  30.3 
 
 
513 aa  114  5e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0524218  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6113  Aldehyde Dehydrogenase  28.12 
 
 
466 aa  114  5e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.401659  normal  0.835317 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3176  aldehyde dehydrogenase  27.39 
 
 
490 aa  114  8.000000000000001e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000139941  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2635  Aldehyde Dehydrogenase  31.06 
 
 
474 aa  113  1.0000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.311715 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3300  phenylacetaldehyde dehydrogenase  27.52 
 
 
494 aa  113  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1842  betaine-aldehyde dehydrogenase  32.08 
 
 
476 aa  113  1.0000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3305  phenylacetaldehyde dehydrogenase  27.29 
 
 
494 aa  112  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1249  bifunctional proline dehydrogenase/pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  26.55 
 
 
1080 aa  112  2.0000000000000002e-23  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.907532  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2499  betaine-aldehyde dehydrogenase  28.78 
 
 
496 aa  112  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.00184375  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3379  phenylacetaldehyde dehydrogenase  27.29 
 
 
494 aa  112  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2158  aldehyde dehydrogenase  25.15 
 
 
475 aa  112  3e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0382  aldehyde dehydrogenase  29.28 
 
 
491 aa  112  3e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.515832 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5114  betaine aldehyde dehydrogenase  28.1 
 
 
490 aa  112  3e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.502365  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3474  phenylacetaldehyde dehydrogenase  27.29 
 
 
494 aa  112  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3083  betaine-aldehyde dehydrogenase  28.65 
 
 
499 aa  111  3e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.36697 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2196  aldehyde dehydrogenase  25.15 
 
 
475 aa  112  3e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0387  aldehyde dehydrogenase family protein  28.05 
 
 
473 aa  111  4.0000000000000004e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1018  Aldehyde Dehydrogenase  26.69 
 
 
510 aa  111  4.0000000000000004e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3372  phenylacetaldehyde dehydrogenase  27.29 
 
 
494 aa  111  4.0000000000000004e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4593  aldehyde dehydrogenase  29.26 
 
 
487 aa  111  4.0000000000000004e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1989  aldehyde dehydrogenase  27.62 
 
 
494 aa  111  5e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.73515  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1075  Aldehyde Dehydrogenase  25.28 
 
 
475 aa  111  5e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0217  aldehyde dehydrogenase  28.26 
 
 
491 aa  111  5e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2008  aldehyde dehydrogenase  27.62 
 
 
494 aa  111  5e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.288735  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0227  aldehyde dehydrogenase  28.26 
 
 
491 aa  111  5e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.596332  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>