More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_3827 on replicon NC_009956
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012803  Mlut_20290  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  53.81 
 
 
706 aa  676    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0650346  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3071  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  52.72 
 
 
690 aa  655    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.329771 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0907  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  61.52 
 
 
687 aa  791    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.338542  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3568  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  52.96 
 
 
682 aa  648    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.282162 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5320  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  56.04 
 
 
675 aa  720    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.248137  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3090  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  52.59 
 
 
684 aa  681    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.748677  hitchhiker  0.00334678 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4152  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  58.1 
 
 
686 aa  761    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.39195  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0226  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  50.07 
 
 
683 aa  655    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.577017 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26540  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  56.04 
 
 
681 aa  726    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.212629 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3636  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  58.42 
 
 
678 aa  743    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.387162 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0658  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  68.51 
 
 
664 aa  887    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0685  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  61.33 
 
 
674 aa  766    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1832  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  60.33 
 
 
678 aa  790    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0934  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  55.59 
 
 
691 aa  721    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0748  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  62.84 
 
 
675 aa  839    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.778513 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0437  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  77.66 
 
 
676 aa  1056    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.68112 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3827  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  100 
 
 
678 aa  1360    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.145671  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1925  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  59.52 
 
 
679 aa  754    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0838003  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0031  phenylacetic acid degradation protein paaN  54.4 
 
 
678 aa  693    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.300256  normal  0.45539 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2485  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  55.06 
 
 
683 aa  693    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00712993  hitchhiker  0.00576818 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3053  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  53.22 
 
 
702 aa  666    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3359  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  59.91 
 
 
685 aa  759    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.990834  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1515  phenylacetic acid degradation protein paaN  50.44 
 
 
686 aa  660    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.629181  normal  0.465185 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3255  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  53.43 
 
 
703 aa  680    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.607573  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4804  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  57.53 
 
 
686 aa  752    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.27422 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1556  phenylacetic acid degradation protein paaN  60.59 
 
 
690 aa  803    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1850  phenylacetic acid degradation protein paaN  51.7 
 
 
679 aa  692    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.8142  normal  0.547776 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1910  phenylacetic acid degradation protein paaN  58.72 
 
 
686 aa  735    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0302284  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2639  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  53.33 
 
 
683 aa  642    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.31992  normal  0.197677 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2626  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  52.44 
 
 
684 aa  634  1e-180  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.574883  normal  0.162198 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2489  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  52.59 
 
 
684 aa  633  1e-180  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.997274 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2268  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  51.56 
 
 
681 aa  632  1e-180  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2258  phenylacetic acid degradation protein paaN  51.41 
 
 
681 aa  629  1e-179  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3270  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  52.3 
 
 
684 aa  630  1e-179  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.289293  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1226  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  53.46 
 
 
686 aa  631  1e-179  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1474  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  51.47 
 
 
681 aa  631  1e-179  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1572  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  51.26 
 
 
681 aa  630  1e-179  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1913  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  50.59 
 
 
695 aa  626  1e-178  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0600585  normal  0.0559603 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0649  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  46.53 
 
 
683 aa  603  1.0000000000000001e-171  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.940422  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0094  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  50.3 
 
 
688 aa  595  1e-169  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05275  aldehyde dehydrogenase  46.76 
 
 
836 aa  577  1.0000000000000001e-163  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0895  aldehyde dehydrogenase  44.17 
 
 
531 aa  383  1e-105  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.335826 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2699  aldehyde dehydrogenase  44.72 
 
 
531 aa  377  1e-103  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3656  aldehyde dehydrogenase  44.73 
 
 
519 aa  375  1e-102  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1625  aldehyde dehydrogenase  43.6 
 
 
518 aa  372  1e-101  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0898756  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1420  aldehyde dehydrogenase  44.31 
 
 
531 aa  371  1e-101  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0677446  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0217  aldehyde dehydrogenase  44.53 
 
 
520 aa  362  1e-98  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.286269  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0090  aldehyde dehydrogenase  43.84 
 
 
516 aa  360  4e-98  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2947  aldehyde dehydrogenase  44.47 
 
 
523 aa  357  2.9999999999999997e-97  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.738502  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4944  Aldehyde Dehydrogenase  42.13 
 
 
517 aa  336  9e-91  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.141691  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1607  dehydratase  47.75 
 
 
515 aa  159  2e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.244807  normal  0.332328 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0265  aldehyde dehydrogenase  27.59 
 
 
512 aa  128  4.0000000000000003e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00113994 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0272  aldehyde dehydrogenase  29.58 
 
 
517 aa  128  4.0000000000000003e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1779  aldehyde dehydrogenase  29.93 
 
 
485 aa  121  4.9999999999999996e-26  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3788  aldehyde dehydrogenase  28.09 
 
 
510 aa  121  6e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4593  aldehyde dehydrogenase  31.14 
 
 
487 aa  117  5e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2186  aldehyde dehydrogenase  29.7 
 
 
470 aa  116  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0362703  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2043  aldehyde dehydrogenase  29.26 
 
 
470 aa  116  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4733  Aldehyde Dehydrogenase  26.84 
 
 
506 aa  112  2.0000000000000002e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.29898  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2689  aldehyde dehydrogenase  29.12 
 
 
798 aa  111  4.0000000000000004e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.583529 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001017  proline dehydrogenase (Proline oxidase)/delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  27.12 
 
 
1043 aa  110  8.000000000000001e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.135188  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2499  betaine-aldehyde dehydrogenase  29.07 
 
 
496 aa  109  1e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.00184375  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2788  betaine-aldehyde dehydrogenase  30.14 
 
 
493 aa  110  1e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1104  aldehyde dehydrogenase  28.77 
 
 
474 aa  110  1e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.304588  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1036  aldehyde dehydrogenase  27.62 
 
 
494 aa  109  1e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.922959  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0169  bifunctional proline dehydrogenase/pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  28.43 
 
 
1039 aa  109  2e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0936263  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2635  betaine aldehyde dehydrogenase  26.97 
 
 
496 aa  109  2e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1018  Aldehyde Dehydrogenase  27.95 
 
 
510 aa  108  2e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2689  betaine aldehyde dehydrogenase  26.97 
 
 
496 aa  109  2e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2233  Aldehyde dehydrogenase (NAD(+))  25.84 
 
 
788 aa  108  4e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.635265  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3794  aldehyde dehydrogenase  27.13 
 
 
783 aa  108  4e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0958  aldehyde dehydrogenase  29.3 
 
 
492 aa  108  4e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.938749  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5222  Betaine-aldehyde dehydrogenase  28.88 
 
 
494 aa  108  5e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.938507  normal  0.927599 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0152  Aldehyde Dehydrogenase  28.82 
 
 
510 aa  107  6e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1043  1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  28.42 
 
 
515 aa  107  6e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4835  Betaine-aldehyde dehydrogenase  31.27 
 
 
505 aa  107  9e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0460635 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0904  aldehyde dehydrogenase  26.69 
 
 
481 aa  107  9e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6577  aldehyde dehydrogenase  27.88 
 
 
479 aa  106  1e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0117224  normal  0.0233893 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3064  aldehyde dehydrogenase family protein  30.58 
 
 
505 aa  105  2e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0192942  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1776  betaine-aldehyde dehydrogenase  30.62 
 
 
472 aa  105  2e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.146977  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7546  betaine-aldehyde dehydrogenase  29.79 
 
 
474 aa  106  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.51441 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2462  betaine-aldehyde dehydrogenase  28.57 
 
 
496 aa  105  2e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.1149  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2507  betaine-aldehyde dehydrogenase  28.57 
 
 
496 aa  105  2e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.982399 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6113  Aldehyde Dehydrogenase  27.75 
 
 
466 aa  105  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.401659  normal  0.835317 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0667  aldehyde dehydrogenase  31.85 
 
 
486 aa  105  4e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2239  aldehyde dehydrogenase  31.85 
 
 
486 aa  105  4e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0390454  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2177  betaine aldehyde dehydrogenase  25.29 
 
 
496 aa  105  4e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07096  bifunctional proline dehydrogenase/pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  27 
 
 
1043 aa  105  4e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0569  aldehyde dehydrogenase  31.85 
 
 
486 aa  105  4e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.710627  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2844  betaine-aldehyde dehydrogenase  28.88 
 
 
481 aa  104  5e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0486  aldehyde dehydrogenase  31.53 
 
 
486 aa  104  5e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.577547  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3281  aldehyde dehydrogenase  27.77 
 
 
499 aa  104  6e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.575722  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0387  aldehyde dehydrogenase family protein  28.25 
 
 
473 aa  104  6e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1054  Aldehyde Dehydrogenase  29.63 
 
 
513 aa  104  6e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1278  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  28.19 
 
 
492 aa  104  7e-21  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.000390072  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1610  aldehyde dehydrogenase  31.53 
 
 
486 aa  103  8e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.156903  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1371  aldehyde dehydrogenase  28.97 
 
 
500 aa  103  8e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0762191 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1637  aldehyde dehydrogenase  31.53 
 
 
486 aa  103  8e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2001  aldehyde dehydrogenase  30.11 
 
 
506 aa  103  8e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.230641  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1663  aldehyde dehydrogenase  31.53 
 
 
486 aa  103  8e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.131134  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>