More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_26540 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_5320  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  79.08 
 
 
675 aa  1036    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.248137  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0031  phenylacetic acid degradation protein paaN  68.26 
 
 
678 aa  885    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.300256  normal  0.45539 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26540  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  100 
 
 
681 aa  1368    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.212629 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3270  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  53.08 
 
 
684 aa  637    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.289293  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3568  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  53.83 
 
 
682 aa  651    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.282162 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3053  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  58.13 
 
 
702 aa  741    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3359  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  58.05 
 
 
685 aa  744    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.990834  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1925  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  55.26 
 
 
679 aa  714    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0838003  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3827  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  56.04 
 
 
678 aa  727    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.145671  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2485  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  65.68 
 
 
683 aa  841    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00712993  hitchhiker  0.00576818 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1910  phenylacetic acid degradation protein paaN  73.82 
 
 
686 aa  961    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0302284  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3071  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  52.13 
 
 
690 aa  661    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.329771 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20290  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  55.38 
 
 
706 aa  707    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0650346  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1850  phenylacetic acid degradation protein paaN  52.07 
 
 
679 aa  716    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.8142  normal  0.547776 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1226  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  54.63 
 
 
686 aa  649    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3636  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  54.81 
 
 
678 aa  702    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.387162 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0658  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  54.18 
 
 
664 aa  676    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0685  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  57.76 
 
 
674 aa  726    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1474  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  51.03 
 
 
681 aa  636    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1832  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  55.11 
 
 
678 aa  723    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0934  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  60.98 
 
 
691 aa  797    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1913  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  57.48 
 
 
695 aa  717    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0600585  normal  0.0559603 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0437  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  56.95 
 
 
676 aa  743    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.68112 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3090  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  50.44 
 
 
684 aa  660    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.748677  hitchhiker  0.00334678 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2489  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  53.23 
 
 
684 aa  640    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.997274 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1515  phenylacetic acid degradation protein paaN  51.7 
 
 
686 aa  708    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.629181  normal  0.465185 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0094  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  60.68 
 
 
688 aa  777    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0226  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  49.19 
 
 
683 aa  641    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.577017 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2268  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  51.03 
 
 
681 aa  636    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4152  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  61.61 
 
 
686 aa  809    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.39195  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3255  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  57.02 
 
 
703 aa  743    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.607573  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0907  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  57.63 
 
 
687 aa  748    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.338542  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2626  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  53.08 
 
 
684 aa  639    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.574883  normal  0.162198 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4804  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  62.91 
 
 
686 aa  832    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.27422 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1556  phenylacetic acid degradation protein paaN  58.43 
 
 
690 aa  777    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0748  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  59.05 
 
 
675 aa  775    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.778513 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2258  phenylacetic acid degradation protein paaN  51.18 
 
 
681 aa  635  1e-180  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1572  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  51.03 
 
 
681 aa  632  1e-180  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2639  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  53.24 
 
 
683 aa  634  1e-180  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.31992  normal  0.197677 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0649  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  46.77 
 
 
683 aa  632  1e-180  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.940422  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05275  aldehyde dehydrogenase  46.55 
 
 
836 aa  587  1e-166  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0895  aldehyde dehydrogenase  47.09 
 
 
531 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.335826 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1420  aldehyde dehydrogenase  45.68 
 
 
531 aa  404  1e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0677446  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3656  aldehyde dehydrogenase  46.6 
 
 
519 aa  403  1e-111  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2699  aldehyde dehydrogenase  45.88 
 
 
531 aa  405  1e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0090  aldehyde dehydrogenase  46.9 
 
 
516 aa  402  9.999999999999999e-111  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1625  aldehyde dehydrogenase  44.77 
 
 
518 aa  400  9.999999999999999e-111  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0898756  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0217  aldehyde dehydrogenase  46.09 
 
 
520 aa  384  1e-105  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.286269  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2947  aldehyde dehydrogenase  45.63 
 
 
523 aa  374  1e-102  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.738502  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4944  Aldehyde Dehydrogenase  44.51 
 
 
517 aa  375  1e-102  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.141691  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1607  dehydratase  52.75 
 
 
515 aa  184  5.0000000000000004e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.244807  normal  0.332328 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4733  Aldehyde Dehydrogenase  27.34 
 
 
506 aa  132  3e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.29898  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1476  betaine aldehyde dehydrogenase  27.75 
 
 
490 aa  129  2.0000000000000002e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5405  Aldehyde Dehydrogenase  30.8 
 
 
529 aa  129  2.0000000000000002e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.264091  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2635  betaine aldehyde dehydrogenase  28.08 
 
 
496 aa  128  4.0000000000000003e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2689  betaine aldehyde dehydrogenase  28.08 
 
 
496 aa  128  4.0000000000000003e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4080  betaine aldehyde dehydrogenase  27.65 
 
 
485 aa  126  1e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0402  betaine aldehyde dehydrogenase  28.12 
 
 
490 aa  125  3e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2457  aldehyde dehydrogenase  26.81 
 
 
463 aa  122  9.999999999999999e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0875  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)(+))  26.94 
 
 
483 aa  123  9.999999999999999e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1514  betaine aldehyde dehydrogenase  28.17 
 
 
490 aa  122  9.999999999999999e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0736273  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5114  betaine aldehyde dehydrogenase  28.43 
 
 
490 aa  121  3e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.502365  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2916  betaine aldehyde dehydrogenase  27.01 
 
 
490 aa  121  3.9999999999999996e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4936  betaine aldehyde dehydrogenase  28.68 
 
 
490 aa  121  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.208261  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5063  betaine aldehyde dehydrogenase  28.68 
 
 
490 aa  121  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.921344  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1554  aldehyde dehydrogenase  28.35 
 
 
498 aa  121  4.9999999999999996e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.220201 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0265  aldehyde dehydrogenase  28.73 
 
 
512 aa  121  4.9999999999999996e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00113994 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2177  betaine aldehyde dehydrogenase  28.35 
 
 
496 aa  120  6e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3788  aldehyde dehydrogenase  27.45 
 
 
510 aa  120  7e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2555  betaine aldehyde dehydrogenase  27.83 
 
 
490 aa  120  7e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0789453  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1708  Betaine-aldehyde dehydrogenase  29.65 
 
 
494 aa  119  9.999999999999999e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1779  aldehyde dehydrogenase  27.76 
 
 
485 aa  119  1.9999999999999998e-25  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4012  Aldehyde Dehydrogenase  26.41 
 
 
508 aa  118  3.9999999999999997e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4860  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  28.54 
 
 
491 aa  117  5e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0955697 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3722  succinic semialdehyde dehydrogenase  26.09 
 
 
500 aa  116  1.0000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5243  betaine aldehyde dehydrogenase  27.21 
 
 
490 aa  116  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0991696  normal  0.0622571 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2830  betaine aldehyde dehydrogenase  26.82 
 
 
490 aa  115  2.0000000000000002e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.143897  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4593  aldehyde dehydrogenase  29.48 
 
 
487 aa  115  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0544  Aldehyde Dehydrogenase_  25.94 
 
 
477 aa  116  2.0000000000000002e-24  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.257528  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31700  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  28.69 
 
 
495 aa  115  3e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.465703  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0535  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  31.67 
 
 
487 aa  114  5e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2213  Aldehyde Dehydrogenase  27.38 
 
 
499 aa  114  5e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00273985 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2844  betaine-aldehyde dehydrogenase  28.12 
 
 
481 aa  114  6e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1018  Aldehyde Dehydrogenase  26.31 
 
 
510 aa  114  7.000000000000001e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1247  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  28.44 
 
 
502 aa  114  7.000000000000001e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.791196 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3064  aldehyde dehydrogenase family protein  30.24 
 
 
505 aa  114  8.000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0192942  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0327  betaine aldehyde dehydrogenase  28.44 
 
 
490 aa  114  8.000000000000001e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1220  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  28.44 
 
 
523 aa  114  8.000000000000001e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1237  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  28.44 
 
 
523 aa  114  8.000000000000001e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.399844  normal  0.627262 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0560  Aldehyde Dehydrogenase  26.12 
 
 
500 aa  114  9e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0272  aldehyde dehydrogenase  27.57 
 
 
517 aa  113  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2499  betaine-aldehyde dehydrogenase  27.91 
 
 
496 aa  113  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.00184375  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1371  aldehyde dehydrogenase  28.29 
 
 
500 aa  113  1.0000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0762191 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3377  aldehyde dehydrogenase  28.9 
 
 
482 aa  113  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1622  Betaine-aldehyde dehydrogenase  29.07 
 
 
478 aa  112  2.0000000000000002e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4733  betaine aldehyde dehydrogenase  27.41 
 
 
490 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.187184  normal  0.498706 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0129  betaine aldehyde dehydrogenase  27.53 
 
 
494 aa  112  2.0000000000000002e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00429668  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1493  Aldehyde Dehydrogenase  25.53 
 
 
477 aa  112  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0589665  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0343  betaine aldehyde dehydrogenase  28.44 
 
 
490 aa  112  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0028  succinate-semialdehyde dehydrogenase oxidoreductase protein  26.77 
 
 
497 aa  111  3e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>