More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_1910 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013159  Svir_26540  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  73.82 
 
 
681 aa  962    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.212629 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4804  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  62.23 
 
 
686 aa  815    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.27422 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3827  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  58.72 
 
 
678 aa  737    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.145671  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1515  phenylacetic acid degradation protein paaN  52.89 
 
 
686 aa  695    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.629181  normal  0.465185 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3359  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  60.15 
 
 
685 aa  743    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.990834  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0094  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  58.22 
 
 
688 aa  701    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1910  phenylacetic acid degradation protein paaN  100 
 
 
686 aa  1363    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0302284  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3090  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  51.47 
 
 
684 aa  650    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.748677  hitchhiker  0.00334678 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0031  phenylacetic acid degradation protein paaN  70.19 
 
 
678 aa  904    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.300256  normal  0.45539 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0748  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  58.72 
 
 
675 aa  762    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.778513 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3053  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  57.68 
 
 
702 aa  712    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0907  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  58.61 
 
 
687 aa  741    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.338542  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3636  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  56.91 
 
 
678 aa  710    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.387162 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20290  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  56.47 
 
 
706 aa  709    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0650346  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0658  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  55.52 
 
 
664 aa  674    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5320  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  70.13 
 
 
675 aa  891    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.248137  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0685  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  58.22 
 
 
674 aa  712    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4152  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  61.76 
 
 
686 aa  796    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.39195  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0226  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  50.3 
 
 
683 aa  646    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.577017 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1832  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  57.5 
 
 
678 aa  733    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0934  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  61.6 
 
 
691 aa  790    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1850  phenylacetic acid degradation protein paaN  54.88 
 
 
679 aa  734    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.8142  normal  0.547776 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2485  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  64.55 
 
 
683 aa  824    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00712993  hitchhiker  0.00576818 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1913  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  58.43 
 
 
695 aa  711    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0600585  normal  0.0559603 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0437  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  57.4 
 
 
676 aa  732    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.68112 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1556  phenylacetic acid degradation protein paaN  58.28 
 
 
690 aa  748    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1925  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  57.61 
 
 
679 aa  729    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0838003  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3255  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  56.58 
 
 
703 aa  725    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.607573  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1226  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  54.12 
 
 
686 aa  622  1e-177  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2258  phenylacetic acid degradation protein paaN  51.68 
 
 
681 aa  617  1e-175  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2268  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  51.24 
 
 
681 aa  615  1e-175  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0649  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  47.2 
 
 
683 aa  615  1e-175  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.940422  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1474  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  51.24 
 
 
681 aa  615  1e-175  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3071  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  50.52 
 
 
690 aa  618  1e-175  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.329771 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2626  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  52.06 
 
 
684 aa  613  9.999999999999999e-175  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.574883  normal  0.162198 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3270  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  52.35 
 
 
684 aa  613  9.999999999999999e-175  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.289293  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3568  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  51.32 
 
 
682 aa  612  9.999999999999999e-175  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.282162 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1572  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  51.24 
 
 
681 aa  612  9.999999999999999e-175  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2489  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  52.21 
 
 
684 aa  612  9.999999999999999e-175  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.997274 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2639  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  52.21 
 
 
683 aa  611  1e-173  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.31992  normal  0.197677 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05275  aldehyde dehydrogenase  46.32 
 
 
836 aa  573  1.0000000000000001e-162  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0895  aldehyde dehydrogenase  48.05 
 
 
531 aa  412  1e-113  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.335826 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3656  aldehyde dehydrogenase  48.34 
 
 
519 aa  392  1e-108  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1420  aldehyde dehydrogenase  46.28 
 
 
531 aa  393  1e-108  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0677446  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2699  aldehyde dehydrogenase  46.49 
 
 
531 aa  391  1e-107  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0090  aldehyde dehydrogenase  48.25 
 
 
516 aa  391  1e-107  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1625  aldehyde dehydrogenase  46.47 
 
 
518 aa  386  1e-106  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0898756  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2947  aldehyde dehydrogenase  47.37 
 
 
523 aa  376  1e-103  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.738502  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0217  aldehyde dehydrogenase  46.25 
 
 
520 aa  369  1e-100  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.286269  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4944  Aldehyde Dehydrogenase  44.71 
 
 
517 aa  342  2e-92  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.141691  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1607  dehydratase  54.64 
 
 
515 aa  196  2e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.244807  normal  0.332328 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4593  aldehyde dehydrogenase  30.63 
 
 
487 aa  110  6e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3862  aldehyde dehydrogenase family protein  27.17 
 
 
480 aa  108  2e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1779  aldehyde dehydrogenase  29.8 
 
 
485 aa  108  3e-22  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1456  putative betaine aldehyde dehydrogenase (BADH) oxidoreductase protein  30.19 
 
 
478 aa  107  8e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.812422 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4410  Aldehyde Dehydrogenase  31.36 
 
 
491 aa  107  9e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1818  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  30.17 
 
 
474 aa  106  1e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5405  Aldehyde Dehydrogenase  29.57 
 
 
529 aa  106  1e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.264091  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0265  aldehyde dehydrogenase  30.06 
 
 
512 aa  106  1e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00113994 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2533  aldehyde dehydrogenase  27.93 
 
 
468 aa  105  2e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4080  betaine aldehyde dehydrogenase  26.67 
 
 
485 aa  105  3e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0387  aldehyde dehydrogenase family protein  28.48 
 
 
473 aa  105  3e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1366  Aldehyde dehydrogenase (NAD(+))  27.86 
 
 
511 aa  104  6e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1410  2-hydroxymuconic semialdehyde dehydrogenase  23.04 
 
 
488 aa  103  1e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1415  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  29.89 
 
 
474 aa  103  1e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2290  betaine-aldehyde dehydrogenase  26.65 
 
 
503 aa  103  1e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.109533 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1729  aldehyde dehydrogenase  29.47 
 
 
475 aa  102  2e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00132327  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0272  aldehyde dehydrogenase  29.35 
 
 
517 aa  102  2e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0875  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)(+))  26.36 
 
 
483 aa  102  3e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3731  aldehyde dehydrogenase  30.94 
 
 
493 aa  101  4e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.576813  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3791  aldehyde dehydrogenase  30.94 
 
 
493 aa  101  5e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0604454  normal  0.0877723 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3718  aldehyde dehydrogenase  30.94 
 
 
495 aa  101  5e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.297586  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1095  aldehyde dehydrogenase  27.31 
 
 
506 aa  101  5e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.298073  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2499  betaine-aldehyde dehydrogenase  29.2 
 
 
496 aa  101  5e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.00184375  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0158  aldehyde dehydrogenase  25.1 
 
 
495 aa  100  6e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0535  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  32.44 
 
 
487 aa  100  6e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0153  aldehyde dehydrogenase  25.1 
 
 
495 aa  100  6e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4442  delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  30.59 
 
 
1310 aa  101  6e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.248851 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2599  aldehyde dehydrogenase  30.48 
 
 
472 aa  100  9e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.423682  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0825  aldehyde dehydrogenase  27.84 
 
 
499 aa  100  9e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2177  betaine aldehyde dehydrogenase  25 
 
 
496 aa  99.8  1e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31700  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  29.52 
 
 
495 aa  100  1e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.465703  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3441  succinate semialdehyde dehydrogenase  27.4 
 
 
479 aa  100  1e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.301737  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2635  Aldehyde Dehydrogenase  30.95 
 
 
474 aa  99.8  1e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.311715 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1309  aldehyde dehydrogenase  25.25 
 
 
477 aa  100  1e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.472659  normal  0.0179284 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2457  aldehyde dehydrogenase  26.79 
 
 
463 aa  100  1e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0728  aldehyde dehydrogenase family protein  29.38 
 
 
506 aa  99.4  2e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4860  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  29.01 
 
 
491 aa  98.6  3e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0955697 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3559  aldehyde dehydrogenase  28.34 
 
 
475 aa  99  3e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.548914  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3165  Betaine-aldehyde dehydrogenase  26.06 
 
 
492 aa  98.2  4e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3410  aldehyde dehydrogenase  25.38 
 
 
506 aa  98.2  4e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2352  aldehyde dehydrogenase  29.8 
 
 
474 aa  98.6  4e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.448726  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4340  aldehyde dehydrogenase  30.27 
 
 
513 aa  98.2  5e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0524218  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7342  aldehyde dehydrogenase  27.33 
 
 
498 aa  97.8  6e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.524049  normal  0.607968 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1493  Aldehyde Dehydrogenase  24.55 
 
 
477 aa  97.8  6e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0589665  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3458  bifunctional proline dehydrogenase/pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  24.73 
 
 
1064 aa  97.8  6e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00916432  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2073  succinic-semialdehyde dehydrogenase NAD(P)+  24.83 
 
 
474 aa  97.4  7e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.578512  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2726  aldehyde dehydrogenase  25.86 
 
 
506 aa  97.4  7e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1776  betaine-aldehyde dehydrogenase  28.45 
 
 
472 aa  97.4  8e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.146977  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2446  aldehyde dehydrogenase  28.86 
 
 
478 aa  97.4  8e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>