More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_3862 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002947  PP_2694  aldehyde dehydrogenase family protein  71.61 
 
 
480 aa  710    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.657549 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3862  aldehyde dehydrogenase family protein  100 
 
 
480 aa  991    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3058  aldehyde dehydrogenase  71.61 
 
 
480 aa  711    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1815  aldehyde dehydrogenase  63.98 
 
 
491 aa  641    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0877  aldehyde dehydrogenase  63.06 
 
 
487 aa  638    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001563  aldehyde dehydrogenase B  62.63 
 
 
486 aa  625  1e-178  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.813557  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2128  aldehyde dehydrogenase  62 
 
 
486 aa  627  1e-178  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0517784  hitchhiker  0.00570201 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05501  hypothetical protein  61.78 
 
 
486 aa  622  1e-177  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0813  aldehyde dehydrogenase  63.69 
 
 
482 aa  616  1e-175  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1240  aldehyde dehydrogenase  61.52 
 
 
484 aa  601  1.0000000000000001e-171  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.208234 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3381  aldehyde dehydrogenase  59.87 
 
 
482 aa  590  1e-167  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.464458  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1958  aldehyde dehydrogenase  58.86 
 
 
479 aa  588  1e-167  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0577  aldehyde dehydrogenase  58.94 
 
 
483 aa  585  1e-166  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6489  aldehyde dehydrogenase  58.4 
 
 
482 aa  578  1e-164  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1478  aldehyde dehydrogenase  58.53 
 
 
481 aa  581  1e-164  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.696903  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1357  betaine-aldehyde dehydrogenase  57.47 
 
 
480 aa  578  1e-164  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.368184  normal  0.825895 
 
 
-
 
NC_004310  BR0210  aldehyde dehydrogenase family protein  58.09 
 
 
477 aa  572  1.0000000000000001e-162  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3974  aldehyde dehydrogenase  58.99 
 
 
475 aa  574  1.0000000000000001e-162  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0277  aldehyde dehydrogenase  57.17 
 
 
477 aa  573  1.0000000000000001e-162  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.872601  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0828  aldehyde dehydrogenase  57.05 
 
 
479 aa  570  1e-161  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0391677  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3422  aldehyde dehydrogenase  57.62 
 
 
479 aa  568  1e-161  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.228587  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4477  aldehyde dehydrogenase  58.44 
 
 
498 aa  571  1e-161  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.749064  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2910  Aldehyde Dehydrogenase  57.38 
 
 
477 aa  565  1e-160  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0201  aldehyde dehydrogenase family protein  57.66 
 
 
477 aa  567  1e-160  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5802  aldehyde dehydrogenase  56.63 
 
 
480 aa  565  1e-160  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5803  Aldehyde Dehydrogenase  56.24 
 
 
480 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.164732  normal  0.396611 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3171  Aldehyde Dehydrogenase  56.96 
 
 
477 aa  562  1.0000000000000001e-159  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.427314  normal  0.922652 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1119  aldehyde dehydrogenase  57.83 
 
 
479 aa  560  1e-158  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.65747 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2844  aldehyde dehydrogenase  57.98 
 
 
482 aa  560  1e-158  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.281069  normal  0.552255 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1046  Aldehyde Dehydrogenase  56.99 
 
 
485 aa  551  1e-156  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1732  Aldehyde Dehydrogenase  57.2 
 
 
478 aa  553  1e-156  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0174509  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2664  aldehyde dehydrogenase  57.17 
 
 
480 aa  554  1e-156  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.350023  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0452  aldehyde dehydrogenase  57.93 
 
 
480 aa  550  1e-155  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1126  aldehyde dehydrogenase  56.99 
 
 
485 aa  549  1e-155  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.393989 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1025  aldehyde dehydrogenase  57.75 
 
 
480 aa  547  1e-154  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1598  aldehyde dehydrogenase  56.38 
 
 
479 aa  545  1e-154  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0495  Aldehyde Dehydrogenase  55.23 
 
 
482 aa  544  1e-153  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1418  betaine-aldehyde dehydrogenase  54.93 
 
 
477 aa  541  9.999999999999999e-153  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00255167  normal  0.0518765 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6141  aldehyde dehydrogenase  60.77 
 
 
446 aa  537  1e-151  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0247  aldehyde dehydrogenase  57.32 
 
 
482 aa  533  1e-150  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5935  aldehyde dehydrogenase  50 
 
 
476 aa  515  1.0000000000000001e-145  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1043  Aldehyde Dehydrogenase  52.65 
 
 
483 aa  509  1e-143  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.414752  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3747  aldehyde dehydrogenase  51.37 
 
 
478 aa  483  1e-135  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2256  aldehyde dehydrogenase  49.47 
 
 
478 aa  461  9.999999999999999e-129  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.134767  hitchhiker  0.000000459097 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3017  aldehyde dehydrogenase  49.58 
 
 
478 aa  454  1.0000000000000001e-126  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3959  Aldehyde Dehydrogenase  46.53 
 
 
482 aa  422  1e-117  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.424065  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1054  aldehyde dehydrogenase  56.41 
 
 
441 aa  417  9.999999999999999e-116  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.395537  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0544  aldehyde dehydrogenase  42.49 
 
 
482 aa  375  1e-103  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.292442  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4482  Aldehyde Dehydrogenase  38.99 
 
 
479 aa  354  2e-96  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0437923  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4431  Aldehyde Dehydrogenase  40.88 
 
 
483 aa  346  5e-94  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0589221  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1459  aldehyde dehydrogenase  38.08 
 
 
505 aa  343  2.9999999999999997e-93  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4209  Aldehyde Dehydrogenase  40.21 
 
 
483 aa  341  2e-92  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1554  aldehyde dehydrogenase  37.27 
 
 
498 aa  336  5e-91  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.220201 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1856  aldehyde dehydrogenase  40.84 
 
 
488 aa  336  5e-91  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1779  aldehyde dehydrogenase  38.48 
 
 
485 aa  336  5.999999999999999e-91  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1826  aldehyde dehydrogenase  38.93 
 
 
485 aa  335  1e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.225626 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3763  aldehyde dehydrogenase  37.79 
 
 
481 aa  334  2e-90  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2635  Aldehyde Dehydrogenase  41.61 
 
 
474 aa  333  3e-90  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.311715 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0859  Aldehyde Dehydrogenase  38.46 
 
 
478 aa  333  4e-90  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2240  Aldehyde Dehydrogenase  39.58 
 
 
482 aa  332  1e-89  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.455066  normal  0.336013 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3632  aldehyde dehydrogenase family protein  37.94 
 
 
482 aa  330  3e-89  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1702  Aldehyde Dehydrogenase  38.49 
 
 
498 aa  328  1.0000000000000001e-88  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2387  aldehyde dehydrogenase (NAD+)  39 
 
 
493 aa  328  2.0000000000000001e-88  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.957539  normal  0.715084 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4351  aldehyde dehydrogenase  37.76 
 
 
491 aa  322  7e-87  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1303  Aldehyde Dehydrogenase  39.04 
 
 
516 aa  322  8e-87  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0829  aldehyde dehydrogenase  35.97 
 
 
503 aa  322  9.999999999999999e-87  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0391046  unclonable  0.0000197255 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0560  Aldehyde Dehydrogenase  37.87 
 
 
500 aa  322  9.999999999999999e-87  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0383  Aldehyde Dehydrogenase  39.29 
 
 
493 aa  318  1e-85  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0316  Aldehyde Dehydrogenase  37.39 
 
 
496 aa  318  1e-85  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1222  aldehyde dehydrogenase  35.98 
 
 
497 aa  317  3e-85  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1496  NAD-dependent aldehyde dehydrogenases  34.66 
 
 
496 aa  315  9e-85  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000254816  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3306  Aldehyde Dehydrogenase  40.55 
 
 
497 aa  314  1.9999999999999998e-84  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2213  Aldehyde Dehydrogenase  36.21 
 
 
499 aa  314  2.9999999999999996e-84  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00273985 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1253  Aldehyde Dehydrogenase  37.89 
 
 
493 aa  309  6.999999999999999e-83  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3314  aldehyde dehydrogenase  36.97 
 
 
496 aa  307  3e-82  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1076  aldehyde dehydrogenase  42.24 
 
 
505 aa  304  2.0000000000000002e-81  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.992962  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2823  betaine aldehyde dehydrogenase  35.83 
 
 
491 aa  295  1e-78  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1480  aldehyde dehydrogenase  36.34 
 
 
490 aa  293  4e-78  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0515859  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2257  aldehyde dehydrogenase  38.26 
 
 
457 aa  292  1e-77  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.955322  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3867  aldehyde dehydrogenase  36.04 
 
 
498 aa  290  3e-77  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00214537  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1476  betaine aldehyde dehydrogenase  36.01 
 
 
490 aa  287  2.9999999999999996e-76  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3176  aldehyde dehydrogenase  35.68 
 
 
490 aa  284  2.0000000000000002e-75  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000139941  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0129  betaine aldehyde dehydrogenase  35.62 
 
 
494 aa  284  2.0000000000000002e-75  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00429668  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5059  betaine aldehyde dehydrogenase  36.69 
 
 
489 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0560116 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0212  Aldehyde Dehydrogenase  34.79 
 
 
484 aa  283  4.0000000000000003e-75  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1591  betaine aldehyde dehydrogenase  37.11 
 
 
489 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1276  aldehyde dehydrogenase  34.65 
 
 
497 aa  283  5.000000000000001e-75  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.420346  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2131  aldehyde dehydrogenase  36.11 
 
 
480 aa  282  1e-74  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1328  aldehyde dehydrogenase  37.66 
 
 
483 aa  281  3e-74  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.447584  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0292  hypothetical protein  36.08 
 
 
488 aa  280  4e-74  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0152  Aldehyde Dehydrogenase  36.45 
 
 
510 aa  280  5e-74  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6158  betaine aldehyde dehydrogenase  36.48 
 
 
490 aa  279  6e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2262  aldehyde dehydrogenase  35.64 
 
 
493 aa  279  7e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3646  aldehyde dehydrogenase family protein  35.64 
 
 
493 aa  279  1e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.196663 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5033  betaine-aldehyde dehydrogenase  36.81 
 
 
507 aa  278  1e-73  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.489638  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4650  betaine-aldehyde dehydrogenase  36.81 
 
 
507 aa  278  1e-73  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4738  betaine-aldehyde dehydrogenase  36.81 
 
 
507 aa  278  1e-73  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2084  aldehyde dehydrogenase  35.64 
 
 
493 aa  278  2e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0158  aldehyde dehydrogenase  34.51 
 
 
495 aa  277  3e-73  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0153  aldehyde dehydrogenase  34.51 
 
 
495 aa  277  3e-73  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>